MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 34341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_015680	TAC	2	6	1204112	1204117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284840
24003	NC_015680	TGGGA	2	10	1204128	1204137	20 %	20 %	60 %	0 %	337284840
24004	NC_015680	TGAT	2	8	1204209	1204216	25 %	50 %	25 %	0 %	337284840
24005	NC_015680	TAC	2	6	1204217	1204222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284840
24006	NC_015680	ACG	2	6	1204244	1204249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284840
24007	NC_015680	CCT	2	6	1204279	1204284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284840
24008	NC_015680	CTAC	2	8	1204333	1204340	25 %	25 %	0 %	50 %	337284840
24009	NC_015680	GCA	2	6	1204493	1204498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284840
24010	NC_015680	CCT	2	6	1204555	1204560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284840
24011	NC_015680	TCG	2	6	1204657	1204662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284841
24012	NC_015680	GA	4	8	1204668	1204675	50 %	0 %	50 %	0 %	337284841
24013	NC_015680	GAG	2	6	1204704	1204709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284841
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24015	NC_015680	CCCT	2	8	1204758	1204765	0 %	25 %	0 %	75 %	337284841
24016	NC_015680	GGT	2	6	1204831	1204836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284841
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24019	NC_015680	GCC	2	6	1205002	1205007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284841
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24021	NC_015680	GAG	2	6	1205055	1205060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284841
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24033	NC_015680	G	6	6	1205624	1205629	0 %	0 %	100 %	0 %	337284842
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24038	NC_015680	A	6	6	1206016	1206021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24039	NC_015680	TCT	2	6	1206065	1206070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284843
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24228	NC_015680	CAGCT	2	10	1216247	1216256	20 %	20 %	20 %	40 %	337284853
24229	NC_015680	TTCC	2	8	1216282	1216289	0 %	50 %	0 %	50 %	337284853
24230	NC_015680	CGA	2	6	1216422	1216427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284853
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24232	NC_015680	ATT	2	6	1216465	1216470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284853
24233	NC_015680	AGG	2	6	1216582	1216587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24234	NC_015680	GCAG	2	8	1216630	1216637	25 %	0 %	50 %	25 %	337284854
24235	NC_015680	TAATTA	2	12	1216648	1216659	50 %	50 %	0 %	0 %	337284854
24236	NC_015680	CTC	2	6	1216726	1216731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284854
24237	NC_015680	CAT	2	6	1216756	1216761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284854
24238	NC_015680	AGG	2	6	1216772	1216777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284854
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24242	NC_015680	CAT	2	6	1216849	1216854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284854
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24337	NC_015680	A	7	7	1221638	1221644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24338	NC_015680	AGC	2	6	1221700	1221705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284862
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24342	NC_015680	TCG	2	6	1221758	1221763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284862
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24345	NC_015680	GTA	2	6	1221904	1221909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284862
24346	NC_015680	AGCCC	2	10	1221946	1221955	20 %	0 %	20 %	60 %	337284862
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24348	NC_015680	GTC	2	6	1222009	1222014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284862
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24351	NC_015680	TCG	2	6	1222145	1222150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284862
24352	NC_015680	TC	3	6	1222236	1222241	0 %	50 %	0 %	50 %	337284862
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24467	NC_015680	TCA	2	6	1228696	1228701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284869
24468	NC_015680	TGATAT	2	12	1228746	1228757	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337284869
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24492	NC_015680	GAA	2	6	1229577	1229582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284870
24493	NC_015680	ACA	2	6	1229619	1229624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284870
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