MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 117866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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100002	NC_016641	T	8	8	5163419	5163426	0 %	100 %	0 %	0 %	374324557
100003	NC_016641	CCT	2	6	5163427	5163432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374324557
100004	NC_016641	TTC	2	6	5163486	5163491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374324558
100005	NC_016641	ACTG	2	8	5163521	5163528	25 %	25 %	25 %	25 %	374324558
100006	NC_016641	GCT	2	6	5163610	5163615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374324558
100007	NC_016641	CGGA	2	8	5163709	5163716	25 %	0 %	50 %	25 %	374324558
100008	NC_016641	AAT	2	6	5163734	5163739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374324558
100009	NC_016641	TCG	2	6	5163793	5163798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374324558
100010	NC_016641	CAGCGA	2	12	5163820	5163831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374324558
100011	NC_016641	GGC	2	6	5163860	5163865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374324558
100012	NC_016641	TC	3	6	5163900	5163905	0 %	50 %	0 %	50 %	374324558
100013	NC_016641	ACC	2	6	5163911	5163916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374324559
100014	NC_016641	CAG	2	6	5163985	5163990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374324559
100015	NC_016641	CGG	2	6	5164000	5164005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374324559
100016	NC_016641	TTC	2	6	5164103	5164108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374324559
100017	NC_016641	C	6	6	5164221	5164226	0 %	0 %	0 %	100 %	374324559
100018	NC_016641	ACTC	2	8	5164262	5164269	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100019	NC_016641	TCC	2	6	5164270	5164275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100020	NC_016641	AGA	2	6	5164334	5164339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100021	NC_016641	CCA	2	6	5164396	5164401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374324560
100022	NC_016641	CTC	2	6	5164557	5164562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374324560
100023	NC_016641	GTA	2	6	5164614	5164619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374324560
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100025	NC_016641	TCA	2	6	5164974	5164979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374324560
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100032	NC_016641	CAT	2	6	5165280	5165285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374324560
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100036	NC_016641	CATC	2	8	5165388	5165395	25 %	25 %	0 %	50 %	374324560
100037	NC_016641	GA	3	6	5165405	5165410	50 %	0 %	50 %	0 %	374324560
100038	NC_016641	GCTT	2	8	5165448	5165455	0 %	50 %	25 %	25 %	374324560
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100040	NC_016641	CCG	2	6	5165480	5165485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374324560
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100043	NC_016641	CTC	2	6	5165558	5165563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100044	NC_016641	CTC	2	6	5165601	5165606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100045	NC_016641	TGC	2	6	5165620	5165625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100046	NC_016641	GTC	2	6	5165634	5165639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100047	NC_016641	TCC	2	6	5165790	5165795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374324561
100048	NC_016641	ATC	2	6	5165916	5165921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374324561
100049	NC_016641	TCA	2	6	5165956	5165961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374324561
100050	NC_016641	TCA	2	6	5166091	5166096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374324561
100051	NC_016641	CTGC	2	8	5166130	5166137	0 %	25 %	25 %	50 %	374324561
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100053	NC_016641	AGC	2	6	5166223	5166228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374324561
100054	NC_016641	GTT	2	6	5166246	5166251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374324561
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100065	NC_016641	GCTG	2	8	5166653	5166660	0 %	25 %	50 %	25 %	374324561
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100071	NC_016641	ATA	2	6	5166918	5166923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374324561
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100075	NC_016641	TAC	2	6	5167373	5167378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374324561
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100078	NC_016641	GTG	2	6	5167612	5167617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100079	NC_016641	TG	3	6	5167620	5167625	0 %	50 %	50 %	0 %	374324562
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100084	NC_016641	ACG	2	6	5167923	5167928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374324562
100085	NC_016641	CTA	2	6	5167983	5167988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374324562
