MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 34341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_015680	GGTG	2	8	1230038	1230045	0 %	25 %	75 %	0 %	337284870
24503	NC_015680	TTC	2	6	1230066	1230071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284870
24504	NC_015680	ACG	2	6	1230124	1230129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284870
24505	NC_015680	AGA	2	6	1230130	1230135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284870
24506	NC_015680	GGC	2	6	1230149	1230154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284870
24507	NC_015680	AGG	2	6	1230207	1230212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284870
24508	NC_015680	GAG	2	6	1230234	1230239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284870
24509	NC_015680	CGA	2	6	1230302	1230307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284870
24510	NC_015680	TGG	2	6	1230353	1230358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284870
24511	NC_015680	AAG	2	6	1230504	1230509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284870
24512	NC_015680	GCG	2	6	1230529	1230534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284870
24513	NC_015680	TAG	2	6	1230580	1230585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284870
24514	NC_015680	AG	3	6	1230603	1230608	50 %	0 %	50 %	0 %	337284870
24515	NC_015680	GAA	2	6	1230661	1230666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284870
24516	NC_015680	CCT	2	6	1230678	1230683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284871
24517	NC_015680	CAG	2	6	1230714	1230719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284871
24518	NC_015680	CCT	2	6	1230720	1230725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284871
24519	NC_015680	TCG	2	6	1230785	1230790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284871
24520	NC_015680	AACCTT	2	12	1230856	1230867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284871
24521	NC_015680	CAG	2	6	1230972	1230977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24522	NC_015680	TC	3	6	1231008	1231013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24523	NC_015680	TTC	2	6	1231019	1231024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24524	NC_015680	TCA	2	6	1231057	1231062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24525	NC_015680	GTT	2	6	1231082	1231087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24526	NC_015680	AGT	2	6	1231110	1231115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24527	NC_015680	GT	3	6	1231129	1231134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24528	NC_015680	GAG	2	6	1231149	1231154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24529	NC_015680	GAG	2	6	1231177	1231182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24530	NC_015680	CG	3	6	1231206	1231211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24531	NC_015680	TTAA	2	8	1231213	1231220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24532	NC_015680	CGGGCT	2	12	1231244	1231255	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24533	NC_015680	ATT	2	6	1231314	1231319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24534	NC_015680	AGTGC	2	10	1231375	1231384	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24535	NC_015680	CTA	2	6	1231427	1231432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24536	NC_015680	GAA	2	6	1231436	1231441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24537	NC_015680	AGTC	2	8	1231488	1231495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24538	NC_015680	AGA	2	6	1231556	1231561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24539	NC_015680	ATA	2	6	1231626	1231631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24540	NC_015680	CTC	2	6	1231701	1231706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24541	NC_015680	GCTGA	2	10	1231771	1231780	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24542	NC_015680	CTGAG	2	10	1231783	1231792	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24543	NC_015680	AAAACA	2	12	1231914	1231925	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	337284872
24544	NC_015680	CTG	2	6	1231977	1231982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284872
24545	NC_015680	CTC	2	6	1231991	1231996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284872
24546	NC_015680	TCA	2	6	1232103	1232108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284872
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24550	NC_015680	AGTCA	2	10	1232322	1232331	40 %	20 %	20 %	20 %	337284873
24551	NC_015680	TCA	2	6	1232392	1232397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284873
24552	NC_015680	T	6	6	1232453	1232458	0 %	100 %	0 %	0 %	337284873
24553	NC_015680	CT	3	6	1232518	1232523	0 %	50 %	0 %	50 %	337284873
24554	NC_015680	TCC	2	6	1232602	1232607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284873
24555	NC_015680	GAA	2	6	1232644	1232649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284873
24556	NC_015680	CCA	2	6	1232724	1232729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24557	NC_015680	TCT	2	6	1232858	1232863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24558	NC_015680	CCCG	2	8	1232942	1232949	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24559	NC_015680	TC	3	6	1232997	1233002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24560	NC_015680	ATG	2	6	1233152	1233157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24561	NC_015680	AGA	2	6	1233158	1233163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24562	NC_015680	AAG	2	6	1233174	1233179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24563	NC_015680	TCT	2	6	1233197	1233202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284874
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24565	NC_015680	TCT	2	6	1233290	1233295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284874
24566	NC_015680	GTCATC	2	12	1233343	1233354	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	337284874
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24568	NC_015680	ACG	2	6	1233412	1233417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284874
