MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-1

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016635	TTG	2	6	16	21	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016635	AGA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381184505
3	NC_016635	AATT	2	8	125	132	50 %	50 %	0 %	0 %	381184505
4	NC_016635	A	6	6	173	178	100 %	0 %	0 %	0 %	381184505
5	NC_016635	TGA	2	6	201	206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381184505
6	NC_016635	TGT	2	6	249	254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	381184505
7	NC_016635	CTG	2	6	278	283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	381184505
8	NC_016635	TCA	2	6	347	352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	381184505
9	NC_016635	GAA	2	6	408	413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	381184505
10	NC_016635	A	6	6	412	417	100 %	0 %	0 %	0 %	381184505
11	NC_016635	ATA	2	6	425	430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	381184505
12	NC_016635	A	6	6	430	435	100 %	0 %	0 %	0 %	381184505
13	NC_016635	ATAA	2	8	448	455	75 %	25 %	0 %	0 %	381184505
14	NC_016635	GATA	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	381184505
15	NC_016635	TA	3	6	472	477	50 %	50 %	0 %	0 %	381184505
16	NC_016635	GAC	2	6	499	504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	381184505
17	NC_016635	ATG	2	6	512	517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	381184505
18	NC_016635	TGATT	2	10	522	531	20 %	60 %	20 %	0 %	381184505
19	NC_016635	GATT	2	8	733	740	25 %	50 %	25 %	0 %	381184505
20	NC_016635	T	7	7	775	781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016635	TTAATT	2	12	830	841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016635	GTG	2	6	842	847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016635	A	6	6	880	885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016635	TCA	2	6	918	923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016635	TCGCT	2	10	966	975	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_016635	CAAA	2	8	976	983	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016635	CT	3	6	1088	1093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016635	CTGT	2	8	1125	1132	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016635	AGG	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016635	T	7	7	1243	1249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016635	GCCT	2	8	1250	1257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016635	TAC	2	6	1410	1415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016635	C	6	6	1418	1423	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_016635	AT	3	6	1557	1562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016635	AAT	2	6	1570	1575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016635	ATA	2	6	1589	1594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016635	ATTTG	2	10	1608	1617	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016635	A	7	7	1645	1651	100 %	0 %	0 %	0 %	381184506
39	NC_016635	GAAA	2	8	1704	1711	75 %	0 %	25 %	0 %	381184506
40	NC_016635	TAGCTT	2	12	1736	1747	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	381184506
41	NC_016635	ATT	2	6	1754	1759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	381184506
42	NC_016635	A	8	8	1778	1785	100 %	0 %	0 %	0 %	381184506

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.