MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 117866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_016641	TAAT	2	8	616516	616523	50 %	50 %	0 %	0 %	374320482
12003	NC_016641	GGA	2	6	616524	616529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374320482
12004	NC_016641	TTC	2	6	616550	616555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320482
12005	NC_016641	CTG	2	6	616595	616600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320482
12006	NC_016641	CCG	2	6	616673	616678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320482
12007	NC_016641	CGT	2	6	616703	616708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320482
12008	NC_016641	CAT	2	6	616796	616801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320482
12009	NC_016641	TTG	2	6	616836	616841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320482
12010	NC_016641	GCG	2	6	616907	616912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320482
12011	NC_016641	CATC	2	8	616930	616937	25 %	25 %	0 %	50 %	374320482
12012	NC_016641	CGACA	2	10	616949	616958	40 %	0 %	20 %	40 %	374320482
12013	NC_016641	ATC	2	6	617031	617036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320482
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12015	NC_016641	AAT	2	6	617141	617146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320482
12016	NC_016641	GCA	2	6	617173	617178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320482
12017	NC_016641	AAT	2	6	617189	617194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320482
12018	NC_016641	AT	3	6	617225	617230	50 %	50 %	0 %	0 %	374320482
12019	NC_016641	CCA	2	6	617272	617277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320482
12020	NC_016641	ATC	2	6	617397	617402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320482
12021	NC_016641	GTATT	2	10	617415	617424	20 %	60 %	20 %	0 %	374320482
12022	NC_016641	CTG	2	6	617537	617542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320482
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12024	NC_016641	TC	3	6	617623	617628	0 %	50 %	0 %	50 %	374320482
12025	NC_016641	CTG	2	6	617633	617638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320482
12026	NC_016641	TGA	2	6	617664	617669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320482
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12028	NC_016641	GTT	2	6	617807	617812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320482
12029	NC_016641	GCC	2	6	617870	617875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320482
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12031	NC_016641	CGCATA	2	12	617931	617942	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374320482
12032	NC_016641	TCA	2	6	617947	617952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320482
12033	NC_016641	C	6	6	617980	617985	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12034	NC_016641	TTAC	2	8	618014	618021	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12035	NC_016641	ATCTAT	2	12	618067	618078	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12036	NC_016641	T	7	7	618080	618086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12037	NC_016641	CAC	2	6	618114	618119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12038	NC_016641	ATG	2	6	618216	618221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320483
12039	NC_016641	CAG	2	6	618278	618283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320483
12040	NC_016641	TCCG	2	8	618293	618300	0 %	25 %	25 %	50 %	374320483
12041	NC_016641	T	6	6	618322	618327	0 %	100 %	0 %	0 %	374320483
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12043	NC_016641	AAAT	2	8	618390	618397	75 %	25 %	0 %	0 %	374320483
12044	NC_016641	ATA	2	6	618467	618472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320483
12045	NC_016641	CA	3	6	618478	618483	50 %	0 %	0 %	50 %	374320483
12046	NC_016641	ACCT	2	8	618497	618504	25 %	25 %	0 %	50 %	374320483
12047	NC_016641	CAT	2	6	618584	618589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320483
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12049	NC_016641	ATGAA	2	10	618770	618779	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12050	NC_016641	GGA	2	6	618802	618807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12051	NC_016641	TCT	2	6	618818	618823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12052	NC_016641	A	6	6	618860	618865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12053	NC_016641	CTAA	2	8	618911	618918	50 %	25 %	0 %	25 %	374320484
12054	NC_016641	TTTC	2	8	618925	618932	0 %	75 %	0 %	25 %	374320484
12055	NC_016641	CAGC	2	8	618955	618962	25 %	0 %	25 %	50 %	374320484
12056	NC_016641	TTC	2	6	619079	619084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320484
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12058	NC_016641	TCT	2	6	619233	619238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320484
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12062	NC_016641	ACT	2	6	619420	619425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320485
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12065	NC_016641	T	6	6	619534	619539	0 %	100 %	0 %	0 %	374320485
12066	NC_016641	ATCA	2	8	619602	619609	50 %	25 %	0 %	25 %	374320485
12067	NC_016641	CTTTA	2	10	619644	619653	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12068	NC_016641	TG	3	6	619660	619665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12075	NC_016641	AAT	2	6	619870	619875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12083	NC_016641	AAAT	2	8	620083	620090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12123	NC_016641	CATA	2	8	622228	622235	50 %	25 %	0 %	25 %	374320487
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12242	NC_016641	TCG	2	6	628025	628030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320492
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12245	NC_016641	ATT	2	6	628129	628134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320492
