MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015733	CAC	2	6	280045	280050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485176
6002	NC_015733	GCAC	2	8	280084	280091	25 %	0 %	25 %	50 %	339485176
6003	NC_015733	TGA	2	6	280116	280121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485176
6004	NC_015733	CGGA	2	8	280263	280270	25 %	0 %	50 %	25 %	339485176
6005	NC_015733	ATG	2	6	280282	280287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485176
6006	NC_015733	TTC	2	6	280329	280334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485177
6007	NC_015733	TCG	2	6	280360	280365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485177
6008	NC_015733	TGA	2	6	280402	280407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485177
6009	NC_015733	GC	3	6	280460	280465	0 %	0 %	50 %	50 %	339485177
6010	NC_015733	CGA	2	6	280478	280483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485177
6011	NC_015733	AGC	2	6	280555	280560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485177
6012	NC_015733	GCC	2	6	280643	280648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485177
6013	NC_015733	ACCCGC	2	12	280705	280716	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	339485177
6014	NC_015733	AGA	2	6	280726	280731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485177
6015	NC_015733	GGTT	2	8	280746	280753	0 %	50 %	50 %	0 %	339485177
6016	NC_015733	TGT	2	6	280768	280773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485177
6017	NC_015733	CGC	2	6	280835	280840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485177
6018	NC_015733	GCGCGA	2	12	280955	280966	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339485177
6019	NC_015733	CGCCTG	2	12	281013	281024	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339485177
6020	NC_015733	TCGTTG	2	12	281025	281036	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	339485177
6021	NC_015733	GACAGC	2	12	281040	281051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485177
6022	NC_015733	GAC	2	6	281061	281066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485177
6023	NC_015733	GAG	2	6	281148	281153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339485177
6024	NC_015733	GTG	2	6	281181	281186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485177
6025	NC_015733	GAA	2	6	281205	281210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485177
6026	NC_015733	CAC	2	6	281304	281309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485177
6027	NC_015733	GCC	2	6	281331	281336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485177
6028	NC_015733	CGA	2	6	281348	281353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485177
6029	NC_015733	CGA	2	6	281402	281407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485177
6030	NC_015733	GTG	2	6	281443	281448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485177
6031	NC_015733	G	7	7	281458	281464	0 %	0 %	100 %	0 %	339485177
6032	NC_015733	GGGCTG	2	12	281475	281486	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	339485177
6033	NC_015733	GCA	2	6	281510	281515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485177
6034	NC_015733	TGG	2	6	281516	281521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485177
6035	NC_015733	TGG	2	6	281546	281551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485177
6036	NC_015733	GCA	2	6	281710	281715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_015733	TTC	2	6	281767	281772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485178
6038	NC_015733	GAT	2	6	281784	281789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485178
6039	NC_015733	GGC	2	6	281793	281798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485178
6040	NC_015733	GGT	2	6	281811	281816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485178
6041	NC_015733	CG	3	6	281925	281930	0 %	0 %	50 %	50 %	339485178
6042	NC_015733	TTC	2	6	281946	281951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485178
6043	NC_015733	AGC	2	6	282062	282067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485178
6044	NC_015733	ATG	2	6	282109	282114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485178
6045	NC_015733	CGG	2	6	282152	282157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485178
6046	NC_015733	TGG	2	6	282161	282166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485178
6047	NC_015733	CAC	2	6	282177	282182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485178
6048	NC_015733	GTC	2	6	282258	282263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485178
6049	NC_015733	GCCGC	2	10	282300	282309	0 %	0 %	40 %	60 %	339485178
6050	NC_015733	AC	3	6	282377	282382	50 %	0 %	0 %	50 %	339485178
6051	NC_015733	CAT	2	6	282384	282389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485178
6052	NC_015733	GCA	2	6	282401	282406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485178
6053	NC_015733	TGGC	2	8	282502	282509	0 %	25 %	50 %	25 %	339485178
6054	NC_015733	CAC	2	6	282540	282545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485178
6055	NC_015733	GGC	2	6	282581	282586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485178
6056	NC_015733	ACAGC	2	10	282614	282623	40 %	0 %	20 %	40 %	339485178
6057	NC_015733	GCA	2	6	282633	282638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485179
6058	NC_015733	ACC	2	6	282705	282710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485179
6059	NC_015733	CA	3	6	282795	282800	50 %	0 %	0 %	50 %	339485179
6060	NC_015733	GCG	2	6	282899	282904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485179
6061	NC_015733	CAC	2	6	282917	282922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485179
6062	NC_015733	GC	3	6	283029	283034	0 %	0 %	50 %	50 %	339485179
6063	NC_015733	GGT	2	6	283132	283137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_015733	CGG	2	6	283150	283155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_015733	T	6	6	283159	283164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_015733	GTA	2	6	283181	283186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_015733	GAC	3	9	283239	283247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485180
6068	NC_015733	GGC	2	6	283274	283279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485180
6069	NC_015733	CG	3	6	283296	283301	0 %	0 %	50 %	50 %	339485180
6070	NC_015733	GGC	2	6	283310	283315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485180
6071	NC_015733	GGGT	2	8	283375	283382	0 %	25 %	75 %	0 %	339485180
6072	NC_015733	TGC	2	6	283393	283398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485180
6073	NC_015733	CGA	2	6	283409	283414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485180
6074	NC_015733	GTG	3	9	283422	283430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485180
6075	NC_015733	GGT	2	6	283442	283447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485180
6076	NC_015733	GCG	2	6	283448	283453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485180
6077	NC_015733	GGC	2	6	283517	283522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485180
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6079	NC_015733	GGC	2	6	283564	283569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485180
