MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
111501	NC_015733	CCGA	2	8	5157992	5157999	25 %	0 %	25 %	50 %	339489439
111502	NC_015733	ACCGAT	2	12	5158041	5158052	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339489439
111503	NC_015733	GC	3	6	5158056	5158061	0 %	0 %	50 %	50 %	339489439
111504	NC_015733	GCG	2	6	5158094	5158099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489439
111505	NC_015733	GC	3	6	5158106	5158111	0 %	0 %	50 %	50 %	339489439
111506	NC_015733	TCC	2	6	5158348	5158353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339489439
111507	NC_015733	TGC	2	6	5158379	5158384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489439
111508	NC_015733	CGG	2	6	5158533	5158538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489439
111509	NC_015733	GCA	2	6	5158568	5158573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489439
111510	NC_015733	GCA	2	6	5158616	5158621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489439
111511	NC_015733	GCA	2	6	5158739	5158744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489439
111512	NC_015733	AGC	2	6	5158798	5158803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489439
111513	NC_015733	GCG	2	6	5158822	5158827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489439
111514	NC_015733	GAT	2	6	5158860	5158865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489439
111515	NC_015733	GCG	2	6	5158878	5158883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489439
111516	NC_015733	CTC	2	6	5158911	5158916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339489440
111517	NC_015733	CG	3	6	5158962	5158967	0 %	0 %	50 %	50 %	339489440
111518	NC_015733	CAC	2	6	5158991	5158996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489440
111519	NC_015733	TCG	2	6	5159008	5159013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489440
111520	NC_015733	TGA	2	6	5159147	5159152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489440
111521	NC_015733	CG	3	6	5159213	5159218	0 %	0 %	50 %	50 %	339489440
111522	NC_015733	CGG	2	6	5159233	5159238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489440
111523	NC_015733	CTAC	2	8	5159366	5159373	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111524	NC_015733	GCG	2	6	5159395	5159400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111525	NC_015733	CGT	2	6	5159482	5159487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111526	NC_015733	CGT	2	6	5159539	5159544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111527	NC_015733	CAGC	2	8	5159649	5159656	25 %	0 %	25 %	50 %	339489441
111528	NC_015733	CTT	2	6	5159753	5159758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489441
111529	NC_015733	GAT	2	6	5159768	5159773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489441
111530	NC_015733	GTA	2	6	5159789	5159794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489441
111531	NC_015733	CGA	2	6	5159818	5159823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111532	NC_015733	GC	4	8	5159828	5159835	0 %	0 %	50 %	50 %	339489441
111533	NC_015733	GCAC	2	8	5159844	5159851	25 %	0 %	25 %	50 %	339489441
111534	NC_015733	ACC	2	6	5159912	5159917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489441
111535	NC_015733	CGC	2	6	5159920	5159925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489441
111536	NC_015733	TCG	2	6	5159949	5159954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111537	NC_015733	CACG	2	8	5159998	5160005	25 %	0 %	25 %	50 %	339489441
111538	NC_015733	TCT	3	9	5160031	5160039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489441
111539	NC_015733	CTT	2	6	5160146	5160151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489441
111540	NC_015733	TCG	2	6	5160153	5160158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111541	NC_015733	CTTC	2	8	5160235	5160242	0 %	50 %	0 %	50 %	339489441
111542	NC_015733	TCG	2	6	5160258	5160263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111543	NC_015733	GC	3	6	5160270	5160275	0 %	0 %	50 %	50 %	339489441
111544	NC_015733	ACCAC	2	10	5160387	5160396	40 %	0 %	0 %	60 %	339489441
111545	NC_015733	GCA	2	6	5160442	5160447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111546	NC_015733	TCG	2	6	5160465	5160470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111547	NC_015733	CAC	2	6	5160514	5160519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489441
111548	NC_015733	CGAT	2	8	5160567	5160574	25 %	25 %	25 %	25 %	339489441
111549	NC_015733	ACC	2	6	5160609	5160614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489441
111550	NC_015733	CGT	2	6	5160673	5160678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111551	NC_015733	CCG	2	6	5160679	5160684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489441
111552	NC_015733	CCA	3	9	5160685	5160693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489441
111553	NC_015733	CAC	2	6	5160718	5160723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489441
111554	NC_015733	CGGT	2	8	5160783	5160790	0 %	25 %	50 %	25 %	339489441
111555	NC_015733	ACC	2	6	5160824	5160829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489441
111556	NC_015733	ACG	2	6	5160854	5160859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111557	NC_015733	AGC	2	6	5160870	5160875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111558	NC_015733	TTC	2	6	5161013	5161018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489441
