MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015733	GCG	2	6	602269	602274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485463
13002	NC_015733	CAAGGA	2	12	602299	602310	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	339485463
13003	NC_015733	CGA	2	6	602317	602322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485463
13004	NC_015733	GC	4	8	602359	602366	0 %	0 %	50 %	50 %	339485463
13005	NC_015733	TGG	2	6	602376	602381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485463
13006	NC_015733	GGT	2	6	602383	602388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485463
13007	NC_015733	GGT	2	6	602404	602409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485463
13008	NC_015733	GT	4	8	602408	602415	0 %	50 %	50 %	0 %	339485463
13009	NC_015733	T	6	6	602482	602487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_015733	GC	4	8	602545	602552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13011	NC_015733	GCC	2	6	602628	602633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13012	NC_015733	ATTC	2	8	602725	602732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13013	NC_015733	GAA	2	6	602737	602742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_015733	TGC	3	9	602785	602793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_015733	TGT	2	6	602833	602838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_015733	GGCC	2	8	602842	602849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13017	NC_015733	GGT	2	6	602882	602887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_015733	AGA	2	6	602965	602970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485464
13019	NC_015733	CACC	2	8	603019	603026	25 %	0 %	0 %	75 %	339485464
13020	NC_015733	GATG	2	8	603124	603131	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_015733	TGA	2	6	603155	603160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_015733	GT	3	6	603291	603296	0 %	50 %	50 %	0 %	339485465
13023	NC_015733	GGT	2	6	603297	603302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485465
13024	NC_015733	GC	4	8	603331	603338	0 %	0 %	50 %	50 %	339485465
13025	NC_015733	TGG	3	9	603365	603373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485465
13026	NC_015733	GGCG	2	8	603375	603382	0 %	0 %	75 %	25 %	339485465
13027	NC_015733	GCAA	2	8	603482	603489	50 %	0 %	25 %	25 %	339485465
13028	NC_015733	TCG	2	6	603548	603553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485465
13029	NC_015733	CTG	2	6	603589	603594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485465
13030	NC_015733	CGC	2	6	603681	603686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485465
13031	NC_015733	CAT	2	6	603708	603713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485465
13032	NC_015733	CG	3	6	603798	603803	0 %	0 %	50 %	50 %	339485465
13033	NC_015733	GCCGA	2	10	603841	603850	20 %	0 %	40 %	40 %	339485465
13034	NC_015733	CTAT	2	8	603951	603958	25 %	50 %	0 %	25 %	339485465
13035	NC_015733	CG	3	6	603988	603993	0 %	0 %	50 %	50 %	339485465
13036	NC_015733	GGC	2	6	604063	604068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485465
13037	NC_015733	GC	3	6	604072	604077	0 %	0 %	50 %	50 %	339485465
13038	NC_015733	GTGG	2	8	604095	604102	0 %	25 %	75 %	0 %	339485465
13039	NC_015733	CGG	2	6	604244	604249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485465
13040	NC_015733	TCA	2	6	604259	604264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485465
13041	NC_015733	TGC	2	6	604358	604363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485465
13042	NC_015733	TGC	2	6	604419	604424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485466
13043	NC_015733	TCA	2	6	604461	604466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485466
13044	NC_015733	TGG	2	6	604497	604502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485466
13045	NC_015733	CATTT	2	10	604541	604550	20 %	60 %	0 %	20 %	339485466
13046	NC_015733	CCA	3	9	604554	604562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485466
13047	NC_015733	TGG	2	6	604566	604571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485466
13048	NC_015733	CTG	2	6	604601	604606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485466
13049	NC_015733	CGA	2	6	604639	604644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485466
13050	NC_015733	TGA	2	6	604714	604719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485466
13051	NC_015733	CGC	2	6	604727	604732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485466
13052	NC_015733	G	6	6	604769	604774	0 %	0 %	100 %	0 %	339485466
13053	NC_015733	TCT	2	6	604804	604809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485466
13054	NC_015733	CGG	2	6	604963	604968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485466
13055	NC_015733	ATC	2	6	604979	604984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485466
13056	NC_015733	GCA	2	6	605013	605018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485466
13057	NC_015733	TGC	2	6	605048	605053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485466
13058	NC_015733	GTT	2	6	605061	605066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485466
13059	NC_015733	CAC	2	6	605137	605142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485467
13060	NC_015733	CGT	2	6	605143	605148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485467
13061	NC_015733	CGG	2	6	605161	605166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485467
13062	NC_015733	GCGCAG	2	12	605231	605242	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339485467
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13064	NC_015733	GC	3	6	605372	605377	0 %	0 %	50 %	50 %	339485467
13065	NC_015733	GGCTTC	2	12	605411	605422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485467
13066	NC_015733	CGC	2	6	605456	605461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485467
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13069	NC_015733	CAG	2	6	605543	605548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485467
13070	NC_015733	CGC	2	6	605620	605625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485467
