MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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119502	NC_015733	CTG	2	6	5519873	5519878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489751
119503	NC_015733	AAC	2	6	5519892	5519897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339489751
119504	NC_015733	GCC	2	6	5519961	5519966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489751
119505	NC_015733	CAA	2	6	5519987	5519992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339489751
119506	NC_015733	TCG	2	6	5520036	5520041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489751
119507	NC_015733	CAA	2	6	5520059	5520064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339489751
119508	NC_015733	CCA	2	6	5520115	5520120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489751
119509	NC_015733	CAC	2	6	5520178	5520183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489751
119510	NC_015733	GCA	2	6	5520193	5520198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489751
119511	NC_015733	CTT	2	6	5520210	5520215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489752
119512	NC_015733	CGG	2	6	5520252	5520257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489752
119513	NC_015733	CAT	2	6	5520381	5520386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489752
119514	NC_015733	CGGC	2	8	5520405	5520412	0 %	0 %	50 %	50 %	339489752
119515	NC_015733	GTT	2	6	5520466	5520471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339489752
119516	NC_015733	AGT	2	6	5520477	5520482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489752
119517	NC_015733	ACC	2	6	5520536	5520541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489752
119518	NC_015733	CTC	2	6	5520667	5520672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339489752
119519	NC_015733	CGG	2	6	5520673	5520678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489752
119520	NC_015733	GGC	2	6	5520717	5520722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489752
119521	NC_015733	GGGT	2	8	5520806	5520813	0 %	25 %	75 %	0 %	339489752
119522	NC_015733	GCC	2	6	5520850	5520855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489752
119523	NC_015733	GGT	2	6	5520922	5520927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339489752
119524	NC_015733	GTT	2	6	5520928	5520933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339489752
119525	NC_015733	GCG	2	6	5520948	5520953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489752
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119527	NC_015733	GGGTC	2	10	5520999	5521008	0 %	20 %	60 %	20 %	339489752
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119531	NC_015733	TCG	2	6	5521094	5521099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489752
119532	NC_015733	GCG	2	6	5521113	5521118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489752
119533	NC_015733	ATT	2	6	5521195	5521200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119534	NC_015733	CAT	2	6	5521212	5521217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119535	NC_015733	GCC	2	6	5521255	5521260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119536	NC_015733	AT	3	6	5521276	5521281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119537	NC_015733	CAG	2	6	5521289	5521294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119538	NC_015733	CAAG	2	8	5521330	5521337	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119539	NC_015733	CCA	2	6	5521387	5521392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119540	NC_015733	CCTG	2	8	5521470	5521477	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119541	NC_015733	CAA	2	6	5521497	5521502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119542	NC_015733	GCAC	2	8	5521532	5521539	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119543	NC_015733	CAGGTG	2	12	5521554	5521565	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119544	NC_015733	CCA	2	6	5521606	5521611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119545	NC_015733	AGC	2	6	5521633	5521638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119546	NC_015733	ACCT	2	8	5521668	5521675	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119547	NC_015733	GCC	2	6	5521717	5521722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119548	NC_015733	CGCT	2	8	5521743	5521750	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119549	NC_015733	CATGG	2	10	5521797	5521806	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119550	NC_015733	CGCC	2	8	5521810	5521817	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119551	NC_015733	GGTC	2	8	5521831	5521838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119552	NC_015733	CAA	2	6	5521877	5521882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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119554	NC_015733	CGG	2	6	5521937	5521942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119555	NC_015733	CTA	2	6	5521970	5521975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119556	NC_015733	CGC	2	6	5521987	5521992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119557	NC_015733	CGCC	2	8	5522078	5522085	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119558	NC_015733	CCG	2	6	5522116	5522121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119559	NC_015733	GCCAC	2	10	5522127	5522136	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
119560	NC_015733	TCA	2	6	5522218	5522223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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119562	NC_015733	GCCA	2	8	5522298	5522305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119563	NC_015733	ACC	2	6	5522397	5522402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119564	NC_015733	CCTGG	2	10	5522426	5522435	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
119565	NC_015733	TGA	2	6	5522524	5522529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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119568	NC_015733	TCG	2	6	5522590	5522595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119569	NC_015733	GCCG	2	8	5522631	5522638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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119571	NC_015733	TGCT	2	8	5522695	5522702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119572	NC_015733	ACG	2	6	5522758	5522763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119573	NC_015733	CAT	2	6	5522813	5522818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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119578	NC_015733	GAA	2	6	5522964	5522969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119579	NC_015733	GCTG	2	8	5523103	5523110	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119580	NC_015733	GCC	2	6	5523200	5523205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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119583	NC_015733	GCGCC	2	10	5523368	5523377	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
119584	NC_015733	CG	3	6	5523511	5523516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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119589	NC_015733	ACG	2	6	5523908	5523913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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119591	NC_015733	TGC	2	6	5524049	5524054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119592	NC_015733	TGC	2	6	5524073	5524078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119593	NC_015733	GCC	2	6	5524133	5524138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119594	NC_015733	GGC	3	9	5524156	5524164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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119596	NC_015733	CGG	2	6	5524244	5524249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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119600	NC_015733	AGC	2	6	5524392	5524397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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119602	NC_015733	T	6	6	5524533	5524538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119603	NC_015733	ACGC	2	8	5524541	5524548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119604	NC_015733	AGCCTG	2	12	5524555	5524566	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119605	NC_015733	CTG	2	6	5524615	5524620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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119609	NC_015733	TGCC	2	8	5524732	5524739	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119610	NC_015733	ACCA	2	8	5524762	5524769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119611	NC_015733	CTG	2	6	5524801	5524806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119612	NC_015733	GC	3	6	5524960	5524965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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119616	NC_015733	CAC	2	6	5525136	5525141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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119619	NC_015733	CGCA	2	8	5525172	5525179	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119620	NC_015733	GCGAT	2	10	5525204	5525213	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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119622	NC_015733	AAC	2	6	5525312	5525317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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119839	NC_015733	AC	3	6	5533898	5533903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119840	NC_015733	TGTA	2	8	5533911	5533918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119841	NC_015733	AAT	2	6	5533936	5533941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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