MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 34341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_015680	AG	3	6	1649198	1649203	50 %	0 %	50 %	0 %	337285304
33003	NC_015680	TCT	3	9	1649249	1649257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285304
33004	NC_015680	GA	3	6	1649293	1649298	50 %	0 %	50 %	0 %	337285304
33005	NC_015680	ATA	2	6	1649323	1649328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285304
33006	NC_015680	GAAG	2	8	1649448	1649455	50 %	0 %	50 %	0 %	337285304
33007	NC_015680	GCC	2	6	1649488	1649493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337285304
33008	NC_015680	CTA	2	6	1649565	1649570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285304
33009	NC_015680	ACC	2	6	1649602	1649607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285304
33010	NC_015680	AGCG	2	8	1649619	1649626	25 %	0 %	50 %	25 %	337285304
33011	NC_015680	CGA	2	6	1649684	1649689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285304
33012	NC_015680	GCC	2	6	1649721	1649726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337285304
33013	NC_015680	AGG	3	9	1649779	1649787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285304
33014	NC_015680	GGTT	2	8	1649791	1649798	0 %	50 %	50 %	0 %	337285304
33015	NC_015680	AAG	2	6	1649879	1649884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285304
33016	NC_015680	GAG	2	6	1649916	1649921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285304
33017	NC_015680	GAG	2	6	1649938	1649943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285304
33018	NC_015680	GAG	2	6	1649947	1649952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285304
33019	NC_015680	TCA	2	6	1649975	1649980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285304
33020	NC_015680	ATA	2	6	1650004	1650009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285304
33021	NC_015680	GA	4	8	1650015	1650022	50 %	0 %	50 %	0 %	337285304
33022	NC_015680	AAC	2	6	1650124	1650129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337285305
33023	NC_015680	CTC	2	6	1650207	1650212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285305
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33025	NC_015680	TCT	2	6	1650255	1650260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285305
33026	NC_015680	ACC	2	6	1650271	1650276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33027	NC_015680	TG	3	6	1650310	1650315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33028	NC_015680	TC	3	6	1650318	1650323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33029	NC_015680	TCC	2	6	1650341	1650346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33030	NC_015680	CGTC	2	8	1650380	1650387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33031	NC_015680	GAT	2	6	1650534	1650539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285306
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33034	NC_015680	GTCTT	2	10	1650613	1650622	0 %	60 %	20 %	20 %	337285306
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33038	NC_015680	TC	3	6	1650810	1650815	0 %	50 %	0 %	50 %	337285306
33039	NC_015680	AGG	2	6	1650917	1650922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285306
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33041	NC_015680	TGT	2	6	1650974	1650979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337285306
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33043	NC_015680	CAGT	2	8	1651007	1651014	25 %	25 %	25 %	25 %	337285306
33044	NC_015680	TAT	2	6	1651074	1651079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285306
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33046	NC_015680	GGCCA	2	10	1651133	1651142	20 %	0 %	40 %	40 %	337285306
33047	NC_015680	GCCT	2	8	1651164	1651171	0 %	25 %	25 %	50 %	337285306
33048	NC_015680	ATC	2	6	1651276	1651281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285306
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33050	NC_015680	TCC	2	6	1651412	1651417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285307
33051	NC_015680	C	6	6	1651416	1651421	0 %	0 %	0 %	100 %	337285307
33052	NC_015680	AT	3	6	1651456	1651461	50 %	50 %	0 %	0 %	337285307
33053	NC_015680	ACG	2	6	1651484	1651489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285307
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33056	NC_015680	TCG	2	6	1651745	1651750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285307
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33063	NC_015680	GAG	2	6	1652155	1652160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285307
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33065	NC_015680	GACG	2	8	1652205	1652212	25 %	0 %	50 %	25 %	337285307
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33101	NC_015680	CTC	2	6	1654284	1654289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285308
33102	NC_015680	GGC	2	6	1654295	1654300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337285308
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33108	NC_015680	AGT	2	6	1654648	1654653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285308
