MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015733	GGGCA	2	10	461722	461731	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10002	NC_015733	CGGCG	2	10	461770	461779	0 %	0 %	60 %	40 %	339485322
10003	NC_015733	CAG	3	9	461815	461823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485322
10004	NC_015733	CGG	2	6	461842	461847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485322
10005	NC_015733	ACG	2	6	461918	461923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485322
10006	NC_015733	GTTC	2	8	461941	461948	0 %	50 %	25 %	25 %	339485322
10007	NC_015733	CGA	2	6	462205	462210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485323
10008	NC_015733	TTG	2	6	462245	462250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485323
10009	NC_015733	CGG	2	6	462292	462297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485323
10010	NC_015733	CG	3	6	462318	462323	0 %	0 %	50 %	50 %	339485323
10011	NC_015733	TGC	2	6	462339	462344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485323
10012	NC_015733	GGCT	2	8	462370	462377	0 %	25 %	50 %	25 %	339485323
10013	NC_015733	CCTGG	2	10	462419	462428	0 %	20 %	40 %	40 %	339485323
10014	NC_015733	CTG	2	6	462437	462442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485323
10015	NC_015733	CCT	2	6	462450	462455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339485323
10016	NC_015733	CTG	2	6	462521	462526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485323
10017	NC_015733	GGA	2	6	462538	462543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339485323
10018	NC_015733	TCG	2	6	462564	462569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485323
10019	NC_015733	TTG	2	6	462572	462577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485323
10020	NC_015733	GGT	2	6	462584	462589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485323
10021	NC_015733	GCT	2	6	462631	462636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485323
10022	NC_015733	GAC	2	6	462650	462655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485323
10023	NC_015733	GCC	2	6	462656	462661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485323
10024	NC_015733	CGCC	2	8	462724	462731	0 %	0 %	25 %	75 %	339485323
10025	NC_015733	GCG	2	6	462741	462746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485323
10026	NC_015733	GACC	2	8	462778	462785	25 %	0 %	25 %	50 %	339485323
10027	NC_015733	TTCAGC	2	12	462800	462811	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339485323
10028	NC_015733	GCA	2	6	462841	462846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485323
10029	NC_015733	CGA	2	6	462862	462867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485323
10030	NC_015733	CAG	2	6	462905	462910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485323
10031	NC_015733	GGT	2	6	462913	462918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485323
10032	NC_015733	CAA	2	6	463000	463005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485323
10033	NC_015733	TGCG	2	8	463011	463018	0 %	25 %	50 %	25 %	339485323
10034	NC_015733	GCA	2	6	463038	463043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485323
10035	NC_015733	TAC	2	6	463058	463063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485323
10036	NC_015733	GC	3	6	463064	463069	0 %	0 %	50 %	50 %	339485323
10037	NC_015733	GAT	2	6	463096	463101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485323
10038	NC_015733	GTT	2	6	463123	463128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485323
10039	NC_015733	GCC	2	6	463189	463194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485323
10040	NC_015733	TGC	2	6	463246	463251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485324
10041	NC_015733	ATC	2	6	463266	463271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485324
10042	NC_015733	GCCAG	2	10	463312	463321	20 %	0 %	40 %	40 %	339485324
10043	NC_015733	GCC	2	6	463353	463358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485324
10044	NC_015733	CAG	2	6	463388	463393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485324
10045	NC_015733	CAG	2	6	463409	463414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485324
10046	NC_015733	CGG	3	9	463447	463455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485324
10047	NC_015733	GCC	2	6	463469	463474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485324
10048	NC_015733	TGG	2	6	463651	463656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485324
10049	NC_015733	GGC	2	6	463705	463710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485324
10050	NC_015733	CGAGC	2	10	463733	463742	20 %	0 %	40 %	40 %	339485324
10051	NC_015733	GA	3	6	463838	463843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_015733	GCG	2	6	463972	463977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485325
10053	NC_015733	GAC	2	6	463981	463986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485325
10054	NC_015733	GT	3	6	464012	464017	0 %	50 %	50 %	0 %	339485325
10055	NC_015733	GTTG	2	8	464058	464065	0 %	50 %	50 %	0 %	339485325
10056	NC_015733	TGG	2	6	464084	464089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485325
10057	NC_015733	GAA	2	6	464101	464106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485325
10058	NC_015733	CGG	2	6	464156	464161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485325
10059	NC_015733	GCA	2	6	464227	464232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485326
10060	NC_015733	GGCA	2	8	464276	464283	25 %	0 %	50 %	25 %	339485326
10061	NC_015733	GCT	2	6	464299	464304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485326
10062	NC_015733	TCA	2	6	464350	464355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485326
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10064	NC_015733	CCG	2	6	464402	464407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485326
10065	NC_015733	GAC	2	6	464490	464495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485326
10066	NC_015733	GCACG	2	10	464498	464507	20 %	0 %	40 %	40 %	339485326
10067	NC_015733	GAA	2	6	464543	464548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485326
10068	NC_015733	GCT	2	6	464573	464578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485326
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10070	NC_015733	TGAGT	2	10	464828	464837	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_015733	GCTC	2	8	464851	464858	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10072	NC_015733	CTGC	2	8	464989	464996	0 %	25 %	25 %	50 %	339485327
10073	NC_015733	CGC	4	12	465023	465034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485327
10074	NC_015733	GCC	2	6	465130	465135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485327
10075	NC_015733	CAG	2	6	465164	465169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485327
10076	NC_015733	GGCA	2	8	465176	465183	25 %	0 %	50 %	25 %	339485327