111559	NC_015733	GTCAC	2	10	5161161	5161170	20 %	20 %	20 %	40 %	339489441
111560	NC_015733	CTT	2	6	5161214	5161219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489441
111561	NC_015733	CT	3	6	5161260	5161265	0 %	50 %	0 %	50 %	339489441
111562	NC_015733	GGT	2	6	5161271	5161276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339489441
111563	NC_015733	GCGCG	2	10	5161277	5161286	0 %	0 %	60 %	40 %	339489441
111564	NC_015733	GAG	2	6	5161291	5161296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339489441
111565	NC_015733	CCTTGA	3	18	5161315	5161332	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339489441
111566	NC_015733	CG	3	6	5161339	5161344	0 %	0 %	50 %	50 %	339489441
111567	NC_015733	ACG	2	6	5161355	5161360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111568	NC_015733	CCA	2	6	5161365	5161370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489441
111569	NC_015733	CGA	2	6	5161404	5161409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111570	NC_015733	CTT	2	6	5161418	5161423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489441
111571	NC_015733	GCA	2	6	5161431	5161436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111572	NC_015733	GCG	2	6	5161443	5161448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489441
111573	NC_015733	CCGGGG	2	12	5161477	5161488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489441
111574	NC_015733	GCC	2	6	5161500	5161505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489441
111575	NC_015733	GGC	2	6	5161514	5161519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489441
111576	NC_015733	GCA	2	6	5161533	5161538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111577	NC_015733	CGG	2	6	5161546	5161551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489441
111578	NC_015733	GCG	2	6	5161611	5161616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489441
111579	NC_015733	CG	3	6	5161625	5161630	0 %	0 %	50 %	50 %	339489441
111580	NC_015733	TTC	2	6	5161667	5161672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489441
111581	NC_015733	GCTGC	2	10	5161676	5161685	0 %	20 %	40 %	40 %	339489441
111582	NC_015733	TCT	2	6	5161696	5161701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489441
111583	NC_015733	TGG	2	6	5161750	5161755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339489441
111584	NC_015733	GCT	2	6	5161805	5161810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111585	NC_015733	CTG	2	6	5161895	5161900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111586	NC_015733	CAG	2	6	5161901	5161906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489441
111587	NC_015733	TC	3	6	5161969	5161974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111588	NC_015733	GGC	2	6	5162012	5162017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339489442
111589	NC_015733	TCG	2	6	5162043	5162048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489442
111590	NC_015733	TCG	2	6	5162070	5162075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489442
111591	NC_015733	CGC	2	6	5162110	5162115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489442
111592	NC_015733	CCG	2	6	5162128	5162133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489442
111593	NC_015733	GTC	2	6	5162168	5162173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489442
111594	NC_015733	TTC	2	6	5162198	5162203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489442
111595	NC_015733	CAA	2	6	5162222	5162227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339489442
111596	NC_015733	TTC	2	6	5162294	5162299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489442
111597	NC_015733	TTC	2	6	5162318	5162323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339489442
111598	NC_015733	TCG	2	6	5162340	5162345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489442
111599	NC_015733	CTC	2	6	5162363	5162368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339489442
111600	NC_015733	CTG	2	6	5162420	5162425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339489442
111601	NC_015733	TCA	2	6	5162449	5162454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489442
111602	NC_015733	CATGG	2	10	5162552	5162561	20 %	20 %	40 %	20 %	339489442
111603	NC_015733	TCA	2	6	5162568	5162573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339489442
111604	NC_015733	GAT	2	6	5162576	5162581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489442
111605	NC_015733	CGC	2	6	5162582	5162587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339489442
111606	NC_015733	TGA	2	6	5162611	5162616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489442
111607	NC_015733	CAC	2	6	5162662	5162667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339489442
111608	NC_015733	CG	3	6	5162692	5162697	0 %	0 %	50 %	50 %	339489442
111609	NC_015733	AGC	2	6	5162919	5162924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489442
111610	NC_015733	CG	3	6	5162956	5162961	0 %	0 %	50 %	50 %	339489442
111611	NC_015733	ATG	2	6	5162964	5162969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489442
111612	NC_015733	CAG	2	6	5162981	5162986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339489442
111613	NC_015733	GTT	2	6	5162996	5163001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339489442
111614	NC_015733	GAT	2	6	5163053	5163058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339489442
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