MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas putida S16 chromosome

Total Repeats: 129509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015733	GTC	2	6	211525	211530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485122
4502	NC_015733	GGC	2	6	211639	211644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485123
4503	NC_015733	CTG	2	6	211649	211654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4504	NC_015733	GCT	2	6	211697	211702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4505	NC_015733	GCT	3	9	211738	211746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4506	NC_015733	GCG	2	6	211752	211757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485123
4507	NC_015733	TTG	2	6	211779	211784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485123
4508	NC_015733	CAG	2	6	211808	211813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4509	NC_015733	CTG	2	6	211841	211846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4510	NC_015733	GCT	2	6	211849	211854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4511	NC_015733	GC	3	6	211888	211893	0 %	0 %	50 %	50 %	339485123
4512	NC_015733	CAG	2	6	211943	211948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4513	NC_015733	CAG	2	6	212081	212086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4514	NC_015733	CAGGCA	2	12	212090	212101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485123
4515	NC_015733	TGC	2	6	212179	212184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485124
4516	NC_015733	GCGAC	2	10	212186	212195	20 %	0 %	40 %	40 %	339485124
4517	NC_015733	GGCTG	2	10	212241	212250	0 %	20 %	60 %	20 %	339485124
4518	NC_015733	GCC	2	6	212253	212258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485124
4519	NC_015733	CTG	2	6	212280	212285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485124
4520	NC_015733	TGT	2	6	212309	212314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485124
4521	NC_015733	CTG	2	6	212364	212369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485124
4522	NC_015733	GTC	2	6	212433	212438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485124
4523	NC_015733	TGA	2	6	212441	212446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485124
4524	NC_015733	GGT	2	6	212502	212507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485124
4525	NC_015733	GTA	2	6	212562	212567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485124
4526	NC_015733	CGC	2	6	212585	212590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485124
4527	NC_015733	GAT	2	6	212607	212612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485124
4528	NC_015733	GCC	2	6	212620	212625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485124
4529	NC_015733	CCG	2	6	212662	212667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485124
4530	NC_015733	GAA	2	6	212706	212711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339485124
4531	NC_015733	CAT	2	6	212717	212722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485124
4532	NC_015733	AGT	2	6	212727	212732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485124
4533	NC_015733	CGG	2	6	212744	212749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485124
4534	NC_015733	GCC	3	9	212751	212759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485124
4535	NC_015733	GTG	2	6	212854	212859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485124
4536	NC_015733	TTG	2	6	213011	213016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485125
4537	NC_015733	GTA	2	6	213103	213108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485125
4538	NC_015733	TTGCTC	2	12	213130	213141	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	339485125
4539	NC_015733	TCG	2	6	213239	213244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485125
4540	NC_015733	CTG	2	6	213310	213315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485125
4541	NC_015733	GC	3	6	213329	213334	0 %	0 %	50 %	50 %	339485125
4542	NC_015733	GGGT	2	8	213507	213514	0 %	25 %	75 %	0 %	339485125
4543	NC_015733	CCA	2	6	213632	213637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485125
4544	NC_015733	CAC	2	6	213640	213645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485125
4545	NC_015733	GCC	2	6	213649	213654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485125
4546	NC_015733	CAT	2	6	213703	213708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485125
4547	NC_015733	CG	4	8	213885	213892	0 %	0 %	50 %	50 %	339485125
4548	NC_015733	TCGG	2	8	213911	213918	0 %	25 %	50 %	25 %	339485125
4549	NC_015733	GC	3	6	213974	213979	0 %	0 %	50 %	50 %	339485125
4550	NC_015733	CGG	2	6	213999	214004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485125
4551	NC_015733	CCAG	2	8	214017	214024	25 %	0 %	25 %	50 %	339485125
4552	NC_015733	TTG	2	6	214052	214057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485125
4553	NC_015733	GCG	2	6	214058	214063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485125
4554	NC_015733	CAG	2	6	214123	214128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485125
4555	NC_015733	CGGGT	2	10	214182	214191	0 %	20 %	60 %	20 %	339485125
4556	NC_015733	GTC	2	6	214243	214248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485125
4557	NC_015733	CGGCC	2	10	214252	214261	0 %	0 %	40 %	60 %	339485125
4558	NC_015733	ATC	2	6	214268	214273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485125
4559	NC_015733	GCA	2	6	214311	214316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485125
4560	NC_015733	CGT	2	6	214320	214325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485125
4561	NC_015733	GTA	2	6	214345	214350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485125
4562	NC_015733	GCT	2	6	214370	214375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485125
4563	NC_015733	GGC	2	6	214416	214421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485125
4564	NC_015733	CAG	3	9	214517	214525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4565	NC_015733	GCT	2	6	214580	214585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4566	NC_015733	CAG	2	6	214604	214609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4567	NC_015733	GTA	2	6	214619	214624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485126
4568	NC_015733	GCCC	2	8	214633	214640	0 %	0 %	25 %	75 %	339485126
