MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11004	NC_015733	TCG	2	6	507383	507388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485365
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11007	NC_015733	CTG	2	6	507598	507603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485365
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11020	NC_015733	GCA	2	6	508247	508252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485367
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11101	NC_015733	TA	3	6	512114	512119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_015733	GCTTT	2	10	512147	512156	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11103	NC_015733	CTT	2	6	512250	512255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11105	NC_015733	GTT	2	6	512273	512278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11108	NC_015733	GC	3	6	512469	512474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11109	NC_015733	GGC	2	6	512704	512709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_015733	GCG	2	6	512762	512767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_015733	CGA	2	6	512937	512942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11114	NC_015733	GT	3	6	513064	513069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11116	NC_015733	GGA	2	6	513106	513111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11118	NC_015733	GC	3	6	513235	513240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11119	NC_015733	GGT	2	6	513244	513249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_015733	GTG	2	6	513328	513333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11122	NC_015733	ACC	2	6	513394	513399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11123	NC_015733	GAA	2	6	513633	513638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_015733	TGC	2	6	513709	513714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_015733	GTC	2	6	513721	513726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11126	NC_015733	TCGTG	2	10	513730	513739	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11127	NC_015733	TGG	2	6	513799	513804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_015733	GGA	2	6	513835	513840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11130	NC_015733	AC	3	6	513886	513891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11131	NC_015733	AC	3	6	514055	514060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11132	NC_015733	GGA	2	6	514115	514120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11136	NC_015733	TGT	2	6	514289	514294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11138	NC_015733	CTG	2	6	514409	514414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11155	NC_015733	AGTCG	2	10	515618	515627	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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11232	NC_015733	AGCG	2	8	519973	519980	25 %	0 %	50 %	25 %	339485372
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11234	NC_015733	CAC	2	6	520109	520114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11235	NC_015733	AGC	2	6	520144	520149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11236	NC_015733	A	6	6	520169	520174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11237	NC_015733	A	6	6	520179	520184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11238	NC_015733	GGCA	2	8	520201	520208	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11239	NC_015733	GGAC	2	8	520255	520262	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11240	NC_015733	CCA	2	6	520308	520313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11241	NC_015733	TGA	2	6	520377	520382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11242	NC_015733	TCT	2	6	520573	520578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11243	NC_015733	GGA	2	6	520581	520586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11244	NC_015733	TTCCC	2	10	520618	520627	0 %	40 %	0 %	60 %	339485373
11245	NC_015733	TTCGG	2	10	520712	520721	0 %	40 %	40 %	20 %	339485373
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11247	NC_015733	GC	3	6	520766	520771	0 %	0 %	50 %	50 %	339485373
11248	NC_015733	GAA	2	6	520861	520866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485373
11249	NC_015733	TGC	2	6	520879	520884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485373
11250	NC_015733	GCC	2	6	520916	520921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485373
11251	NC_015733	CTG	2	6	520955	520960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485373
11252	NC_015733	GAC	2	6	521018	521023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485373
11253	NC_015733	GCT	2	6	521029	521034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485373
11254	NC_015733	CTG	2	6	521063	521068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485373
11255	NC_015733	CGA	2	6	521089	521094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485373
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11273	NC_015733	CCT	2	6	521904	521909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11275	NC_015733	TCC	2	6	521954	521959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11277	NC_015733	TGG	2	6	522030	522035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11278	NC_015733	GCT	2	6	522110	522115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11280	NC_015733	ACC	2	6	522224	522229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485374
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11291	NC_015733	GTC	2	6	522923	522928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11344	NC_015733	TGG	2	6	525350	525355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11368	NC_015733	GCC	2	6	526300	526305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485380
11369	NC_015733	CG	3	6	526313	526318	0 %	0 %	50 %	50 %	339485380
11370	NC_015733	AGC	2	6	526351	526356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485380
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11372	NC_015733	CTG	2	6	526464	526469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485380
11373	NC_015733	GTC	2	6	526491	526496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485380
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11380	NC_015733	CCG	2	6	526696	526701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485380
11381	NC_015733	CGT	2	6	526722	526727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485380
11382	NC_015733	TCG	2	6	526777	526782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485380
11383	NC_015733	TCG	2	6	526825	526830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485380
