MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 117866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016641	GCA	3	9	666986	666994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320529
13002	NC_016641	CAG	2	6	667020	667025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320529
13003	NC_016641	CTT	2	6	667106	667111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_016641	GGC	2	6	667121	667126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_016641	CGCTT	2	10	667221	667230	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13006	NC_016641	GCT	2	6	667255	667260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_016641	TTC	2	6	667297	667302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_016641	GTA	2	6	667316	667321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_016641	CGG	2	6	667360	667365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_016641	T	6	6	667577	667582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_016641	T	6	6	667586	667591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_016641	CAGG	2	8	667681	667688	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13013	NC_016641	TTATCA	2	12	667743	667754	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13014	NC_016641	A	7	7	667808	667814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_016641	ATGT	2	8	667863	667870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_016641	CTT	2	6	667874	667879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_016641	GCG	2	6	668036	668041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_016641	GCA	2	6	668043	668048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_016641	GCGGA	2	10	668049	668058	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13020	NC_016641	GAA	2	6	668133	668138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_016641	CCCA	2	8	668189	668196	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13022	NC_016641	ACCA	2	8	668341	668348	50 %	0 %	0 %	50 %	374320530
13023	NC_016641	TGC	2	6	668390	668395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320530
13024	NC_016641	ACGA	2	8	668396	668403	50 %	0 %	25 %	25 %	374320530
13025	NC_016641	TCA	2	6	668558	668563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320530
13026	NC_016641	TAA	2	6	668607	668612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320530
13027	NC_016641	ATG	2	6	668651	668656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320530
13028	NC_016641	CTGT	2	8	668715	668722	0 %	50 %	25 %	25 %	374320530
13029	NC_016641	TCC	2	6	668768	668773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320530
13030	NC_016641	AT	3	6	668879	668884	50 %	50 %	0 %	0 %	374320530
13031	NC_016641	TTCA	2	8	668896	668903	25 %	50 %	0 %	25 %	374320530
13032	NC_016641	CGA	2	6	669020	669025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320530
13033	NC_016641	GTCC	2	8	669062	669069	0 %	25 %	25 %	50 %	374320530
13034	NC_016641	TGG	2	6	669071	669076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320530
13035	NC_016641	TCG	2	6	669102	669107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320530
13036	NC_016641	GTT	2	6	669202	669207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320530
13037	NC_016641	CGA	2	6	669222	669227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320530
13038	NC_016641	AT	3	6	669284	669289	50 %	50 %	0 %	0 %	374320530
13039	NC_016641	GAAATC	2	12	669327	669338	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	374320531
13040	NC_016641	T	6	6	669459	669464	0 %	100 %	0 %	0 %	374320531
13041	NC_016641	ATC	2	6	669543	669548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320531
13042	NC_016641	TGG	2	6	669562	669567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320531
13043	NC_016641	CTT	2	6	669590	669595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320531
13044	NC_016641	AAC	2	6	669664	669669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320531
13045	NC_016641	ATC	2	6	669691	669696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320531
13046	NC_016641	TGG	2	6	669706	669711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320531
13047	NC_016641	TGC	2	6	669832	669837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320531
13048	NC_016641	TCA	2	6	669893	669898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320531
13049	NC_016641	CAGC	2	8	669930	669937	25 %	0 %	25 %	50 %	374320531
13050	NC_016641	AAC	2	6	669951	669956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320531
13051	NC_016641	TCG	2	6	670004	670009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320531
13052	NC_016641	CGC	2	6	670019	670024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320531
13053	NC_016641	GTAGC	2	10	670049	670058	20 %	20 %	40 %	20 %	374320531
13054	NC_016641	ATC	2	6	670072	670077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320531
13055	NC_016641	TA	3	6	670092	670097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_016641	CTAT	2	8	670102	670109	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13057	NC_016641	AT	3	6	670208	670213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_016641	TA	3	6	670237	670242	50 %	50 %	0 %	0 %	374320532
13059	NC_016641	A	6	6	670291	670296	100 %	0 %	0 %	0 %	374320532
13060	NC_016641	GCC	2	6	670355	670360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320532
13061	NC_016641	CCT	2	6	670403	670408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320532
13062	NC_016641	GAA	2	6	670418	670423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320532
13063	NC_016641	GCT	2	6	670548	670553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320532
13064	NC_016641	GAAT	2	8	670585	670592	50 %	25 %	25 %	0 %	374320532
13065	NC_016641	GCC	2	6	670748	670753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320532
13066	NC_016641	CAG	2	6	670815	670820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320532
13067	NC_016641	GCAG	2	8	670941	670948	25 %	0 %	50 %	25 %	374320532
13068	NC_016641	A	6	6	671056	671061	100 %	0 %	0 %	0 %	374320532
13069	NC_016641	ACCG	2	8	671091	671098	25 %	0 %	25 %	50 %	374320532
13070	NC_016641	CTG	3	9	671118	671126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320532
13071	NC_016641	ATTCT	2	10	671138	671147	20 %	60 %	0 %	20 %	374320532
13072	NC_016641	AGC	2	6	671185	671190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320532
13073	NC_016641	TCA	2	6	671218	671223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320532
13074	NC_016641	CGC	2	6	671234	671239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320532
13075	NC_016641	TCG	2	6	671279	671284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320532
13076	NC_016641	CAA	2	6	671401	671406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_016641	AT	3	6	671463	671468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_016641	TAA	2	6	671539	671544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_016641	GTAAA	2	10	671551	671560	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_016641	TAA	2	6	671587	671592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_016641	AACT	2	8	671695	671702	50 %	25 %	0 %	25 %	374320533
13082	NC_016641	GAA	2	6	671790	671795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320533
13083	NC_016641	AGC	2	6	671938	671943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320533
