MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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122002	NC_015733	GCA	2	6	5630499	5630504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489837
122003	NC_015733	AACA	2	8	5630545	5630552	75 %	0 %	0 %	25 %	339489837
122004	NC_015733	AGC	2	6	5630639	5630644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489837
122005	NC_015733	CCGC	2	8	5630686	5630693	0 %	0 %	25 %	75 %	339489838
122006	NC_015733	AGGGCC	2	12	5630713	5630724	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339489838
122007	NC_015733	CAT	2	6	5630732	5630737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489838
122008	NC_015733	GAAGGC	2	12	5630775	5630786	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	339489838
122009	NC_015733	CTGG	2	8	5630828	5630835	0 %	25 %	50 %	25 %	339489838
122010	NC_015733	CGG	2	6	5630947	5630952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489838
122011	NC_015733	GAA	2	6	5630966	5630971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339489838
122012	NC_015733	CG	3	6	5630995	5631000	0 %	0 %	50 %	50 %	339489838
122013	NC_015733	AGC	2	6	5631049	5631054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489838
122014	NC_015733	GTG	2	6	5631063	5631068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339489838
122015	NC_015733	CCA	2	6	5631086	5631091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489838
122016	NC_015733	CTG	2	6	5631096	5631101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489838
122017	NC_015733	CTG	2	6	5631117	5631122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489838
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122021	NC_015733	CG	3	6	5631457	5631462	0 %	0 %	50 %	50 %	339489839
122022	NC_015733	CTG	2	6	5631550	5631555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489839
122023	NC_015733	GCA	3	9	5631563	5631571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489839
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122045	NC_015733	TCG	2	6	5632812	5632817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489840
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122112	NC_015733	CTG	2	6	5636715	5636720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489843
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122114	NC_015733	TCCC	2	8	5636908	5636915	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
122115	NC_015733	CGC	2	6	5636925	5636930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122116	NC_015733	CGACCT	2	12	5636967	5636978	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339489844
122117	NC_015733	GCG	2	6	5636980	5636985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489844
122118	NC_015733	GCG	3	9	5637031	5637039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489844
122119	NC_015733	GCG	2	6	5637042	5637047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489844
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122123	NC_015733	GCT	2	6	5637159	5637164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489844
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122219	NC_015733	ATC	2	6	5641187	5641192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489848
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122226	NC_015733	TG	3	6	5641459	5641464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122227	NC_015733	GCA	2	6	5641518	5641523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122228	NC_015733	AC	3	6	5641621	5641626	50 %	0 %	0 %	50 %	339489849
122229	NC_015733	CA	3	6	5641666	5641671	50 %	0 %	0 %	50 %	339489849
122230	NC_015733	GCCC	2	8	5641684	5641691	0 %	0 %	25 %	75 %	339489849
122231	NC_015733	CTG	2	6	5641712	5641717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489849
122232	NC_015733	CAC	2	6	5641738	5641743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489849
122233	NC_015733	GTG	2	6	5641761	5641766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339489849
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122235	NC_015733	GC	3	6	5641826	5641831	0 %	0 %	50 %	50 %	339489849
122236	NC_015733	CCCG	2	8	5641841	5641848	0 %	0 %	25 %	75 %	339489849
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122265	NC_015733	CT	4	8	5643387	5643394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122266	NC_015733	TCA	2	6	5643400	5643405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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122315	NC_015733	CG	3	6	5645524	5645529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122316	NC_015733	GCC	2	6	5645616	5645621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122317	NC_015733	GC	3	6	5645698	5645703	0 %	0 %	50 %	50 %	339489853
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122327	NC_015733	CGA	2	6	5646157	5646162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489853
122328	NC_015733	AGCGC	2	10	5646180	5646189	20 %	0 %	40 %	40 %	339489853
122329	NC_015733	CCAC	2	8	5646294	5646301	25 %	0 %	0 %	75 %	339489853
122330	NC_015733	GTT	2	6	5646316	5646321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339489853
122331	NC_015733	GCCG	2	8	5646329	5646336	0 %	0 %	50 %	50 %	339489853
122332	NC_015733	TCG	2	6	5646342	5646347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489853
122333	NC_015733	CTA	2	6	5646361	5646366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489853
122334	NC_015733	ATG	2	6	5646431	5646436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489853
122335	NC_015733	GGC	2	6	5646452	5646457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489853
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122337	NC_015733	GCC	2	6	5646488	5646493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489853
122338	NC_015733	CGG	2	6	5646613	5646618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489853
122339	NC_015733	GGC	2	6	5646650	5646655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489853
122340	NC_015733	CTG	2	6	5646656	5646661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489853
122341	NC_015733	GAA	2	6	5646698	5646703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339489853
122342	NC_015733	CTT	2	6	5646754	5646759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489853
122343	NC_015733	CCTGGA	2	12	5646823	5646834	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339489853
122344	NC_015733	GGC	2	6	5646884	5646889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489853
122345	NC_015733	GTG	2	6	5646929	5646934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339489853
122346	NC_015733	CCG	2	6	5646939	5646944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489853
122347	NC_015733	CGA	2	6	5646949	5646954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489853
122348	NC_015733	CGA	2	6	5647027	5647032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489853
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122352	NC_015733	GCTG	2	8	5647318	5647325	0 %	25 %	50 %	25 %	339489853
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122355	NC_015733	T	6	6	5647515	5647520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122356	NC_015733	GCTTCG	2	12	5647602	5647613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489854
122357	NC_015733	G	7	7	5647647	5647653	0 %	0 %	100 %	0 %	339489854
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122371	NC_015733	CGAA	2	8	5648487	5648494	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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122400	NC_015733	CTG	2	6	5650500	5650505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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122446	NC_015733	GGC	2	6	5652754	5652759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489859
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122452	NC_015733	CTG	2	6	5652968	5652973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489859
122453	NC_015733	TGC	2	6	5652975	5652980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489859
122454	NC_015733	TGGGC	2	10	5652981	5652990	0 %	20 %	60 %	20 %	339489859
122455	NC_015733	GCG	2	6	5653008	5653013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489859
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122458	NC_015733	TGC	3	9	5653107	5653115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489859
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