MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 34341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015680	TTCT	2	8	620970	620977	0 %	75 %	0 %	25 %	337284213
12502	NC_015680	TCA	2	6	621112	621117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284213
12503	NC_015680	CA	3	6	621126	621131	50 %	0 %	0 %	50 %	337284214
12504	NC_015680	GAA	2	6	621162	621167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284214
12505	NC_015680	TAG	2	6	621437	621442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284214
12506	NC_015680	GGAGA	2	10	621487	621496	40 %	0 %	60 %	0 %	337284214
12507	NC_015680	AGGA	2	8	621628	621635	50 %	0 %	50 %	0 %	337284214
12508	NC_015680	AGG	2	6	621671	621676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284214
12509	NC_015680	AAG	2	6	621680	621685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284214
12510	NC_015680	AGG	2	6	621689	621694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284214
12511	NC_015680	CAG	2	6	621714	621719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284215
12512	NC_015680	TTCC	2	8	621761	621768	0 %	50 %	0 %	50 %	337284215
12513	NC_015680	CGT	2	6	621811	621816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284215
12514	NC_015680	TGA	2	6	621818	621823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284215
12515	NC_015680	GGA	2	6	621887	621892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284215
12516	NC_015680	GAA	2	6	621966	621971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284215
12517	NC_015680	GA	3	6	621996	622001	50 %	0 %	50 %	0 %	337284215
12518	NC_015680	GCG	2	6	622003	622008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284215
12519	NC_015680	CAG	2	6	622011	622016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284215
12520	NC_015680	TAGC	2	8	622115	622122	25 %	25 %	25 %	25 %	337284215
12521	NC_015680	CAT	2	6	622140	622145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284215
12522	NC_015680	GAT	2	6	622198	622203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284215
12523	NC_015680	GGA	2	6	622232	622237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284215
12524	NC_015680	CT	3	6	622271	622276	0 %	50 %	0 %	50 %	337284215
12525	NC_015680	TC	3	6	622317	622322	0 %	50 %	0 %	50 %	337284215
12526	NC_015680	ATT	2	6	622387	622392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284215
12527	NC_015680	CT	3	6	622419	622424	0 %	50 %	0 %	50 %	337284215
12528	NC_015680	CTT	2	6	622443	622448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284215
12529	NC_015680	AAGC	2	8	622502	622509	50 %	0 %	25 %	25 %	337284215
12530	NC_015680	AG	4	8	622567	622574	50 %	0 %	50 %	0 %	337284215
12531	NC_015680	AGG	2	6	622582	622587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284215
12532	NC_015680	AGA	2	6	622615	622620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_015680	AAG	2	6	622630	622635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284216
12534	NC_015680	CCT	2	6	622648	622653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284216
12535	NC_015680	CTC	2	6	622664	622669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284216
12536	NC_015680	CTCC	2	8	622720	622727	0 %	25 %	0 %	75 %	337284216
12537	NC_015680	GGC	2	6	622734	622739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284216
12538	NC_015680	AAG	2	6	622808	622813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284216
12539	NC_015680	TCT	2	6	622948	622953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284216
12540	NC_015680	TCA	2	6	622962	622967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284216
12541	NC_015680	GGT	2	6	623017	623022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284216
12542	NC_015680	CCCT	2	8	623062	623069	0 %	25 %	0 %	75 %	337284216
12543	NC_015680	CTT	2	6	623075	623080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284216
12544	NC_015680	CCT	2	6	623135	623140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284216
12545	NC_015680	CTC	2	6	623195	623200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284216
12546	NC_015680	CTT	2	6	623222	623227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284216
12547	NC_015680	CCT	2	6	623335	623340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284216
12548	NC_015680	TGA	2	6	623410	623415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284216
12549	NC_015680	CCT	2	6	623446	623451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12550	NC_015680	ACC	2	6	623461	623466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12551	NC_015680	GAG	2	6	623565	623570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284217
12552	NC_015680	CGA	2	6	623603	623608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284217
12553	NC_015680	AC	3	6	623614	623619	50 %	0 %	0 %	50 %	337284217
12554	NC_015680	ACC	2	6	623641	623646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284217
12555	NC_015680	AGG	2	6	623803	623808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284217
12556	NC_015680	ACG	2	6	623829	623834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284217
12557	NC_015680	TGG	2	6	623837	623842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284217
12558	NC_015680	GAG	2	6	623847	623852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284217
12559	NC_015680	AGG	2	6	623919	623924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284217
12560	NC_015680	TTC	2	6	623997	624002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284217
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12562	NC_015680	GCGA	2	8	624048	624055	25 %	0 %	50 %	25 %	337284217
12563	NC_015680	ACGG	2	8	624168	624175	25 %	0 %	50 %	25 %	337284217
12564	NC_015680	AGG	2	6	624205	624210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284217
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12568	NC_015680	CT	3	6	624407	624412	0 %	50 %	0 %	50 %	337284217
12569	NC_015680	GCC	2	6	624422	624427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284217
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12571	NC_015680	GAAAA	2	10	624530	624539	80 %	0 %	20 %	0 %	337284217
12572	NC_015680	GAG	2	6	624558	624563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284217
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12574	NC_015680	CTT	2	6	624780	624785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284218
12575	NC_015680	CTC	2	6	624936	624941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284218
12576	NC_015680	TAT	2	6	624960	624965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284218
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12578	NC_015680	CATGG	2	10	625085	625094	20 %	20 %	40 %	20 %	337284218
12579	NC_015680	GTA	2	6	625164	625169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284218
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12581	NC_015680	AGA	2	6	625242	625247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12585	NC_015680	GAG	2	6	625350	625355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284219
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12589	NC_015680	GCG	3	9	625474	625482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284219
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12591	NC_015680	GAC	2	6	625506	625511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284219
12592	NC_015680	ATG	2	6	625684	625689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284219
12593	NC_015680	CTGGAT	2	12	625707	625718	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	337284219
12594	NC_015680	TGT	2	6	625730	625735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337284219
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12596	NC_015680	ACC	2	6	625779	625784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284219
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12600	NC_015680	TAG	2	6	625963	625968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284219
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12602	NC_015680	GTC	2	6	626199	626204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284219
12603	NC_015680	CGT	2	6	626216	626221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284219
12604	NC_015680	CCTG	2	8	626279	626286	0 %	25 %	25 %	50 %	337284219
12605	NC_015680	GTG	2	6	626302	626307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284219
12606	NC_015680	GAG	2	6	626319	626324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284219
12607	NC_015680	ACG	2	6	626353	626358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284219
12608	NC_015680	TGGTC	2	10	626423	626432	0 %	40 %	40 %	20 %	337284219
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12610	NC_015680	TGG	2	6	626462	626467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284219
12611	NC_015680	GAC	2	6	626532	626537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284219
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12615	NC_015680	CCA	2	6	626626	626631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284219
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12618	NC_015680	TGG	2	6	626669	626674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284219
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12984	NC_015680	GTA	2	6	644899	644904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284237
12985	NC_015680	GAC	2	6	644947	644952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284237
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