MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 34341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015680	TAT	2	6	200826	200831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_015680	GAA	2	6	200859	200864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_015680	ATCCG	2	10	200876	200885	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4004	NC_015680	GAA	2	6	200888	200893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_015680	T	6	6	200943	200948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_015680	ATT	2	6	200971	200976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_015680	CAA	2	6	200982	200987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_015680	CCT	2	6	200988	200993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_015680	TAC	2	6	201001	201006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_015680	CT	3	6	201042	201047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_015680	TGGA	2	8	201057	201064	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_015680	CTT	2	6	201104	201109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_015680	TGGC	2	8	201244	201251	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_015680	TGT	2	6	201252	201257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_015680	CTT	2	6	201305	201310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283745
4016	NC_015680	ACT	3	9	201361	201369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283745
4017	NC_015680	TCT	2	6	201457	201462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283745
4018	NC_015680	GGA	2	6	201526	201531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283745
4019	NC_015680	AGG	2	6	201615	201620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283745
4020	NC_015680	ATA	2	6	201726	201731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283745
4021	NC_015680	GGC	2	6	201807	201812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283745
4022	NC_015680	TTA	2	6	201853	201858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283745
4023	NC_015680	GGA	2	6	201869	201874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283745
4024	NC_015680	CCG	2	6	201982	201987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_015680	GT	3	6	202027	202032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015680	CGTG	2	8	202057	202064	0 %	25 %	50 %	25 %	337283746
4027	NC_015680	AGC	2	6	202092	202097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283746
4028	NC_015680	CCA	2	6	202143	202148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283746
4029	NC_015680	CGA	2	6	202201	202206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283746
4030	NC_015680	AGA	2	6	202215	202220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283746
4031	NC_015680	GAG	2	6	202223	202228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283746
4032	NC_015680	GCCT	2	8	202404	202411	0 %	25 %	25 %	50 %	337283746
4033	NC_015680	GAA	3	9	202471	202479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283746
4034	NC_015680	GGT	2	6	202484	202489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_015680	A	6	6	202517	202522	100 %	0 %	0 %	0 %	337283747
4036	NC_015680	CAAGAA	2	12	202598	202609	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	337283747
4037	NC_015680	GGC	2	6	202670	202675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283747
4038	NC_015680	GCA	2	6	202703	202708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283747
4039	NC_015680	AAG	2	6	202824	202829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283747
4040	NC_015680	AGGC	2	8	202848	202855	25 %	0 %	50 %	25 %	337283747
4041	NC_015680	AGG	2	6	202930	202935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283747
4042	NC_015680	CAAGC	2	10	203010	203019	40 %	0 %	20 %	40 %	337283747
4043	NC_015680	GTG	2	6	203029	203034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283747
4044	NC_015680	GAG	2	6	203045	203050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283748
4045	NC_015680	AGA	2	6	203064	203069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283748
4046	NC_015680	CTC	2	6	203098	203103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283748
4047	NC_015680	ACA	3	9	203106	203114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283748
4048	NC_015680	CAT	2	6	203116	203121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283748
4049	NC_015680	GTG	2	6	203166	203171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283748
4050	NC_015680	GTC	2	6	203177	203182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283748
4051	NC_015680	AG	3	6	203232	203237	50 %	0 %	50 %	0 %	337283748
4052	NC_015680	AGG	2	6	203244	203249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283748
4053	NC_015680	TGG	2	6	203296	203301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283748
4054	NC_015680	GGC	2	6	203335	203340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283748
4055	NC_015680	GGC	2	6	203426	203431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283748
4056	NC_015680	TAGCA	2	10	203546	203555	40 %	20 %	20 %	20 %	337283749
4057	NC_015680	TGA	2	6	203609	203614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283749
4058	NC_015680	CGA	2	6	203648	203653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283749
4059	NC_015680	CAC	2	6	203687	203692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283749
4060	NC_015680	TC	3	6	203718	203723	0 %	50 %	0 %	50 %	337283749
4061	NC_015680	GAC	2	6	203802	203807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283749
4062	NC_015680	CTA	2	6	203936	203941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283749
4063	NC_015680	GA	3	6	204083	204088	50 %	0 %	50 %	0 %	337283749
4064	NC_015680	GAG	2	6	204120	204125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283749
4065	NC_015680	GTC	2	6	204186	204191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283749
4066	NC_015680	GTCCC	2	10	204308	204317	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4067	NC_015680	CCCCGC	2	12	204340	204351	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
4068	NC_015680	TCG	2	6	204379	204384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_015680	GGACC	2	10	204430	204439	20 %	0 %	40 %	40 %	337283750
4070	NC_015680	AGG	2	6	204456	204461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283750
4071	NC_015680	GAA	2	6	204479	204484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283750
4072	NC_015680	AAG	2	6	204542	204547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283750
4073	NC_015680	GTT	2	6	204609	204614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283750
4074	NC_015680	TTG	2	6	204658	204663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283750
4075	NC_015680	GAG	2	6	204732	204737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283750
4076	NC_015680	ATT	2	6	204798	204803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283751
4077	NC_015680	GAG	2	6	204867	204872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283751
4078	NC_015680	GTC	2	6	204873	204878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283751
4079	NC_015680	GAG	2	6	204974	204979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283751
4080	NC_015680	AGG	2	6	205017	205022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283751
4081	NC_015680	GAAG	2	8	205060	205067	50 %	0 %	50 %	0 %	337283751
4082	NC_015680	TGG	2	6	205205	205210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283751
4083	NC_015680	GGT	2	6	205221	205226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_015680	TTA	2	6	205284	205289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283752
