MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pelagibacterium halotolerans B2 chromosome

Total Repeats: 80342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016078	CGA	2	6	245272	245277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383325
5002	NC_016078	CCCAGC	2	12	245295	245306	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	357383325
5003	NC_016078	CGC	2	6	245377	245382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383325
5004	NC_016078	CG	3	6	245391	245396	0 %	0 %	50 %	50 %	357383325
5005	NC_016078	T	6	6	245414	245419	0 %	100 %	0 %	0 %	357383325
5006	NC_016078	CTT	2	6	245425	245430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357383325
5007	NC_016078	GAT	2	6	245438	245443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357383325
5008	NC_016078	GCC	3	9	245448	245456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383325
5009	NC_016078	CCG	2	6	245482	245487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383325
5010	NC_016078	GCC	2	6	245495	245500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383325
5011	NC_016078	CGT	2	6	245543	245548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383325
5012	NC_016078	GC	3	6	245550	245555	0 %	0 %	50 %	50 %	357383325
5013	NC_016078	TCG	2	6	245562	245567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383325
5014	NC_016078	TTTC	2	8	245620	245627	0 %	75 %	0 %	25 %	357383325
5015	NC_016078	GCC	2	6	245632	245637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383325
5016	NC_016078	GCC	2	6	245655	245660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383325
5017	NC_016078	TCG	2	6	245800	245805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383325
5018	NC_016078	GCC	2	6	245885	245890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383325
5019	NC_016078	ATC	2	6	245895	245900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383325
5020	NC_016078	CGCC	2	8	245911	245918	0 %	0 %	25 %	75 %	357383325
5021	NC_016078	CGC	2	6	245930	245935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383325
5022	NC_016078	CAG	3	9	246011	246019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383325
5023	NC_016078	GC	3	6	246026	246031	0 %	0 %	50 %	50 %	357383325
5024	NC_016078	CGCC	2	8	246049	246056	0 %	0 %	25 %	75 %	357383325
5025	NC_016078	CGAC	2	8	246100	246107	25 %	0 %	25 %	50 %	357383325
5026	NC_016078	TCG	2	6	246150	246155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383325
5027	NC_016078	CCG	2	6	246177	246182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383325
5028	NC_016078	CCGC	2	8	246247	246254	0 %	0 %	25 %	75 %	357383326
5029	NC_016078	GC	3	6	246259	246264	0 %	0 %	50 %	50 %	357383326
5030	NC_016078	CGTT	2	8	246271	246278	0 %	50 %	25 %	25 %	357383326
5031	NC_016078	TCG	2	6	246334	246339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383326
5032	NC_016078	CAG	2	6	246462	246467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383326
5033	NC_016078	CGC	2	6	246509	246514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383326
5034	NC_016078	GAAG	2	8	246528	246535	50 %	0 %	50 %	0 %	357383326
5035	NC_016078	CCA	2	6	246554	246559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383326
5036	NC_016078	CGC	2	6	246596	246601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383326
5037	NC_016078	CGC	2	6	246626	246631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383326
5038	NC_016078	GTG	2	6	246654	246659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357383326
5039	NC_016078	GTG	2	6	246676	246681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357383326
5040	NC_016078	GCGCC	2	10	246707	246716	0 %	0 %	40 %	60 %	357383326
5041	NC_016078	GCC	2	6	246738	246743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383326
5042	NC_016078	CCG	2	6	246788	246793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383326
5043	NC_016078	CGC	2	6	246912	246917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383326
5044	NC_016078	GC	3	6	246923	246928	0 %	0 %	50 %	50 %	357383326
5045	NC_016078	TCA	2	6	246983	246988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383326
5046	NC_016078	TCCA	2	8	247074	247081	25 %	25 %	0 %	50 %	357383327
5047	NC_016078	CG	4	8	247141	247148	0 %	0 %	50 %	50 %	357383327
5048	NC_016078	AGG	2	6	247165	247170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357383327
5049	NC_016078	CAC	2	6	247277	247282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383327
5050	NC_016078	CGC	2	6	247292	247297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383327
5051	NC_016078	TG	3	6	247393	247398	0 %	50 %	50 %	0 %	357383327
5052	NC_016078	TTC	2	6	247415	247420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357383327
5053	NC_016078	GCAGG	2	10	247502	247511	20 %	0 %	60 %	20 %	357383327
5054	NC_016078	GC	3	6	247575	247580	0 %	0 %	50 %	50 %	357383327
5055	NC_016078	GCG	2	6	247610	247615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383327
5056	NC_016078	CCATGC	2	12	247666	247677	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	357383327
5057	NC_016078	ATC	2	6	247680	247685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383327
5058	NC_016078	GAT	2	6	247694	247699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357383327
5059	NC_016078	CGC	2	6	247760	247765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383327
5060	NC_016078	TAA	2	6	247901	247906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357383328
5061	NC_016078	ATAA	2	8	247934	247941	75 %	25 %	0 %	0 %	357383328
5062	NC_016078	AT	3	6	247948	247953	50 %	50 %	0 %	0 %	357383328
5063	NC_016078	GGC	2	6	248041	248046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383329
5064	NC_016078	CGC	2	6	248055	248060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383329
5065	NC_016078	CGC	2	6	248149	248154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383329
5066	NC_016078	GCC	2	6	248203	248208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383329
5067	NC_016078	TCGC	2	8	248242	248249	0 %	25 %	25 %	50 %	357383329