12246	NC_016641	TGTT	2	8	628148	628155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12247	NC_016641	A	6	6	628205	628210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12255	NC_016641	AT	3	6	628870	628875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12363	NC_016641	GCT	2	6	634214	634219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320499
12364	NC_016641	ATA	2	6	634222	634227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320499
12365	NC_016641	ATACTC	2	12	634237	634248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320499
12366	NC_016641	GAT	3	9	634257	634265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320499
12367	NC_016641	CAT	2	6	634346	634351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320499
12368	NC_016641	AG	3	6	634429	634434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12369	NC_016641	CAA	2	6	634444	634449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12370	NC_016641	TCC	2	6	634472	634477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12371	NC_016641	AAT	2	6	634482	634487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12372	NC_016641	A	7	7	634501	634507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12373	NC_016641	T	7	7	634549	634555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12374	NC_016641	A	6	6	634575	634580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12375	NC_016641	A	7	7	634729	634735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12376	NC_016641	AGG	2	6	634737	634742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12377	NC_016641	ATG	2	6	634746	634751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320500
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12383	NC_016641	GTC	2	6	635007	635012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320500
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12389	NC_016641	GGA	2	6	635354	635359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374320500
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12395	NC_016641	CTG	2	6	635606	635611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320501
12396	NC_016641	TTTC	2	8	635632	635639	0 %	75 %	0 %	25 %	374320501
12397	NC_016641	TCC	2	6	635653	635658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320501
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12399	NC_016641	GGA	2	6	635781	635786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374320501
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12401	NC_016641	CA	3	6	635814	635819	50 %	0 %	0 %	50 %	374320501
12402	NC_016641	ATT	2	6	635850	635855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320501
12403	NC_016641	ATC	2	6	635881	635886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320501
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12405	NC_016641	TGCT	2	8	636003	636010	0 %	50 %	25 %	25 %	374320501
12406	NC_016641	CGG	2	6	636078	636083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320501
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12413	NC_016641	GGA	2	6	636439	636444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12414	NC_016641	TAC	2	6	636486	636491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320502
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12424	NC_016641	CAG	2	6	637017	637022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320502
12425	NC_016641	TGA	2	6	637039	637044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320502
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12429	NC_016641	TTG	2	6	637212	637217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320503
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12443	NC_016641	ACTT	2	8	637951	637958	25 %	50 %	0 %	25 %	374320503
12444	NC_016641	TA	4	8	637996	638003	50 %	50 %	0 %	0 %	374320503
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12449	NC_016641	GGTATC	2	12	638215	638226	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374320503
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12452	NC_016641	GCTC	2	8	638414	638421	0 %	25 %	25 %	50 %	374320503
12453	NC_016641	TCA	2	6	638460	638465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320503
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12467	NC_016641	AATG	2	8	639235	639242	50 %	25 %	25 %	0 %	374320503
12468	NC_016641	CAT	2	6	639265	639270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320503
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12470	NC_016641	TGC	2	6	639375	639380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320503
12471	NC_016641	TAT	2	6	639437	639442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320503
12472	NC_016641	TTA	2	6	639470	639475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320503
12473	NC_016641	AGT	2	6	639512	639517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320503
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12476	NC_016641	T	7	7	639763	639769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12477	NC_016641	ATA	2	6	639823	639828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320504
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12482	NC_016641	TCC	2	6	640163	640168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320504
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12484	NC_016641	CTT	3	9	640224	640232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320504
12485	NC_016641	TCT	3	9	640262	640270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320504
12486	NC_016641	TAA	2	6	640326	640331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12487	NC_016641	ATTC	2	8	640333	640340	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12488	NC_016641	ATT	2	6	640383	640388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12489	NC_016641	ACAA	2	8	640439	640446	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12490	NC_016641	ATA	2	6	640474	640479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12491	NC_016641	AAAG	2	8	640486	640493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12492	NC_016641	A	6	6	640518	640523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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