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11387	NC_015733	TTC	2	6	527016	527021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485380
11388	NC_015733	CCAG	2	8	527026	527033	25 %	0 %	25 %	50 %	339485380
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11391	NC_015733	ACCA	2	8	527244	527251	50 %	0 %	0 %	50 %	339485380
11392	NC_015733	GTG	2	6	527280	527285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485380
11393	NC_015733	AAGG	2	8	527286	527293	50 %	0 %	50 %	0 %	339485380
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11397	NC_015733	GTT	2	6	527481	527486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485380
11398	NC_015733	CGT	2	6	527497	527502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485380
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11401	NC_015733	GGTA	2	8	527600	527607	25 %	25 %	50 %	0 %	339485380
11402	NC_015733	CGT	2	6	527648	527653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485380
11403	NC_015733	CGC	2	6	527658	527663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485380
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11405	NC_015733	GTT	2	6	527700	527705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485380
11406	NC_015733	CGA	3	9	527714	527722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485380
11407	NC_015733	CAT	2	6	527846	527851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485380
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11411	NC_015733	CTG	2	6	528204	528209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485380
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11418	NC_015733	TCG	2	6	528599	528604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485380
11419	NC_015733	CTG	2	6	528609	528614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485380
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11423	NC_015733	TGA	2	6	528656	528661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485380
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11432	NC_015733	CCTGGC	2	12	529040	529051	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339485380
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11435	NC_015733	CAA	2	6	529187	529192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485380
11436	NC_015733	TACATG	2	12	529218	529229	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	339485380
11437	NC_015733	TGG	2	6	529246	529251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485380
11438	NC_015733	CG	3	6	529265	529270	0 %	0 %	50 %	50 %	339485380
11439	NC_015733	CAG	2	6	529299	529304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485380
11440	NC_015733	GGT	2	6	529311	529316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485380
11441	NC_015733	GGT	2	6	529329	529334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485380
11442	NC_015733	GAC	2	6	529419	529424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485380
11443	NC_015733	TATCGA	2	12	529535	529546	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	339485380
11444	NC_015733	AGG	2	6	529614	529619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11445	NC_015733	AAG	2	6	529741	529746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485381
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11448	NC_015733	CTG	2	6	530002	530007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
11449	NC_015733	CGT	2	6	530058	530063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
11450	NC_015733	GAC	2	6	530079	530084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485381
11451	NC_015733	GCT	2	6	530100	530105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
11452	NC_015733	ACG	2	6	530108	530113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485381
11453	NC_015733	GGA	2	6	530133	530138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339485381
11454	NC_015733	TGA	2	6	530145	530150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485381
11455	NC_015733	GCT	2	6	530187	530192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
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11457	NC_015733	CCTG	2	8	530322	530329	0 %	25 %	25 %	50 %	339485381
11458	NC_015733	CCTG	2	8	530349	530356	0 %	25 %	25 %	50 %	339485381
11459	NC_015733	TGC	2	6	530357	530362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
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11461	NC_015733	TCG	2	6	530433	530438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
11462	NC_015733	AAC	2	6	530452	530457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485381
11463	NC_015733	CTG	2	6	530470	530475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
11464	NC_015733	CAT	2	6	530493	530498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485381
11465	NC_015733	TGC	2	6	530519	530524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
11466	NC_015733	CTG	2	6	530542	530547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
11467	NC_015733	GTCGCG	2	12	530558	530569	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339485381
11468	NC_015733	ACT	2	6	530669	530674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485381
11469	NC_015733	GAA	2	6	530733	530738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485381
11470	NC_015733	ACC	2	6	530800	530805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485381
11471	NC_015733	AAG	2	6	530818	530823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485381
11472	NC_015733	TGC	2	6	530888	530893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
11473	NC_015733	GC	4	8	531064	531071	0 %	0 %	50 %	50 %	339485381
11474	NC_015733	TGA	2	6	531074	531079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485381
11475	NC_015733	CAA	2	6	531087	531092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485381
11476	NC_015733	GCCA	2	8	531102	531109	25 %	0 %	25 %	50 %	339485381
11477	NC_015733	ATC	2	6	531121	531126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485381
11478	NC_015733	TAC	2	6	531157	531162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485381
11479	NC_015733	TCG	2	6	531332	531337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
11480	NC_015733	ACC	2	6	531340	531345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485381
11481	NC_015733	GCT	2	6	531357	531362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485381
11482	NC_015733	ACG	2	6	531392	531397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485381
11483	NC_015733	GAA	3	9	531414	531422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485381
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11485	NC_015733	CAT	2	6	531582	531587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485381
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