MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
113001	NC_015733	GAA	2	6	5226148	5226153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339489498
113002	NC_015733	GGC	2	6	5226188	5226193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489498
113003	NC_015733	GGGC	2	8	5226217	5226224	0 %	0 %	75 %	25 %	339489498
113004	NC_015733	CAC	2	6	5226226	5226231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489498
113005	NC_015733	CCA	2	6	5226242	5226247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489498
113006	NC_015733	ACC	2	6	5226265	5226270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489498
113007	NC_015733	AGT	2	6	5226279	5226284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489498
113008	NC_015733	CGGCCC	2	12	5226355	5226366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489498
113009	NC_015733	TGGCG	2	10	5226488	5226497	0 %	20 %	60 %	20 %	339489498
113010	NC_015733	CTG	2	6	5226505	5226510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489498
113011	NC_015733	GAGC	2	8	5226529	5226536	25 %	0 %	50 %	25 %	339489498
113012	NC_015733	AC	3	6	5226597	5226602	50 %	0 %	0 %	50 %	339489498
113013	NC_015733	A	6	6	5226719	5226724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113014	NC_015733	GTC	2	6	5226755	5226760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113015	NC_015733	CTCAC	2	10	5226785	5226794	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
113016	NC_015733	TCT	2	6	5226799	5226804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113017	NC_015733	GT	3	6	5226810	5226815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113018	NC_015733	TGGC	2	8	5226844	5226851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113019	NC_015733	CCGC	2	8	5226857	5226864	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113020	NC_015733	GAT	2	6	5226937	5226942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113021	NC_015733	GC	3	6	5227086	5227091	0 %	0 %	50 %	50 %	339489499
113022	NC_015733	GGA	2	6	5227163	5227168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339489499
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113024	NC_015733	GCCTGA	2	12	5227219	5227230	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339489499
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113027	NC_015733	CTG	2	6	5227398	5227403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489499
113028	NC_015733	GCGT	2	8	5227438	5227445	0 %	25 %	50 %	25 %	339489499
113029	NC_015733	CAG	2	6	5227519	5227524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113030	NC_015733	CCG	2	6	5227570	5227575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489500
113031	NC_015733	GAT	3	9	5227589	5227597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489500
113032	NC_015733	TTC	2	6	5227692	5227697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489500
113033	NC_015733	GCTGGG	2	12	5227700	5227711	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	339489500
113034	NC_015733	ATC	2	6	5227725	5227730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489500
113035	NC_015733	GTG	3	9	5227737	5227745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339489500
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113042	NC_015733	CGGC	2	8	5228118	5228125	0 %	0 %	50 %	50 %	339489501
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113045	NC_015733	GCC	2	6	5228257	5228262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489501
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113054	NC_015733	TCA	2	6	5228534	5228539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489502
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113088	NC_015733	TGCC	2	8	5230019	5230026	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113089	NC_015733	ACG	2	6	5230113	5230118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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113110	NC_015733	TGG	2	6	5230838	5230843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339489503
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113116	NC_015733	GCA	2	6	5231076	5231081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489503
113117	NC_015733	AGC	2	6	5231085	5231090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489503
113118	NC_015733	GTG	2	6	5231216	5231221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339489503
113119	NC_015733	CGG	2	6	5231382	5231387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489503
113120	NC_015733	CGGCCT	2	12	5231418	5231429	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339489503
113121	NC_015733	AGGT	2	8	5231438	5231445	25 %	25 %	50 %	0 %	339489503
113122	NC_015733	CGG	2	6	5231517	5231522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489503
113123	NC_015733	CGATG	2	10	5231565	5231574	20 %	20 %	40 %	20 %	339489503
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113127	NC_015733	GTCA	2	8	5231866	5231873	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113128	NC_015733	TGG	2	6	5231898	5231903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113129	NC_015733	G	6	6	5231902	5231907	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113130	NC_015733	TCA	2	6	5231940	5231945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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113145	NC_015733	GCG	2	6	5232693	5232698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489504
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113154	NC_015733	A	6	6	5233145	5233150	100 %	0 %	0 %	0 %	339489504
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113208	NC_015733	GGC	2	6	5236054	5236059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113209	NC_015733	A	7	7	5236082	5236088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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113212	NC_015733	AACTC	2	10	5236248	5236257	40 %	20 %	0 %	40 %	339489507
