MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 34341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_015680	CTC	2	6	747260	747265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284332
15002	NC_015680	CAC	2	6	747287	747292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15003	NC_015680	TCT	2	6	747341	747346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15004	NC_015680	CGA	2	6	747381	747386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284333
15005	NC_015680	AGA	2	6	747387	747392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284333
15006	NC_015680	TC	3	6	747401	747406	0 %	50 %	0 %	50 %	337284333
15007	NC_015680	AAG	2	6	747461	747466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284333
15008	NC_015680	TTA	2	6	747576	747581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284334
15009	NC_015680	CAT	2	6	747616	747621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284334
15010	NC_015680	TGT	2	6	747669	747674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284334
15011	NC_015680	CCT	2	6	747822	747827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284334
15012	NC_015680	CTT	2	6	747840	747845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284334
15013	NC_015680	CT	3	6	747848	747853	0 %	50 %	0 %	50 %	337284334
15014	NC_015680	AGA	2	6	747868	747873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284334
15015	NC_015680	TCC	2	6	747919	747924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284334
15016	NC_015680	CGA	2	6	747978	747983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284334
15017	NC_015680	TCT	2	6	748023	748028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284334
15018	NC_015680	AGG	2	6	748130	748135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284334
15019	NC_015680	ACC	3	9	748162	748170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15020	NC_015680	AGG	2	6	748184	748189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_015680	TTA	2	6	748193	748198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_015680	GTT	2	6	748201	748206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_015680	CCT	2	6	748282	748287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284335
15024	NC_015680	TCC	2	6	748292	748297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284335
15025	NC_015680	AAG	2	6	748310	748315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284335
15026	NC_015680	TCA	2	6	748328	748333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284335
15027	NC_015680	AGC	2	6	748373	748378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284335
15028	NC_015680	GAA	2	6	748420	748425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284335
15029	NC_015680	GTA	2	6	748426	748431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284335
15030	NC_015680	TCC	2	6	748451	748456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284335
15031	NC_015680	TAT	2	6	748486	748491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284335
15032	NC_015680	TCT	2	6	748590	748595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284335
15033	NC_015680	CCCTC	2	10	748596	748605	0 %	20 %	0 %	80 %	337284335
15034	NC_015680	GACC	2	8	748623	748630	25 %	0 %	25 %	50 %	337284335
15035	NC_015680	CTT	2	6	748985	748990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284335
15036	NC_015680	CTT	2	6	748993	748998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284335
15037	NC_015680	GAG	2	6	749073	749078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284336
15038	NC_015680	CCAG	2	8	749105	749112	25 %	0 %	25 %	50 %	337284336
15039	NC_015680	CTTTC	2	10	749128	749137	0 %	60 %	0 %	40 %	337284336
15040	NC_015680	GAG	2	6	749190	749195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284336
15041	NC_015680	TC	3	6	749205	749210	0 %	50 %	0 %	50 %	337284336
15042	NC_015680	CG	3	6	749228	749233	0 %	0 %	50 %	50 %	337284336
15043	NC_015680	CAA	2	6	749267	749272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284336
15044	NC_015680	CGA	2	6	749303	749308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284336
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15047	NC_015680	GGCC	2	8	749468	749475	0 %	0 %	50 %	50 %	337284336
15048	NC_015680	AGT	2	6	749522	749527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284336
15049	NC_015680	TAGAG	2	10	749537	749546	40 %	20 %	40 %	0 %	337284336
15050	NC_015680	CCT	2	6	749561	749566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284336
15051	NC_015680	TC	4	8	749590	749597	0 %	50 %	0 %	50 %	337284336
15052	NC_015680	GAGAC	2	10	749635	749644	40 %	0 %	40 %	20 %	337284336
15053	NC_015680	AGT	2	6	749720	749725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284336
15054	NC_015680	CAA	2	6	749804	749809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284336
15055	NC_015680	CCA	2	6	749863	749868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284336
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15057	NC_015680	GGAA	2	8	749911	749918	50 %	0 %	50 %	0 %	337284336
15058	NC_015680	AAG	2	6	749932	749937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284336
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15061	NC_015680	TCG	2	6	750133	750138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284336
15062	NC_015680	AAC	2	6	750147	750152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284336
15063	NC_015680	TCT	2	6	750167	750172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284336
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15070	NC_015680	CATC	2	8	750601	750608	25 %	25 %	0 %	50 %	337284337
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15093	NC_015680	GAT	2	6	751641	751646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284337
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15102	NC_015680	TAG	3	9	751942	751950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284337
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15104	NC_015680	CCTC	2	8	751988	751995	0 %	25 %	0 %	75 %	337284337
15105	NC_015680	TC	3	6	752002	752007	0 %	50 %	0 %	50 %	337284337
15106	NC_015680	GGT	2	6	752050	752055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284337
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15108	NC_015680	CCTCC	2	10	752136	752145	0 %	20 %	0 %	80 %	337284337
15109	NC_015680	GGT	2	6	752199	752204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284337
15110	NC_015680	CGTCA	2	10	752205	752214	20 %	20 %	20 %	40 %	337284337
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15113	NC_015680	GA	3	6	752467	752472	50 %	0 %	50 %	0 %	337284337
15114	NC_015680	AG	3	6	752493	752498	50 %	0 %	50 %	0 %	337284337
15115	NC_015680	AGCC	2	8	752502	752509	25 %	0 %	25 %	50 %	337284337
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15117	NC_015680	AGCC	2	8	752608	752615	25 %	0 %	25 %	50 %	337284337
15118	NC_015680	TGT	2	6	752639	752644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284337
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15121	NC_015680	CCAA	2	8	752712	752719	50 %	0 %	0 %	50 %	337284337
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15237	NC_015680	ACT	2	6	758297	758302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284342
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15241	NC_015680	TCA	2	6	758492	758497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284342
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15244	NC_015680	AG	3	6	758686	758691	50 %	0 %	50 %	0 %	337284342
15245	NC_015680	GGAA	2	8	758699	758706	50 %	0 %	50 %	0 %	337284342
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15247	NC_015680	CGT	3	9	758862	758870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284342
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15355	NC_015680	ACTT	2	8	764285	764292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15363	NC_015680	AGAAAG	2	12	764626	764637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284349
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15365	NC_015680	ATT	2	6	764677	764682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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