MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 chromosome

Total Repeats: 39883

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_016605	TCC	2	6	1603302	1603307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35003	NC_016605	CCTT	2	8	1603316	1603323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35004	NC_016605	TC	3	6	1603348	1603353	0 %	50 %	0 %	50 %	377810337
35005	NC_016605	TCTTTG	2	12	1603483	1603494	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	377810337
35006	NC_016605	AAC	3	9	1603509	1603517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377810337
35007	NC_016605	T	7	7	1603525	1603531	0 %	100 %	0 %	0 %	377810337
35008	NC_016605	TAG	2	6	1603655	1603660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377810337
35009	NC_016605	TGG	2	6	1603739	1603744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377810337
35010	NC_016605	ATTT	2	8	1603784	1603791	25 %	75 %	0 %	0 %	377810337
35011	NC_016605	TAT	2	6	1603809	1603814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377810337
35012	NC_016605	A	6	6	1603838	1603843	100 %	0 %	0 %	0 %	377810337
35013	NC_016605	ATC	2	6	1603860	1603865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810337
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35015	NC_016605	CAA	2	6	1603919	1603924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377810337
35016	NC_016605	CAT	2	6	1603970	1603975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810337
35017	NC_016605	T	7	7	1603986	1603992	0 %	100 %	0 %	0 %	377810337
35018	NC_016605	AAT	2	6	1603993	1603998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377810337
35019	NC_016605	A	6	6	1604055	1604060	100 %	0 %	0 %	0 %	377810337
35020	NC_016605	TAT	2	6	1604085	1604090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377810337
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35039	NC_016605	TA	3	6	1604909	1604914	50 %	50 %	0 %	0 %	377810337
35040	NC_016605	CTTT	2	8	1605020	1605027	0 %	75 %	0 %	25 %	377810337
35041	NC_016605	TCT	2	6	1605062	1605067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35042	NC_016605	TAT	2	6	1605069	1605074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35043	NC_016605	CTA	2	6	1605085	1605090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35044	NC_016605	ATA	2	6	1605174	1605179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377810338
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35054	NC_016605	TTGC	2	8	1605544	1605551	0 %	50 %	25 %	25 %	377810338
35055	NC_016605	TGC	2	6	1605564	1605569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810338
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35067	NC_016605	ATC	2	6	1606057	1606062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35119	NC_016605	T	6	6	1608577	1608582	0 %	100 %	0 %	0 %	377810340
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35133	NC_016605	T	6	6	1609048	1609053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35134	NC_016605	CATTG	2	10	1609066	1609075	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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35200	NC_016605	TAAA	2	8	1612818	1612825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35202	NC_016605	T	6	6	1612917	1612922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35225	NC_016605	A	6	6	1613947	1613952	100 %	0 %	0 %	0 %	377810344
35226	NC_016605	GAC	2	6	1613961	1613966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810344
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35233	NC_016605	ATG	2	6	1614216	1614221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377810344
35234	NC_016605	TGT	2	6	1614224	1614229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377810344
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35236	NC_016605	GTT	3	9	1614363	1614371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377810344
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35470	NC_016605	A	6	6	1625196	1625201	100 %	0 %	0 %	0 %	377810354
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35476	NC_016605	T	6	6	1625388	1625393	0 %	100 %	0 %	0 %	377810354
35477	NC_016605	TCT	2	6	1625456	1625461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377810354
35478	NC_016605	TTA	2	6	1625532	1625537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377810354
35479	NC_016605	AATA	2	8	1625584	1625591	75 %	25 %	0 %	0 %	377810354
35480	NC_016605	TGA	2	6	1625678	1625683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377810354
35481	NC_016605	TAT	2	6	1625688	1625693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377810354
35482	NC_016605	TTA	2	6	1625753	1625758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377810354
35483	NC_016605	A	7	7	1625758	1625764	100 %	0 %	0 %	0 %	377810354
35484	NC_016605	ATA	2	6	1625827	1625832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377810354
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35488	NC_016605	T	6	6	1626238	1626243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35489	NC_016605	AGA	2	6	1626271	1626276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35490	NC_016605	TAT	2	6	1626296	1626301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35491	NC_016605	ACT	2	6	1626303	1626308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35492	NC_016605	ATTT	2	8	1626348	1626355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35494	NC_016605	ACGA	2	8	1626416	1626423	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35495	NC_016605	CAT	2	6	1626431	1626436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35496	NC_016605	AAACA	2	10	1626511	1626520	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35497	NC_016605	CTG	2	6	1626522	1626527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35498	NC_016605	TCT	2	6	1626606	1626611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35499	NC_016605	ATT	2	6	1626648	1626653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377810355
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