5068	NC_016078	ATGCCG	2	12	248255	248266	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	357383329
5069	NC_016078	GC	3	6	248279	248284	0 %	0 %	50 %	50 %	357383329
5070	NC_016078	CG	3	6	248312	248317	0 %	0 %	50 %	50 %	357383329
5071	NC_016078	CGC	2	6	248346	248351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383329
5072	NC_016078	CTG	2	6	248395	248400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383329
5073	NC_016078	ACC	2	6	248513	248518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383329
5074	NC_016078	GCT	2	6	248520	248525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383329
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5076	NC_016078	CGC	2	6	248579	248584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383329
5077	NC_016078	GCG	2	6	248585	248590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383329
5078	NC_016078	CAT	2	6	248592	248597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383329
5079	NC_016078	CTC	2	6	248620	248625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357383329
5080	NC_016078	GCC	2	6	248626	248631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383329
5081	NC_016078	CACC	2	8	248637	248644	25 %	0 %	0 %	75 %	357383329
5082	NC_016078	CG	3	6	248648	248653	0 %	0 %	50 %	50 %	357383329
5083	NC_016078	GGT	2	6	248730	248735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357383329
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5086	NC_016078	CAC	2	6	248811	248816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383329
5087	NC_016078	GCC	2	6	248848	248853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383329
5088	NC_016078	GGT	2	6	248874	248879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357383329
5089	NC_016078	CGA	2	6	248884	248889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383329
5090	NC_016078	A	6	6	248964	248969	100 %	0 %	0 %	0 %	357383330
5091	NC_016078	CAT	2	6	249102	249107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383330
5092	NC_016078	A	6	6	249184	249189	100 %	0 %	0 %	0 %	357383330
5093	NC_016078	CCG	2	6	249241	249246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383330
5094	NC_016078	CGC	2	6	249253	249258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383330
5095	NC_016078	GGTC	2	8	249269	249276	0 %	25 %	50 %	25 %	357383330
5096	NC_016078	C	6	6	249318	249323	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5097	NC_016078	TCT	2	6	249324	249329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_016078	GCG	2	6	249356	249361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383331
5099	NC_016078	CGC	3	9	249382	249390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383331
5100	NC_016078	GC	5	10	249405	249414	0 %	0 %	50 %	50 %	357383331
5101	NC_016078	A	7	7	249449	249455	100 %	0 %	0 %	0 %	357383331
5102	NC_016078	CAG	2	6	249460	249465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383331
5103	NC_016078	ATC	2	6	249490	249495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383331
5104	NC_016078	CGAG	2	8	249530	249537	25 %	0 %	50 %	25 %	357383331
5105	NC_016078	GTG	2	6	249559	249564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357383331
5106	NC_016078	CCG	3	9	249581	249589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383331
5107	NC_016078	GTC	2	6	249591	249596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383331
5108	NC_016078	GCG	2	6	249607	249612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383331
5109	NC_016078	TCG	2	6	249617	249622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383331
5110	NC_016078	GCT	2	6	249691	249696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383331
5111	NC_016078	A	6	6	249742	249747	100 %	0 %	0 %	0 %	357383331
5112	NC_016078	CGCC	2	8	249794	249801	0 %	0 %	25 %	75 %	357383331
5113	NC_016078	TCTT	2	8	249913	249920	0 %	75 %	0 %	25 %	357383331
5114	NC_016078	TGT	2	6	249926	249931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357383331
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5117	NC_016078	CAA	2	6	250379	250384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357383332
5118	NC_016078	CGG	2	6	250393	250398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383332
5119	NC_016078	CGC	2	6	250439	250444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383332
5120	NC_016078	GGC	2	6	250454	250459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383332
5121	NC_016078	GC	3	6	250462	250467	0 %	0 %	50 %	50 %	357383332
5122	NC_016078	CCA	2	6	250492	250497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383332
5123	NC_016078	CG	3	6	250501	250506	0 %	0 %	50 %	50 %	357383332
5124	NC_016078	CAT	2	6	250508	250513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383332
5125	NC_016078	TCA	2	6	250546	250551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383332
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5127	NC_016078	CCA	2	6	250600	250605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383332
5128	NC_016078	GC	3	6	250612	250617	0 %	0 %	50 %	50 %	357383332
5129	NC_016078	CCA	2	6	250624	250629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383332
5130	NC_016078	GGT	2	6	250637	250642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357383332
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5132	NC_016078	CGGGG	2	10	250655	250664	0 %	0 %	80 %	20 %	357383332
5133	NC_016078	CAT	2	6	250688	250693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383332
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5162	NC_016078	GGC	2	6	251764	251769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5163	NC_016078	GC	3	6	251795	251800	0 %	0 %	50 %	50 %	357383333
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5177	NC_016078	GAA	2	6	252288	252293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5178	NC_016078	GC	3	6	252489	252494	0 %	0 %	50 %	50 %	357383334
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5186	NC_016078	GGC	2	6	252875	252880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5223	NC_016078	CTTC	2	8	254486	254493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5224	NC_016078	CT	4	8	254532	254539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5225	NC_016078	CGG	2	6	254674	254679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383337
