MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 34341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015680	CTT	2	6	100175	100180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_015680	CGG	2	6	100232	100237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_015680	GGAGG	2	10	100310	100319	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_015680	AGG	2	6	100395	100400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_015680	GGAT	2	8	100401	100408	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_015680	GCC	2	6	100435	100440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2007	NC_015680	ATG	3	9	100478	100486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283614
2008	NC_015680	TTA	2	6	100489	100494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283614
2009	NC_015680	CTC	2	6	100528	100533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283614
2010	NC_015680	GGT	2	6	100562	100567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283614
2011	NC_015680	ACA	2	6	100621	100626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283614
2012	NC_015680	CCG	2	6	100627	100632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283614
2013	NC_015680	TCC	2	6	100750	100755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2014	NC_015680	TCCT	2	8	100773	100780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2015	NC_015680	GCGA	2	8	100785	100792	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2016	NC_015680	GAA	2	6	100826	100831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_015680	ACA	2	6	100876	100881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_015680	ACC	2	6	100908	100913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2019	NC_015680	GTG	2	6	100923	100928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_015680	GAC	2	6	100929	100934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2021	NC_015680	CGG	2	6	100997	101002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_015680	CCT	2	6	101036	101041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2023	NC_015680	CTT	2	6	101044	101049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2024	NC_015680	AAT	2	6	101128	101133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_015680	GAGC	2	8	101223	101230	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2029	NC_015680	A	7	7	101333	101339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2033	NC_015680	ATG	2	6	101477	101482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_015680	AAGA	2	8	101492	101499	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_015680	GGA	2	6	101506	101511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_015680	GGA	2	6	101518	101523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2037	NC_015680	TGT	2	6	101617	101622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2039	NC_015680	TAT	2	6	101679	101684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_015680	AAGA	2	8	101697	101704	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_015680	A	7	7	101736	101742	100 %	0 %	0 %	0 %	337283615
2042	NC_015680	TAT	2	6	101744	101749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283615
2043	NC_015680	TAG	2	6	101758	101763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283615
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2047	NC_015680	TAAAA	2	10	101978	101987	80 %	20 %	0 %	0 %	337283615
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2092	NC_015680	ATA	2	6	104287	104292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2098	NC_015680	GTGA	2	8	104763	104770	25 %	25 %	50 %	0 %	337283617
2099	NC_015680	TCG	2	6	104798	104803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2102	NC_015680	TGGG	2	8	104853	104860	0 %	25 %	75 %	0 %	337283618
2103	NC_015680	TGT	2	6	104874	104879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283618
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2112	NC_015680	CGG	2	6	105243	105248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283619
2113	NC_015680	T	6	6	105259	105264	0 %	100 %	0 %	0 %	337283619
2114	NC_015680	TCA	2	6	105279	105284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283619
2115	NC_015680	TA	3	6	105319	105324	50 %	50 %	0 %	0 %	337283619
2116	NC_015680	TC	3	6	105521	105526	0 %	50 %	0 %	50 %	337283619
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2124	NC_015680	GAG	2	6	106020	106025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283620
2125	NC_015680	CGT	2	6	106026	106031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283620
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2127	NC_015680	GGA	2	6	106055	106060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283620
2128	NC_015680	GCC	2	6	106063	106068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283620
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2233	NC_015680	AGCT	2	8	112547	112554	25 %	25 %	25 %	25 %	337283626
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2242	NC_015680	TTG	2	6	112961	112966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2243	NC_015680	T	6	6	113040	113045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2244	NC_015680	TA	4	8	113102	113109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2245	NC_015680	CCCCG	2	10	113118	113127	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2246	NC_015680	TA	3	6	113150	113155	50 %	50 %	0 %	0 %	337283627
2247	NC_015680	CGG	2	6	113293	113298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283627
2248	NC_015680	CT	3	6	113300	113305	0 %	50 %	0 %	50 %	337283627
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2367	NC_015680	CGT	2	6	118658	118663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283630
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2370	NC_015680	GGAGC	2	10	118779	118788	20 %	0 %	60 %	20 %	337283630
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2372	NC_015680	TCCCT	2	10	118879	118888	0 %	40 %	0 %	60 %	337283630
2373	NC_015680	CGT	2	6	118973	118978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283630
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2491	NC_015680	T	6	6	124873	124878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2492	NC_015680	AT	3	6	124889	124894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2493	NC_015680	GAG	2	6	124968	124973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2496	NC_015680	T	6	6	125032	125037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2500	NC_015680	CCTTT	2	10	125257	125266	0 %	60 %	0 %	40 %	337283639

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