MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 117866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016641	TAT	2	6	232160	232165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320097
4502	NC_016641	CAG	3	9	232191	232199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320097
4503	NC_016641	TCC	2	6	232228	232233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320097
4504	NC_016641	TGC	2	6	232263	232268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320097
4505	NC_016641	TGAC	2	8	232313	232320	25 %	25 %	25 %	25 %	374320097
4506	NC_016641	TTGCCG	2	12	232348	232359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320097
4507	NC_016641	GAGGG	2	10	232391	232400	20 %	0 %	80 %	0 %	374320097
4508	NC_016641	CGC	2	6	232420	232425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320097
4509	NC_016641	TAT	2	6	232445	232450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320097
4510	NC_016641	TCA	2	6	232466	232471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320097
4511	NC_016641	TTCA	2	8	232515	232522	25 %	50 %	0 %	25 %	374320097
4512	NC_016641	TA	3	6	232549	232554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_016641	TGC	2	6	232632	232637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320098
4514	NC_016641	CGC	3	9	232683	232691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320098
4515	NC_016641	GCT	2	6	232699	232704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320098
4516	NC_016641	GCA	2	6	232722	232727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320098
4517	NC_016641	AGCC	2	8	232761	232768	25 %	0 %	25 %	50 %	374320098
4518	NC_016641	AAC	2	6	232886	232891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320098
4519	NC_016641	ATA	2	6	233030	233035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374320098
4520	NC_016641	AGC	2	6	233052	233057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320098
4521	NC_016641	ATG	2	6	233148	233153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320098
4522	NC_016641	CGG	2	6	233154	233159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320098
4523	NC_016641	TGC	2	6	233186	233191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320098
4524	NC_016641	GAT	2	6	233330	233335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320098
4525	NC_016641	CAG	2	6	233351	233356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320098
4526	NC_016641	CCA	2	6	233485	233490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374320098
4527	NC_016641	AT	3	6	233615	233620	50 %	50 %	0 %	0 %	374320098
4528	NC_016641	GCT	2	6	233681	233686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320098
4529	NC_016641	CTT	2	6	233758	233763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_016641	CT	3	6	233780	233785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_016641	CTC	2	6	233850	233855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_016641	AGC	2	6	233866	233871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_016641	ATG	2	6	233909	233914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_016641	CAA	2	6	233947	233952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_016641	TGC	2	6	233972	233977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320099
4536	NC_016641	TTC	2	6	234095	234100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320099
4537	NC_016641	GGA	2	6	234105	234110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374320099
4538	NC_016641	ACCG	2	8	234120	234127	25 %	0 %	25 %	50 %	374320099
4539	NC_016641	CAG	2	6	234166	234171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320099
4540	NC_016641	CT	3	6	234209	234214	0 %	50 %	0 %	50 %	374320099
4541	NC_016641	AAAACG	2	12	234221	234232	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	374320099
4542	NC_016641	GCA	2	6	234321	234326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320099
4543	NC_016641	CTG	2	6	234334	234339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320099
4544	NC_016641	GTC	2	6	234412	234417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320099
4545	NC_016641	CAAGC	2	10	234420	234429	40 %	0 %	20 %	40 %	374320099
4546	NC_016641	GTG	2	6	234473	234478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320099
4547	NC_016641	CGCT	2	8	234611	234618	0 %	25 %	25 %	50 %	374320099
4548	NC_016641	AAC	2	6	234625	234630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320099
4549	NC_016641	GGC	2	6	234670	234675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320099
4550	NC_016641	CTCC	2	8	234710	234717	0 %	25 %	0 %	75 %	374320099
4551	NC_016641	TGA	2	6	234818	234823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320099
4552	NC_016641	AAG	2	6	234917	234922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320099
4553	NC_016641	GAAA	2	8	234999	235006	75 %	0 %	25 %	0 %	374320099
4554	NC_016641	CGG	2	6	235058	235063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320099
4555	NC_016641	ATC	2	6	235222	235227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320100
4556	NC_016641	GTG	2	6	235269	235274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320100
4557	NC_016641	TACG	2	8	235302	235309	25 %	25 %	25 %	25 %	374320100
4558	NC_016641	TGA	2	6	235425	235430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320100
4559	NC_016641	CCAGT	2	10	235431	235440	20 %	20 %	20 %	40 %	374320100
4560	NC_016641	CGC	2	6	235536	235541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320100
4561	NC_016641	ATC	2	6	235599	235604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320100
4562	NC_016641	TGG	2	6	235632	235637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320100
4563	NC_016641	GTC	2	6	235763	235768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320100