4569	NC_015733	CTG	2	6	214701	214706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4570	NC_015733	CAG	2	6	214712	214717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4571	NC_015733	GCA	2	6	214720	214725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4572	NC_015733	GGC	2	6	214735	214740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485126
4573	NC_015733	TGG	2	6	214879	214884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485126
4574	NC_015733	GCG	2	6	214918	214923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485126
4575	NC_015733	GCT	2	6	214997	215002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4576	NC_015733	GCTCCA	2	12	215041	215052	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339485126
4577	NC_015733	CAG	2	6	215054	215059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4578	NC_015733	AGC	2	6	215075	215080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4579	NC_015733	ACCGA	2	10	215097	215106	40 %	0 %	20 %	40 %	339485126
4580	NC_015733	CGG	2	6	215212	215217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485126
4581	NC_015733	GCTC	2	8	215251	215258	0 %	25 %	25 %	50 %	339485126
4582	NC_015733	CTG	2	6	215439	215444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485126
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4584	NC_015733	CAG	4	12	215525	215536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4585	NC_015733	CCA	2	6	215551	215556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485126
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4587	NC_015733	AGC	2	6	215625	215630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485126
4588	NC_015733	CCA	2	6	215759	215764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339485127
4589	NC_015733	CAG	3	9	215769	215777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485127
4590	NC_015733	TG	3	6	215798	215803	0 %	50 %	50 %	0 %	339485127
4591	NC_015733	GCG	2	6	215812	215817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485127
4592	NC_015733	TCG	2	6	215824	215829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485127
4593	NC_015733	GC	3	6	215860	215865	0 %	0 %	50 %	50 %	339485127
4594	NC_015733	CAG	2	6	215919	215924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485127
4595	NC_015733	CGCTG	2	10	215961	215970	0 %	20 %	40 %	40 %	339485127
4596	NC_015733	GGC	2	6	215990	215995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485127
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4599	NC_015733	GCA	2	6	216032	216037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485127
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4601	NC_015733	GCC	2	6	216082	216087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485127
4602	NC_015733	GCT	2	6	216095	216100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485127
4603	NC_015733	CAG	2	6	216111	216116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485127
4604	NC_015733	GTT	2	6	216161	216166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339485127
4605	NC_015733	AGC	2	6	216175	216180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485127
4606	NC_015733	CAG	2	6	216195	216200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339485127
4607	NC_015733	AAC	2	6	216306	216311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339485127
4608	NC_015733	CAT	2	6	216348	216353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339485128
4609	NC_015733	TCG	2	6	216517	216522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485128
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4614	NC_015733	CGG	2	6	216917	216922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485128
4615	NC_015733	TGG	2	6	216938	216943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485128
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4617	NC_015733	GGC	2	6	216972	216977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485128
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4619	NC_015733	GTA	2	6	217056	217061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485128
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4742	NC_015733	CTC	2	6	222417	222422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4748	NC_015733	GTC	2	6	222642	222647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4755	NC_015733	CTG	2	6	223008	223013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4871	NC_015733	GCC	2	6	229102	229107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485133
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4875	NC_015733	GCC	2	6	229284	229289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485133
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4982	NC_015733	GCC	2	6	234032	234037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339485138
4983	NC_015733	TGC	2	6	234155	234160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485138
4984	NC_015733	GGC	2	6	234162	234167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485138
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4986	NC_015733	GCGAG	2	10	234271	234280	20 %	0 %	60 %	20 %	339485139
4987	NC_015733	AGG	2	6	234301	234306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339485139
4988	NC_015733	GTC	2	6	234315	234320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339485139
4989	NC_015733	CGCC	2	8	234326	234333	0 %	0 %	25 %	75 %	339485139
4990	NC_015733	GCG	2	6	234366	234371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339485139
4991	NC_015733	GAT	2	6	234402	234407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339485139
4992	NC_015733	GTG	2	6	234423	234428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485139
4993	NC_015733	TGCA	2	8	234610	234617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4994	NC_015733	CGA	2	6	234631	234636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4995	NC_015733	GGT	2	6	234658	234663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4996	NC_015733	CAC	2	6	234692	234697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4997	NC_015733	TGG	2	6	234736	234741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339485140
4998	NC_015733	TCC	2	6	234845	234850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4999	NC_015733	TTTC	2	8	234858	234865	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5000	NC_015733	CACAG	2	10	234989	234998	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

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