MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Paenibacillus terrae HPL-003 chromosome

Total Repeats: 117866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016641	CGA	2	6	52	57	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016641	TGG	2	6	114	119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016641	ATA	2	6	270	275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016641	AAT	2	6	276	281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016641	GA	4	8	290	297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016641	CCA	2	6	584	589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_016641	TCA	2	6	633	638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016641	TGAA	2	8	648	655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016641	GTAT	2	8	672	679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016641	TCG	2	6	821	826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016641	G	6	6	866	871	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016641	AAC	2	6	939	944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016641	CTC	2	6	993	998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016641	ACG	2	6	1042	1047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016641	ACC	2	6	1237	1242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_016641	AGG	2	6	1373	1378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016641	GGT	2	6	1460	1465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016641	CCT	2	6	1478	1483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_016641	TC	3	6	1633	1638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016641	GCC	2	6	1730	1735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_016641	TTC	2	6	1973	1978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016641	CG	3	6	1979	1984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016641	TTCTC	2	10	1993	2002	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016641	CTA	2	6	2083	2088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016641	CAGCC	2	10	2108	2117	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_016641	CATC	2	8	2167	2174	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016641	GGT	2	6	2225	2230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016641	TGT	2	6	2246	2251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016641	CGG	2	6	2334	2339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016641	TGG	2	6	2550	2555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016641	AC	4	8	2612	2619	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016641	CACT	2	8	2674	2681	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016641	CTT	2	6	3099	3104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016641	ACT	2	6	3255	3260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016641	TCGC	2	8	3420	3427	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016641	CAG	2	6	3518	3523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016641	GCTT	2	8	3581	3588	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016641	GTT	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016641	TCG	2	6	3627	3632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016641	TCC	2	6	3651	3656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_016641	TCA	2	6	3720	3725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016641	TGAA	2	8	3734	3741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016641	TTTCG	2	10	3811	3820	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016641	CA	3	6	3883	3888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016641	TG	3	6	3891	3896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016641	TCG	2	6	3907	3912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016641	GAGT	2	8	3948	3955	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016641	AGG	2	6	4034	4039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016641	ATC	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016641	CGG	2	6	4107	4112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016641	GTG	2	6	4162	4167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016641	GT	3	6	4177	4182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016641	GTA	2	6	4340	4345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016641	GT	3	6	4347	4352	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016641	ATG	2	6	4372	4377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016641	TCC	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_016641	CTG	2	6	4444	4449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016641	CACGA	2	10	4499	4508	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_016641	GAC	2	6	4512	4517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016641	CAC	2	6	4525	4530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_016641	ATCT	2	8	4556	4563	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016641	TTC	2	6	4600	4605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016641	AG	3	6	4839	4844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016641	TCC	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_016641	CTC	2	6	4910	4915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_016641	GCC	2	6	4989	4994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_016641	GC	4	8	4996	5003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016641	AAT	2	6	5013	5018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016641	GCT	2	6	5053	5058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016641	TCT	2	6	5081	5086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016641	TTC	2	6	5126	5131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016641	TCA	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016641	CTG	2	6	5221	5226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016641	TCG	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016641	CCA	2	6	5320	5325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_016641	CATC	2	8	5348	5355	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016641	TCC	2	6	5377	5382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_016641	CCG	2	6	5480	5485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_016641	TAGGT	2	10	5487	5496	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016641	TAACC	2	10	5511	