MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 34341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_015680	ACA	2	6	797093	797098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_015680	GGT	2	6	797149	797154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_015680	ACC	2	6	797173	797178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16005	NC_015680	AT	3	6	797203	797208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_015680	ATGA	2	8	797293	797300	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_015680	CGG	2	6	797310	797315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16008	NC_015680	CCA	2	6	797423	797428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284387
16009	NC_015680	ATGG	2	8	797447	797454	25 %	25 %	50 %	0 %	337284387
16010	NC_015680	AGG	2	6	797524	797529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284387
16011	NC_015680	GAA	2	6	797534	797539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284387
16012	NC_015680	CCTGC	2	10	797690	797699	0 %	20 %	20 %	60 %	337284387
16013	NC_015680	CTG	2	6	797742	797747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284387
16014	NC_015680	CTCC	2	8	797748	797755	0 %	25 %	0 %	75 %	337284387
16015	NC_015680	GCT	2	6	797786	797791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284387
16016	NC_015680	GCG	2	6	797799	797804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284387
16017	NC_015680	CGAAA	2	10	797890	797899	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16018	NC_015680	TGG	2	6	797918	797923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284388
16019	NC_015680	GAG	2	6	797926	797931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284388
16020	NC_015680	GATGAA	2	12	797958	797969	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337284388
16021	NC_015680	CAC	2	6	798034	798039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284388
16022	NC_015680	GAT	3	9	798042	798050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284388
16023	NC_015680	GGA	2	6	798051	798056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284388
16024	NC_015680	ATCCTG	2	12	798100	798111	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	337284388
16025	NC_015680	CGC	2	6	798113	798118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284388
16026	NC_015680	CCTCT	2	10	798180	798189	0 %	40 %	0 %	60 %	337284388
16027	NC_015680	CGG	2	6	798204	798209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284388
16028	NC_015680	GAA	2	6	798243	798248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284388
16029	NC_015680	A	6	6	798247	798252	100 %	0 %	0 %	0 %	337284388
16030	NC_015680	ATG	2	6	798262	798267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284388
16031	NC_015680	TTC	2	6	798298	798303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284388
16032	NC_015680	CAT	2	6	798372	798377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284388
16033	NC_015680	GAA	2	6	798513	798518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284388
16034	NC_015680	ATA	2	6	798571	798576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337284388
16035	NC_015680	AGA	2	6	798701	798706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284388
16036	NC_015680	TACC	2	8	798717	798724	25 %	25 %	0 %	50 %	337284388
16037	NC_015680	CAGG	2	8	798747	798754	25 %	0 %	50 %	25 %	337284388
16038	NC_015680	CTG	2	6	798827	798832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284388
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16042	NC_015680	GCG	2	6	799141	799146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284388
16043	NC_015680	ACC	2	6	799166	799171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284388
16044	NC_015680	TTC	2	6	799244	799249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284388
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16048	NC_015680	AGATA	2	10	799428	799437	60 %	20 %	20 %	0 %	337284388
16049	NC_015680	GTGG	2	8	799527	799534	0 %	25 %	75 %	0 %	337284388
16050	NC_015680	GAG	2	6	799537	799542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284388
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16053	NC_015680	AG	3	6	799719	799724	50 %	0 %	50 %	0 %	337284388
16054	NC_015680	AAG	2	6	799798	799803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284388
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16058	NC_015680	AAT	2	6	800028	800033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_015680	AGT	2	6	800057	800062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_015680	GAG	2	6	800067	800072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_015680	ATG	2	6	800079	800084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_015680	ATG	2	6	800151	800156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284389
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16244	NC_015680	ATG	2	6	809031	809036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284398
16245	NC_015680	GTC	2	6	809156	809161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284398
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16252	NC_015680	ACG	3	9	809700	809708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284399
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16259	NC_015680	GAAAAA	2	12	809982	809993	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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16273	NC_015680	TA	3	6	810775	810780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16274	NC_015680	ATA	2	6	810802	810807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16275	NC_015680	GTGG	2	8	810816	810823	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16276	NC_015680	GGA	2	6	810888	810893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284401
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16292	NC_015680	GAA	2	6	811569	811574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284401
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16294	NC_015680	CAT	2	6	811620	811625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16296	NC_015680	CCT	2	6	811797	811802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16299	NC_015680	TCCC	2	8	811874	811881	0 %	25 %	0 %	75 %	337284402
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16310	NC_015680	GCCT	2	8	812317	812324	0 %	25 %	25 %	50 %	337284402
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16324	NC_015680	TCA	2	6	812852	812857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284404
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16353	NC_015680	CTTCT	2	10	814681	814690	0 %	60 %	0 %	40 %	337284407
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16363	NC_015680	CGC	2	6	815092	815097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284408
16364	NC_015680	CGC	2	6	815116	815121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284408
16365	NC_015680	CCT	2	6	815137	815142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284408
16366	NC_015680	CCCTCG	2	12	815191	815202	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	337284408
16367	NC_015680	TCG	2	6	815223	815228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284408
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16372	NC_015680	AGCGTA	2	12	815459	815470	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	337284408
16373	NC_015680	CTT	2	6	815489	815494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284408
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16464	NC_015680	CAG	2	6	819727	819732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284412
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16466	NC_015680	TAG	2	6	819824	819829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284412
16467	NC_015680	ACG	2	6	819839	819844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284412
16468	NC_015680	GGT	2	6	819877	819882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16469	NC_015680	GGTC	2	8	819891	819898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16470	NC_015680	CGA	2	6	819918	819923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16471	NC_015680	TCA	2	6	820079	820084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16472	NC_015680	TCA	2	6	820104	820109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16473	NC_015680	TCC	2	6	820122	820127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16474	NC_015680	C	6	6	820126	820131	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16475	NC_015680	CTC	2	6	820170	820175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16476	NC_015680	GC	3	6	820206	820211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16477	NC_015680	AC	3	6	820213	820218	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16478	NC_015680	AGG	2	6	820229	820234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16479	NC_015680	TCA	2	6	820243	820248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16480	NC_015680	GCT	2	6	820257	820262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16481	NC_015680	CCT	2	6	820277	820282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284413
16482	NC_015680	CT	3	6	820295	820300	0 %	50 %	0 %	50 %	337284413
16483	NC_015680	T	6	6	820347	820352	0 %	100 %	0 %	0 %	337284413
16484	NC_015680	CGA	2	6	820354	820359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284413
16485	NC_015680	GAC	2	6	820415	820420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284413
16486	NC_015680	CTC	2	6	820439	820444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284413
16487	NC_015680	GTA	2	6	820448	820453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284413
16488	NC_015680	CTC	3	9	820457	820465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284413
16489	NC_015680	GCC	2	6	820482	820487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284413
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16491	NC_015680	ACG	2	6	820641	820646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284413
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