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100087	NC_016641	AC	3	6	5168071	5168076	50 %	0 %	0 %	50 %	374324562
100088	NC_016641	CT	4	8	5168085	5168092	0 %	50 %	0 %	50 %	374324562
100089	NC_016641	TGTTT	2	10	5168097	5168106	0 %	80 %	20 %	0 %	374324562
100090	NC_016641	ATTT	2	8	5168115	5168122	25 %	75 %	0 %	0 %	374324562
100091	NC_016641	T	6	6	5168120	5168125	0 %	100 %	0 %	0 %	374324562
100092	NC_016641	TCA	2	6	5168182	5168187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374324562
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100096	NC_016641	CCTG	2	8	5168305	5168312	0 %	25 %	25 %	50 %	374324562
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100098	NC_016641	ACA	2	6	5168379	5168384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374324562
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100100	NC_016641	ACT	2	6	5168440	5168445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374324562
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100102	NC_016641	TTTA	2	8	5168606	5168613	25 %	75 %	0 %	0 %	374324562
100103	NC_016641	ACAG	2	8	5168694	5168701	50 %	0 %	25 %	25 %	374324562
100104	NC_016641	GTT	2	6	5168742	5168747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374324562
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100106	NC_016641	A	6	6	5168859	5168864	100 %	0 %	0 %	0 %	374324562
100107	NC_016641	AAT	2	6	5168937	5168942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374324563
100108	NC_016641	CTG	2	6	5168981	5168986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374324563
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100110	NC_016641	TGCC	2	8	5169026	5169033	0 %	25 %	25 %	50 %	374324563
100111	NC_016641	GCA	2	6	5169140	5169145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374324563
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100115	NC_016641	AGC	2	6	5169225	5169230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374324563
100116	NC_016641	GAT	2	6	5169347	5169352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374324563
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100228	NC_016641	TC	5	10	5174624	5174633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100229	NC_016641	TGG	2	6	5174683	5174688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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100342	NC_016641	TTA	2	6	5180754	5180759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100464	NC_016641	GTC	2	6	5186612	5186617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374324586
100465	NC_016641	CGATG	2	10	5186734	5186743	20 %	20 %	40 %	20 %	374324586
100466	NC_016641	TAA	2	6	5186781	5186786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374324586
100467	NC_016641	ATG	2	6	5186843	5186848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374324586
100468	NC_016641	CTT	2	6	5186883	5186888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374324586
100469	NC_016641	TGA	2	6	5186899	5186904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374324586
100470	NC_016641	ACC	2	6	5186905	5186910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374324586
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100473	NC_016641	CTG	2	6	5187015	5187020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374324586
100474	NC_016641	T	6	6	5187058	5187063	0 %	100 %	0 %	0 %	374324586
100475	NC_016641	AATT	2	8	5187103	5187110	50 %	50 %	0 %	0 %	374324586
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100477	NC_016641	ACA	2	6	5187200	5187205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374324586
100478	NC_016641	AT	3	6	5187234	5187239	50 %	50 %	0 %	0 %	374324586
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100480	NC_016641	TGA	2	6	5187345	5187350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374324586
100481	NC_016641	GAAA	2	8	5187368	5187375	75 %	0 %	25 %	0 %	374324586
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100483	NC_016641	CTC	2	6	5187419	5187424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100484	NC_016641	TGA	2	6	5187528	5187533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100485	NC_016641	T	7	7	5187558	5187564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100486	NC_016641	TTAT	2	8	5187601	5187608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100487	NC_016641	TTG	2	6	5187613	5187618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100488	NC_016641	AATA	2	8	5187627	5187634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100489	NC_016641	AGA	2	6	5187721	5187726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100490	NC_016641	GA	3	6	5187867	5187872	50 %	0 %	50 %	0 %	374324587
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100492	NC_016641	CTCC	2	8	5188113	5188120	0 %	25 %	0 %	75 %	374324588
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100494	NC_016641	ACG	2	6	5188265	5188270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374324588
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100497	NC_016641	TATC	2	8	5188295	5188302	25 %	50 %	0 %	25 %	374324588
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