MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
116001	NC_015733	CAC	2	6	5360007	5360012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489622
116002	NC_015733	TCC	2	6	5360042	5360047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339489622
116003	NC_015733	TGG	2	6	5360064	5360069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339489622
116004	NC_015733	GGGCCA	2	12	5360076	5360087	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339489622
116005	NC_015733	GTC	2	6	5360095	5360100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489622
116006	NC_015733	GCA	2	6	5360133	5360138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489622
116007	NC_015733	CGC	2	6	5360145	5360150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489622
116008	NC_015733	GGCC	2	8	5360224	5360231	0 %	0 %	50 %	50 %	339489622
116009	NC_015733	CGG	2	6	5360247	5360252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489622
116010	NC_015733	AGC	2	6	5360279	5360284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489622
116011	NC_015733	TGC	2	6	5360381	5360386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489623
116012	NC_015733	TC	3	6	5360435	5360440	0 %	50 %	0 %	50 %	339489623
116013	NC_015733	GCG	2	6	5360470	5360475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489623
116014	NC_015733	CGG	3	9	5360514	5360522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489623
116015	NC_015733	CTG	2	6	5360526	5360531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489623
116016	NC_015733	CTG	2	6	5360574	5360579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489623
116017	NC_015733	TGGC	2	8	5360581	5360588	0 %	25 %	50 %	25 %	339489623
116018	NC_015733	GGC	2	6	5360601	5360606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489623
116019	NC_015733	GTT	3	9	5360610	5360618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339489623
116020	NC_015733	GCT	2	6	5360696	5360701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489623
116021	NC_015733	AGC	2	6	5360791	5360796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489623
116022	NC_015733	GTC	2	6	5360820	5360825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489623
116023	NC_015733	CAC	2	6	5360843	5360848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489623
116024	NC_015733	GCCA	2	8	5360878	5360885	25 %	0 %	25 %	50 %	339489623
116025	NC_015733	GC	3	6	5360886	5360891	0 %	0 %	50 %	50 %	339489623
116026	NC_015733	GGC	2	6	5360943	5360948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489623
116027	NC_015733	CGGCG	2	10	5360955	5360964	0 %	0 %	60 %	40 %	339489623
116028	NC_015733	CTT	2	6	5360997	5361002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489623
116029	NC_015733	AGT	2	6	5361038	5361043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489623
116030	NC_015733	GCA	2	6	5361116	5361121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489623
116031	NC_015733	CGC	2	6	5361170	5361175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489623
116032	NC_015733	CGG	2	6	5361225	5361230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489623
116033	NC_015733	CTG	2	6	5361266	5361271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489623
116034	NC_015733	GC	3	6	5361314	5361319	0 %	0 %	50 %	50 %	339489623
116035	NC_015733	CCT	2	6	5361338	5361343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339489623
116036	NC_015733	ACC	2	6	5361358	5361363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489623
116037	NC_015733	ACC	2	6	5361433	5361438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489623
116038	NC_015733	TCGG	2	8	5361448	5361455	0 %	25 %	50 %	25 %	339489623
116039	NC_015733	ACGC	2	8	5361471	5361478	25 %	0 %	25 %	50 %	339489623
116040	NC_015733	TGC	2	6	5361583	5361588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489623
116041	NC_015733	TGT	2	6	5361620	5361625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339489623
116042	NC_015733	GC	4	8	5361629	5361636	0 %	0 %	50 %	50 %	339489623
116043	NC_015733	CTTGA	2	10	5361651	5361660	20 %	40 %	20 %	20 %	339489623
116044	NC_015733	CAG	3	9	5361693	5361701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489623
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116047	NC_015733	GCG	2	6	5361802	5361807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489624
116048	NC_015733	AGCG	2	8	5361816	5361823	25 %	0 %	50 %	25 %	339489624
116049	NC_015733	CCGC	2	8	5361825	5361832	0 %	0 %	25 %	75 %	339489624
116050	NC_015733	CCG	2	6	5362140	5362145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489624
116051	NC_015733	CTC	2	6	5362228	5362233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339489625
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116053	NC_015733	GCC	2	6	5362373	5362378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489625
116054	NC_015733	CAG	2	6	5362444	5362449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489625
116055	NC_015733	CCGG	2	8	5362454	5362461	0 %	0 %	50 %	50 %	339489625
116056	NC_015733	TGT	2	6	5362503	5362508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339489625
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116059	NC_015733	TGC	2	6	5362611	5362616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489625
116060	NC_015733	GC	3	6	5362639	5362644	0 %	0 %	50 %	50 %	339489625
116061	NC_015733	CCG	2	6	5362698	5362703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489625
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116066	NC_015733	GC	3	6	5362828	5362833	0 %	0 %	50 %	50 %	339489625
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116073	NC_015733	CGAACA	2	12	5363237	5363248	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	339489626