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24572	NC_015680	CCTG	2	8	1233527	1233534	0 %	25 %	25 %	50 %	337284874
24573	NC_015680	GAG	2	6	1233570	1233575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284874
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24578	NC_015680	CGTC	2	8	1233788	1233795	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24579	NC_015680	GGT	2	6	1233823	1233828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284875
24580	NC_015680	CTGG	2	8	1233946	1233953	0 %	25 %	50 %	25 %	337284875
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24599	NC_015680	AG	3	6	1235044	1235049	50 %	0 %	50 %	0 %	337284875
24600	NC_015680	GCG	2	6	1235055	1235060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284875
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24604	NC_015680	AAGG	2	8	1235198	1235205	50 %	0 %	50 %	0 %	337284875
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24608	NC_015680	TGGA	2	8	1235393	1235400	25 %	25 %	50 %	0 %	337284875
24609	NC_015680	AG	3	6	1235483	1235488	50 %	0 %	50 %	0 %	337284875
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24615	NC_015680	CTT	2	6	1235712	1235717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24616	NC_015680	TCT	2	6	1235724	1235729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24617	NC_015680	TATC	2	8	1235752	1235759	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24618	NC_015680	T	6	6	1235776	1235781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24620	NC_015680	GAC	2	6	1235822	1235827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24738	NC_015680	ATA	3	9	1240784	1240792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337284884
24739	NC_015680	AAG	2	6	1241057	1241062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284884
24740	NC_015680	GAC	2	6	1241086	1241091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284884
24741	NC_015680	ACT	2	6	1241158	1241163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284884
24742	NC_015680	AGCGTT	2	12	1241191	1241202	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	337284884
24743	NC_015680	CTT	2	6	1241213	1241218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284884
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24745	NC_015680	TC	3	6	1241334	1241339	0 %	50 %	0 %	50 %	337284884
24746	NC_015680	CT	3	6	1241350	1241355	0 %	50 %	0 %	50 %	337284884
24747	NC_015680	CAT	2	6	1241358	1241363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284884
24748	NC_015680	CT	3	6	1241382	1241387	0 %	50 %	0 %	50 %	337284884
24749	NC_015680	TC	3	6	1241390	1241395	0 %	50 %	0 %	50 %	337284884
24750	NC_015680	TAC	2	6	1241410	1241415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284884
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24752	NC_015680	ACG	2	6	1241507	1241512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284884
24753	NC_015680	ACG	3	9	1241533	1241541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284884
24754	NC_015680	ACGA	2	8	1241611	1241618	50 %	0 %	25 %	25 %	337284884
24755	NC_015680	GTCTG	2	10	1241692	1241701	0 %	40 %	40 %	20 %	337284884
24756	NC_015680	CGAG	2	8	1241753	1241760	25 %	0 %	50 %	25 %	337284884
24757	NC_015680	CAG	2	6	1241798	1241803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284884
24758	NC_015680	GCG	2	6	1241867	1241872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284884
24759	NC_015680	TCA	2	6	1241879	1241884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284884
24760	NC_015680	TAC	2	6	1241920	1241925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284884
24761	NC_015680	GTC	2	6	1241932	1241937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284884
24762	NC_015680	GCATT	2	10	1242008	1242017	20 %	40 %	20 %	20 %	337284884
24763	NC_015680	ATG	2	6	1242041	1242046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284884
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24765	NC_015680	GGA	2	6	1242127	1242132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284884
24766	NC_015680	GGC	2	6	1242148	1242153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284884
24767	NC_015680	TCC	2	6	1242179	1242184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284884
24768	NC_015680	GAG	3	9	1242210	1242218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284884
24769	NC_015680	CTT	2	6	1242235	1242240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284885
24770	NC_015680	AGA	2	6	1242259	1242264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284885
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24772	NC_015680	TCATGC	2	12	1242318	1242329	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	337284885
24773	NC_015680	TCA	2	6	1242333	1242338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284885
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24777	NC_015680	GGTG	2	8	1242466	1242473	0 %	25 %	75 %	0 %	337284885
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24781	NC_015680	AGT	2	6	1242791	1242796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284885
24782	NC_015680	TAAT	2	8	1242798	1242805	50 %	50 %	0 %	0 %	337284885
24783	NC_015680	A	6	6	1242867	1242872	100 %	0 %	0 %	0 %	337284885
24784	NC_015680	CCA	2	6	1243043	1243048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284885
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24792	NC_015680	CTT	2	6	1243419	1243424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284885
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24799	NC_015680	GTT	2	6	1243991	1243996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284885
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24801	NC_015680	AGA	2	6	1244107	1244112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284885
24802	NC_015680	ATT	2	6	1244127	1244132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284885
24803	NC_015680	TTA	2	6	1244155	1244160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284885
24804	NC_015680	AAG	2	6	1244166	1244171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284885
24805	NC_015680	TTG	2	6	1244187	1244192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284885
