MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 34341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_015680	CA	3	6	1551510	1551515	50 %	0 %	0 %	50 %	337285198
31003	NC_015680	TGG	2	6	1551550	1551555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285198
31004	NC_015680	TC	3	6	1551563	1551568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31005	NC_015680	CTC	2	6	1551574	1551579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31006	NC_015680	CT	3	6	1551587	1551592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31007	NC_015680	CTT	2	6	1551611	1551616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31008	NC_015680	TCTT	2	8	1551630	1551637	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31009	NC_015680	GGA	2	6	1551654	1551659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31010	NC_015680	CTT	2	6	1551699	1551704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31011	NC_015680	ATA	2	6	1551792	1551797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31012	NC_015680	TCT	2	6	1551826	1551831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31013	NC_015680	TCA	2	6	1551846	1551851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31014	NC_015680	T	6	6	1551949	1551954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31015	NC_015680	CT	3	6	1551958	1551963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31016	NC_015680	CTTTT	2	10	1551976	1551985	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31017	NC_015680	CCCCT	2	10	1552106	1552115	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
31018	NC_015680	AAT	2	6	1552116	1552121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31019	NC_015680	CGG	3	9	1552147	1552155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31020	NC_015680	TTA	2	6	1552189	1552194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285199
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31022	NC_015680	CTT	3	9	1552265	1552273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285199
31023	NC_015680	ACT	2	6	1552291	1552296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285199
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31029	NC_015680	CTG	2	6	1552584	1552589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285199
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31035	NC_015680	GA	3	6	1552743	1552748	50 %	0 %	50 %	0 %	337285199
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31038	NC_015680	TGA	2	6	1552966	1552971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285200
31039	NC_015680	TGG	2	6	1553004	1553009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285200
31040	NC_015680	CATAGC	2	12	1553026	1553037	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	337285200
31041	NC_015680	TA	3	6	1553042	1553047	50 %	50 %	0 %	0 %	337285200
31042	NC_015680	CTT	2	6	1553071	1553076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285200
31043	NC_015680	CTA	2	6	1553077	1553082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285200
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31045	NC_015680	CT	3	6	1553186	1553191	0 %	50 %	0 %	50 %	337285200
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31049	NC_015680	TC	3	6	1553333	1553338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31050	NC_015680	GCC	2	6	1553374	1553379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31051	NC_015680	CTG	2	6	1553400	1553405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285201
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31053	NC_015680	GAA	2	6	1553442	1553447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285201
31054	NC_015680	TACTT	2	10	1553512	1553521	20 %	60 %	0 %	20 %	337285201
31055	NC_015680	ACC	2	6	1553525	1553530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285201
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31057	NC_015680	GGC	2	6	1553806	1553811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337285201
31058	NC_015680	TTC	2	6	1553835	1553840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285201
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31088	NC_015680	CAT	2	6	1555180	1555185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31099	NC_015680	CTTT	2	8	1555782	1555789	0 %	75 %	0 %	25 %	337285203
31100	NC_015680	AAT	2	6	1555853	1555858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31101	NC_015680	TGG	2	6	1555914	1555919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31102	NC_015680	G	6	6	1555925	1555930	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31103	NC_015680	TTG	2	6	1555953	1555958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31104	NC_015680	T	6	6	1556106	1556111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31105	NC_015680	AAG	2	6	1556218	1556223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31106	NC_015680	CGAGG	2	10	1556291	1556300	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31107	NC_015680	CCGC	2	8	1556365	1556372	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31108	NC_015680	CTT	2	6	1556386	1556391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31109	NC_015680	GC	3	6	1556395	1556400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31110	NC_015680	CTT	2	6	1556476	1556481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31111	NC_015680	T	6	6	1556535	1556540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31112	NC_015680	TTCAT	2	10	1556569	1556578	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31113	NC_015680	TTAT	2	8	1556723	1556730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31114	NC_015680	T	7	7	1556738	1556744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31115	NC_015680	AGTT	2	8	1556745	1556752	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31116	NC_015680	CAC	2	6	1556761	1556766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31117	NC_015680	CTT	2	6	1556768	1556773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31118	NC_015680	GGT	2	6	1556860	1556865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31119	NC_015680	CAT	2	6	1556890	1556895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285204
31120	NC_015680	CTT	2	6	1556965	1556970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285204
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31122	NC_015680	AG	3	6	1557029	1557034	50 %	0 %	50 %	0 %	337285204
31123	NC_015680	CTC	2	6	1557119	1557124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285204
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31222	NC_015680	AAT	2	6	1561008	1561013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285207
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31233	NC_015680	GGCT	2	8	1561536	1561543	0 %	25 %	50 %	25 %	337285207
31234	NC_015680	CGAGA	2	10	1561734	1561743	40 %	0 %	40 %	20 %	337285207
31235	NC_015680	CGT	2	6	1561746	1561751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285207
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31343	NC_015680	AG	4	8	1567295	1567302	50 %	0 %	50 %	0 %	337285212
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31355	NC_015680	CAC	2	6	1567611	1567616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285212
31356	NC_015680	TTC	2	6	1567629	1567634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285212
31357	NC_015680	CAT	2	6	1567644	1567649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285212
31358	NC_015680	CGA	2	6	1567661	1567666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285212
31359	NC_015680	ATT	2	6	1567693	1567698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285212
31360	NC_015680	GA	3	6	1567723	1567728	50 %	0 %	50 %	0 %	337285212
31361	NC_015680	GAAG	2	8	1567868	1567875	50 %	0 %	50 %	0 %	337285212
31362	NC_015680	G	7	7	1567936	1567942	0 %	0 %	100 %	0 %	337285212
31363	NC_015680	TTA	2	6	1567960	1567965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285212
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31374	NC_015680	CGG	2	6	1568474	1568479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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31472	NC_015680	TCT	2	6	1574276	1574281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285218
31473	NC_015680	TCCTTC	2	12	1574307	1574318	0 %	50 %	0 %	50 %	337285218
31474	NC_015680	TCG	2	6	1574375	1574380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285218
31475	NC_015680	CTA	2	6	1574384	1574389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285218
31476	NC_015680	ATA	2	6	1574410	1574415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285218
31477	NC_015680	TCA	2	6	1574439	1574444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285218
31478	NC_015680	T	6	6	1574513	1574518	0 %	100 %	0 %	0 %	337285218
31479	NC_015680	TAC	2	6	1574553	1574558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285218
31480	NC_015680	TTC	2	6	1574565	1574570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285218
31481	NC_015680	TGGC	2	8	1574594	1574601	0 %	25 %	50 %	25 %	337285218
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31484	NC_015680	ATA	2	6	1574687	1574692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285218
31485	NC_015680	TC	3	6	1574701	1574706	0 %	50 %	0 %	50 %	337285218
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