MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_015733	GCAT	2	8	695376	695383	25 %	25 %	25 %	25 %	339485538
15002	NC_015733	GGCG	2	8	695449	695456	0 %	0 %	75 %	25 %	339485538
15003	NC_015733	CGGG	2	8	695536	695543	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15004	NC_015733	CGC	2	6	695569	695574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15005	NC_015733	GCT	2	6	695583	695588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15006	NC_015733	AAG	2	6	695637	695642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485539
15007	NC_015733	CCA	2	6	695704	695709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485539
15008	NC_015733	CCA	2	6	695738	695743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485539
15009	NC_015733	GC	3	6	695754	695759	0 %	0 %	50 %	50 %	339485539
15010	NC_015733	GCT	2	6	695885	695890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485539
15011	NC_015733	GGC	2	6	695891	695896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485539
15012	NC_015733	CAG	2	6	696137	696142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485539
15013	NC_015733	CTG	2	6	696195	696200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485539
15014	NC_015733	GCC	2	6	696202	696207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485539
15015	NC_015733	TGC	2	6	696229	696234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485539
15016	NC_015733	GCC	2	6	696292	696297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485539
15017	NC_015733	CTG	2	6	696423	696428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485539
15018	NC_015733	CGGC	2	8	696449	696456	0 %	0 %	50 %	50 %	339485539
15019	NC_015733	CCA	2	6	696473	696478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485539
15020	NC_015733	AGC	2	6	696493	696498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485539
15021	NC_015733	CGAT	2	8	696529	696536	25 %	25 %	25 %	25 %	339485539
15022	NC_015733	CGC	3	9	696545	696553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485539
15023	NC_015733	GGCC	2	8	696649	696656	0 %	0 %	50 %	50 %	339485540
15024	NC_015733	ACG	2	6	696756	696761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485540
15025	NC_015733	GCCC	2	8	696762	696769	0 %	0 %	25 %	75 %	339485540
15026	NC_015733	CCG	2	6	696939	696944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485540
15027	NC_015733	CGC	2	6	696973	696978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485540
15028	NC_015733	AGA	2	6	696996	697001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485540
15029	NC_015733	CAAG	2	8	697105	697112	50 %	0 %	25 %	25 %	339485540
15030	NC_015733	GGCCGA	2	12	697171	697182	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339485540
15031	NC_015733	GCTG	2	8	697249	697256	0 %	25 %	50 %	25 %	339485540
15032	NC_015733	ACC	3	9	697307	697315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485540
15033	NC_015733	CTG	2	6	697394	697399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485540
15034	NC_015733	GTG	2	6	697574	697579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485540
15035	NC_015733	CTC	2	6	697582	697587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339485540
15036	NC_015733	GAC	2	6	697604	697609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485540
15037	NC_015733	ACG	2	6	697641	697646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485540
15038	NC_015733	TTC	2	6	697697	697702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485540
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15040	NC_015733	TCG	2	6	697737	697742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485540
15041	NC_015733	GC	3	6	697761	697766	0 %	0 %	50 %	50 %	339485540
15042	NC_015733	CTG	2	6	697804	697809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485540
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15045	NC_015733	GC	3	6	697900	697905	0 %	0 %	50 %	50 %	339485540
15046	NC_015733	GC	3	6	697952	697957	0 %	0 %	50 %	50 %	339485540
15047	NC_015733	GAT	2	6	697966	697971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485540
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15049	NC_015733	CGC	2	6	698140	698145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485540
15050	NC_015733	CTG	2	6	698150	698155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485540
15051	NC_015733	ACC	2	6	698219	698224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485540
15052	NC_015733	TGC	2	6	698235	698240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485540
15053	NC_015733	GCCAC	2	10	698259	698268	20 %	0 %	20 %	60 %	339485540
15054	NC_015733	CAA	2	6	698461	698466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485540
15055	NC_015733	GCAGC	2	10	698548	698557	20 %	0 %	40 %	40 %	339485540
15056	NC_015733	CCG	2	6	698569	698574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485540
15057	NC_015733	CTG	3	9	698690	698698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485540
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15061	NC_015733	TCGC	2	8	698841	698848	0 %	25 %	25 %	50 %	339485540
15062	NC_015733	CGA	2	6	698926	698931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485540
15063	NC_015733	GAGC	2	8	698998	699005	25 %	0 %	50 %	25 %	339485540
15064	NC_015733	GGTA	2	8	699010	699017	25 %	25 %	50 %	0 %	339485540
15065	NC_015733	CAA	2	6	699070	699075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485540