13084	NC_016641	T	6	6	672059	672064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_016641	TA	3	6	672092	672097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_016641	CGC	2	6	672099	672104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13087	NC_016641	T	6	6	672137	672142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_016641	CAT	2	6	672154	672159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_016641	ATT	2	6	672202	672207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_016641	TCC	2	6	672255	672260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13091	NC_016641	TCT	2	6	672430	672435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_016641	TCT	2	6	672444	672449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_016641	AT	3	6	672465	672470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_016641	CAT	2	6	672490	672495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_016641	TTC	2	6	672559	672564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_016641	CGA	2	6	672571	672576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_016641	AAT	2	6	672588	672593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_016641	AGG	2	6	672613	672618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_016641	TAT	2	6	672647	672652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320534
13100	NC_016641	AGG	2	6	672694	672699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374320534
13101	NC_016641	AGCA	2	8	672706	672713	50 %	0 %	25 %	25 %	374320534
13102	NC_016641	CGG	2	6	672839	672844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320534
13103	NC_016641	ATC	2	6	672859	672864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320534
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13105	NC_016641	CTG	2	6	672891	672896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320534
13106	NC_016641	AAAC	2	8	672897	672904	75 %	0 %	0 %	25 %	374320534
13107	NC_016641	TGT	2	6	672922	672927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320534
13108	NC_016641	GCT	2	6	672968	672973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320534
13109	NC_016641	ATT	2	6	673077	673082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320534
13110	NC_016641	CTG	2	6	673084	673089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320534
13111	NC_016641	GAGCC	2	10	673150	673159	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13112	NC_016641	AACAG	2	10	673162	673171	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13113	NC_016641	T	6	6	673198	673203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_016641	CTTT	2	8	673219	673226	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13115	NC_016641	CAT	2	6	673278	673283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320535
13116	NC_016641	TCTT	2	8	673301	673308	0 %	75 %	0 %	25 %	374320535
13117	NC_016641	CCA	2	6	673376	673381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320535
13118	NC_016641	CAAG	2	8	673402	673409	50 %	0 %	25 %	25 %	374320535
13119	NC_016641	ATC	2	6	673442	673447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320535
13120	NC_016641	TAT	2	6	673496	673501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_016641	CTT	2	6	673566	673571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13122	NC_016641	AATTG	2	10	673607	673616	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_016641	AGG	2	6	673665	673670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_016641	CTTT	2	8	673745	673752	0 %	75 %	0 %	25 %	374320536
13125	NC_016641	G	6	6	673757	673762	0 %	0 %	100 %	0 %	374320536
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13242	NC_016641	CAT	2	6	680026	680031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320542
13243	NC_016641	AG	3	6	680113	680118	50 %	0 %	50 %	0 %	374320542
13244	NC_016641	ATC	2	6	680134	680139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320542
13245	NC_016641	G	6	6	680237	680242	0 %	0 %	100 %	0 %	374320542
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13247	NC_016641	GGA	2	6	680286	680291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374320542
13248	NC_016641	A	9	9	680316	680324	100 %	0 %	0 %	0 %	374320542
13249	NC_016641	TCA	2	6	680351	680356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13250	NC_016641	TGC	2	6	680374	680379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13251	NC_016641	CTT	2	6	680386	680391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13252	NC_016641	TTG	2	6	680399	680404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320543
13253	NC_016641	TCA	2	6	680463	680468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320543
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13256	NC_016641	CTG	2	6	680531	680536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320543
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13258	NC_016641	TCAT	2	8	680610	680617	25 %	50 %	0 %	25 %	374320543
13259	NC_016641	TCCAA	2	10	680650	680659	40 %	20 %	0 %	40 %	374320543
13260	NC_016641	TGTT	2	8	680699	680706	0 %	75 %	25 %	0 %	374320543
13261	NC_016641	GCT	2	6	680736	680741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320543
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13267	NC_016641	TG	3	6	680991	680996	0 %	50 %	50 %	0 %	374320543
13268	NC_016641	GTT	2	6	681128	681133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320543
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13302	NC_016641	CCA	2	6	683203	683208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13303	NC_016641	GCAA	2	8	683274	683281	50 %	0 %	25 %	25 %	374320544
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13352	NC_016641	GCT	2	6	685892	685897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320544
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13361	NC_016641	CATG	2	8	686493	686500	25 %	25 %	25 %	25 %	374320545
13362	NC_016641	CT	3	6	686549	686554	0 %	50 %	0 %	50 %	374320545
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13365	NC_016641	CGT	2	6	686722	686727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320545
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13367	NC_016641	AGT	2	6	686784	686789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320545
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13439	NC_016641	GTGC	2	8	691422	691429	0 %	25 %	50 %	25 %	374320547
13440	NC_016641	TCC	2	6	691430	691435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320547
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13473	NC_016641	TCCG	2	8	694338	694345	0 %	25 %	25 %	50 %	374320549
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13486	NC_016641	AGC	2	6	695072	695077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13487	NC_016641	CCCG	2	8	695116	695123	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13488	NC_016641	TCTT	2	8	695125	695132	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13489	NC_016641	TAT	2	6	695151	695156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320550
13490	NC_016641	TCA	2	6	695281	695286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320550
13491	NC_016641	CTG	2	6	695346	695351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320550
13492	NC_016641	T	6	6	695379	695384	0 %	100 %	0 %	0 %	374320550
13493	NC_016641	CTT	2	6	695399	695404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320550
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13500	NC_016641	GTA	2	6	695852	695857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320550

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