MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 117866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_016641	CAT	2	6	537122	537127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10502	NC_016641	GAA	2	6	537318	537323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320414
10503	NC_016641	TTG	2	6	537326	537331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320414
10504	NC_016641	GT	3	6	537352	537357	0 %	50 %	50 %	0 %	374320414
10505	NC_016641	GGA	2	6	537367	537372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374320414
10506	NC_016641	AGA	2	6	537420	537425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320414
10507	NC_016641	AGGT	2	8	537617	537624	25 %	25 %	50 %	0 %	374320414
10508	NC_016641	TAA	2	6	537636	537641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320414
10509	NC_016641	CAG	2	6	537705	537710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320414
10510	NC_016641	AGC	2	6	537745	537750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320414
10511	NC_016641	GCT	2	6	537756	537761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320414
10512	NC_016641	CAA	2	6	537765	537770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320414
10513	NC_016641	CCGC	2	8	537930	537937	0 %	0 %	25 %	75 %	374320414
10514	NC_016641	AACG	2	8	537939	537946	50 %	0 %	25 %	25 %	374320414
10515	NC_016641	CAG	3	9	538071	538079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320414
10516	NC_016641	GCT	2	6	538117	538122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320414
10517	NC_016641	TGTT	2	8	538170	538177	0 %	75 %	25 %	0 %	374320414
10518	NC_016641	GCC	2	6	538262	538267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320414
10519	NC_016641	ACCTG	2	10	538316	538325	20 %	20 %	20 %	40 %	374320414
10520	NC_016641	CAA	2	6	538345	538350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320414
10521	NC_016641	TCT	2	6	538384	538389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320414
10522	NC_016641	CCT	2	6	538400	538405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10523	NC_016641	CGA	2	6	538442	538447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10524	NC_016641	AG	3	6	538489	538494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_016641	CA	3	6	538524	538529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10526	NC_016641	T	6	6	538554	538559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_016641	ATT	2	6	538567	538572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_016641	AAAT	2	8	538573	538580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_016641	ACA	2	6	538708	538713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320415
10530	NC_016641	CCA	2	6	538715	538720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320415
10531	NC_016641	TGC	2	6	538790	538795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320415
10532	NC_016641	TCA	2	6	538816	538821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320415
10533	NC_016641	TG	3	6	538838	538843	0 %	50 %	50 %	0 %	374320415
10534	NC_016641	ATA	2	6	538879	538884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320415
10535	NC_016641	ATA	2	6	538942	538947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320415
10536	NC_016641	GCC	2	6	538999	539004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320415
10537	NC_016641	TTG	2	6	539014	539019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320415
10538	NC_016641	TGT	3	9	539039	539047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320415
10539	NC_016641	AT	3	6	539050	539055	50 %	50 %	0 %	0 %	374320415
10540	NC_016641	CGA	2	6	539168	539173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320415
10541	NC_016641	ATA	2	6	539179	539184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320415
10542	NC_016641	CGG	2	6	539247	539252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320415
10543	NC_016641	AT	3	6	539348	539353	50 %	50 %	0 %	0 %	374320415
10544	NC_016641	TCA	2	6	539434	539439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320415
10545	NC_016641	CAC	2	6	539448	539453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320415
10546	NC_016641	AAT	2	6	539504	539509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_016641	TGC	2	6	539554	539559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10548	NC_016641	AAAAAT	2	12	539568	539579	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_016641	AGC	2	6	539580	539585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_016641	TG	3	6	539689	539694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_016641	TCCGC	2	10	539714	539723	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10552	NC_016641	AAC	2	6	539735	539740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_016641	TA	3	6	539774	539779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_016641	T	6	6	539785	539790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_016641	A	6	6	539800	539805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_016641	GGC	2	6	539935	539940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_016641	AGG	2	6	539944	539949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_016641	A	8	8	540023	540030	100 %	0 %	0 %	0 %	374320416
10559	NC_016641	CAG	2	6	540031	540036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320416
10560	NC_016641	CAG	2	6	540049	540054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320416
10561	NC_016641	GGC	2	6	540055	540060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320416
10562	NC_016641	GAA	2	6	540102	540107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320416
10563	NC_016641	AAC	2	6	540112	540117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320416
10564	NC_016641	CGT	2	6	540124	540129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320416
10565	NC_016641	CAT	2	6	540259	540264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10566	NC_016641	CTC	2	6	540281	540286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10567	NC_016641	ATAC	2	8	540340	540347	50 %	25 %	0 %	25 %	374320417
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10569	NC_016641	TGAA	2	8	540455	540462	50 %	25 %	25 %	0 %	374320417
10570	NC_016641	TTGG	2	8	540551	540558	0 %	50 %	50 %	0 %	374320417