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15070	NC_015733	GCCG	2	8	699241	699248	0 %	0 %	50 %	50 %	339485540
15071	NC_015733	TGG	2	6	699475	699480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485541
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15078	NC_015733	CGGCG	2	10	699590	699599	0 %	0 %	60 %	40 %	339485541
15079	NC_015733	GCTG	2	8	699634	699641	0 %	25 %	50 %	25 %	339485541
15080	NC_015733	GTG	2	6	699657	699662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485541
15081	NC_015733	CTGG	2	8	699713	699720	0 %	25 %	50 %	25 %	339485541
15082	NC_015733	TGGCGC	2	12	699724	699735	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339485541
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15085	NC_015733	TGAC	2	8	699929	699936	25 %	25 %	25 %	25 %	339485541
15086	NC_015733	CTG	2	6	700057	700062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485542
15087	NC_015733	CGT	2	6	700113	700118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485542
15088	NC_015733	GCCA	2	8	700142	700149	25 %	0 %	25 %	50 %	339485542
15089	NC_015733	ATC	2	6	700219	700224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485542
15090	NC_015733	ACG	2	6	700229	700234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485542
15091	NC_015733	GAC	2	6	700276	700281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485542
15092	NC_015733	TGGC	2	8	700310	700317	0 %	25 %	50 %	25 %	339485542
15093	NC_015733	CG	3	6	700449	700454	0 %	0 %	50 %	50 %	339485543
15094	NC_015733	CCG	2	6	700470	700475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485543
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15099	NC_015733	GTCATC	2	12	700578	700589	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339485543
15100	NC_015733	GCT	2	6	700629	700634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485543
15101	NC_015733	ACG	2	6	700780	700785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485543
15102	NC_015733	TCG	2	6	700810	700815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485543
15103	NC_015733	GAG	2	6	700821	700826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339485543
15104	NC_015733	ACC	2	6	700858	700863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485543
15105	NC_015733	GAC	2	6	700896	700901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485543
15106	NC_015733	TGCG	2	8	700924	700931	0 %	25 %	50 %	25 %	339485543
15107	NC_015733	GGC	2	6	700947	700952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485543
15108	NC_015733	TGG	2	6	701035	701040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485543
15109	NC_015733	CTCCAA	2	12	701057	701068	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	339485543
15110	NC_015733	GCGTG	2	10	701207	701216	0 %	20 %	60 %	20 %	339485543
15111	NC_015733	AGC	2	6	701221	701226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485543
15112	NC_015733	CACC	2	8	701333	701340	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15113	NC_015733	TG	3	6	701368	701373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_015733	T	7	7	701433	701439	0 %	100 %	0 %	0 %	339485544
15115	NC_015733	GCT	2	6	701588	701593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485544
15116	NC_015733	GCT	2	6	701633	701638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485544
15117	NC_015733	GCA	2	6	701642	701647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485544
15118	NC_015733	GGCT	2	8	701719	701726	0 %	25 %	50 %	25 %	339485544
15119	NC_015733	CATGG	2	10	701733	701742	20 %	20 %	40 %	20 %	339485544
15120	NC_015733	GC	3	6	701745	701750	0 %	0 %	50 %	50 %	339485544
15121	NC_015733	GCC	2	6	701785	701790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485544
15122	NC_015733	GTC	2	6	701799	701804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485544
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15125	NC_015733	CGG	2	6	701954	701959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15345	NC_015733	A	7	7	711264	711270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15349	NC_015733	GC	3	6	711499	711504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15350	NC_015733	CCA	2	6	711630	711635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15351	NC_015733	GC	3	6	711705	711710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15352	NC_015733	A	7	7	711843	711849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15353	NC_015733	T	7	7	711872	711878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15354	NC_015733	CA	3	6	711916	711921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15355	NC_015733	TG	3	6	711926	711931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15356	NC_015733	GCA	2	6	711956	711961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15357	NC_015733	CAT	2	6	712068	712073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485555
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15360	NC_015733	CCG	2	6	712199	712204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485555
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15362	NC_015733	CTG	2	6	712308	712313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485555
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15396	NC_015733	AGC	2	6	713391	713396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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