MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 chromosome

Total Repeats: 39883

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_016605	TAA	2	6	1301036	1301041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377810023
28503	NC_016605	TCA	2	6	1301087	1301092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810023
28504	NC_016605	ACC	2	6	1301110	1301115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377810023
28505	NC_016605	TAT	2	6	1301195	1301200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377810023
28506	NC_016605	ACC	2	6	1301235	1301240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377810023
28507	NC_016605	CTTTT	2	10	1301262	1301271	0 %	80 %	0 %	20 %	377810023
28508	NC_016605	AATT	2	8	1301274	1301281	50 %	50 %	0 %	0 %	377810023
28509	NC_016605	A	6	6	1301314	1301319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28510	NC_016605	ACC	2	6	1301341	1301346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28511	NC_016605	ATTT	2	8	1301379	1301386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28512	NC_016605	T	6	6	1301394	1301399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28513	NC_016605	TAAA	2	8	1301404	1301411	75 %	25 %	0 %	0 %	377810024
28514	NC_016605	ATT	2	6	1301424	1301429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377810024
28515	NC_016605	TTA	2	6	1301506	1301511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377810024
28516	NC_016605	ATG	2	6	1301593	1301598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377810024
28517	NC_016605	TGC	2	6	1301679	1301684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28518	NC_016605	TGC	2	6	1301691	1301696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28519	NC_016605	TGC	2	6	1301703	1301708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28520	NC_016605	TGC	2	6	1301724	1301729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28521	NC_016605	TGC	2	6	1301736	1301741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28522	NC_016605	TGC	2	6	1301748	1301753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28523	NC_016605	TGC	2	6	1301760	1301765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28524	NC_016605	TGC	2	6	1301772	1301777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28525	NC_016605	TGC	2	6	1301784	1301789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28526	NC_016605	TGC	2	6	1301796	1301801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28527	NC_016605	TGC	2	6	1301808	1301813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28528	NC_016605	TGC	2	6	1301820	1301825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28529	NC_016605	TGC	2	6	1301832	1301837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28530	NC_016605	CTTG	2	8	1301904	1301911	0 %	50 %	25 %	25 %	377810024
28531	NC_016605	ATT	2	6	1301958	1301963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377810024
28532	NC_016605	GATG	2	8	1301974	1301981	25 %	25 %	50 %	0 %	377810024
28533	NC_016605	ACT	2	6	1302094	1302099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810024
28534	NC_016605	GTT	2	6	1302106	1302111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377810024
28535	NC_016605	CTG	2	6	1302167	1302172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28536	NC_016605	GTC	2	6	1302196	1302201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28537	NC_016605	AGAA	2	8	1302318	1302325	75 %	0 %	25 %	0 %	377810024
28538	NC_016605	TAC	2	6	1302332	1302337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810024
28539	NC_016605	CTG	2	6	1302345	1302350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28540	NC_016605	AGA	2	6	1302414	1302419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377810024
28541	NC_016605	GTT	2	6	1302454	1302459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377810024
28542	NC_016605	ATT	2	6	1302468	1302473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377810024
28543	NC_016605	CCT	2	6	1302508	1302513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	377810024
28544	NC_016605	CATT	2	8	1302551	1302558	25 %	50 %	0 %	25 %	377810024
28545	NC_016605	AGT	2	6	1302566	1302571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377810024
28546	NC_016605	AGC	2	6	1302609	1302614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28547	NC_016605	T	6	6	1302715	1302720	0 %	100 %	0 %	0 %	377810024
28548	NC_016605	CTG	2	6	1302732	1302737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28549	NC_016605	AGTATT	2	12	1302744	1302755	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	377810024
28550	NC_016605	GGAA	2	8	1302829	1302836	50 %	0 %	50 %	0 %	377810024
28551	NC_016605	AT	3	6	1302889	1302894	50 %	50 %	0 %	0 %	377810024
28552	NC_016605	T	6	6	1302913	1302918	0 %	100 %	0 %	0 %	377810024
28553	NC_016605	ATTG	2	8	1302969	1302976	25 %	50 %	25 %	0 %	377810024
28554	NC_016605	CCA	2	6	1302979	1302984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377810024
28555	NC_016605	CAGT	2	8	1303051	1303058	25 %	25 %	25 %	25 %	377810024
28556	NC_016605	GCA	2	6	1303135	1303140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28557	NC_016605	T	7	7	1303142	1303148	0 %	100 %	0 %	0 %	377810024
28558	NC_016605	TAG	2	6	1303223	1303228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377810024
28559	NC_016605	TAC	2	6	1303253	1303258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810024
28560	NC_016605	AGC	2	6	1303263	1303268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28561	NC_016605	AGT	2	6	1303269	1303274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377810024
28562	NC_016605	TTG	2	6	1303295	1303300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377810024
28563	NC_016605	TTGC	2	8	1303337	1303344	0 %	50 %	25 %	25 %	377810024
28564	NC_016605	TAG	2	6	1303349	1303354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377810024
28565	NC_016605	ACT	2	6	1303369	1303374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810024
28566	NC_016605	TGC	2	6	1303398	1303403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810024
28567	NC_016605	ACT	2	6	1303434	1303439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810024
28568	NC_016605	TCC	2	6	1303465	1303470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	377810024
28569	NC_016605	ACTCCA	2	12	1303483	1303494	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	377810024
28570	NC_016605	TCC	2	6	1303583	1303588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28571	NC_016605	A	7	7	1303589	1303595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28572	NC_016605	ATAA	2	8	1303611	1303618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28573	NC_016605	CTT	2	6	1303647	1303652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28574	NC_016605	ATT	2	6	1303667	1303672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28575	NC_016605	AACATA	2	12	1303691	1303702	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28576	NC_016605	AC	3	6	1303705	1303710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28577	NC_016605	TAAT	2	8	1303723	1303730	50 %	50 %	0 %	0 %	377810025
28578	NC_016605	GCAG	2	8	1303784	1303791	25 %	0 %	50 %	25 %	377810025
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28580	NC_016605	AAT	2	6	1303802	1303807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377810025
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28585	NC_016605	A	6	6	1304021	1304026	100 %	0 %	0 %	0 %	377810025
28586	NC_016605	A	6	6	1304030	1304035	100 %	0 %	0 %	0 %	377810025
28587	NC_016605	GTT	2	6	1304056	1304061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377810025
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28589	NC_016605	AGCC	2	8	1304208	1304215	25 %	0 %	25 %	50 %	377810025
28590	NC_016605	A	6	6	1304278	1304283	100 %	0 %	0 %	0 %	377810025
28591	NC_016605	T	6	6	1304341	1304346	0 %	100 %	0 %	0 %	377810025
28592	NC_016605	CTC	2	6	1304383	1304388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	377810025
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28597	NC_016605	AAT	2	6	1304482	1304487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377810025
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28601	NC_016605	T	6	6	1304758	1304763	0 %	100 %	0 %	0 %	377810025
28602	NC_016605	CAA	2	6	1304787	1304792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377810025
28603	NC_016605	ATC	2	6	1304807	1304812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810025
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28607	NC_016605	CCA	2	6	1305070	1305075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377810026
28608	NC_016605	AAT	2	6	1305085	1305090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377810026
28609	NC_016605	T	7	7	1305138	1305144	0 %	100 %	0 %	0 %	377810026
28610	NC_016605	TTTA	2	8	1305210	1305217	25 %	75 %	0 %	0 %	377810026
28611	NC_016605	TTG	2	6	1305284	1305289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377810026
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