MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 34341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_015680	CGC	2	6	545827	545832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284136
11003	NC_015680	AGG	2	6	545901	545906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284136
11004	NC_015680	TCCT	2	8	545913	545920	0 %	50 %	0 %	50 %	337284136
11005	NC_015680	CGG	2	6	545974	545979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284136
11006	NC_015680	AGCG	2	8	546022	546029	25 %	0 %	50 %	25 %	337284136
11007	NC_015680	TTC	2	6	546050	546055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284136
11008	NC_015680	CTT	2	6	546059	546064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284136
11009	NC_015680	TCG	2	6	546072	546077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284136
11010	NC_015680	TTA	2	6	546091	546096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284136
11011	NC_015680	GAG	2	6	546137	546142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284136
11012	NC_015680	GCAACG	2	12	546162	546173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284136
11013	NC_015680	CCG	2	6	546182	546187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284136
11014	NC_015680	AGG	2	6	546192	546197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284136
11015	NC_015680	ACG	2	6	546213	546218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284136
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11017	NC_015680	TCC	2	6	546252	546257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284136
11018	NC_015680	TCG	2	6	546384	546389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284136
11019	NC_015680	GAA	2	6	546407	546412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284136
11020	NC_015680	CGC	2	6	546451	546456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284136
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11022	NC_015680	GGT	2	6	546640	546645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_015680	CTC	2	6	546659	546664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284137
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11026	NC_015680	CGC	2	6	546892	546897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284137
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11030	NC_015680	CTG	2	6	547041	547046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284137
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11033	NC_015680	ACCAC	2	10	547140	547149	40 %	0 %	0 %	60 %	337284137
11034	NC_015680	TCG	2	6	547173	547178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284137
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11056	NC_015680	AGG	2	6	548214	548219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284137
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11061	NC_015680	CCCT	2	8	548505	548512	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11062	NC_015680	ATT	2	6	548564	548569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_015680	GAG	3	9	548571	548579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_015680	GAG	2	6	548645	548650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284138
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11087	NC_015680	CTTC	2	8	549585	549592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11088	NC_015680	A	6	6	549626	549631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11093	NC_015680	GTT	2	6	549946	549951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_015680	A	7	7	549958	549964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_015680	TTG	2	6	549990	549995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_015680	GAG	2	6	550088	550093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11099	NC_015680	CTG	2	6	550264	550269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284141
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11101	NC_015680	TAGG	2	8	550320	550327	25 %	25 %	50 %	0 %	337284141
11102	NC_015680	TAT	2	6	550353	550358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284141
11103	NC_015680	TCC	2	6	550371	550376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284141
11104	NC_015680	CAATGC	2	12	550460	550471	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	337284141
11105	NC_015680	TGA	3	9	550539	550547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284141
11106	NC_015680	ATCC	2	8	550591	550598	25 %	25 %	0 %	50 %	337284141
11107	NC_015680	TCG	2	6	550648	550653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284141
11108	NC_015680	CTT	2	6	550656	550661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284141
11109	NC_015680	TG	3	6	550704	550709	0 %	50 %	50 %	0 %	337284141
11110	NC_015680	T	7	7	550742	550748	0 %	100 %	0 %	0 %	337284141
11111	NC_015680	TTTG	2	8	550776	550783	0 %	75 %	25 %	0 %	337284141
11112	NC_015680	G	6	6	550795	550800	0 %	0 %	100 %	0 %	337284141
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11117	NC_015680	CAT	2	6	551028	551033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284141
11118	NC_015680	ACA	2	6	551047	551052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284141
11119	NC_015680	CTT	2	6	551152	551157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284141
11120	NC_015680	CCG	2	6	551164	551169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284141
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11122	NC_015680	CTT	2	6	551240	551245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284141
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11369	NC_015680	AGC	2	6	562874	562879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284150
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11373	NC_015680	CTT	2	6	563054	563059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284150
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11381	NC_015680	TCT	2	6	563455	563460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284152
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11489	NC_015680	CCT	2	6	568249	568254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284158
11490	NC_015680	AT	3	6	568288	568293	50 %	50 %	0 %	0 %	337284158
11491	NC_015680	CTT	2	6	568317	568322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284158
11492	NC_015680	GAC	2	6	568381	568386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284158
11493	NC_015680	CGT	2	6	568393	568398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284158
11494	NC_015680	TCC	2	6	568451	568456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284158
11495	NC_015680	ATT	2	6	568529	568534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284158
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11497	NC_015680	TCC	2	6	568595	568600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284158
11498	NC_015680	GAT	2	6	568665	568670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284158
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11500	NC_015680	TCC	2	6	568704	568709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284158

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