MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015733	CGC	2	6	578657	578662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485434
12502	NC_015733	AGGC	2	8	578690	578697	25 %	0 %	50 %	25 %	339485434
12503	NC_015733	CGC	2	6	578729	578734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485434
12504	NC_015733	GCA	2	6	578772	578777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485434
12505	NC_015733	CG	3	6	578825	578830	0 %	0 %	50 %	50 %	339485434
12506	NC_015733	GC	3	6	578835	578840	0 %	0 %	50 %	50 %	339485434
12507	NC_015733	GCC	2	6	578847	578852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485434
12508	NC_015733	CGG	2	6	578902	578907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485435
12509	NC_015733	GTT	2	6	578941	578946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485435
12510	NC_015733	CGA	2	6	578974	578979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485435
12511	NC_015733	ACC	2	6	579015	579020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485435
12512	NC_015733	GGCT	2	8	579079	579086	0 %	25 %	50 %	25 %	339485435
12513	NC_015733	GTG	2	6	579095	579100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485435
12514	NC_015733	CCA	2	6	579154	579159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485435
12515	NC_015733	GCG	2	6	579239	579244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485435
12516	NC_015733	CAA	2	6	579253	579258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485435
12517	NC_015733	CGT	2	6	579356	579361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485435
12518	NC_015733	GGT	2	6	579379	579384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485435
12519	NC_015733	CTT	2	6	579391	579396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485435
12520	NC_015733	TCT	2	6	579453	579458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485435
12521	NC_015733	AGC	2	6	579567	579572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485435
12522	NC_015733	GAG	2	6	579581	579586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339485435
12523	NC_015733	GCT	2	6	579631	579636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485435
12524	NC_015733	GGT	2	6	579652	579657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485435
12525	NC_015733	CGG	2	6	579669	579674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485435
12526	NC_015733	GGC	2	6	579685	579690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485435
12527	NC_015733	TTG	2	6	579734	579739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485435
12528	NC_015733	TGG	2	6	579815	579820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_015733	GCA	2	6	579924	579929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_015733	CAC	2	6	579951	579956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485436
12531	NC_015733	GCC	2	6	579976	579981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485436
12532	NC_015733	CCA	2	6	580043	580048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485436
12533	NC_015733	CGCC	2	8	580064	580071	0 %	0 %	25 %	75 %	339485436
12534	NC_015733	C	6	6	580088	580093	0 %	0 %	0 %	100 %	339485436
12535	NC_015733	ACC	3	9	580108	580116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485436
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12538	NC_015733	TTC	2	6	580237	580242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485436
12539	NC_015733	TTC	2	6	580255	580260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485436
12540	NC_015733	ATC	2	6	580306	580311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485436
12541	NC_015733	ATC	2	6	580400	580405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12542	NC_015733	CTG	3	9	580515	580523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485437
12543	NC_015733	TGGCG	2	10	580598	580607	0 %	20 %	60 %	20 %	339485437
12544	NC_015733	CAG	3	9	580608	580616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485437
12545	NC_015733	GTT	2	6	580661	580666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485437
12546	NC_015733	CTG	2	6	580707	580712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485437
12547	NC_015733	TGC	2	6	580780	580785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485437
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12549	NC_015733	TGC	2	6	580841	580846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485437
12550	NC_015733	GCC	2	6	580854	580859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485437
12551	NC_015733	CTG	2	6	580917	580922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485437
12552	NC_015733	CGGG	2	8	580936	580943	0 %	0 %	75 %	25 %	339485437
12553	NC_015733	CTGG	3	12	580953	580964	0 %	25 %	50 %	25 %	339485437
12554	NC_015733	GTT	2	6	580991	580996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485437
12555	NC_015733	TGC	2	6	580999	581004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485437
12556	NC_015733	TGC	2	6	581052	581057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485437
12557	NC_015733	AGTGG	2	10	581070	581079	20 %	20 %	60 %	0 %	339485437
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12559	NC_015733	CG	3	6	581187	581192	0 %	0 %	50 %	50 %	339485437
12560	NC_015733	GGC	2	6	581195	581200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485437
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12563	NC_015733	ACCG	2	8	581414	581421	25 %	0 %	25 %	50 %	339485438
12564	NC_015733	TGC	2	6	581451	581456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485438
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12568	NC_015733	GCT	2	6	581578	581583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485438
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12574	NC_015733	GGT	2	6	581798	581803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485438
12575	NC_015733	GCCT	2	8	581831	581838	0 %	25 %	25 %	50 %	339485438
12576	NC_015733	AGCG	2	8	581861	581868	25 %	0 %	50 %	25 %	339485438
12577	NC_015733	GCG	2	6	581883	581888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485438
12578	NC_015733	AGT	2	6	581937	581942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_015733	TCTCA	2	10	582016	582025	20 %	40 %	0 %	40 %	339485439
12580	NC_015733	GCT	2	6	582081	582086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485439
12581	NC_015733	CGGTGG	2	12	582186	582197	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	339485439
12582	NC_015733	GTA	2	6	582216	582221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485439
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12584	NC_015733	GGT	2	6	582240	582245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485439
12585	NC_015733	CTT	2	6	582251	582256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485439
12586	NC_015733	CTG	2	6	582297	582302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485439
12587	NC_015733	CTG	2	6	582339	582344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485439
12588	NC_015733	GC	3	6	582345	582350	0 %	0 %	50 %	50 %	339485439
12589	NC_015733	CGG	2	6	582351	582356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485439
12590	NC_015733	CGG	2	6	582365	582370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485439
12591	NC_015733	GGGC	2	8	582449	582456	0 %	0 %	75 %	25 %	339485439
12592	NC_015733	AGC	2	6	582505	582510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485439
12593	NC_015733	AGT	3	9	582517	582525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485439
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12596	NC_015733	GAT	2	6	582750	582755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485440
12597	NC_015733	CAAGC	2	10	582858	582867	40 %	0 %	20 %	40 %	339485440
12598	NC_015733	CCG	2	6	582884	582889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485440
12599	NC_015733	CCAGCA	2	12	582905	582916	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	339485440
12600	NC_015733	GCG	2	6	582972	582977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485440
12601	NC_015733	CAC	2	6	583029	583034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485440
12602	NC_015733	AAC	2	6	583051	583056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485440
12603	NC_015733	GGC	2	6	583209	583214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485440
12604	NC_015733	GCC	2	6	583311	583316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485440
12605	NC_015733	GTC	2	6	583389	583394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485440
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12607	NC_015733	ATC	2	6	583503	583508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485440
12608	NC_015733	CG	3	6	583515	583520	0 %	0 %	50 %	50 %	339485440
12609	NC_015733	GGC	3	9	583544	583552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485440
12610	NC_015733	TGT	2	6	583688	583693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485440
12611	NC_015733	TGG	2	6	583694	583699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485440
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12613	NC_015733	CGA	2	6	583757	583762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485440
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12615	NC_015733	GCG	2	6	583884	583889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485440
12616	NC_015733	CAAGG	2	10	583905	583914	40 %	0 %	40 %	20 %	339485440
12617	NC_015733	GGC	2	6	583946	583951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485441
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12619	NC_015733	CAG	2	6	584021	584026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485441
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