MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_015733	CGG	2	6	623200	623205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485483
13502	NC_015733	TGG	2	6	623228	623233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485483
13503	NC_015733	ATG	2	6	623317	623322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485483
13504	NC_015733	TC	3	6	623323	623328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13505	NC_015733	AC	3	6	623336	623341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13506	NC_015733	GCG	2	6	623392	623397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485484
13507	NC_015733	CTT	2	6	623408	623413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485484
13508	NC_015733	TGC	2	6	623434	623439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485484
13509	NC_015733	CGG	2	6	623457	623462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485484
13510	NC_015733	GC	4	8	623524	623531	0 %	0 %	50 %	50 %	339485484
13511	NC_015733	GTC	2	6	623553	623558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485484
13512	NC_015733	CTT	2	6	623612	623617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485484
13513	NC_015733	GCG	2	6	623650	623655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485484
13514	NC_015733	GCG	2	6	623684	623689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485484
13515	NC_015733	TTC	2	6	623740	623745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485484
13516	NC_015733	GC	3	6	623756	623761	0 %	0 %	50 %	50 %	339485484
13517	NC_015733	TCG	2	6	623770	623775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485484
13518	NC_015733	CAGA	2	8	623777	623784	50 %	0 %	25 %	25 %	339485484
13519	NC_015733	GCGG	2	8	623895	623902	0 %	0 %	75 %	25 %	339485484
13520	NC_015733	GGT	2	6	623937	623942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485484
13521	NC_015733	GGT	2	6	623954	623959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485484
13522	NC_015733	CTG	2	6	624042	624047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485484
13523	NC_015733	CCA	3	9	624059	624067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485484
13524	NC_015733	TGG	2	6	624084	624089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485484
13525	NC_015733	AGC	2	6	624142	624147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485484
13526	NC_015733	GCA	2	6	624167	624172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485484
13527	NC_015733	TGC	2	6	624296	624301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485484
13528	NC_015733	CAG	2	6	624381	624386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485484
13529	NC_015733	TTCGCC	2	12	624387	624398	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	339485484
13530	NC_015733	CA	3	6	624430	624435	50 %	0 %	0 %	50 %	339485484
13531	NC_015733	GTC	2	6	624684	624689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485484
13532	NC_015733	GCTT	2	8	624718	624725	0 %	50 %	25 %	25 %	339485484
13533	NC_015733	CGG	2	6	624745	624750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485484
13534	NC_015733	GGT	2	6	624786	624791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485484
13535	NC_015733	GCG	2	6	624820	624825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485484
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13537	NC_015733	CAGG	2	8	624989	624996	25 %	0 %	50 %	25 %	339485484
13538	NC_015733	CGG	2	6	625005	625010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485484
13539	NC_015733	AGC	2	6	625012	625017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485484
13540	NC_015733	CGC	2	6	625028	625033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485484
13541	NC_015733	GGC	2	6	625035	625040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485484
13542	NC_015733	AGC	2	6	625042	625047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485484
13543	NC_015733	CTGCA	2	10	625167	625176	20 %	20 %	20 %	40 %	339485484
13544	NC_015733	TCT	2	6	625254	625259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485485
13545	NC_015733	TTC	2	6	625375	625380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13546	NC_015733	TCT	2	6	625492	625497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13547	NC_015733	TTC	2	6	625613	625618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13548	NC_015733	GAT	2	6	625806	625811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485486
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13550	NC_015733	TTG	3	9	625828	625836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485486
13551	NC_015733	CTC	2	6	625842	625847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339485486
13552	NC_015733	GAA	2	6	626001	626006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485486
13553	NC_015733	CTC	2	6	626022	626027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339485486
13554	NC_015733	CCA	2	6	626036	626041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485486
13555	NC_015733	TTG	2	6	626095	626100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485486
13556	NC_015733	CCA	2	6	626156	626161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485486
13557	NC_015733	CTGG	2	8	626172	626179	0 %	25 %	50 %	25 %	339485486
13558	NC_015733	CAC	2	6	626187	626192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485486
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13560	NC_015733	GCGCC	2	10	626255	626264	0 %	0 %	40 %	60 %	339485486
13561	NC_015733	GCC	2	6	626266	626271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485486
13562	NC_015733	CA	3	6	626276	626281	50 %	0 %	0 %	50 %	339485486
13563	NC_015733	ACC	3	9	626317	626325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485486
13564	NC_015733	CTT	2	6	626349	626354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485486
13565	NC_015733	GCAT	2	8	626359	626366	25 %	25 %	25 %	25 %	339485486
13566	NC_015733	CAG	2	6	626430	626435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485486
13567	NC_015733	TCA	2	6	626477	626482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485486
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13570	NC_015733	GGTGC	2	10	626675	626684	0 %	20 %	60 %	20 %	339485486
13571	NC_015733	CGGC	2	8	626786	626793	0 %	0 %	50 %	50 %	339485486
13572	NC_015733	CGG	2	6	626837	626842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485486
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13586	NC_015733	CGC	2	6	627381	627386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485487
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13588	NC_015733	GGT	2	6	627426	627431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485487
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13594	NC_015733	GCG	2	6	627606	627611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485487
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13597	NC_015733	CGA	2	6	627708	627713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485487
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13602	NC_015733	TCA	2	6	627809	627814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485487
13603	NC_015733	AC	3	6	627837	627842	50 %	0 %	0 %	50 %	339485487
13604	NC_015733	GCT	3	9	627862	627870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485487
13605	NC_015733	TCG	2	6	627899	627904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485487
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13607	NC_015733	GC	3	6	628148	628153	0 %	0 %	50 %	50 %	339485488
13608	NC_015733	CCA	2	6	628169	628174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485488
13609	NC_015733	GC	3	6	628175	628180	0 %	0 %	50 %	50 %	339485488
13610	NC_015733	TCG	2	6	628216	628221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485488
13611	NC_015733	CAC	2	6	628224	628229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485488
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13614	NC_015733	GGC	2	6	628338	628343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485488
13615	NC_015733	CGT	2	6	628388	628393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485488
13616	NC_015733	ACGGT	2	10	628424	628433	20 %	20 %	40 %	20 %	339485488
13617	NC_015733	AGC	2	6	628471	628476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485488
13618	NC_015733	AGA	2	6	628487	628492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485488
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13978	NC_015733	CACT	2	8	644144	644151	25 %	25 %	0 %	50 %	339485499
13979	NC_015733	CGG	2	6	644184	644189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485499
13980	NC_015733	GCT	2	6	644206	644211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485499
13981	NC_015733	TGA	2	6	644222	644227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485499
13982	NC_015733	GCC	2	6	644248	644253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485500
13983	NC_015733	CCGA	2	8	644267	644274	25 %	0 %	25 %	50 %	339485500
13984	NC_015733	CTG	2	6	644374	644379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485500
13985	NC_015733	GGC	2	6	644454	644459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485500
13986	NC_015733	GGC	2	6	644461	644466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485500
13987	NC_015733	CGG	2	6	644498	644503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485500
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13993	NC_015733	GCC	2	6	644977	644982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13994	NC_015733	CTT	2	6	645075	645080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13997	NC_015733	AGC	2	6	645171	645176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485501
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13999	NC_015733	ACC	2	6	645248	645253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485501
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