24806	NC_015680	TAC	2	6	1244283	1244288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284885
24807	NC_015680	TGG	2	6	1244347	1244352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284885
24808	NC_015680	TGTT	2	8	1244382	1244389	0 %	75 %	25 %	0 %	337284885
24809	NC_015680	TGG	2	6	1244390	1244395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284885
24810	NC_015680	GGT	2	6	1244426	1244431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24811	NC_015680	AAGA	2	8	1244444	1244451	75 %	0 %	25 %	0 %	337284886
24812	NC_015680	TTC	2	6	1244618	1244623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284886
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24815	NC_015680	TTC	3	9	1244723	1244731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284886
24816	NC_015680	CTC	2	6	1244846	1244851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284886
24817	NC_015680	CTG	2	6	1244880	1244885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284886
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24819	NC_015680	AAT	2	6	1244944	1244949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337284887
24820	NC_015680	AGG	2	6	1244988	1244993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284887
24821	NC_015680	TCC	2	6	1244996	1245001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284887
24822	NC_015680	TCA	2	6	1245074	1245079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284887
24823	NC_015680	CACAAT	2	12	1245231	1245242	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	337284887
24824	NC_015680	ACA	2	6	1245257	1245262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284887
24825	NC_015680	GCA	2	6	1245280	1245285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284887
24826	NC_015680	TTC	2	6	1245337	1245342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284887
24827	NC_015680	CGC	2	6	1245351	1245356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284887
24828	NC_015680	CAA	2	6	1245365	1245370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284887
24829	NC_015680	TC	3	6	1245471	1245476	0 %	50 %	0 %	50 %	337284888
24830	NC_015680	CCT	2	6	1245485	1245490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284888
24831	NC_015680	GAT	2	6	1245615	1245620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284888
24832	NC_015680	GCA	3	9	1245636	1245644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284888
24833	NC_015680	GCA	2	6	1245658	1245663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284888
24834	NC_015680	CAA	2	6	1245697	1245702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284888
24835	NC_015680	GCC	2	6	1245741	1245746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284888
24836	NC_015680	G	6	6	1245771	1245776	0 %	0 %	100 %	0 %	337284888
24837	NC_015680	ATT	2	6	1245865	1245870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284889
24838	NC_015680	ATT	2	6	1245884	1245889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284889
24839	NC_015680	GTT	2	6	1246031	1246036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284889
24840	NC_015680	AAG	2	6	1246045	1246050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284890
24841	NC_015680	GTTTG	2	10	1246068	1246077	0 %	60 %	40 %	0 %	337284890
24842	NC_015680	ACA	2	6	1246148	1246153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284890
24843	NC_015680	ACA	2	6	1246171	1246176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284890
24844	NC_015680	TTG	2	6	1246211	1246216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284890
24845	NC_015680	CTA	2	6	1246299	1246304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284890
24846	NC_015680	TAC	2	6	1246417	1246422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284890
24847	NC_015680	CAC	2	6	1246449	1246454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284890
24848	NC_015680	CAA	2	6	1246562	1246567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284890
24849	NC_015680	TCA	2	6	1246571	1246576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284890
24850	NC_015680	ACC	2	6	1246717	1246722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284890
24851	NC_015680	T	7	7	1246930	1246936	0 %	100 %	0 %	0 %	337284891
24852	NC_015680	ACAAT	2	10	1247029	1247038	60 %	20 %	0 %	20 %	337284891
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24854	NC_015680	AAG	2	6	1247160	1247165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284891
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24974	NC_015680	TTA	2	6	1252271	1252276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24975	NC_015680	CAA	2	6	1252290	1252295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24976	NC_015680	ATTA	2	8	1252333	1252340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24977	NC_015680	AGG	2	6	1252344	1252349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24978	NC_015680	ATC	2	6	1252375	1252380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284898
24979	NC_015680	ATT	2	6	1252451	1252456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284898
24980	NC_015680	ATC	2	6	1252489	1252494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284898
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24988	NC_015680	ATC	2	6	1252714	1252719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284898
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24994	NC_015680	TACT	2	8	1252846	1252853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24995	NC_015680	TTTA	2	8	1252866	1252873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24996	NC_015680	T	6	6	1252934	1252939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24997	NC_015680	TAC	2	6	1252994	1252999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24998	NC_015680	TAAC	2	8	1253025	1253032	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24999	NC_015680	AATA	2	8	1253045	1253052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25000	NC_015680	TAT	2	6	1253065	1253070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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