MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015733	TTC	2	6	324471	324476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485217
7002	NC_015733	TGC	2	6	324533	324538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485217
7003	NC_015733	CAT	2	6	324564	324569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485217
7004	NC_015733	GC	3	6	324589	324594	0 %	0 %	50 %	50 %	339485217
7005	NC_015733	CGG	2	6	324752	324757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485217
7006	NC_015733	GCT	2	6	324788	324793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485217
7007	NC_015733	CGC	2	6	324812	324817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485217
7008	NC_015733	GTA	2	6	324870	324875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485217
7009	NC_015733	GCA	2	6	324896	324901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485217
7010	NC_015733	TCC	2	6	324907	324912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339485217
7011	NC_015733	AGT	2	6	324965	324970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485217
7012	NC_015733	CTG	2	6	324993	324998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485217
7013	NC_015733	ACACCC	2	12	325013	325024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485217
7014	NC_015733	TCTTG	2	10	325186	325195	0 %	60 %	20 %	20 %	339485218
7015	NC_015733	GGC	2	6	325217	325222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485218
7016	NC_015733	GGC	2	6	325249	325254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485218
7017	NC_015733	CGTT	2	8	325317	325324	0 %	50 %	25 %	25 %	339485218
7018	NC_015733	GC	3	6	325350	325355	0 %	0 %	50 %	50 %	339485218
7019	NC_015733	CGA	2	6	325366	325371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485218
7020	NC_015733	TAC	2	6	325487	325492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485218
7021	NC_015733	CGC	2	6	325540	325545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485218
7022	NC_015733	TGA	2	6	325624	325629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485218
7023	NC_015733	TCT	2	6	325666	325671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485218
7024	NC_015733	TGA	2	6	325753	325758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485218
7025	NC_015733	CGGCA	2	10	325805	325814	20 %	0 %	40 %	40 %	339485218
7026	NC_015733	CAG	2	6	325886	325891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485218
7027	NC_015733	GCC	2	6	325892	325897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485218
7028	NC_015733	GC	3	6	325986	325991	0 %	0 %	50 %	50 %	339485218
7029	NC_015733	GCA	2	6	326005	326010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485218
7030	NC_015733	GTC	2	6	326015	326020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485218
7031	NC_015733	GCG	2	6	326053	326058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485218
7032	NC_015733	CG	3	6	326112	326117	0 %	0 %	50 %	50 %	339485218
7033	NC_015733	GTC	2	6	326249	326254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485218
7034	NC_015733	GCC	2	6	326334	326339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485218
7035	NC_015733	TGG	2	6	326347	326352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485218
7036	NC_015733	GCGG	2	8	326359	326366	0 %	0 %	75 %	25 %	339485218
7037	NC_015733	GCC	2	6	326414	326419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485218
7038	NC_015733	GC	3	6	326469	326474	0 %	0 %	50 %	50 %	339485218
7039	NC_015733	GGC	2	6	326519	326524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485218
7040	NC_015733	GCG	2	6	326550	326555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485218
7041	NC_015733	GCC	2	6	326570	326575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485218
7042	NC_015733	GGCT	2	8	326688	326695	0 %	25 %	50 %	25 %	339485218
7043	NC_015733	GTT	2	6	326822	326827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485218
7044	NC_015733	CGTT	2	8	326862	326869	0 %	50 %	25 %	25 %	339485218
7045	NC_015733	GCA	2	6	327061	327066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485218
7046	NC_015733	GCA	2	6	327070	327075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485218
7047	NC_015733	GAT	2	6	327305	327310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485218
7048	NC_015733	CAG	2	6	327311	327316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485218
7049	NC_015733	ACA	2	6	327467	327472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_015733	TG	3	6	327515	327520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_015733	TGC	2	6	327611	327616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_015733	CCCT	2	8	327641	327648	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7053	NC_015733	AAG	2	6	327651	327656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_015733	CGG	2	6	327683	327688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485219
7055	NC_015733	CAT	2	6	327729	327734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485219
7056	NC_015733	GCTG	2	8	327755	327762	0 %	25 %	50 %	25 %	339485219
7057	NC_015733	GCC	2	6	327772	327777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485219
7058	NC_015733	CCAT	2	8	327782	327789	25 %	25 %	0 %	50 %	339485219
7059	NC_015733	GCG	2	6	327874	327879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485219