4085	NC_015680	AAGGG	2	10	205298	205307	40 %	0 %	60 %	0 %	337283752
4086	NC_015680	CTGG	2	8	205382	205389	0 %	25 %	50 %	25 %	337283752
4087	NC_015680	AGG	2	6	205392	205397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283752
4088	NC_015680	GGC	2	6	205436	205441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283752
4089	NC_015680	GCC	2	6	205460	205465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283752
4090	NC_015680	CATAGC	2	12	205468	205479	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	337283752
4091	NC_015680	TCG	2	6	205488	205493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283752
4092	NC_015680	TCG	2	6	205551	205556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283752
4093	NC_015680	CCA	2	6	205596	205601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283752
4094	NC_015680	GGA	2	6	205778	205783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283753
4095	NC_015680	GAT	2	6	205800	205805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283753
4096	NC_015680	TGC	2	6	205824	205829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283753
4097	NC_015680	AGG	2	6	205830	205835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283753
4098	NC_015680	CGA	2	6	205862	205867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283753
4099	NC_015680	TCC	2	6	205932	205937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_015680	CGG	2	6	205972	205977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_015680	A	6	6	205985	205990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_015680	GGT	2	6	205997	206002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_015680	CTC	2	6	206110	206115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283754
4104	NC_015680	TGA	2	6	206178	206183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283754
4105	NC_015680	GGC	2	6	206231	206236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283755
4106	NC_015680	AGTTGA	2	12	206245	206256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283755
4107	NC_015680	CGC	2	6	206287	206292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283755
4108	NC_015680	AGG	2	6	206333	206338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283755
4109	NC_015680	ATA	2	6	206360	206365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283755
4110	NC_015680	GATA	2	8	206407	206414	50 %	25 %	25 %	0 %	337283755
4111	NC_015680	GACGG	2	10	206432	206441	20 %	0 %	60 %	20 %	337283755
4112	NC_015680	CGG	2	6	206542	206547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283755
4113	NC_015680	CAC	2	6	206554	206559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283755
4114	NC_015680	CTTCG	2	10	206579	206588	0 %	40 %	20 %	40 %	337283755
4115	NC_015680	CGA	2	6	206593	206598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283755
4116	NC_015680	ACT	2	6	206607	206612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283755
4117	NC_015680	CCT	2	6	206629	206634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283755
4118	NC_015680	CGT	2	6	206647	206652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283755
4119	NC_015680	TC	3	6	206753	206758	0 %	50 %	0 %	50 %	337283755
4120	NC_015680	GGA	2	6	206809	206814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283755
4121	NC_015680	AAT	2	6	206816	206821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283755
4122	NC_015680	GAG	3	9	206846	206854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283755
4123	NC_015680	CTA	2	6	206941	206946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283755
4124	NC_015680	CT	3	6	206952	206957	0 %	50 %	0 %	50 %	337283755
4125	NC_015680	ACG	2	6	207009	207014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283755
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4127	NC_015680	TGC	2	6	207263	207268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283756
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4130	NC_015680	CAGG	2	8	207329	207336	25 %	0 %	50 %	25 %	337283756
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4138	NC_015680	GGA	2	6	207779	207784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283756
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4140	NC_015680	TC	3	6	207881	207886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4141	NC_015680	GGT	2	6	207887	207892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_015680	GT	3	6	207891	207896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4222	NC_015680	AG	3	6	211883	211888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4223	NC_015680	A	6	6	211931	211936	100 %	0 %	0 %	0 %	337283761
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4242	NC_015680	TA	3	6	213084	213089	50 %	50 %	0 %	0 %	337283761
4243	NC_015680	GAG	3	9	213141	213149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283761
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4245	NC_015680	ACG	2	6	213228	213233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283762
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4248	NC_015680	CGG	2	6	213349	213354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283762
4249	NC_015680	CGG	2	6	213429	213434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283762
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4365	NC_015680	CAA	2	6	218672	218677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4366	NC_015680	CAA	2	6	218681	218686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4367	NC_015680	CG	3	6	218694	218699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4369	NC_015680	TC	3	6	218745	218750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4370	NC_015680	ATT	2	6	218767	218772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4372	NC_015680	ACG	2	6	218839	218844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4373	NC_015680	CGA	2	6	218858	218863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4374	NC_015680	TA	3	6	218914	218919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4375	NC_015680	A	6	6	218968	218973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4376	NC_015680	AGG	2	6	219003	219008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4377	NC_015680	AG	3	6	219014	219019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4378	NC_015680	ATT	2	6	219033	219038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4379	NC_015680	T	6	6	219109	219114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4380	NC_015680	TTA	2	6	219153	219158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4381	NC_015680	TGCC	2	8	219229	219236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4382	NC_015680	TAT	2	6	219237	219242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4383	NC_015680	AGG	2	6	219267	219272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4384	NC_015680	AGAA	2	8	219443	219450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4385	NC_015680	T	6	6	219496	219501	0 %	100 %	0 %	0 %	337283768
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4390	NC_015680	CCT	2	6	219654	219659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283768
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4405	NC_015680	CTTC	2	8	220281	220288	0 %	50 %	0 %	50 %	337283768
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4497	NC_015680	GAC	2	6	225509	225514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283772
4498	NC_015680	TCTT	2	8	225601	225608	0 %	75 %	0 %	25 %	337283772
4499	NC_015680	TA	3	6	225665	225670	50 %	50 %	0 %	0 %	337283772
4500	NC_015680	GAA	2	6	225686	225691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283772

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