MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 117866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_016641	TTC	2	6	805564	805569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320666
15503	NC_016641	T	6	6	805681	805686	0 %	100 %	0 %	0 %	374320666
15504	NC_016641	TTTA	2	8	805744	805751	25 %	75 %	0 %	0 %	374320666
15505	NC_016641	TTC	3	9	805804	805812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320666
15506	NC_016641	TCC	2	6	805824	805829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15507	NC_016641	CGG	2	6	805837	805842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15508	NC_016641	CGTA	2	8	805909	805916	25 %	25 %	25 %	25 %	374320667
15509	NC_016641	TC	3	6	805923	805928	0 %	50 %	0 %	50 %	374320667
15510	NC_016641	CGTC	2	8	805941	805948	0 %	25 %	25 %	50 %	374320667
15511	NC_016641	AAAG	2	8	805954	805961	75 %	0 %	25 %	0 %	374320667
15512	NC_016641	TTC	2	6	806066	806071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320667
15513	NC_016641	CAG	2	6	806090	806095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320667
15514	NC_016641	CGC	2	6	806336	806341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320668
15515	NC_016641	TCA	2	6	806471	806476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320668
15516	NC_016641	CAG	2	6	806479	806484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320668
15517	NC_016641	CTT	2	6	806487	806492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320668
15518	NC_016641	AT	3	6	806503	806508	50 %	50 %	0 %	0 %	374320668
15519	NC_016641	ACA	2	6	806570	806575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320668
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15521	NC_016641	ATC	3	9	806647	806655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320668
15522	NC_016641	T	6	6	806658	806663	0 %	100 %	0 %	0 %	374320668
15523	NC_016641	CTG	2	6	806671	806676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320668
15524	NC_016641	CTT	2	6	806715	806720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320668
15525	NC_016641	TGC	2	6	806750	806755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320668
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15527	NC_016641	AT	3	6	806954	806959	50 %	50 %	0 %	0 %	374320668
15528	NC_016641	GCATTC	2	12	807016	807027	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374320668
15529	NC_016641	ATG	2	6	807028	807033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320668
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15532	NC_016641	CAT	2	6	807315	807320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320668
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15534	NC_016641	GGC	2	6	807406	807411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320668
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15537	NC_016641	CAT	2	6	807549	807554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320668
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15539	NC_016641	CATA	2	8	807647	807654	50 %	25 %	0 %	25 %	374320668
15540	NC_016641	CTC	2	6	807698	807703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320668
15541	NC_016641	TAT	2	6	807711	807716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320668
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15543	NC_016641	ATC	2	6	807756	807761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320669
15544	NC_016641	CAC	2	6	807955	807960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320669
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15546	NC_016641	ATT	2	6	808069	808074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320669
15547	NC_016641	TGG	2	6	808080	808085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320669
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15550	NC_016641	CCATG	2	10	808185	808194	20 %	20 %	20 %	40 %	374320669
15551	NC_016641	GGAT	2	8	808229	808236	25 %	25 %	50 %	0 %	374320669
15552	NC_016641	GGC	2	6	808381	808386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320669
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15554	NC_016641	CA	3	6	808476	808481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15555	NC_016641	CTG	2	6	808631	808636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15556	NC_016641	TCC	2	6	808753	808758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15557	NC_016641	CT	3	6	808806	808811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15558	NC_016641	ACA	2	6	808902	808907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15559	NC_016641	TTCA	2	8	808986	808993	25 %	50 %	0 %	25 %	374320670
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15565	NC_016641	TCT	2	6	809506	809511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320670
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15590	NC_016641	TCC	2	6	810463	810468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320671
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15593	NC_016641	AAT	2	6	810600	810605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320671
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15602	NC_016641	CAG	2	6	811079	811084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320672
15603	NC_016641	CTTG	2	8	811171	811178	0 %	50 %	25 %	25 %	374320672
15604	NC_016641	CAT	2	6	811279	811284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320672
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15608	NC_016641	TCACCA	2	12	811432	811443	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	374320672
15609	NC_016641	GTAT	2	8	811482	811489	25 %	50 %	25 %	0 %	374320672
15610	NC_016641	GCAAAA	2	12	811507	811518	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	374320672
15611	NC_016641	TTGC	2	8	811520	811527	0 %	50 %	25 %	25 %	374320672
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15616	NC_016641	CAT	2	6	811799	811804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320673
15617	NC_016641	GCA	2	6	811874	811879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320673
15618	NC_016641	TCGT	2	8	811963	811970	0 %	50 %	25 %	25 %	374320673
15619	NC_016641	ACC	2	6	811972	811977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320673
15620	NC_016641	GTA	2	6	811985	811990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320673
15621	NC_016641	CGA	2	6	812136	812141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320673