4564	NC_016641	AGC	2	6	235790	235795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320100
4565	NC_016641	GAT	3	9	235808	235816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320100
4566	NC_016641	CGT	2	6	235870	235875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320100
4567	NC_016641	GTA	2	6	235931	235936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320100
4568	NC_016641	GCT	2	6	235956	235961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320100
4569	NC_016641	ACA	3	9	236007	236015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_016641	GCA	2	6	236034	236039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_016641	T	6	6	236050	236055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_016641	CT	4	8	236159	236166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_016641	AGA	2	6	236195	236200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_016641	CGGA	2	8	236261	236268	25 %	0 %	50 %	25 %	374320101
4575	NC_016641	GGC	2	6	236294	236299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374320101
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4578	NC_016641	CATT	2	8	236348	236355	25 %	50 %	0 %	25 %	374320101
4579	NC_016641	GCA	2	6	236363	236368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320101
4580	NC_016641	GC	3	6	236380	236385	0 %	0 %	50 %	50 %	374320101
4581	NC_016641	TGA	2	6	236399	236404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320101
4582	NC_016641	TTGA	2	8	236443	236450	25 %	50 %	25 %	0 %	374320101
4583	NC_016641	GCC	2	6	236479	236484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320101
4584	NC_016641	TGGC	2	8	236563	236570	0 %	25 %	50 %	25 %	374320101
4585	NC_016641	GCA	2	6	236603	236608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320101
4586	NC_016641	GCT	2	6	236621	236626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320101
4587	NC_016641	CTC	3	9	236643	236651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320101
4588	NC_016641	GACG	2	8	236678	236685	25 %	0 %	50 %	25 %	374320101
4589	NC_016641	TCC	2	6	236719	236724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320101
4590	NC_016641	GAT	2	6	236745	236750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320101
4591	NC_016641	GCT	2	6	236756	236761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320101
4592	NC_016641	TG	3	6	236812	236817	0 %	50 %	50 %	0 %	374320101
4593	NC_016641	ATC	2	6	236826	236831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320101
4594	NC_016641	AGC	2	6	236849	236854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320101
4595	NC_016641	CATA	2	8	236911	236918	50 %	25 %	0 %	25 %	374320101
4596	NC_016641	AAAT	2	8	236919	236926	75 %	25 %	0 %	0 %	374320101
4597	NC_016641	CA	3	6	236977	236982	50 %	0 %	0 %	50 %	374320101
4598	NC_016641	ACA	2	6	236999	237004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320101
4599	NC_016641	CCT	2	6	237044	237049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4600	NC_016641	TATAA	2	10	237086	237095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_016641	TTTTTC	2	12	237128	237139	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4602	NC_016641	GT	3	6	237166	237171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_016641	GAAT	2	8	237216	237223	50 %	25 %	25 %	0 %	374320102
4604	NC_016641	CAGG	2	8	237254	237261	25 %	0 %	50 %	25 %	374320102
4605	NC_016641	ATTT	2	8	237305	237312	25 %	75 %	0 %	0 %	374320102
4606	NC_016641	AAG	2	6	237318	237323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320102
4607	NC_016641	CCT	2	6	237476	237481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374320102
4608	NC_016641	A	6	6	237516	237521	100 %	0 %	0 %	0 %	374320102
4609	NC_016641	TCGC	2	8	237539	237546	0 %	25 %	25 %	50 %	374320102
4610	NC_016641	GTT	2	6	237718	237723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320102
4611	NC_016641	GCT	2	6	237766	237771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320102
4612	NC_016641	AAC	2	6	237818	237823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320102
4613	NC_016641	TTG	2	6	237864	237869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320102
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4618	NC_016641	TTA	2	6	238065	238070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374320102
4619	NC_016641	A	6	6	238113	238118	100 %	0 %	0 %	0 %	374320102
4620	NC_016641	CAA	2	6	238137	238142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320102
4621	NC_016641	GAAG	2	8	238213	238220	50 %	0 %	50 %	0 %	374320102
4622	NC_016641	CAA	2	6	238249	238254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320102
4623	NC_016641	CCG	2	6	238353	238358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320102
4624	NC_016641	AAC	2	6	238359	238364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374320102
4625	NC_016641	CA	3	6	238369	238374	50 %	0 %	0 %	50 %	374320102
4626	NC_016641	CTG	2	6	238376	238381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320102
4627	NC_016641	GAA	2	6	238451	238456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320102
4628	NC_016641	GTG	2	6	238488	238493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374320102
4629	NC_016641	CTAAT	2	10	238513	238522	40 %	40 %	0 %	20 %	374320102
4630	NC_016641	CGGT	2	8	238523	238530	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4631	NC_016641	T	8	8	238589	238596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_016641	ATTC	2	8	238614	238621	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4633	NC_016641	CAG	2	6	238644	238649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320103