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113217	NC_015733	ATC	2	6	5236502	5236507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489507
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113221	NC_015733	GC	4	8	5236710	5236717	0 %	0 %	50 %	50 %	339489507
113222	NC_015733	GGC	2	6	5236719	5236724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489507
113223	NC_015733	CAT	2	6	5236768	5236773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489507
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113226	NC_015733	GTT	2	6	5236950	5236955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339489507
113227	NC_015733	CTG	2	6	5236990	5236995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489507
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113229	NC_015733	GCTG	2	8	5237064	5237071	0 %	25 %	50 %	25 %	339489507
113230	NC_015733	TGA	2	6	5237082	5237087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489507
113231	NC_015733	GAT	2	6	5237158	5237163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489507
113232	NC_015733	GCCAC	2	10	5237185	5237194	20 %	0 %	20 %	60 %	339489507
113233	NC_015733	GC	3	6	5237304	5237309	0 %	0 %	50 %	50 %	339489507
113234	NC_015733	GCA	2	6	5237328	5237333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489507
113235	NC_015733	TGC	2	6	5237355	5237360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489507
113236	NC_015733	AAC	2	6	5237417	5237422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339489507
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113239	NC_015733	GCT	2	6	5237634	5237639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489507
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113241	NC_015733	GGT	2	6	5237716	5237721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339489507
113242	NC_015733	GCTGCA	2	12	5237733	5237744	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339489507
113243	NC_015733	GTT	2	6	5237758	5237763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339489507
113244	NC_015733	CTGCCG	2	12	5237825	5237836	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339489507
113245	NC_015733	CAG	2	6	5237884	5237889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489507
113246	NC_015733	GCG	2	6	5237903	5237908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489507
113247	NC_015733	TGG	2	6	5237987	5237992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339489507
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113250	NC_015733	GAC	2	6	5238226	5238231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113251	NC_015733	CAA	2	6	5238377	5238382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113252	NC_015733	TGG	2	6	5238417	5238422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339489508
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113260	NC_015733	TGC	2	6	5238768	5238773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489508
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113262	NC_015733	CTG	2	6	5238833	5238838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489508
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113287	NC_015733	GGC	2	6	5239973	5239978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489510
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113329	NC_015733	CTG	2	6	5241480	5241485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489511
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113334	NC_015733	CTG	2	6	5241789	5241794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489511
113335	NC_015733	CGA	2	6	5241839	5241844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489511
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113337	NC_015733	CTG	2	6	5241918	5241923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489511
113338	NC_015733	CGGCAT	2	12	5241984	5241995	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339489512
113339	NC_015733	GCC	3	9	5242014	5242022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489512
113340	NC_015733	TCG	2	6	5242063	5242068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489512
113341	NC_015733	CTCG	2	8	5242137	5242144	0 %	25 %	25 %	50 %	339489512
113342	NC_015733	CCA	3	9	5242148	5242156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489512
113343	NC_015733	CTC	2	6	5242182	5242187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339489512
113344	NC_015733	TCG	2	6	5242304	5242309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113345	NC_015733	CAT	2	6	5242338	5242343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113346	NC_015733	CATA	2	8	5242374	5242381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113347	NC_015733	CATT	2	8	5242438	5242445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113348	NC_015733	CGA	2	6	5242550	5242555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489513
113349	NC_015733	ACC	2	6	5242638	5242643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489513
113350	NC_015733	AAC	2	6	5242654	5242659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339489513
113351	NC_015733	TGC	2	6	5242660	5242665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489513
113352	NC_015733	CCGC	2	8	5242808	5242815	0 %	0 %	25 %	75 %	339489513
113353	NC_015733	CGGCC	2	10	5242877	5242886	0 %	0 %	40 %	60 %	339489513
113354	NC_015733	ACCT	2	8	5242899	5242906	25 %	25 %	0 %	50 %	339489513
113355	NC_015733	CTG	2	6	5242959	5242964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489513
113356	NC_015733	CGG	2	6	5242972	5242977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489513
