MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 117866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016641	AAT	2	6	282248	282253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_016641	ACG	2	6	282297	282302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_016641	ATT	2	6	282329	282334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320149
5504	NC_016641	CTT	2	6	282366	282371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320149
5505	NC_016641	TAA	2	6	282372	282377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320149
5506	NC_016641	ATTC	2	8	282410	282417	25 %	50 %	0 %	25 %	374320149
5507	NC_016641	A	6	6	282428	282433	100 %	0 %	0 %	0 %	374320149
5508	NC_016641	T	6	6	282452	282457	0 %	100 %	0 %	0 %	374320149
5509	NC_016641	TCA	2	6	282478	282483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320149
5510	NC_016641	CAAA	2	8	282629	282636	75 %	0 %	0 %	25 %	374320149
5511	NC_016641	AC	3	6	282698	282703	50 %	0 %	0 %	50 %	374320149
5512	NC_016641	CTGT	2	8	282722	282729	0 %	50 %	25 %	25 %	374320149
5513	NC_016641	CAA	2	6	282783	282788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320149
5514	NC_016641	CGT	3	9	282875	282883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_016641	TAC	2	6	282993	282998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_016641	T	7	7	283080	283086	0 %	100 %	0 %	0 %	374320150
5517	NC_016641	GCG	2	6	283094	283099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320150
5518	NC_016641	TTG	2	6	283172	283177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320150
5519	NC_016641	TTC	2	6	283226	283231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320150
5520	NC_016641	TGC	2	6	283247	283252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320150
5521	NC_016641	CGG	2	6	283270	283275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320150
5522	NC_016641	ATA	2	6	283319	283324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320150
5523	NC_016641	GTC	2	6	283330	283335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320150
5524	NC_016641	CATC	2	8	283548	283555	25 %	25 %	0 %	50 %	374320150
5525	NC_016641	GCC	2	6	283601	283606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320150
5526	NC_016641	AAGC	2	8	283764	283771	50 %	0 %	25 %	25 %	374320150
5527	NC_016641	ATCC	2	8	283837	283844	25 %	25 %	0 %	50 %	374320150
5528	NC_016641	ATCC	2	8	283908	283915	25 %	25 %	0 %	50 %	374320150
5529	NC_016641	T	7	7	283926	283932	0 %	100 %	0 %	0 %	374320150
5530	NC_016641	CTG	2	6	284037	284042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320150
5531	NC_016641	GTT	2	6	284060	284065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320150
5532	NC_016641	ATT	2	6	284232	284237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_016641	TCA	2	6	284285	284290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_016641	CGG	2	6	284360	284365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_016641	T	7	7	284367	284373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_016641	ATC	2	6	284492	284497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320151
5537	NC_016641	GCT	2	6	284522	284527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320151
5538	NC_016641	GGCA	2	8	284544	284551	25 %	0 %	50 %	25 %	374320151
5539	NC_016641	AT	3	6	284617	284622	50 %	50 %	0 %	0 %	374320151
5540	NC_016641	CAA	2	6	284668	284673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320151
5541	NC_016641	CAG	2	6	284681	284686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320151
5542	NC_016641	AGA	2	6	284716	284721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320151
5543	NC_016641	GAA	2	6	284747	284752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320151
5544	NC_016641	GGC	2	6	284780	284785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320151
5545	NC_016641	ATT	2	6	284807	284812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320151
5546	NC_016641	GCG	4	12	284940	284951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320151
5547	NC_016641	CCG	2	6	285013	285018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320151
5548	NC_016641	CCT	2	6	285055	285060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320151
5549	NC_016641	CGT	2	6	285076	285081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320151
5550	NC_016641	AATCGA	2	12	285238	285249	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	374320151
5551	NC_016641	CGC	2	6	285304	285309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320151
5552	NC_016641	CAAGCT	2	12	285334	285345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374320151
5553	NC_016641	CAA	2	6	285382	285387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320151
5554	NC_016641	AGT	2	6	285434	285439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320151
5555	NC_016641	A	6	6	285474	285479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_016641	ATT	2	6	285502	285507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_016641	CAGC	2	8	285666	285673	25 %	0 %	25 %	50 %	374320152
5558	NC_016641	CCTTT	2	10	285771	285780	0 %	60 %	0 %	40 %	374320152
5559	NC_016641	TCTAT	2	10	285791	285800	20 %	60 %	0 %	20 %	374320152
5560	NC_016641	TGT	2	6	285843	285848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320152
5561	NC_016641	TTG	2	6	285867	285872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_016641	AT	3	6	285890	285895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_016641	TAAA	2	8	285946	285953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_016641	A	8	8	285951	285958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_016641	AAG	2	6	286028	286033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_016641	ATT	2	6	286041	286046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320153