6080	NC_015733	AAG	2	6	283575	283580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485180
6081	NC_015733	GCG	2	6	283583	283588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485180
6082	NC_015733	TCA	2	6	283595	283600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485180
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6084	NC_015733	GCG	2	6	283853	283858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485181
6085	NC_015733	AGC	2	6	283862	283867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485181
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6087	NC_015733	CCG	2	6	283900	283905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485181
6088	NC_015733	CCA	2	6	283937	283942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485181
6089	NC_015733	ACC	2	6	283978	283983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485181
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6091	NC_015733	CAG	2	6	284034	284039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485181
6092	NC_015733	TAG	2	6	284113	284118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485181
6093	NC_015733	CAC	2	6	284130	284135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485181
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6095	NC_015733	CAT	2	6	284145	284150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485181
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6098	NC_015733	GC	3	6	284201	284206	0 %	0 %	50 %	50 %	339485181
6099	NC_015733	CAC	2	6	284211	284216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485181
6100	NC_015733	CGA	3	9	284318	284326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485181
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6103	NC_015733	TCG	2	6	284416	284421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485181
6104	NC_015733	AGC	2	6	284482	284487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_015733	ACC	2	6	284513	284518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6106	NC_015733	TCA	2	6	284641	284646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_015733	CGA	2	6	284712	284717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485182
6108	NC_015733	GCG	2	6	284729	284734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485182
6109	NC_015733	TC	3	6	284743	284748	0 %	50 %	0 %	50 %	339485182
6110	NC_015733	CGC	2	6	284760	284765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485182
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6114	NC_015733	CTG	2	6	284866	284871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485182
6115	NC_015733	CCTGAC	2	12	285015	285026	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339485182
6116	NC_015733	ACT	2	6	285104	285109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485182
6117	NC_015733	GGC	2	6	285157	285162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485182
6118	NC_015733	CTG	3	9	285175	285183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485182
6119	NC_015733	CG	3	6	285194	285199	0 %	0 %	50 %	50 %	339485182
6120	NC_015733	GAA	2	6	285226	285231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485182
6121	NC_015733	GCA	2	6	285237	285242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485182
6122	NC_015733	TGT	2	6	285243	285248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485182
6123	NC_015733	CCA	2	6	285257	285262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485182
6124	NC_015733	GCT	2	6	285371	285376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485182
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6126	NC_015733	GGC	2	6	285448	285453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485182
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6130	NC_015733	T	7	7	285636	285642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_015733	T	6	6	285669	285674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_015733	GTA	2	6	285679	285684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_015733	T	6	6	285686	285691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_015733	AAG	2	6	285802	285807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485183
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6173	NC_015733	AGCC	2	8	287493	287500	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6235	NC_015733	CTGC	2	8	289548	289555	0 %	25 %	25 %	50 %	339485186
6236	NC_015733	GCC	2	6	289714	289719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485186
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6240	NC_015733	GCA	2	6	289941	289946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485186
6241	NC_015733	GC	3	6	290047	290052	0 %	0 %	50 %	50 %	339485186
6242	NC_015733	GTC	2	6	290134	290139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485186
6243	NC_015733	GCCATG	2	12	290143	290154	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339485186
6244	NC_015733	GCA	2	6	290244	290249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485186
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6263	NC_015733	GC	3	6	291054	291059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6264	NC_015733	ACC	2	6	291064	291069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6265	NC_015733	CCG	2	6	291158	291163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485187
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6481	NC_015733	GCA	2	6	300835	300840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6483	NC_015733	ACG	2	6	300945	300950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6484	NC_015733	CAC	2	6	301180	301185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485197
6485	NC_015733	CACC	2	8	301200	301207	25 %	0 %	0 %	75 %	339485197
6486	NC_015733	GTA	2	6	301237	301242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485197
6487	NC_015733	GCC	2	6	301268	301273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485197
6488	NC_015733	TGCG	2	8	301289	301296	0 %	25 %	50 %	25 %	339485197
6489	NC_015733	GCA	2	6	301332	301337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485197
6490	NC_015733	GTG	2	6	301340	301345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485197
6491	NC_015733	GTT	2	6	301480	301485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485197
6492	NC_015733	CG	3	6	301575	301580	0 %	0 %	50 %	50 %	339485197
6493	NC_015733	GCG	2	6	301633	301638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485197
6494	NC_015733	CAGCTC	2	12	301645	301656	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339485197
6495	NC_015733	GTG	2	6	301670	301675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485197
6496	NC_015733	TTC	2	6	301729	301734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339485197
6497	NC_015733	CGT	2	6	301743	301748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485197
6498	NC_015733	CGC	2	6	301788	301793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485197
6499	NC_015733	TGCTGT	2	12	301878	301889	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	339485197
6500	NC_015733	TTG	2	6	301913	301918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485197

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