MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015733	CTC	2	6	6	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015733	GC	3	6	65	70	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015733	GC	3	6	125	130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015733	AGCA	2	8	159	166	50 %	0 %	25 %	25 %	339484942
5	NC_015733	TTG	2	6	220	225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339484942
6	NC_015733	ACA	2	6	385	390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339484942
7	NC_015733	TTC	2	6	417	422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339484942
8	NC_015733	CAGG	2	8	491	498	25 %	0 %	50 %	25 %	339484942
9	NC_015733	GCA	2	6	509	514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484942
10	NC_015733	CTG	2	6	582	587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484942
11	NC_015733	CAGGGC	2	12	597	608	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339484942
12	NC_015733	ATGGCG	2	12	658	669	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339484942
13	NC_015733	TCG	2	6	673	678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484942
14	NC_015733	CTG	2	6	720	725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484942
15	NC_015733	GC	3	6	730	735	0 %	0 %	50 %	50 %	339484942
16	NC_015733	GCG	2	6	738	743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484942
17	NC_015733	GAT	2	6	753	758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484942
18	NC_015733	ATCG	2	8	774	781	25 %	25 %	25 %	25 %	339484942
19	NC_015733	CAC	2	6	786	791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484942
20	NC_015733	TTCT	2	8	915	922	0 %	75 %	0 %	25 %	339484942
21	NC_015733	GC	3	6	950	955	0 %	0 %	50 %	50 %	339484942
22	NC_015733	GTT	2	6	1033	1038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339484943
23	NC_015733	GGCCAG	2	12	1083	1094	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339484943
24	NC_015733	GC	3	6	1103	1108	0 %	0 %	50 %	50 %	339484943
25	NC_015733	GTT	2	6	1239	1244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339484943
26	NC_015733	GCA	2	6	1274	1279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484943
27	NC_015733	GCG	2	6	1312	1317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484943
28	NC_015733	GAT	2	6	1383	1388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484943
29	NC_015733	GGC	2	6	1499	1504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484943
30	NC_015733	CAG	2	6	1524	1529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484943
31	NC_015733	CAC	2	6	1530	1535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484943
32	NC_015733	CGG	2	6	1538	1543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484943
33	NC_015733	GCA	2	6	1565	1570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484943
34	NC_015733	ACC	2	6	1578	1583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484943
35	NC_015733	TGG	2	6	1682	1687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484943
36	NC_015733	CAG	2	6	1713	1718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484943
37	NC_015733	ACG	2	6	1722	1727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484943
38	NC_015733	GGC	2	6	1746	1751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484943
39	NC_015733	GGT	3	9	1764	1772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484943
40	NC_015733	CAC	2	6	1781	1786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484943
41	NC_015733	TTG	2	6	1820	1825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015733	GT	3	6	1827	1832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015733	GCG	2	6	1848	1853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484944
44	NC_015733	CAG	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484944
45	NC_015733	TGC	2	6	2030	2035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484944
46	NC_015733	GAT	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484944
47	NC_015733	TCT	2	6	2156	2161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339484944
48	NC_015733	CCAG	2	8	2249	2256	25 %	0 %	25 %	50 %	339484944
49	NC_015733	CGCT	2	8	2263	2270	0 %	25 %	25 %	50 %	339484944
50	NC_015733	TCG	2	6	2323	2328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484944
51	NC_015733	CGG	2	6	2339	2344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484944
52	NC_015733	AGC	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484944
53	NC_015733	GC	3	6	2436	2441	0 %	0 %	50 %	50 %	339484944
54	NC_015733	T	6	6	2522	2527	0 %	100 %	0 %	0 %	339484945
55	NC_015733	CGC	2	6	2552	2557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484945
56	NC_015733	TCG	2	6	2650	2655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484945
57	NC_015733	CAGG	2	8	2671	2678	25 %	0 %	50 %	25 %	339484945
58	NC_015733	CTG	2	6	2717	2722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484945
59	NC_015733	CAC	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484945
60	NC_015733	GC	3	6	2834	2839	0 %	0 %	50 %	50 %	339484945
61	NC_015733	CAG	2	6	2840	2845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484945
62	NC_015733	TGGCC	2	10	2896	2905	0 %	20 %	40 %	40 %	339484945
63	NC_015733	GCT	2	6	2944	2949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484945
64	NC_015733	GGC	2	6	2984	2989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484945
65	NC_015733	TCG	2	6	3000	3005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484945
66	NC_015733	GTC	2	6	3131	3136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484945
67	NC_015733	TCG	2	6	3159	3164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484945
68	NC_015733	GGC	2	6	3203	3208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484945
69	NC_015733	CTT	2	6	3241	3246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339484945
70	NC_015733	GGT	2	6	3254	3259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484945
71	NC_015733	GAA	2	6	3278	3283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339484945
72	NC_015733	CCG	2	6	3288	3293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484945
73	NC_015733	CG	3	6	3325	3330	0 %	0 %	50 %	50 %	339484945
74	NC_015733	AGT	2	6	3337	3342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484945
75	NC_015733	TG	3	6	3373	3378	0 %	50 %	50 %	0 %	339484945
76	NC_015733	GGAT	2	8	3394	3401	25 %	25 %	50 %	0 %	339484945
77	NC_015733	GGT	2	6	3467	3472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484945
78	NC_015733	TGG	2	6	3498	3503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484945
79	NC_015733	TCGA	2	8	3537	3544	25 %	25 %	25 %	25 %	339484945
80	NC_015733	GAT	2	6	3614	3619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484945
81	NC_015733	GC	3	6	3629	3634	0 %	0 %	50 %	50 %	339484945
82	NC_015733	CAG	2	6	3651	3656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484945