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33113	NC_015680	TTA	2	6	1655040	1655045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33114	NC_015680	TGA	2	6	1655108	1655113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285309
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33118	NC_015680	GAT	2	6	1655211	1655216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285309
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33222	NC_015680	CCCTC	2	10	1660022	1660031	0 %	20 %	0 %	80 %	337285313
33223	NC_015680	CGT	2	6	1660050	1660055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285313
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33228	NC_015680	CT	3	6	1660275	1660280	0 %	50 %	0 %	50 %	337285313
33229	NC_015680	CT	3	6	1660288	1660293	0 %	50 %	0 %	50 %	337285313
33230	NC_015680	ATA	2	6	1660496	1660501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33231	NC_015680	TGA	2	6	1660504	1660509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33232	NC_015680	CTC	2	6	1660549	1660554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285314
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33403	NC_015680	CGG	2	6	1668698	1668703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337285322
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33405	NC_015680	ACT	2	6	1668805	1668810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285322
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33420	NC_015680	GAG	2	6	1669698	1669703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285322
33421	NC_015680	CAGC	2	8	1669790	1669797	25 %	0 %	25 %	50 %	337285322
33422	NC_015680	TTC	2	6	1669852	1669857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285323
33423	NC_015680	CTC	2	6	1669873	1669878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285323
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33426	NC_015680	GAG	2	6	1669957	1669962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285323
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33429	NC_015680	TGC	2	6	1670435	1670440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285323
33430	NC_015680	A	6	6	1670456	1670461	100 %	0 %	0 %	0 %	337285323
33431	NC_015680	TCG	2	6	1670486	1670491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285323
33432	NC_015680	TCA	2	6	1670571	1670576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33433	NC_015680	TCT	3	9	1670611	1670619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33434	NC_015680	GAA	2	6	1670660	1670665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285324
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33436	NC_015680	TAC	2	6	1670684	1670689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285324
33437	NC_015680	ATT	2	6	1670736	1670741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285324
33438	NC_015680	GCTCT	2	10	1670797	1670806	0 %	40 %	20 %	40 %	337285324
33439	NC_015680	CAA	2	6	1670866	1670871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337285324
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33442	NC_015680	ACC	2	6	1670939	1670944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285324
33443	NC_015680	GA	3	6	1670975	1670980	50 %	0 %	50 %	0 %	337285324
33444	NC_015680	CT	3	6	1671031	1671036	0 %	50 %	0 %	50 %	337285324
33445	NC_015680	GAT	2	6	1671097	1671102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285324
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33448	NC_015680	TC	3	6	1671367	1671372	0 %	50 %	0 %	50 %	337285325
33449	NC_015680	CGA	2	6	1671389	1671394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285325
33450	NC_015680	TCC	2	6	1671406	1671411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285325
33451	NC_015680	C	6	6	1671410	1671415	0 %	0 %	0 %	100 %	337285325
33452	NC_015680	ACG	2	6	1671481	1671486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285325
33453	NC_015680	TTG	2	6	1671523	1671528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337285325
33454	NC_015680	GAA	2	6	1671537	1671542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285325
33455	NC_015680	ACG	2	6	1671562	1671567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285325
33456	NC_015680	TCC	2	6	1671568	1671573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285325
33457	NC_015680	TAT	2	6	1671609	1671614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285325
33458	NC_015680	GTGG	2	8	1671654	1671661	0 %	25 %	75 %	0 %	337285325
33459	NC_015680	TCCC	2	8	1671673	1671680	0 %	25 %	0 %	75 %	337285325
33460	NC_015680	CAC	2	6	1671702	1671707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285325
33461	NC_015680	TCC	2	6	1671762	1671767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285326
33462	NC_015680	CCT	2	6	1671856	1671861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285326
33463	NC_015680	TCC	2	6	1671903	1671908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285326
33464	NC_015680	GA	3	6	1671910	1671915	50 %	0 %	50 %	0 %	337285326
33465	NC_015680	CCA	2	6	1671922	1671927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285326
33466	NC_015680	AG	3	6	1671968	1671973	50 %	0 %	50 %	0 %	337285326
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