MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 117866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016641	CAT	2	6	28437	28442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319905
502	NC_016641	CTG	2	6	28543	28548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319905
503	NC_016641	GAC	2	6	28559	28564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319905
504	NC_016641	CAG	2	6	28593	28598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319905
505	NC_016641	TCA	2	6	28649	28654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319905
506	NC_016641	GCA	2	6	28663	28668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319905
507	NC_016641	AAC	2	6	28690	28695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319905
508	NC_016641	AAC	2	6	28869	28874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319905
509	NC_016641	CATC	2	8	29003	29010	25 %	25 %	0 %	50 %	374319905
510	NC_016641	ATA	2	6	29064	29069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319905
511	NC_016641	ATC	2	6	29178	29183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319905
512	NC_016641	ATCC	2	8	29190	29197	25 %	25 %	0 %	50 %	374319905
513	NC_016641	AT	3	6	29230	29235	50 %	50 %	0 %	0 %	374319905
514	NC_016641	CAT	2	6	29255	29260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319905
515	NC_016641	TCA	2	6	29443	29448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319905
516	NC_016641	TAGT	2	8	29520	29527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016641	TTC	2	6	29544	29549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319906
518	NC_016641	GC	3	6	29569	29574	0 %	0 %	50 %	50 %	374319906
519	NC_016641	AAT	2	6	29582	29587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319906
520	NC_016641	GCTT	2	8	29590	29597	0 %	50 %	25 %	25 %	374319906
521	NC_016641	TTGG	2	8	29646	29653	0 %	50 %	50 %	0 %	374319906
522	NC_016641	AGC	2	6	29737	29742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319906
523	NC_016641	AG	3	6	29805	29810	50 %	0 %	50 %	0 %	374319906
524	NC_016641	ATCA	2	8	29979	29986	50 %	25 %	0 %	25 %	374319906
525	NC_016641	TGC	2	6	30082	30087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319906
526	NC_016641	TTC	2	6	30093	30098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319906
527	NC_016641	GGC	2	6	30266	30271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374319906
528	NC_016641	CCG	2	6	30386	30391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374319906
529	NC_016641	TCA	2	6	30410	30415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319906
530	NC_016641	TGC	2	6	30506	30511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319906
531	NC_016641	AAAT	2	8	30703	30710	75 %	25 %	0 %	0 %	374319906
532	NC_016641	GTA	2	6	30744	30749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319906
533	NC_016641	TCC	2	6	30883	30888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319906
534	NC_016641	AAT	2	6	30897	30902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319906
535	NC_016641	TTC	2	6	30912	30917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319906
536	NC_016641	CAC	2	6	30946	30951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319906
537	NC_016641	CGCT	2	8	31135	31142	0 %	25 %	25 %	50 %	374319906
538	NC_016641	CGA	2	6	31205	31210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319906
539	NC_016641	CGC	2	6	31364	31369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374319906
540	NC_016641	GTC	2	6	31392	31397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319906
541	NC_016641	CCCG	2	8	31415	31422	0 %	0 %	25 %	75 %	374319906
542	NC_016641	TCC	2	6	31471	31476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319906
543	NC_016641	GTG	2	6	31522	31527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374319906
544	NC_016641	GCA	2	6	31633	31638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319906
545	NC_016641	ATG	2	6	31651	31656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319906
546	NC_016641	CTT	2	6	31680	31685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319906
547	NC_016641	T	6	6	31775	31780	0 %	100 %	0 %	0 %	374319906
548	NC_016641	TGT	2	6	31796	31801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374319906
549	NC_016641	ATA	2	6	31978	31983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319906
550	NC_016641	GCA	2	6	32021	32026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319906
551	NC_016641	TCCA	2	8	32107	32114	25 %	25 %	0 %	50 %	374319906
552	NC_016641	T	6	6	32127	32132	0 %	100 %	0 %	0 %	374319906
553	NC_016641	TTG	2	6	32179	32184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016641	A	6	6	32234	32239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016641	TC	3	6	32270	32275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_016641	ACC	2	6	32281	32286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_016641	GTAT	2	8	32304	32311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016641	CT	3	6	32489	32494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_016641	TGC	2	6	32503	32508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_016641	CAT	2	6	32547	32552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_016641	CTT	2	6	32629	32634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319907
562	NC_016641	ATG	2	6	32639	32644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319907
563	NC_016641	A	7	7	32778	32784	100 %	0 %	0 %	0 %	374319907
564	NC_016641	TGC	2	6	32856	32861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319907
565	NC_016641	CTTC	2	8	32872	32879	0 %	50 %	0 %	50 %	374319907