83	NC_015733	TCA	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339484945
84	NC_015733	CGG	2	6	3770	3775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484945
85	NC_015733	GGC	2	6	3790	3795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484945
86	NC_015733	ACC	2	6	3860	3865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484945
87	NC_015733	GGT	2	6	3914	3919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484945
88	NC_015733	ACC	2	6	3924	3929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484945
89	NC_015733	GAA	2	6	3938	3943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339484945
90	NC_015733	CAC	2	6	3962	3967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484945
91	NC_015733	CGA	2	6	3988	3993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484945
92	NC_015733	GTC	2	6	3998	4003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484945
93	NC_015733	CTG	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484945
94	NC_015733	CAC	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484945
95	NC_015733	GTT	2	6	4121	4126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339484945
96	NC_015733	GCC	2	6	4175	4180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484945
97	NC_015733	CAG	2	6	4277	4282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484945
98	NC_015733	GCC	3	9	4334	4342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484945
99	NC_015733	GGGAA	2	10	4363	4372	40 %	0 %	60 %	0 %	339484945
100	NC_015733	CCA	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484945
101	NC_015733	A	6	6	4523	4528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015733	A	7	7	4710	4716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015733	TGAA	2	8	4782	4789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015733	A	7	7	4788	4794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015733	GCG	2	6	4861	4866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015733	A	8	8	4898	4905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015733	CAG	2	6	4985	4990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484946
108	NC_015733	TCA	2	6	4992	4997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339484946
109	NC_015733	CTG	2	6	5030	5035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484946
110	NC_015733	CCAG	2	8	5073	5080	25 %	0 %	25 %	50 %	339484946
111	NC_015733	CTGGC	2	10	5115	5124	0 %	20 %	40 %	40 %	339484946
112	NC_015733	CCG	2	6	5167	5172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484946
113	NC_015733	GGT	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484946
114	NC_015733	GCA	2	6	5209	5214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484946
115	NC_015733	CAC	2	6	5296	5301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484946
116	NC_015733	CCA	3	9	5410	5418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484946
117	NC_015733	ACA	2	6	5419	5424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339484946
118	NC_015733	GTG	2	6	5568	5573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484946
119	NC_015733	CAG	2	6	5621	5626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484946
120	NC_015733	GCA	2	6	5680	5685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484946
121	NC_015733	CGC	2	6	5801	5806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484946
122	NC_015733	GCGCA	2	10	5819	5828	20 %	0 %	40 %	40 %	339484946
123	NC_015733	GC	3	6	5894	5899	0 %	0 %	50 %	50 %	339484946
124	NC_015733	AGCC	2	8	6002	6009	25 %	0 %	25 %	50 %	339484946
125	NC_015733	CAAC	2	8	6012	6019	50 %	0 %	0 %	50 %	339484946
126	NC_015733	GCA	3	9	6034	6042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484946
127	NC_015733	ACC	2	6	6051	6056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484946
128	NC_015733	CCA	2	6	6060	6065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484946
129	NC_015733	TCG	2	6	6156	6161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484946
130	NC_015733	GGCC	2	8	6217	6224	0 %	0 %	50 %	50 %	339484946
131	NC_015733	GGC	2	6	6227	6232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484946
132	NC_015733	CCG	2	6	6264	6269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484946
133	NC_015733	GGC	2	6	6290	6295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484946
134	NC_015733	T	6	6	6377	6382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015733	AGC	3	9	6411	6419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339484947
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376	NC_015733	GC	3	6	16813	16818	0 %	0 %	50 %	50 %	339484955
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378	NC_015733	CCCTG	2	10	16894	16903	0 %	20 %	20 %	60 %	339484955
379	NC_015733	TGA	2	6	16959	16964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484955
380	NC_015733	GTG	2	6	17051	17056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339484955
381	NC_015733	GCG	2	6	17083	17088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484955
382	NC_015733	GGC	2	6	17110	17115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484955
383	NC_015733	GCC	2	6	17130	17135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339484955
384	NC_015733	TGT	2	6	17140	17145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339484955
385	NC_015733	GTC	2	6	17321	17326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
386	NC_015733	GCAT	2	8	17381	17388	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
387	NC_015733	CCT	2	6	17398	17403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
388	NC_015733	GAT	2	6	17452	17457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339484956
389	NC_015733	CAA	2	6	17464	17469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339484956
390	NC_015733	CCA	2	6	17505	17510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484956
391	NC_015733	ACC	2	6	17685	17690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339484956
392	NC_015733	CGG	3	9	17694	17702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484956
393	NC_015733	GGC	2	6	17723	17728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339484956
394	NC_015733	GC	3	6	17742	17747	0 %	0 %	50 %	50 %	339484956
395	NC_015733	GTT	2	6	17779	17784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339484956
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397	NC_015733	CA	3	6	17897	17902	50 %	0 %	0 %	50 %	339484956
398	NC_015733	TCG	2	6	17952	17957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339484956
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414	NC_015733	TCC	2	6	18666	18671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339484957
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500	NC_015733	GAA	2	6	22926	22931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339484960

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