5567	NC_016641	TCA	2	6	286239	286244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320153
5568	NC_016641	CAC	2	6	286336	286341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320153
5569	NC_016641	ACA	2	6	286380	286385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320153
5570	NC_016641	CTG	2	6	286393	286398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320153
5571	NC_016641	GCT	2	6	286456	286461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320153
5572	NC_016641	CCG	2	6	286538	286543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320153
5573	NC_016641	GCC	2	6	286575	286580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320153
5574	NC_016641	CAT	2	6	286585	286590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320153
5575	NC_016641	TA	3	6	286627	286632	50 %	50 %	0 %	0 %	374320153
5576	NC_016641	CGG	2	6	286635	286640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320153
5577	NC_016641	TGG	2	6	286649	286654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320153
5578	NC_016641	AGC	2	6	286655	286660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320153
5579	NC_016641	CTTG	2	8	286678	286685	0 %	50 %	25 %	25 %	374320153
5580	NC_016641	CT	3	6	286704	286709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5581	NC_016641	AAT	2	6	286844	286849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_016641	AGC	2	6	286868	286873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_016641	T	6	6	286892	286897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_016641	CAA	2	6	286898	286903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_016641	CAT	2	6	286933	286938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320154
5586	NC_016641	GTT	2	6	287135	287140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320154
5587	NC_016641	GCA	2	6	287150	287155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320154
5588	NC_016641	GCG	2	6	287177	287182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320154
5589	NC_016641	GGA	2	6	287212	287217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374320154
5590	NC_016641	GTC	2	6	287279	287284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320154
5591	NC_016641	ACG	2	6	287301	287306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320154
5592	NC_016641	ATT	3	9	287309	287317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320154
5593	NC_016641	GGC	2	6	287327	287332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320154
5594	NC_016641	CAG	2	6	287453	287458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320154
5595	NC_016641	GAG	2	6	287462	287467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374320154
5596	NC_016641	TTC	2	6	287485	287490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320154
5597	NC_016641	ATCA	2	8	287573	287580	50 %	25 %	0 %	25 %	374320154
5598	NC_016641	CAT	2	6	287612	287617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320154
5599	NC_016641	ACA	2	6	287627	287632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320154
5600	NC_016641	T	8	8	287644	287651	0 %	100 %	0 %	0 %	374320154
5601	NC_016641	A	7	7	287687	287693	100 %	0 %	0 %	0 %	374320154
5602	NC_016641	ATT	2	6	287723	287728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320154
5603	NC_016641	ATT	2	6	287741	287746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320154
5604	NC_016641	AGCGG	2	10	287792	287801	20 %	0 %	60 %	20 %	374320154
5605	NC_016641	GTTT	2	8	287814	287821	0 %	75 %	25 %	0 %	374320154
5606	NC_016641	TGC	2	6	288012	288017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320154
5607	NC_016641	CCG	2	6	288021	288026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320154
5608	NC_016641	AGC	2	6	288046	288051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320154
5609	NC_016641	TAC	2	6	288059	288064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320154
5610	NC_016641	GGT	2	6	288110	288115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320154
5611	NC_016641	GCTG	2	8	288136	288143	0 %	25 %	50 %	25 %	374320154
5612	NC_016641	CGA	2	6	288220	288225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320154
5613	NC_016641	CAT	2	6	288292	288297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320154
5614	NC_016641	CAC	2	6	288313	288318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320154
5615	NC_016641	TTC	2	6	288441	288446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320154
5616	NC_016641	CTT	2	6	288447	288452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320154
5617	NC_016641	TCA	2	6	288613	288618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320155
5618	NC_016641	CGA	2	6	288643	288648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320155
5619	NC_016641	CAA	2	6	288746	288751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320155
5620	NC_016641	AGC	2	6	288800	288805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320155
5621	NC_016641	TCA	2	6	288862	288867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320155
5622	NC_016641	ATC	2	6	288868	288873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320155
5623	NC_016641	GGCT	2	8	288912	288919	0 %	25 %	50 %	25 %	374320155
5624	NC_016641	TGCT	2	8	288930	288937	0 %	50 %	25 %	25 %	374320155
5625	NC_016641	GTGCT	2	10	289109	289118	0 %	40 %	40 %	20 %	374320155
5626	NC_016641	AAT	2	6	289188	289193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320155
5627	NC_016641	TCA	2	6	289282	289287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320155