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5227	NC_016078	CGC	3	9	254794	254802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383337
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5230	NC_016078	TC	3	6	254917	254922	0 %	50 %	0 %	50 %	357383337
5231	NC_016078	GGGGCA	2	12	254998	255009	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	357383337
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5234	NC_016078	TCG	3	9	255057	255065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383337
5235	NC_016078	CCG	2	6	255082	255087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383337
5236	NC_016078	GCTGCG	2	12	255171	255182	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	357383337
5237	NC_016078	CGATA	2	10	255199	255208	40 %	20 %	20 %	20 %	357383337
5238	NC_016078	GGC	2	6	255209	255214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383337
5239	NC_016078	GC	4	8	255213	255220	0 %	0 %	50 %	50 %	357383337
5240	NC_016078	TCG	3	9	255276	255284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383337
5241	NC_016078	CGA	2	6	255298	255303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383337
5242	NC_016078	GGC	2	6	255304	255309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383337
5243	NC_016078	CGC	2	6	255343	255348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383337
5244	NC_016078	GGC	2	6	255401	255406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383337
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5246	NC_016078	GTT	2	6	255590	255595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5368	NC_016078	CCT	2	6	260381	260386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357383341
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5370	NC_016078	CG	3	6	260428	260433	0 %	0 %	50 %	50 %	357383341
5371	NC_016078	ACT	2	6	260503	260508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383341
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5373	NC_016078	GCC	2	6	260587	260592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5374	NC_016078	TCCC	2	8	260594	260601	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5375	NC_016078	GCC	2	6	260636	260641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5376	NC_016078	CACC	2	8	260643	260650	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5377	NC_016078	GCT	2	6	260665	260670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5379	NC_016078	G	6	6	260703	260708	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5380	NC_016078	CTGG	2	8	260730	260737	0 %	25 %	50 %	25 %	357383342
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5403	NC_016078	GC	3	6	262011	262016	0 %	0 %	50 %	50 %	357383342
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5432	NC_016078	CGG	2	6	263460	263465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5433	NC_016078	TTTGT	2	10	263573	263582	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5436	NC_016078	CTG	2	6	263651	263656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5438	NC_016078	TCAT	2	8	263777	263784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5439	NC_016078	AGC	2	6	263827	263832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5451	NC_016078	CAGGG	2	10	264481	264490	20 %	0 %	60 %	20 %	357383344
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5457	NC_016078	CAGC	2	8	264840	264847	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5458	NC_016078	CCA	2	6	264923	264928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5459	NC_016078	CTC	2	6	264938	264943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5460	NC_016078	CGATC	2	10	264994	265003	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5461	NC_016078	CCCTCT	2	12	265009	265020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5477	NC_016078	TTG	2	6	265827	265832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357383345
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5479	NC_016078	GCG	2	6	265888	265893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357383345
5480	NC_016078	GTC	2	6	265916	265921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357383345
5481	NC_016078	ACC	2	6	265927	265932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383345
5482	NC_016078	AATGGC	2	12	266203	266214	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5483	NC_016078	TCCGC	2	10	266272	266281	0 %	20 %	20 %	60 %	357383346
5484	NC_016078	CCGC	2	8	266287	266294	0 %	0 %	25 %	75 %	357383346
5485	NC_016078	CG	3	6	266297	266302	0 %	0 %	50 %	50 %	357383346
5486	NC_016078	CCGC	2	8	266308	266315	0 %	0 %	25 %	75 %	357383346
5487	NC_016078	CCA	2	6	266342	266347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383346
5488	NC_016078	CAC	3	9	266390	266398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383346
5489	NC_016078	CG	3	6	266410	266415	0 %	0 %	50 %	50 %	357383346
5490	NC_016078	GC	3	6	266473	266478	0 %	0 %	50 %	50 %	357383346
5491	NC_016078	TTG	2	6	266547	266552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357383346
5492	NC_016078	AGC	2	6	266613	266618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383346
5493	NC_016078	ACC	2	6	266619	266624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357383346
5494	NC_016078	CAT	2	6	266639	266644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383346
5495	NC_016078	CAT	2	6	266672	266677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357383346
5496	NC_016078	GAC	2	6	266699	266704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357383346
5497	NC_016078	CCG	2	6	266713	266718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357383346
5498	NC_016078	CCGC	2	8	266841	266848	0 %	0 %	25 %	75 %	357383346
5499	NC_016078	TCGCC	2	10	266863	266872	0 %	20 %	20 %	60 %	357383346
5500	NC_016078	G	6	6	266917	266922	0 %	0 %	100 %	0 %	357383346

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