5520	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_016641	CGC	2	6	5546	5551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016641	ACTC	2	8	5735	5742	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016641	GTT	2	6	5743	5748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016641	CAC	2	6	5803	5808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_016641	GCG	2	6	5818	5823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016641	ATA	2	6	5830	5835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016641	T	8	8	5864	5871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016641	T	6	6	5880	5885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016641	AT	3	6	5942	5947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016641	T	6	6	5975	5980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016641	AAAAG	2	10	6021	6030	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016641	TTTTA	2	10	6063	6072	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016641	TCT	2	6	6281	6286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319881
94	NC_016641	GAT	2	6	6528	6533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319881
95	NC_016641	ATAC	2	8	6579	6586	50 %	25 %	0 %	25 %	374319881
96	NC_016641	G	6	6	6609	6614	0 %	0 %	100 %	0 %	374319881
97	NC_016641	ACTG	2	8	6633	6640	25 %	25 %	25 %	25 %	374319881
98	NC_016641	TGC	2	6	6662	6667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319881
99	NC_016641	GGA	2	6	6689	6694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374319881
100	NC_016641	GCT	2	6	6719	6724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319881
101	NC_016641	GAT	2	6	6735	6740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319881
102	NC_016641	TTG	2	6	6966	6971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374319881
103	NC_016641	CTG	2	6	6994	6999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319881
104	NC_016641	GCT	2	6	7089	7094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319881
105	NC_016641	GAG	3	9	7128	7136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374319881
106	NC_016641	GT	3	6	7239	7244	0 %	50 %	50 %	0 %	374319881
107	NC_016641	GTTTTC	3	18	7309	7326	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	374319881
108	NC_016641	ATT	2	6	7327	7332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319881
109	NC_016641	TTC	2	6	7391	7396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319881
110	NC_016641	TCGCC	2	10	7419	7428	0 %	20 %	20 %	60 %	374319881
111	NC_016641	AAT	2	6	7501	7506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319881
112	NC_016641	GCAA	2	8	7715	7722	50 %	0 %	25 %	25 %	374319881
113	NC_016641	GT	3	6	7728	7733	0 %	50 %	50 %	0 %	374319881
114	NC_016641	CCT	2	6	7772	7777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_016641	TTCG	2	8	7783	7790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016641	TTA	2	6	7820	7825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016641	ACAA	2	8	7859	7866	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016641	A	7	7	7865	7871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016641	AGC	2	6	8041	8046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319882
120	NC_016641	GCA	2	6	8057	8062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319882
121	NC_016641	TCA	2	6	8081	8086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319882
122	NC_016641	CAT	2	6	8097	8102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319882
123	NC_016641	CA	3	6	8145	8150	50 %	0 %	0 %	50 %	374319882
124	NC_016641	ATA	2	6	8156	8161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319882
125	NC_016641	GGC	2	6	8201	8206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374319882
126	NC_016641	ATA	2	6	8282	8287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319882
127	NC_016641	TGT	2	6	8331	8336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374319882
128	NC_016641	GATTT	2	10	8351	8360	20 %	60 %	20 %	0 %	374319882
129	NC_016641	GA	3	6	8394	8399	50 %	0 %	50 %	0 %	374319882
130	NC_016641	CAC	2	6	8517	8522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319882
131	NC_016641	A	6	6	8726	8731	100 %	0 %	0 %	0 %	374319882
132	NC_016641	ATT	2	6	8826	8831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319883
133	NC_016641	TTC	2	6	8833	8838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319883
134	NC_016641	CTA	2	6	8850	8855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319883
135	NC_016641	TGC	2	6	8929	8934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319883
136	NC_016641	TAG	2	6	8981	8986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319883
137	NC_016641	GTT	2	6	8994	8999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374319883
138	NC_016641	T	6	6	8998	9003	0 %	100 %	0 %	0 %	374319883
139	NC_016641	ATA	2	6	9057	9062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319883
140	NC_016641	TGA	2	6	9152	9157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319883
141	NC_016641	TTA	2	6	9182	9187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319883
142	NC_016641	CCG	2	6	9303	9308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374319883
143	NC_016641	AGC	2	6	9337	9342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319883
144	NC_016641	TA	3	6	9622	9627	50 %	50 %	0 %	0 %	374319883
145	NC_016641	GAA	2	6	9702	9707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374319883
146	NC_016641	TCTT	2	8	9763	9770	0 %	75 %	0 %	25 %	374319884
147	NC_016641	TA	3	6	9776	9781	50 %	50 %	0 %	0 %	374319884
148	NC_016641	CT	3	6	9796	9801	0 %	50 %	0 %	50 %	374319884
149	NC_016641	TTCC	2	8	9830	9837	0 %	50 %	0 %	50 %	374319884
150	NC_016641	CGA	2	6	9889	9894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319884
151	NC_016641	GCC	2	6	9997	10002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374319884
152	NC_016641	TA	3	6	10100	10105	50 %	50 %	0 %	0 %	374319884
153	NC_016641	TAA	2	6	10253	10258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319884
154	NC_016641	GCC	2	6	10260	10265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374319884
155	NC_016641	ACT	2	6	10395	10400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319884
156	NC_016641	CCT	2	6	10469	10474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319884