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5632	NC_016641	AAC	2	6	289651	289656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320155
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5636	NC_016641	TCT	2	6	289910	289915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320155
5637	NC_016641	GACAC	2	10	289939	289948	40 %	0 %	20 %	40 %	374320155
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5641	NC_016641	AGTA	2	8	290120	290127	50 %	25 %	25 %	0 %	374320155
5642	NC_016641	AGC	2	6	290170	290175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320155
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5644	NC_016641	CGG	2	6	290276	290281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320155
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5647	NC_016641	CGG	2	6	290446	290451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320155
5648	NC_016641	CTTTAT	2	12	290501	290512	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374320155
5649	NC_016641	CT	3	6	290524	290529	0 %	50 %	0 %	50 %	374320155
5650	NC_016641	CAT	2	6	290601	290606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5652	NC_016641	T	7	7	290752	290758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5653	NC_016641	TGT	2	6	290769	290774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5654	NC_016641	CAT	2	6	290821	290826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5655	NC_016641	GGA	2	6	290831	290836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5656	NC_016641	A	7	7	290876	290882	100 %	0 %	0 %	0 %	374320156
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5662	NC_016641	TTC	2	6	291115	291120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5663	NC_016641	T	6	6	291135	291140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5664	NC_016641	A	6	6	291147	291152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5665	NC_016641	TGC	2	6	291214	291219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5667	NC_016641	T	8	8	291287	291294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5668	NC_016641	ACA	2	6	291370	291375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320157
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5670	NC_016641	TGC	2	6	291428	291433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320157
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5673	NC_016641	GCGCTG	2	12	291508	291519	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374320157
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5718	NC_016641	AT	3	6	293457	293462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5719	NC_016641	A	6	6	293515	293520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5720	NC_016641	TTCT	2	8	293550	293557	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5721	NC_016641	A	7	7	293599	293605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5722	NC_016641	AAAG	2	8	293619	293626	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5723	NC_016641	ATC	2	6	293729	293734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320160
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5727	NC_016641	CTG	2	6	293927	293932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320160
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5730	NC_016641	TGC	2	6	294016	294021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320161
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5732	NC_016641	CCAATG	2	12	294044	294055	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374320161
5733	NC_016641	CAA	2	6	294148	294153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320161
5734	NC_016641	TCC	2	6	294154	294159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320161
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5737	NC_016641	CAAA	2	8	294207	294214	75 %	0 %	0 %	25 %	374320161
5738	NC_016641	CTG	2	6	294235	294240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320161
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5740	NC_016641	CTC	2	6	294310	294315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5741	NC_016641	CTT	2	6	294321	294326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5742	NC_016641	A	7	7	294341	294347	100 %	0 %	0 %	0 %	374320162
5743	NC_016641	TTCG	2	8	294348	294355	0 %	50 %	25 %	25 %	374320162
5744	NC_016641	GGCT	2	8	294369	294376	0 %	25 %	50 %	25 %	374320162
5745	NC_016641	GCC	2	6	294403	294408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320162
5746	NC_016641	CAT	2	6	294422	294427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320162
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5748	NC_016641	T	6	6	294618	294623	0 %	100 %	0 %	0 %	374320162
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5876	NC_016641	AAC	2	6	302179	302184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5877	NC_016641	A	6	6	302185	302190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5878	NC_016641	TGA	2	6	302262	302267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5879	NC_016641	CGG	2	6	302307	302312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5880	NC_016641	TGA	2	6	302317	302322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320174
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5996	NC_016641	TCA	2	6	308560	308565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320181
5997	NC_016641	TTCG	2	8	308599	308606	0 %	50 %	25 %	25 %	374320181
5998	NC_016641	GGC	2	6	308613	308618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320181
5999	NC_016641	ATG	2	6	308622	308627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320181
6000	NC_016641	GGC	2	6	308794	308799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320181

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