15622	NC_016641	CTC	2	6	812160	812165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320673
15623	NC_016641	CGTC	2	8	812230	812237	0 %	25 %	25 %	50 %	374320673
15624	NC_016641	TAA	2	6	812240	812245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320673
15625	NC_016641	TCC	2	6	812269	812274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320673
15626	NC_016641	TTC	2	6	812283	812288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320673
15627	NC_016641	A	6	6	812307	812312	100 %	0 %	0 %	0 %	374320673
15628	NC_016641	AAGGA	2	10	812452	812461	60 %	0 %	40 %	0 %	374320673
15629	NC_016641	CAT	2	6	812493	812498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320673
15630	NC_016641	CTG	2	6	812535	812540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320673
15631	NC_016641	ATC	2	6	812605	812610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320673
15632	NC_016641	GATAC	2	10	812662	812671	40 %	20 %	20 %	20 %	374320673
15633	NC_016641	GGT	2	6	812681	812686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320673
15634	NC_016641	CCT	2	6	812763	812768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15635	NC_016641	TTTTC	2	10	812772	812781	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15636	NC_016641	CT	3	6	812812	812817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15637	NC_016641	T	6	6	812864	812869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15638	NC_016641	A	7	7	812876	812882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15639	NC_016641	AAAT	2	8	812911	812918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15640	NC_016641	ATC	2	6	812967	812972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320674
15641	NC_016641	TTC	2	6	812976	812981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320674
15642	NC_016641	GCA	2	6	813124	813129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320674
15643	NC_016641	CTT	2	6	813159	813164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320674
15644	NC_016641	AGC	2	6	813226	813231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320674
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15646	NC_016641	CTG	2	6	813299	813304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320674
15647	NC_016641	CAT	2	6	813425	813430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320674
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15649	NC_016641	ATATC	2	10	813476	813485	40 %	40 %	0 %	20 %	374320674
15650	NC_016641	TCCA	2	8	813546	813553	25 %	25 %	0 %	50 %	374320674
15651	NC_016641	GTCC	2	8	813554	813561	0 %	25 %	25 %	50 %	374320674
15652	NC_016641	ATA	2	6	813583	813588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320674
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15654	NC_016641	TTACAT	2	12	813738	813749	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374320675
15655	NC_016641	TTC	2	6	813843	813848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320675
15656	NC_016641	TCG	2	6	813851	813856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320675
15657	NC_016641	CCA	2	6	813890	813895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320675
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15659	NC_016641	AT	3	6	813961	813966	50 %	50 %	0 %	0 %	374320675
15660	NC_016641	TCG	2	6	814033	814038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320675
15661	NC_016641	AAT	2	6	814062	814067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320675
15662	NC_016641	CAG	2	6	814113	814118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320675
15663	NC_016641	CATC	2	8	814151	814158	25 %	25 %	0 %	50 %	374320675
15664	NC_016641	TAA	2	6	814196	814201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320675
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15666	NC_016641	TAA	2	6	814427	814432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320675
15667	NC_016641	CGC	2	6	814438	814443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320675
15668	NC_016641	CCGCT	2	10	814485	814494	0 %	20 %	20 %	60 %	374320675
15669	NC_016641	GAG	2	6	814522	814527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374320675
15670	NC_016641	GGA	2	6	814530	814535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374320675
15671	NC_016641	CTCA	2	8	814581	814588	25 %	25 %	0 %	50 %	374320675
15672	NC_016641	GCC	2	6	814659	814664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320675
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15675	NC_016641	GCA	2	6	814778	814783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320675
15676	NC_016641	TCAT	2	8	814786	814793	25 %	50 %	0 %	25 %	374320675
15677	NC_016641	CTT	2	6	814811	814816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320675
15678	NC_016641	CTAAT	2	10	814833	814842	40 %	40 %	0 %	20 %	374320676
15679	NC_016641	TCCTAC	2	12	814869	814880	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	374320676
15680	NC_016641	GCT	2	6	814973	814978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320676
15681	NC_016641	GCAC	2	8	814993	815000	25 %	0 %	25 %	50 %	374320676
15682	NC_016641	AATC	2	8	815193	815200	50 %	25 %	0 %	25 %	374320676
15683	NC_016641	GAT	2	6	815207	815212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320676
15684	NC_016641	TTCC	2	8	815297	815304	0 %	50 %	0 %	50 %	374320676
15685	NC_016641	ACA	2	6	815314	815319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320676
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15687	NC_016641	CCTT	2	8	815542	815549	0 %	50 %	0 %	50 %	374320676
15688	NC_016641	CTT	2	6	815723	815728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320676
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15690	NC_016641	CCA	2	6	815918	815923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320676
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15698	NC_016641	GAT	2	6	816479	816484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15701	NC_016641	CAG	2	6	816616	816621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320677
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15704	NC_016641	TGTC	2	8	816726	816733	0 %	50 %	25 %	25 %	374320677
15705	NC_016641	GA	3	6	816820	816825	50 %	0 %	50 %	0 %	374320677
15706	NC_016641	TCA	2	6	816842	816847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320677
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15709	NC_016641	GT	3	6	817008	817013	0 %	50 %	50 %	0 %	374320677
