MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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120002	NC_015733	AAC	2	6	5540778	5540783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339489765
120003	NC_015733	GAT	2	6	5540819	5540824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489765
120004	NC_015733	GCG	2	6	5540859	5540864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489765
120005	NC_015733	GTC	2	6	5540927	5540932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489765
120006	NC_015733	CAG	2	6	5540933	5540938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489765
120007	NC_015733	CAGC	2	8	5540993	5541000	25 %	0 %	25 %	50 %	339489765
120008	NC_015733	TTG	3	9	5541024	5541032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339489765
120009	NC_015733	TCA	2	6	5541079	5541084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489765
120010	NC_015733	AC	3	6	5541103	5541108	50 %	0 %	0 %	50 %	339489765
120011	NC_015733	CGG	2	6	5541156	5541161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489765
120012	NC_015733	GAT	2	6	5541260	5541265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489765
120013	NC_015733	GCA	2	6	5541280	5541285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489765
120014	NC_015733	GCA	2	6	5541328	5541333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489765
120015	NC_015733	TGGT	2	8	5541339	5541346	0 %	50 %	50 %	0 %	339489765
120016	NC_015733	CAG	2	6	5541410	5541415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489765
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120020	NC_015733	GCA	2	6	5541520	5541525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489765
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120022	NC_015733	GGCGCA	2	12	5541562	5541573	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339489765
120023	NC_015733	GGT	2	6	5541658	5541663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339489765
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120025	NC_015733	CCGC	2	8	5541775	5541782	0 %	0 %	25 %	75 %	339489765
120026	NC_015733	CCA	2	6	5541797	5541802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489765
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120030	NC_015733	CTG	2	6	5541932	5541937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489765
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120037	NC_015733	TCCA	2	8	5542254	5542261	25 %	25 %	0 %	50 %	339489765
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120039	NC_015733	GCG	2	6	5542371	5542376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489765
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120041	NC_015733	GTT	2	6	5542542	5542547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120042	NC_015733	CG	3	6	5542574	5542579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120043	NC_015733	CGC	2	6	5542625	5542630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489766
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120052	NC_015733	TCA	2	6	5543159	5543164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489767
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120107	NC_015733	GC	3	6	5545818	5545823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120108	NC_015733	ACAA	2	8	5545896	5545903	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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120115	NC_015733	TCGA	2	8	5546305	5546312	25 %	25 %	25 %	25 %	339489770
120116	NC_015733	TTC	2	6	5546526	5546531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489770
120117	NC_015733	TTC	2	6	5546550	5546555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489770
120118	NC_015733	GAT	2	6	5546613	5546618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489770
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120211	NC_015733	CCG	2	6	5550890	5550895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489772
120212	NC_015733	CTG	2	6	5550951	5550956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489772
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120214	NC_015733	TGC	2	6	5551001	5551006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489772
120215	NC_015733	GCC	2	6	5551028	5551033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489772
120216	NC_015733	GAAG	2	8	5551073	5551080	50 %	0 %	50 %	0 %	339489772
120217	NC_015733	GCG	2	6	5551123	5551128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489772
120218	NC_015733	CGA	2	6	5551136	5551141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489772
120219	NC_015733	GAA	3	9	5551173	5551181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339489772
120220	NC_015733	TAC	2	6	5551224	5551229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489772
120221	NC_015733	GCT	2	6	5551231	5551236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489772
120222	NC_015733	CCT	2	6	5551279	5551284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120223	NC_015733	CGC	2	6	5551357	5551362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120224	NC_015733	GCCAG	2	10	5551483	5551492	20 %	0 %	40 %	40 %	339489773
120225	NC_015733	C	7	7	5551598	5551604	0 %	0 %	0 %	100 %	339489773
120226	NC_015733	ACC	2	6	5551607	5551612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489773
120227	NC_015733	TGGC	2	8	5551615	5551622	0 %	25 %	50 %	25 %	339489773
120228	NC_015733	GAC	2	6	5551662	5551667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489773
120229	NC_015733	CAC	2	6	5551756	5551761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489773
120230	NC_015733	GCAA	2	8	5551793	5551800	50 %	0 %	25 %	25 %	339489773
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120234	NC_015733	GC	3	6	5552036	5552041	0 %	0 %	50 %	50 %	339489773
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120243	NC_015733	CG	3	6	5552536	5552541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120244	NC_015733	CGA	2	6	5552586	5552591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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120328	NC_015733	T	6	6	5556428	5556433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120329	NC_015733	GAAC	2	8	5556542	5556549	50 %	0 %	25 %	25 %	339489778
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120341	NC_015733	AGT	2	6	5557192	5557197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489779
120342	NC_015733	GGC	2	6	5557284	5557289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489780
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120461	NC_015733	GCG	2	6	5561744	5561749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489783
120462	NC_015733	TGC	2	6	5561750	5561755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489783
120463	NC_015733	CGG	2	6	5561759	5561764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489783
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120485	NC_015733	GCC	2	6	5562774	5562779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489784
120486	NC_015733	GCG	2	6	5562786	5562791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489784
120487	NC_015733	GC	3	6	5562900	5562905	0 %	0 %	50 %	50 %	339489784
120488	NC_015733	GCA	2	6	5563013	5563018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489784
120489	NC_015733	GAT	2	6	5563019	5563024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489784
120490	NC_015733	CCA	2	6	5563094	5563099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120491	NC_015733	AGC	2	6	5563192	5563197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489785
120492	NC_015733	CTCC	2	8	5563248	5563255	0 %	25 %	0 %	75 %	339489785
120493	NC_015733	CA	4	8	5563327	5563334	50 %	0 %	0 %	50 %	339489785
120494	NC_015733	CGG	2	6	5563359	5563364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489785
120495	NC_015733	TCCGCT	2	12	5563406	5563417	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	339489785
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120497	NC_015733	TCA	2	6	5563516	5563521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489785
120498	NC_015733	TCG	2	6	5563574	5563579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489785
120499	NC_015733	CTT	2	6	5563607	5563612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489785
120500	NC_015733	ATG	2	6	5563636	5563641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489785

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