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4635	NC_016641	GCA	2	6	238674	238679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320103
4636	NC_016641	GCTC	2	8	238707	238714	0 %	25 %	25 %	50 %	374320103
4637	NC_016641	CTG	2	6	238761	238766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320103
4638	NC_016641	CTT	2	6	238785	238790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320103
4639	NC_016641	A	7	7	238797	238803	100 %	0 %	0 %	0 %	374320103
4640	NC_016641	AT	3	6	238990	238995	50 %	50 %	0 %	0 %	374320103
4641	NC_016641	CTTG	2	8	239028	239035	0 %	50 %	25 %	25 %	374320103
4642	NC_016641	GCC	2	6	239036	239041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374320103
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4644	NC_016641	T	6	6	239195	239200	0 %	100 %	0 %	0 %	374320103
4645	NC_016641	TAC	2	6	239239	239244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320103
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4647	NC_016641	TCCA	2	8	239357	239364	25 %	25 %	0 %	50 %	374320103
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4652	NC_016641	T	7	7	239563	239569	0 %	100 %	0 %	0 %	374320103
4653	NC_016641	AG	3	6	239577	239582	50 %	0 %	50 %	0 %	374320103
4654	NC_016641	ATAAC	2	10	239590	239599	60 %	20 %	0 %	20 %	374320103
4655	NC_016641	CAT	3	9	239653	239661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320103
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4661	NC_016641	TA	3	6	239946	239951	50 %	50 %	0 %	0 %	374320103
4662	NC_016641	CTT	2	6	239952	239957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320103
4663	NC_016641	CT	3	6	239984	239989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4664	NC_016641	A	7	7	240008	240014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4665	NC_016641	ATA	2	6	240072	240077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4666	NC_016641	ACA	2	6	240091	240096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4667	NC_016641	GAG	2	6	240107	240112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4668	NC_016641	AGA	2	6	240128	240133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374320104
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4673	NC_016641	A	7	7	240292	240298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4674	NC_016641	TGC	2	6	240320	240325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4702	NC_016641	TTCA	2	8	241343	241350	25 %	50 %	0 %	25 %	374320105
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4707	NC_016641	CCCTG	2	10	241590	241599	0 %	20 %	20 %	60 %	374320106
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4715	NC_016641	TCA	2	6	242160	242165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320106
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4724	NC_016641	AGTC	2	8	242940	242947	25 %	25 %	25 %	25 %	374320107
4725	NC_016641	GCA	2	6	243044	243049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320107
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4728	NC_016641	TCG	2	6	243175	243180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320107
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4730	NC_016641	TCG	2	6	243283	243288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320107
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4732	NC_016641	CTT	2	6	243321	243326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374320107
4733	NC_016641	GCA	2	6	243554	243559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320107
4734	NC_016641	GCA	2	6	243563	243568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320107
4735	NC_016641	A	7	7	243850	243856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4736	NC_016641	CCA	2	6	243866	243871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4737	NC_016641	T	6	6	243898	243903	0 %	100 %	0 %	0 %	374320108
4738	NC_016641	TCA	2	6	243906	243911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320108
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4740	NC_016641	TGTGC	2	10	244026	244035	0 %	40 %	40 %	20 %	374320108
4741	NC_016641	A	6	6	244105	244110	100 %	0 %	0 %	0 %	374320108
4742	NC_016641	GTT	2	6	244139	244144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320108
4743	NC_016641	AGC	2	6	244196	244201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374320108
4744	NC_016641	AGG	2	6	244221	244226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374320108
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4746	NC_016641	GTT	2	6	244414	244419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374320108
4747	NC_016641	CCGT	2	8	244435	244442	0 %	25 %	25 %	50 %	374320108
4748	NC_016641	TGCC	2	8	244514	244521	0 %	25 %	25 %	50 %	374320108
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4849	NC_016641	GA	3	6	250385	250390	50 %	0 %	50 %	0 %	374320117
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4859	NC_016641	TAG	2	6	250785	250790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4861	NC_016641	AG	4	8	250815	250822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4865	NC_016641	TAA	2	6	251017	251022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4866	NC_016641	AAC	2	6	251026	251031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4868	NC_016641	CAT	2	6	251067	251072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374320119
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4870	NC_016641	TCG	2	6	251110	251115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374320119
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4873	NC_016641	AAAC	2	8	251315	251322	75 %	0 %	0 %	25 %	374320119
4874	NC_016641	ATG	2	6	251343	251348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374320119
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