113357	NC_015733	GGCG	2	8	5242982	5242989	0 %	0 %	75 %	25 %	339489513
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113361	NC_015733	AAC	2	6	5243157	5243162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339489513
113362	NC_015733	TCA	2	6	5243167	5243172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489513
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113364	NC_015733	TCA	2	6	5243251	5243256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489513
113365	NC_015733	TGC	2	6	5243493	5243498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489514
113366	NC_015733	CGC	2	6	5243521	5243526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489514
113367	NC_015733	CAGCG	2	10	5243548	5243557	20 %	0 %	40 %	40 %	339489514
113368	NC_015733	CGA	2	6	5243586	5243591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489514
113369	NC_015733	CGA	2	6	5243673	5243678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489514
113370	NC_015733	GCC	2	6	5243740	5243745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489514
113371	NC_015733	CGA	2	6	5243904	5243909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489514
113372	NC_015733	CA	3	6	5243925	5243930	50 %	0 %	0 %	50 %	339489514
113373	NC_015733	GATC	2	8	5243969	5243976	25 %	25 %	25 %	25 %	339489515
113374	NC_015733	CTGG	2	8	5243995	5244002	0 %	25 %	50 %	25 %	339489515
113375	NC_015733	CTG	2	6	5244059	5244064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489515
113376	NC_015733	CTG	2	6	5244086	5244091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489515
113377	NC_015733	TCG	2	6	5244111	5244116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489515
113378	NC_015733	CAT	2	6	5244154	5244159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489515
113379	NC_015733	GAT	2	6	5244175	5244180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489515
113380	NC_015733	GCCA	2	8	5244191	5244198	25 %	0 %	25 %	50 %	339489515
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113382	NC_015733	ACG	2	6	5244270	5244275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489515
113383	NC_015733	CTG	2	6	5244305	5244310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489515
113384	NC_015733	CTG	2	6	5244356	5244361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489515
113385	NC_015733	TGC	3	9	5244402	5244410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489515
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113389	NC_015733	TCG	2	6	5244507	5244512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489515
113390	NC_015733	ACG	2	6	5244531	5244536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489515
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113397	NC_015733	CTG	2	6	5244844	5244849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489516
113398	NC_015733	GGC	2	6	5244855	5244860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489516
113399	NC_015733	CCTGGC	2	12	5244876	5244887	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339489516
113400	NC_015733	TGG	2	6	5244982	5244987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339489516
113401	NC_015733	TTCGGC	2	12	5244988	5244999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489516
113402	NC_015733	TGG	2	6	5245018	5245023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339489516
113403	NC_015733	CGG	2	6	5245047	5245052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489516
113404	NC_015733	CGC	2	6	5245058	5245063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489516
113405	NC_015733	CTG	4	12	5245075	5245086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489516
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113409	NC_015733	TTC	2	6	5245111	5245116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489516
113410	NC_015733	GCTG	2	8	5245142	5245149	0 %	25 %	50 %	25 %	339489516
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113416	NC_015733	GGCC	2	8	5245284	5245291	0 %	0 %	50 %	50 %	339489516
113417	NC_015733	TGT	2	6	5245349	5245354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339489516
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113423	NC_015733	CTG	2	6	5245597	5245602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489516
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113433	NC_015733	CTG	3	9	5246002	5246010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489516
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113439	NC_015733	GGT	2	6	5246205	5246210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339489516
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113441	NC_015733	GCAG	2	8	5246435	5246442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113442	NC_015733	CCA	2	6	5246471	5246476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489517
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113447	NC_015733	GCA	2	6	5246684	5246689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489517
113448	NC_015733	CTC	2	6	5246733	5246738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339489517
113449	NC_015733	CTCG	2	8	5246796	5246803	0 %	25 %	25 %	50 %	339489517
113450	NC_015733	GCG	2	6	5246804	5246809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489517
113451	NC_015733	CCA	2	6	5246914	5246919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489517
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113453	NC_015733	CAC	2	6	5247048	5247053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489517
113454	NC_015733	TCA	2	6	5247065	5247070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489517
113455	NC_015733	CCA	2	6	5247079	5247084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489517
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