157	NC_016641	TTTC	2	8	10571	10578	0 %	75 %	0 %	25 %	374319884
158	NC_016641	ACAA	2	8	10689	10696	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_016641	T	7	7	10707	10713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_016641	AC	3	6	10734	10739	50 %	0 %	0 %	50 %	374319885
161	NC_016641	GCG	2	6	10747	10752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374319885
162	NC_016641	ATA	2	6	10823	10828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319885
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164	NC_016641	ATC	2	6	10933	10938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319885
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167	NC_016641	CCA	2	6	11058	11063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319885
168	NC_016641	TGC	2	6	11189	11194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319885
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179	NC_016641	AAT	2	6	11587	11592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319885
180	NC_016641	CCGC	2	8	11600	11607	0 %	0 %	25 %	75 %	374319885
181	NC_016641	A	6	6	11622	11627	100 %	0 %	0 %	0 %	374319885
182	NC_016641	CTT	2	6	11740	11745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319885
183	NC_016641	ATA	2	6	11774	11779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319885
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186	NC_016641	TTCC	2	8	11931	11938	0 %	50 %	0 %	50 %	374319885
187	NC_016641	CCTAAC	2	12	11969	11980	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	374319885
188	NC_016641	CTA	2	6	12015	12020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_016641	CAG	2	6	12104	12109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319886
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192	NC_016641	AATG	2	8	12313	12320	50 %	25 %	25 %	0 %	374319886
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194	NC_016641	AGC	3	9	12405	12413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319886
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196	NC_016641	A	8	8	12567	12574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_016641	GTA	2	6	12607	12612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_016641	CAT	2	6	14792	14797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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268	NC_016641	CTT	2	6	16741	16746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319892
269	NC_016641	GCT	2	6	16759	16764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319892
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272	NC_016641	GGC	2	6	17057	17062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374319892
273	NC_016641	GTA	2	6	17074	17079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319892
274	NC_016641	TGC	2	6	17190	17195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319892
275	NC_016641	CT	3	6	17233	17238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
276	NC_016641	CGG	2	6	17309	17314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374319893
277	NC_016641	GC	3	6	17315	17320	0 %	0 %	50 %	50 %	374319893
278	NC_016641	TCAT	2	8	17379	17386	25 %	50 %	0 %	25 %	374319893
279	NC_016641	GGCAA	2	10	17466	17475	40 %	0 %	40 %	20 %	374319893
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282	NC_016641	A	7	7	17580	17586	100 %	0 %	0 %	0 %	374319893
283	NC_016641	CAG	2	6	17597	17602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319893
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313	NC_016641	TGT	2	6	19060	19065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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316	NC_016641	TA	3	6	19137	19142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
317	NC_016641	TTA	2	6	19234	19239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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323	NC_016641	GGCA	2	8	19333	19340	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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387	NC_016641	CCG	2	6	23009	23014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374319899
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394	NC_016641	T	8	8	23331	23338	0 %	100 %	0 %	0 %	374319899
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397	NC_016641	TATAT	2	10	23593	23602	40 %	60 %	0 %	0 %	374319900
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399	NC_016641	GGCTT	2	10	23722	23731	0 %	40 %	40 %	20 %	374319900
400	NC_016641	AAT	2	6	23762	23767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319900
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403	NC_016641	GCT	2	6	23923	23928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319900
404	NC_016641	CAG	2	6	23933	23938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319900
405	NC_016641	CCA	2	6	24088	24093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319900
406	NC_016641	CTG	2	6	24113	24118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319900
407	NC_016641	GCA	2	6	24169	24174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319900
408	NC_016641	TCA	2	6	24220	24225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319900
409	NC_016641	CT	3	6	24230	24235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
410	NC_016641	TTC	2	6	24242	24247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_016641	GAGG	2	8	24250	24257	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
412	NC_016641	ACA	2	6	24335	24340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319901
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422	NC_016641	GAT	2	6	24964	24969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319902
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430	NC_016641	ATT	2	6	25210	25215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319902
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461	NC_016641	TGT	2	6	26605	26610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
462	NC_016641	A	6	6	26647	26652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_016641	CATT	2	8	28334	28341	25 %	50 %	0 %	25 %	374319905
498	NC_016641	GCG	2	6	28344	28349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374319905
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