10571	NC_016641	CAG	3	9	540565	540573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320417
10572	NC_016641	CAT	2	6	540592	540597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320417
10573	NC_016641	GCTT	2	8	540640	540647	0 %	50 %	25 %	25 %	374320417
10574	NC_016641	CTT	2	6	540657	540662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320417
10575	NC_016641	AGT	2	6	540802	540807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320417
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10579	NC_016641	T	6	6	541090	541095	0 %	100 %	0 %	0 %	374320417
10580	NC_016641	GCAAGC	2	12	541205	541216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320417
10581	NC_016641	ACG	2	6	541328	541333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320417
10582	NC_016641	TGGT	2	8	541397	541404	0 %	50 %	50 %	0 %	374320417
10583	NC_016641	AGC	2	6	541415	541420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320417
10584	NC_016641	GTT	2	6	541423	541428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320417
10585	NC_016641	GAC	2	6	541431	541436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320417
10586	NC_016641	GCTCA	2	10	541480	541489	20 %	20 %	20 %	40 %	374320417
10587	NC_016641	CG	3	6	541512	541517	0 %	0 %	50 %	50 %	374320417
10588	NC_016641	CATCC	2	10	541560	541569	20 %	20 %	0 %	60 %	374320417
10589	NC_016641	ATA	2	6	541691	541696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320417
10590	NC_016641	CGC	2	6	541932	541937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320417
10591	NC_016641	AC	3	6	542015	542020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10592	NC_016641	CGGAT	2	10	542023	542032	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10593	NC_016641	GT	3	6	542040	542045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_016641	AAC	2	6	542052	542057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10595	NC_016641	ATAAA	2	10	542085	542094	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_016641	A	6	6	542092	542097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_016641	CAG	2	6	542195	542200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10599	NC_016641	GAC	2	6	542334	542339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320418
10600	NC_016641	CTG	2	6	542342	542347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320418
10601	NC_016641	CGTT	2	8	542354	542361	0 %	50 %	25 %	25 %	374320418
10602	NC_016641	ATA	2	6	542362	542367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320418
10603	NC_016641	TCCT	2	8	542370	542377	0 %	50 %	0 %	50 %	374320418
10604	NC_016641	TGAT	2	8	542413	542420	25 %	50 %	25 %	0 %	374320418
10605	NC_016641	GTA	2	6	542496	542501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320418
10606	NC_016641	GGT	2	6	542514	542519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320418
10607	NC_016641	AAAAT	2	10	542531	542540	80 %	20 %	0 %	0 %	374320418
10608	NC_016641	TCC	2	6	542626	542631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320418
10609	NC_016641	TCC	2	6	542671	542676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320418
10610	NC_016641	CTG	2	6	542763	542768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320418
10611	NC_016641	ACC	2	6	542773	542778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320418
10612	NC_016641	AGC	2	6	542881	542886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320418
10613	NC_016641	ATG	2	6	542914	542919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320418
10614	NC_016641	ATA	2	6	543068	543073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320419
10615	NC_016641	AGCA	2	8	543097	543104	50 %	0 %	25 %	25 %	374320419
10616	NC_016641	CAA	2	6	543136	543141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320419
10617	NC_016641	CCG	2	6	543143	543148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320419
10618	NC_016641	AACC	2	8	543186	543193	50 %	0 %	0 %	50 %	374320419
10619	NC_016641	TGC	2	6	543262	543267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320419
10620	NC_016641	AGC	2	6	543269	543274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320419
10621	NC_016641	A	6	6	543353	543358	100 %	0 %	0 %	0 %	374320419
10622	NC_016641	T	6	6	543436	543441	0 %	100 %	0 %	0 %	374320419
10623	NC_016641	AGGTTG	2	12	543450	543461	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	374320419
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10738	NC_016641	AT	3	6	550926	550931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10739	NC_016641	TA	3	6	550969	550974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10740	NC_016641	AT	3	6	550983	550988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10741	NC_016641	T	6	6	550993	550998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10742	NC_016641	CTC	2	6	551039	551044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10743	NC_016641	A	7	7	551056	551062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10988	NC_016641	CAG	2	6	563000	563005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320438
10989	NC_016641	GCA	2	6	563038	563043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320438
10990	NC_016641	CGC	2	6	563111	563116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320438
10991	NC_016641	CCA	2	6	563129	563134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320438
10992	NC_016641	CTG	2	6	563156	563161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320438
10993	NC_016641	ACC	2	6	563198	563203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320438
10994	NC_016641	CAG	2	6	563204	563209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320438
10995	NC_016641	CTCCGA	2	12	563318	563329	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374320438
10996	NC_016641	AAT	2	6	563413	563418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320438
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10998	NC_016641	CAG	2	6	563492	563497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320438
10999	NC_016641	T	6	6	563500	563505	0 %	100 %	0 %	0 %	374320438
11000	NC_016641	CGCA	2	8	563591	563598	25 %	0 %	25 %	50 %	374320438

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