MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 34341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_015680	CA	3	6	1179814	1179819	50 %	0 %	0 %	50 %	337284816
23503	NC_015680	TCC	2	6	1179940	1179945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284816
23504	NC_015680	TGG	2	6	1180023	1180028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284816
23505	NC_015680	CGCT	2	8	1180029	1180036	0 %	25 %	25 %	50 %	337284816
23506	NC_015680	ATT	2	6	1180037	1180042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284816
23507	NC_015680	GAA	3	9	1180056	1180064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284816
23508	NC_015680	GT	3	6	1180086	1180091	0 %	50 %	50 %	0 %	337284816
23509	NC_015680	TCC	2	6	1180143	1180148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284816
23510	NC_015680	CAA	2	6	1180158	1180163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284816
23511	NC_015680	AGC	2	6	1180279	1180284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284816
23512	NC_015680	TGAG	2	8	1180311	1180318	25 %	25 %	50 %	0 %	337284816
23513	NC_015680	CCGC	2	8	1180320	1180327	0 %	0 %	25 %	75 %	337284816
23514	NC_015680	CCT	2	6	1180380	1180385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284816
23515	NC_015680	CTTT	2	8	1180507	1180514	0 %	75 %	0 %	25 %	337284816
23516	NC_015680	TCG	2	6	1180612	1180617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284817
23517	NC_015680	CCT	2	6	1180681	1180686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284817
23518	NC_015680	GCCT	2	8	1180730	1180737	0 %	25 %	25 %	50 %	337284817
23519	NC_015680	CCA	2	6	1180816	1180821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284817
23520	NC_015680	GC	3	6	1180837	1180842	0 %	0 %	50 %	50 %	337284817
23521	NC_015680	ACC	2	6	1180863	1180868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284817
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23523	NC_015680	CTT	2	6	1181123	1181128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284817
23524	NC_015680	TCC	2	6	1181133	1181138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284817
23525	NC_015680	TGTT	2	8	1181200	1181207	0 %	75 %	25 %	0 %	337284817
23526	NC_015680	CA	3	6	1181241	1181246	50 %	0 %	0 %	50 %	337284817
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23534	NC_015680	CG	3	6	1181587	1181592	0 %	0 %	50 %	50 %	337284818
23535	NC_015680	CCG	2	6	1181618	1181623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284818
23536	NC_015680	T	6	6	1181645	1181650	0 %	100 %	0 %	0 %	337284818
23537	NC_015680	CTT	2	6	1181691	1181696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284818
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23540	NC_015680	GAG	2	6	1181941	1181946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284818
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23543	NC_015680	TAT	2	6	1182077	1182082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23544	NC_015680	CTC	2	6	1182123	1182128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23545	NC_015680	GAT	2	6	1182143	1182148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23546	NC_015680	TG	3	6	1182223	1182228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23547	NC_015680	TCCAA	2	10	1182239	1182248	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23548	NC_015680	TAT	2	6	1182302	1182307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23549	NC_015680	CCT	3	9	1182349	1182357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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23551	NC_015680	GAG	2	6	1182472	1182477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23552	NC_015680	AGA	2	6	1182480	1182485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23553	NC_015680	GCCA	2	8	1182715	1182722	25 %	0 %	25 %	50 %	337284819
23554	NC_015680	CGT	2	6	1182770	1182775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284819
23555	NC_015680	GGCAT	2	10	1182778	1182787	20 %	20 %	40 %	20 %	337284819
23556	NC_015680	TCCT	2	8	1182795	1182802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23557	NC_015680	TCT	2	6	1182845	1182850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23558	NC_015680	GAT	2	6	1182897	1182902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284820
23559	NC_015680	GATA	2	8	1183039	1183046	50 %	25 %	25 %	0 %	337284820
23560	NC_015680	TGAGGA	2	12	1183196	1183207	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	337284820
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23563	NC_015680	GACA	2	8	1183295	1183302	50 %	0 %	25 %	25 %	337284820
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23591	NC_015680	CGA	2	6	1184688	1184693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284821
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23602	NC_015680	CGA	2	6	1185074	1185079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284822
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23605	NC_015680	TCG	2	6	1185190	1185195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284822
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