10077	NC_015733	CAG	2	6	465224	465229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485327
10078	NC_015733	GCA	2	6	465304	465309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485327
10079	NC_015733	GCC	2	6	465348	465353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485327
10080	NC_015733	GCC	2	6	465363	465368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485327
10081	NC_015733	G	6	6	465376	465381	0 %	0 %	100 %	0 %	339485327
10082	NC_015733	GCA	2	6	465397	465402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485327
10083	NC_015733	GCA	2	6	465427	465432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485327
10084	NC_015733	GAA	2	6	465437	465442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485327
10085	NC_015733	TTCC	2	8	465479	465486	0 %	50 %	0 %	50 %	339485327
10086	NC_015733	CGG	2	6	465496	465501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485327
10087	NC_015733	GCG	2	6	465577	465582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485327
10088	NC_015733	GCA	2	6	465591	465596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485327
10089	NC_015733	GC	3	6	465599	465604	0 %	0 %	50 %	50 %	339485327
10090	NC_015733	GCA	2	6	465610	465615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485327
10091	NC_015733	CATTG	2	10	465725	465734	20 %	40 %	20 %	20 %	339485327
10092	NC_015733	GGTCA	2	10	465737	465746	20 %	20 %	40 %	20 %	339485327
10093	NC_015733	TCT	2	6	465759	465764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485327
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10095	NC_015733	GC	3	6	465833	465838	0 %	0 %	50 %	50 %	339485327
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10099	NC_015733	ATGTGC	2	12	466011	466022	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	339485327
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10102	NC_015733	GTG	2	6	466139	466144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485328
10103	NC_015733	TGG	2	6	466150	466155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485328
10104	NC_015733	TCA	2	6	466160	466165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485328
10105	NC_015733	AGCG	2	8	466288	466295	25 %	0 %	50 %	25 %	339485328
10106	NC_015733	CGC	2	6	466298	466303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485328
10107	NC_015733	GTTCG	2	10	466329	466338	0 %	40 %	40 %	20 %	339485328
10108	NC_015733	GCC	2	6	466360	466365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485328
10109	NC_015733	TCG	2	6	466396	466401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485328
10110	NC_015733	TACA	2	8	466413	466420	50 %	25 %	0 %	25 %	339485328
10111	NC_015733	GTC	2	6	466422	466427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485328
10112	NC_015733	GTC	2	6	466434	466439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485328
10113	NC_015733	GCT	2	6	466518	466523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485328
10114	NC_015733	TCT	2	6	466585	466590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485328
10115	NC_015733	TCGG	2	8	466591	466598	0 %	25 %	50 %	25 %	339485328
10116	NC_015733	GCG	2	6	466611	466616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485328
10117	NC_015733	GTA	2	6	466665	466670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485328
10118	NC_015733	CAT	2	6	466725	466730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485328
10119	NC_015733	TCG	2	6	466753	466758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485328
10120	NC_015733	TCA	2	6	466769	466774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485328
10121	NC_015733	TCA	2	6	466808	466813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485328
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10126	NC_015733	GC	3	6	466950	466955	0 %	0 %	50 %	50 %	339485328
10127	NC_015733	ATC	2	6	466956	466961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485328
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10143	NC_015733	CTG	3	9	467705	467713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485329
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10230	NC_015733	C	6	6	471048	471053	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10231	NC_015733	A	6	6	471240	471245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10357	NC_015733	CG	3	6	477554	477559	0 %	0 %	50 %	50 %	339485337
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10359	NC_015733	TCA	2	6	477690	477695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485337
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10455	NC_015733	CT	3	6	482113	482118	0 %	50 %	0 %	50 %	339485341
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10472	NC_015733	AGC	2	6	483200	483205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485342
10473	NC_015733	CAACCT	2	12	483261	483272	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	339485342
10474	NC_015733	TGG	3	9	483308	483316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485342
10475	NC_015733	GGCCA	2	10	483319	483328	20 %	0 %	40 %	40 %	339485342
10476	NC_015733	AGCTC	2	10	483348	483357	20 %	20 %	20 %	40 %	339485342
10477	NC_015733	GCC	2	6	483359	483364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485342
10478	NC_015733	CG	3	6	483368	483373	0 %	0 %	50 %	50 %	339485342
10479	NC_015733	GCTG	2	8	483390	483397	0 %	25 %	50 %	25 %	339485342
10480	NC_015733	GCT	2	6	483456	483461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485342
10481	NC_015733	GAA	2	6	483576	483581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485342
10482	NC_015733	CTG	2	6	483589	483594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485342
10483	NC_015733	TGC	2	6	483602	483607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485342
10484	NC_015733	TGT	2	6	483608	483613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485342
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10486	NC_015733	CG	3	6	483680	483685	0 %	0 %	50 %	50 %	339485342
10487	NC_015733	GAA	2	6	483712	483717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485342
10488	NC_015733	TACGC	2	10	483791	483800	20 %	20 %	20 %	40 %	339485342
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10490	NC_015733	GC	3	6	483839	483844	0 %	0 %	50 %	50 %	339485342
10491	NC_015733	GCTG	2	8	483893	483900	0 %	25 %	50 %	25 %	339485342
10492	NC_015733	GCAC	2	8	483916	483923	25 %	0 %	25 %	50 %	339485342
10493	NC_015733	GCGG	2	8	483928	483935	0 %	0 %	75 %	25 %	339485342
10494	NC_015733	CTG	2	6	483979	483984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485342
10495	NC_015733	TGG	2	6	484211	484216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485342
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10499	NC_015733	TGGTG	2	10	484434	484443	0 %	40 %	60 %	0 %	339485342
10500	NC_015733	AGC	2	6	484496	484501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485342

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