7060	NC_015733	CTT	2	6	327957	327962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485219
7061	NC_015733	CGG	2	6	327980	327985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485219
7062	NC_015733	GGT	2	6	327994	327999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485219
7063	NC_015733	GGCC	2	8	328026	328033	0 %	0 %	50 %	50 %	339485219
7064	NC_015733	GGCCTG	2	12	328141	328152	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339485219
7065	NC_015733	AAG	2	6	328301	328306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485219
7066	NC_015733	TCG	2	6	328325	328330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485219
7067	NC_015733	GGC	2	6	328335	328340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485219
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7069	NC_015733	ACCG	2	8	328453	328460	25 %	0 %	25 %	50 %	339485219
7070	NC_015733	CTGG	2	8	328509	328516	0 %	25 %	50 %	25 %	339485219
7071	NC_015733	CGG	2	6	328535	328540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485219
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7078	NC_015733	CGT	2	6	328721	328726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485219
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7080	NC_015733	GGC	2	6	328839	328844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485219
7081	NC_015733	CAT	2	6	328851	328856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485219
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7086	NC_015733	GGC	2	6	329019	329024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485219
7087	NC_015733	GCT	2	6	329041	329046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485219
7088	NC_015733	ATGAC	2	10	329048	329057	40 %	20 %	20 %	20 %	339485219
7089	NC_015733	CTG	2	6	329077	329082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485219
7090	NC_015733	GC	3	6	329197	329202	0 %	0 %	50 %	50 %	339485219
7091	NC_015733	GGC	2	6	329217	329222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485219
7092	NC_015733	CTG	2	6	329245	329250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485219
7093	NC_015733	TGG	2	6	329261	329266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485219
7094	NC_015733	AGA	2	6	329303	329308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485219
7095	NC_015733	GCTGT	2	10	329311	329320	0 %	40 %	40 %	20 %	339485219
7096	NC_015733	ATTG	2	8	329324	329331	25 %	50 %	25 %	0 %	339485219
7097	NC_015733	AGC	2	6	329417	329422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7098	NC_015733	GATC	2	8	329716	329723	25 %	25 %	25 %	25 %	339485220
7099	NC_015733	CGA	2	6	329755	329760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485220
7100	NC_015733	GGCAT	2	10	329795	329804	20 %	20 %	40 %	20 %	339485220
7101	NC_015733	AAG	2	6	329825	329830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485220
7102	NC_015733	CG	3	6	329880	329885	0 %	0 %	50 %	50 %	339485220
7103	NC_015733	TTC	2	6	329981	329986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485220
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7105	NC_015733	CGA	2	6	330112	330117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485220
7106	NC_015733	CCA	2	6	330141	330146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485220
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7108	NC_015733	GAA	2	6	330434	330439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485221
7109	NC_015733	ACG	2	6	330441	330446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485221
7110	NC_015733	CTT	2	6	330484	330489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485221
7111	NC_015733	ACC	2	6	330567	330572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485221
7112	NC_015733	GGT	2	6	330652	330657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485221
7113	NC_015733	CGC	2	6	330685	330690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485221
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7116	NC_015733	TCA	2	6	330828	330833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485222
7117	NC_015733	GAGCTG	2	12	330899	330910	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339485222
7118	NC_015733	TAC	2	6	330968	330973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485222
7119	NC_015733	ACAG	2	8	331071	331078	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7120	NC_015733	TGCG	2	8	331127	331134	0 %	25 %	50 %	25 %	339485223
7121	NC_015733	CGA	2	6	331174	331179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485223
7122	NC_015733	GCC	2	6	331193	331198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485223
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7125	NC_015733	CGCT	2	8	331340	331347	0 %	25 %	25 %	50 %	339485223
7126	NC_015733	ATC	2	6	331391	331396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485223
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7231	NC_015733	GGCAC	2	10	336408	336417	20 %	0 %	40 %	40 %	339485228
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7234	NC_015733	GCC	2	6	336531	336536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485228
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7240	NC_015733	GCG	2	6	336705	336710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485228
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