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15717	NC_016641	GCA	2	6	817446	817451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320677
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15725	NC_016641	CTT	2	6	817926	817931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320677
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15728	NC_016641	CCA	2	6	818099	818104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320677
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15730	NC_016641	CAC	2	6	818199	818204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320677
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15733	NC_016641	TACC	2	8	818325	818332	25 %	25 %	0 %	50 %	374320677
15734	NC_016641	CGG	2	6	818369	818374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320677
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15739	NC_016641	TGC	2	6	818602	818607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320677
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15866	NC_016641	GTT	2	6	826210	826215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15867	NC_016641	TCG	2	6	826227	826232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15868	NC_016641	TCC	2	6	826251	826256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15869	NC_016641	GATTT	2	10	826300	826309	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15870	NC_016641	TCA	2	6	826320	826325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15871	NC_016641	TGAA	2	8	826334	826341	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15872	NC_016641	TTTCG	2	10	826411	826420	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15873	NC_016641	TG	3	6	826467	826472	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15874	NC_016641	ATC	2	6	826502	826507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15875	NC_016641	T	9	9	826514	826522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15876	NC_016641	TGG	2	6	826537	826542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15877	NC_016641	CCT	2	6	826567	826572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15878	NC_016641	AGGC	2	8	826580	826587	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15879	NC_016641	GAT	3	9	826643	826651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15880	NC_016641	TTCATT	2	12	826656	826667	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15881	NC_016641	CA	3	6	826668	826673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15882	NC_016641	TAA	2	6	826687	826692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15883	NC_016641	AGG	2	6	826766	826771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15884	NC_016641	ATC	2	6	826822	826827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15885	NC_016641	CGG	2	6	826839	826844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15886	NC_016641	GTG	2	6	826894	826899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15887	NC_016641	GT	3	6	826909	826914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15888	NC_016641	GTA	2	6	827072	827077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15889	NC_016641	GT	3	6	827079	827084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15890	NC_016641	ATG	2	6	827104	827109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15891	NC_016641	TCC	2	6	827130	827135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15892	NC_016641	CTG	2	6	827176	827181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15894	NC_016641	GAC	2	6	827244	827249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15897	NC_016641	TTC	2	6	827332	827337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15898	NC_016641	TCC	2	6	827596	827601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15899	NC_016641	CTC	2	6	827642	827647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15900	NC_016641	GCC	2	6	827721	827726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15901	NC_016641	GC	4	8	827728	827735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15902	NC_016641	AAT	2	6	827745	827750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15903	NC_016641	GCT	2	6	827785	827790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15905	NC_016641	TTC	2	6	827858	827863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15907	NC_016641	CTG	2	6	827953	827958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15908	NC_016641	TCG	2	6	828028	828033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15909	NC_016641	CCA	2	6	828052	828057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15911	NC_016641	TCC	2	6	828109	828114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15914	NC_016641	TAACC	2	10	828243	828252	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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15983	NC_016641	TCAT	2	8	831552	831559	25 %	50 %	0 %	25 %	374320684
15984	NC_016641	GGTC	2	8	831586	831593	0 %	25 %	50 %	25 %	374320684
15985	NC_016641	AGGA	2	8	831594	831601	50 %	0 %	50 %	0 %	374320684
15986	NC_016641	TCC	2	6	831615	831620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320684
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15989	NC_016641	T	6	6	831739	831744	0 %	100 %	0 %	0 %	374320684
15990	NC_016641	ATC	2	6	831848	831853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320684
15991	NC_016641	ACC	2	6	831855	831860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320684
15992	NC_016641	GCT	2	6	831900	831905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320684
15993	NC_016641	ATC	3	9	831974	831982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320684
15994	NC_016641	GCC	2	6	832049	832054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320684
15995	NC_016641	GGTAC	2	10	832118	832127	20 %	20 %	40 %	20 %	374320684
15996	NC_016641	ATG	2	6	832136	832141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320684
15997	NC_016641	TCA	2	6	832200	832205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320684
15998	NC_016641	CTT	2	6	832246	832251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320684
15999	NC_016641	CTT	2	6	832265	832270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320684
16000	NC_016641	GGC	2	6	832307	832312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320684

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