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116085	NC_015733	CGTA	2	8	5363770	5363777	25 %	25 %	25 %	25 %	339489626
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116087	NC_015733	GCCGG	2	10	5364034	5364043	0 %	0 %	60 %	40 %	339489626
116088	NC_015733	GGCGC	2	10	5364122	5364131	0 %	0 %	60 %	40 %	339489626
116089	NC_015733	GCA	2	6	5364179	5364184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489626
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116098	NC_015733	CCG	2	6	5364531	5364536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489627
116099	NC_015733	CCA	2	6	5364568	5364573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489627
116100	NC_015733	TGCCC	2	10	5364577	5364586	0 %	20 %	20 %	60 %	339489627
116101	NC_015733	CCA	2	6	5364625	5364630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489627
116102	NC_015733	AGCG	2	8	5364657	5364664	25 %	0 %	50 %	25 %	339489627
116103	NC_015733	GGC	2	6	5364667	5364672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489627
116104	NC_015733	CAT	2	6	5364674	5364679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489627
116105	NC_015733	CAG	2	6	5364698	5364703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489627
116106	NC_015733	CGC	2	6	5364704	5364709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489627
116107	NC_015733	GCC	2	6	5364788	5364793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489627
116108	NC_015733	CAC	2	6	5364821	5364826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489627
116109	NC_015733	CGG	2	6	5364846	5364851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489627
116110	NC_015733	CGG	2	6	5364880	5364885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489627
116111	NC_015733	CAA	2	6	5364908	5364913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339489627
116112	NC_015733	GC	3	6	5364948	5364953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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116114	NC_015733	CGAT	2	8	5365058	5365065	25 %	25 %	25 %	25 %	339489628
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116229	NC_015733	GCT	2	6	5369768	5369773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489632
116230	NC_015733	GAC	2	6	5369802	5369807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489632
116231	NC_015733	GCA	3	9	5369810	5369818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489632
116232	NC_015733	CAG	2	6	5369826	5369831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489632
116233	NC_015733	CGC	2	6	5369847	5369852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489632
116234	NC_015733	CGA	2	6	5369954	5369959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489632
116235	NC_015733	GC	3	6	5369964	5369969	0 %	0 %	50 %	50 %	339489632
116236	NC_015733	GCCCA	2	10	5369997	5370006	20 %	0 %	20 %	60 %	339489632
116237	NC_015733	CTG	3	9	5370081	5370089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489632
116238	NC_015733	GCA	2	6	5370122	5370127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489632
116239	NC_015733	GGCC	2	8	5370131	5370138	0 %	0 %	50 %	50 %	339489632
116240	NC_015733	CTG	2	6	5370186	5370191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489632
116241	NC_015733	GCT	2	6	5370197	5370202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489632
116242	NC_015733	CTG	2	6	5370258	5370263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489632
116243	NC_015733	TGC	2	6	5370301	5370306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489632
116244	NC_015733	CGCT	2	8	5370309	5370316	0 %	25 %	25 %	50 %	339489632
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116247	NC_015733	GCCG	2	8	5370364	5370371	0 %	0 %	50 %	50 %	339489632
116248	NC_015733	TGAC	2	8	5370504	5370511	25 %	25 %	25 %	25 %	339489633
116249	NC_015733	CTG	2	6	5370548	5370553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489633
116250	NC_015733	CTGATC	2	12	5370575	5370586	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339489633
116251	NC_015733	AGC	2	6	5370593	5370598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489633
116252	NC_015733	C	6	6	5370671	5370676	0 %	0 %	0 %	100 %	339489633
116253	NC_015733	CTG	2	6	5370686	5370691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489633
116254	NC_015733	GCG	2	6	5370774	5370779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489633
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116259	NC_015733	GCG	2	6	5371020	5371025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489633
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116288	NC_015733	GCA	2	6	5372155	5372160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489634
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116327	NC_015733	CG	3	6	5374341	5374346	0 %	0 %	50 %	50 %	339489636
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116330	NC_015733	GAC	2	6	5374393	5374398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489636
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116332	NC_015733	CG	3	6	5374448	5374453	0 %	0 %	50 %	50 %	339489636
116333	NC_015733	GCC	2	6	5374462	5374467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489636
116334	NC_015733	CTG	2	6	5374504	5374509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489636
116335	NC_015733	GAC	2	6	5374510	5374515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489636
116336	NC_015733	GC	3	6	5374520	5374525	0 %	0 %	50 %	50 %	339489636
116337	NC_015733	GCC	2	6	5374531	5374536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489636
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