13071	NC_015733	CCAG	2	8	605630	605637	25 %	0 %	25 %	50 %	339485467
13072	NC_015733	TGC	2	6	605656	605661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485467
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13075	NC_015733	CCCA	2	8	605735	605742	25 %	0 %	0 %	75 %	339485467
13076	NC_015733	G	6	6	605745	605750	0 %	0 %	100 %	0 %	339485467
13077	NC_015733	TTG	2	6	605800	605805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485467
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13079	NC_015733	TGC	2	6	605902	605907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485467
13080	NC_015733	CAT	2	6	605930	605935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485467
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13082	NC_015733	CAG	2	6	606005	606010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485467
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13087	NC_015733	GA	3	6	606319	606324	50 %	0 %	50 %	0 %	339485468
13088	NC_015733	A	6	6	606324	606329	100 %	0 %	0 %	0 %	339485468
13089	NC_015733	CAG	2	6	606419	606424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485469
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13092	NC_015733	TCC	2	6	606537	606542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339485469
13093	NC_015733	CATGC	2	10	606554	606563	20 %	20 %	20 %	40 %	339485469
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13096	NC_015733	GTCCGG	2	12	606737	606748	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339485469
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13100	NC_015733	GC	3	6	606898	606903	0 %	0 %	50 %	50 %	339485469
13101	NC_015733	GCCA	2	8	606908	606915	25 %	0 %	25 %	50 %	339485469
13102	NC_015733	TGC	2	6	606940	606945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485469
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13105	NC_015733	CGT	2	6	606985	606990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485469
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13109	NC_015733	CGGCAA	2	12	607213	607224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485469
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13118	NC_015733	CTT	2	6	607574	607579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485469
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13120	NC_015733	GAT	2	6	607841	607846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485469
13121	NC_015733	ATGG	2	8	607856	607863	25 %	25 %	50 %	0 %	339485469
13122	NC_015733	CTG	2	6	607871	607876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485469
13123	NC_015733	GC	3	6	607967	607972	0 %	0 %	50 %	50 %	339485469
13124	NC_015733	GC	4	8	608071	608078	0 %	0 %	50 %	50 %	339485469
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13128	NC_015733	ATC	2	6	608233	608238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13131	NC_015733	GC	4	8	608591	608598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13132	NC_015733	A	6	6	608611	608616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13161	NC_015733	A	7	7	609580	609586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13228	NC_015733	TGA	2	6	612411	612416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485474
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13230	NC_015733	TGC	2	6	612482	612487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13232	NC_015733	GGT	2	6	612568	612573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485475
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13234	NC_015733	CAG	2	6	612838	612843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485475
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13240	NC_015733	CGA	3	9	612993	613001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485475
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13242	NC_015733	GCA	2	6	613044	613049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485475
13243	NC_015733	GGC	2	6	613117	613122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485475
13244	NC_015733	GCA	2	6	613128	613133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485475
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13247	NC_015733	GCCA	2	8	613310	613317	25 %	0 %	25 %	50 %	339485475
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13330	NC_015733	TGG	2	6	616270	616275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13331	NC_015733	GGCCT	2	10	616367	616376	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13332	NC_015733	AAGC	2	8	616420	616427	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13333	NC_015733	AGA	2	6	616476	616481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485478
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13347	NC_015733	TCT	2	6	616941	616946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485478
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13349	NC_015733	GGTGTC	2	12	616981	616992	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339485478
13350	NC_015733	CGC	2	6	617001	617006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485478
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13352	NC_015733	CTT	2	6	617023	617028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485478
13353	NC_015733	CAC	2	6	617032	617037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485478
13354	NC_015733	GAA	2	6	617110	617115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485478
13355	NC_015733	GCC	2	6	617135	617140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485478
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13357	NC_015733	GCC	2	6	617200	617205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485478
13358	NC_015733	GAT	2	6	617224	617229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485478
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13482	NC_015733	GGT	2	6	622369	622374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485482
13483	NC_015733	TGC	2	6	622418	622423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485482
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