566	NC_016641	ATG	2	6	32902	32907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319907
567	NC_016641	ACC	2	6	32913	32918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319907
568	NC_016641	GATT	2	8	33076	33083	25 %	50 %	25 %	0 %	374319907
569	NC_016641	CAGC	2	8	33109	33116	25 %	0 %	25 %	50 %	374319907
570	NC_016641	GGA	2	6	33146	33151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374319907
571	NC_016641	CATGCT	2	12	33214	33225	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374319907
572	NC_016641	CAG	2	6	33292	33297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319907
573	NC_016641	GAT	2	6	33318	33323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319907
574	NC_016641	CTG	2	6	33374	33379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319907
575	NC_016641	TG	3	6	33413	33418	0 %	50 %	50 %	0 %	374319907
576	NC_016641	TTC	2	6	33449	33454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319907
577	NC_016641	GCT	2	6	33460	33465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319907
578	NC_016641	GTGC	2	8	33502	33509	0 %	25 %	50 %	25 %	374319907
579	NC_016641	ACC	2	6	33510	33515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319907
580	NC_016641	TCC	2	6	33546	33551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319907
581	NC_016641	GA	3	6	33579	33584	50 %	0 %	50 %	0 %	374319907
582	NC_016641	CAG	2	6	33614	33619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319907
583	NC_016641	TCTCAA	2	12	33634	33645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319907
584	NC_016641	ATG	2	6	33707	33712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319907
585	NC_016641	TCGT	2	8	33717	33724	0 %	50 %	25 %	25 %	374319907
586	NC_016641	CAG	2	6	33755	33760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319907
587	NC_016641	TCC	2	6	33828	33833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319907
588	NC_016641	TCC	2	6	33855	33860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319907
589	NC_016641	AATG	2	8	33865	33872	50 %	25 %	25 %	0 %	374319907
590	NC_016641	TGT	2	6	33915	33920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374319907
591	NC_016641	TCC	2	6	33937	33942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_016641	ATC	2	6	34081	34086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319908
593	NC_016641	GCCT	2	8	34160	34167	0 %	25 %	25 %	50 %	374319908
594	NC_016641	CAG	2	6	34176	34181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319908
595	NC_016641	GCT	2	6	34371	34376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319908
596	NC_016641	TGA	2	6	34420	34425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319908
597	NC_016641	C	6	6	34434	34439	0 %	0 %	0 %	100 %	374319908
598	NC_016641	ATA	2	6	34597	34602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319908
599	NC_016641	TCCG	2	8	34648	34655	0 %	25 %	25 %	50 %	374319908
600	NC_016641	TG	3	6	34680	34685	0 %	50 %	50 %	0 %	374319908
601	NC_016641	ATC	2	6	34699	34704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319908
602	NC_016641	CAGCCG	2	12	34771	34782	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374319908
603	NC_016641	GC	3	6	34976	34981	0 %	0 %	50 %	50 %	374319909
604	NC_016641	AGTAA	2	10	35091	35100	60 %	20 %	20 %	0 %	374319909
605	NC_016641	CGG	2	6	35101	35106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374319909
606	NC_016641	TCT	2	6	35155	35160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319909
607	NC_016641	A	6	6	35163	35168	100 %	0 %	0 %	0 %	374319909
608	NC_016641	GCTC	2	8	35216	35223	0 %	25 %	25 %	50 %	374319909
609	NC_016641	TGC	2	6	35253	35258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319909
610	NC_016641	CTG	2	6	35315	35320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319909
611	NC_016641	ACG	2	6	35397	35402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319909
612	NC_016641	TGAA	2	8	35490	35497	50 %	25 %	25 %	0 %	374319909
613	NC_016641	TCA	2	6	35524	35529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319909
614	NC_016641	CAG	2	6	35535	35540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319909
615	NC_016641	CTG	2	6	35550	35555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319909
616	NC_016641	AAT	2	6	35631	35636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319909
617	NC_016641	AGCT	2	8	35667	35674	25 %	25 %	25 %	25 %	374319909
618	NC_016641	TAC	2	6	35837	35842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319909
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620	NC_016641	ACAT	2	8	36066	36073	50 %	25 %	0 %	25 %	374319909
621	NC_016641	GGACT	2	10	36167	36176	20 %	20 %	40 %	20 %	374319909
622	NC_016641	C	6	6	36184	36189	0 %	0 %	0 %	100 %	374319909
623	NC_016641	AT	3	6	36193	36198	50 %	50 %	0 %	0 %	374319909
624	NC_016641	TCA	2	6	36208	36213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319909
625	NC_016641	GC	3	6	36228	36233	0 %	0 %	50 %	50 %	374319909
626	NC_016641	GTT	2	6	36251	36256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016641	TCT	2	6	36281	36286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_016641	TAA	2	6	36339	36344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319910
629	NC_016641	TCA	2	6	36401	36406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319910
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753	NC_016641	CCA	2	6	42545	42550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319915
754	NC_016641	AT	3	6	42555	42560	50 %	50 %	0 %	0 %	374319915
755	NC_016641	AC	3	6	42599	42604	50 %	0 %	0 %	50 %	374319915
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