MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 34341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_015680	CG	3	6	646002	646007	0 %	0 %	50 %	50 %	337284237
13003	NC_015680	TC	3	6	646110	646115	0 %	50 %	0 %	50 %	337284237
13004	NC_015680	GAG	2	6	646483	646488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284237
13005	NC_015680	ACT	2	6	646535	646540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284237
13006	NC_015680	CTG	2	6	646614	646619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284237
13007	NC_015680	TAG	2	6	646682	646687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284237
13008	NC_015680	TCAG	2	8	646688	646695	25 %	25 %	25 %	25 %	337284237
13009	NC_015680	CAT	2	6	646731	646736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284237
13010	NC_015680	GCC	2	6	646750	646755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284237
13011	NC_015680	CGC	2	6	646785	646790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284237
13012	NC_015680	TAT	2	6	646840	646845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284237
13013	NC_015680	CCTC	2	8	646865	646872	0 %	25 %	0 %	75 %	337284237
13014	NC_015680	AGGA	2	8	646876	646883	50 %	0 %	50 %	0 %	337284237
13015	NC_015680	GTC	2	6	647095	647100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284237
13016	NC_015680	GTT	2	6	647131	647136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284237
13017	NC_015680	GCG	2	6	647249	647254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284237
13018	NC_015680	GTT	2	6	647260	647265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284237
13019	NC_015680	CAGG	2	8	647283	647290	25 %	0 %	50 %	25 %	337284237
13020	NC_015680	GTA	2	6	647299	647304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284237
13021	NC_015680	GTA	2	6	647329	647334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284237
13022	NC_015680	TAG	2	6	647384	647389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284237
13023	NC_015680	TA	3	6	647425	647430	50 %	50 %	0 %	0 %	337284237
13024	NC_015680	GTA	2	6	647455	647460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284237
13025	NC_015680	TA	3	6	647492	647497	50 %	50 %	0 %	0 %	337284237
13026	NC_015680	GGA	2	6	647532	647537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284237
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13029	NC_015680	TTCTGG	2	12	647713	647724	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	337284237
13030	NC_015680	ACG	2	6	647807	647812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284237
13031	NC_015680	GCTT	2	8	647829	647836	0 %	50 %	25 %	25 %	337284237
13032	NC_015680	CTT	2	6	647857	647862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284237
13033	NC_015680	GGC	2	6	648010	648015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284237
13034	NC_015680	AGT	2	6	648053	648058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284237
13035	NC_015680	TAG	2	6	648109	648114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_015680	TCA	2	6	648117	648122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13038	NC_015680	GGGC	2	8	648474	648481	0 %	0 %	75 %	25 %	337284238
13039	NC_015680	CTC	2	6	648486	648491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284238
13040	NC_015680	CCA	2	6	648560	648565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284238
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13043	NC_015680	GCT	2	6	648733	648738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284238
13044	NC_015680	G	6	6	648764	648769	0 %	0 %	100 %	0 %	337284238
13045	NC_015680	ATC	2	6	648925	648930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284238
13046	NC_015680	CCTC	2	8	648946	648953	0 %	25 %	0 %	75 %	337284238
13047	NC_015680	ATT	2	6	649012	649017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284238
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13053	NC_015680	TCC	2	6	649252	649257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284238
13054	NC_015680	TTA	2	6	649301	649306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284238
13055	NC_015680	CTTC	2	8	649328	649335	0 %	50 %	0 %	50 %	337284238
13056	NC_015680	ATA	2	6	649377	649382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_015680	GTG	2	6	649439	649444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_015680	CCTC	2	8	649555	649562	0 %	25 %	0 %	75 %	337284239
13059	NC_015680	ACG	2	6	649572	649577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284239
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13088	NC_015680	CCAC	2	8	650903	650910	25 %	0 %	0 %	75 %	337284240
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13092	NC_015680	CCG	2	6	651157	651162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284240
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13101	NC_015680	CTCC	2	8	651456	651463	0 %	25 %	0 %	75 %	337284240
13102	NC_015680	GCTT	2	8	651620	651627	0 %	50 %	25 %	25 %	337284240
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13105	NC_015680	CAG	2	6	651791	651796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284240
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13110	NC_015680	GCC	2	6	651972	651977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284240
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13116	NC_015680	CCTG	2	8	652193	652200	0 %	25 %	25 %	50 %	337284240
13117	NC_015680	TATC	2	8	652256	652263	25 %	50 %	0 %	25 %	337284240
13118	NC_015680	GAAGG	2	10	652308	652317	40 %	0 %	60 %	0 %	337284240
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13120	NC_015680	GGT	2	6	652340	652345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284240
13121	NC_015680	GTC	2	6	652462	652467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284240
13122	NC_015680	TC	3	6	652491	652496	0 %	50 %	0 %	50 %	337284240
13123	NC_015680	AGGA	2	8	652519	652526	50 %	0 %	50 %	0 %	337284240
13124	NC_015680	GTC	2	6	652527	652532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284240
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13133	NC_015680	CAC	2	6	652755	652760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13134	NC_015680	ATC	2	6	652773	652778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13135	NC_015680	TCT	3	9	652832	652840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284241
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13141	NC_015680	CCTT	2	8	653022	653029	0 %	50 %	0 %	50 %	337284241
13142	NC_015680	TC	4	8	653034	653041	0 %	50 %	0 %	50 %	337284241
13143	NC_015680	ACCG	2	8	653055	653062	25 %	0 %	25 %	50 %	337284241
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13194	NC_015680	TAA	2	6	655625	655630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13214	NC_015680	GAA	2	6	656755	656760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284245
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13230	NC_015680	GCC	2	6	657476	657481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284245
13231	NC_015680	CCTG	2	8	657553	657560	0 %	25 %	25 %	50 %	337284245
13232	NC_015680	GTC	2	6	657578	657583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284245
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13236	NC_015680	GA	3	6	657841	657846	50 %	0 %	50 %	0 %	337284245
13237	NC_015680	ATC	2	6	657860	657865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284245
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13239	NC_015680	TTG	2	6	657900	657905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284245
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13241	NC_015680	CCT	2	6	657946	657951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284245
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13350	NC_015680	GGCA	2	8	663274	663281	25 %	0 %	50 %	25 %	337284253
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13487	NC_015680	TTC	2	6	670587	670592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284259
13488	NC_015680	TTC	2	6	670615	670620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284259
13489	NC_015680	CCTT	2	8	670624	670631	0 %	50 %	0 %	50 %	337284259
13490	NC_015680	TCG	2	6	670639	670644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284259
13491	NC_015680	AAGC	2	8	670652	670659	50 %	0 %	25 %	25 %	337284259
13492	NC_015680	TCA	2	6	670661	670666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284259
13493	NC_015680	ATCT	2	8	670686	670693	25 %	50 %	0 %	25 %	337284259
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13496	NC_015680	CTTT	2	8	670811	670818	0 %	75 %	0 %	25 %	337284259
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13499	NC_015680	TCA	2	6	670903	670908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284259
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