MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 34341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015680	GAG	2	6	520994	520999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284106
10502	NC_015680	CAAGG	2	10	521027	521036	40 %	0 %	40 %	20 %	337284106
10503	NC_015680	ATGG	2	8	521234	521241	25 %	25 %	50 %	0 %	337284106
10504	NC_015680	GCC	2	6	521266	521271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284106
10505	NC_015680	AGA	2	6	521389	521394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284106
10506	NC_015680	TTC	2	6	521456	521461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284106
10507	NC_015680	TAA	2	6	521502	521507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337284106
10508	NC_015680	GGC	2	6	521563	521568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284106
10509	NC_015680	GAG	2	6	521609	521614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284106
10510	NC_015680	GTA	2	6	521630	521635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284106
10511	NC_015680	GAG	2	6	521645	521650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284106
10512	NC_015680	GCT	2	6	521710	521715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284106
10513	NC_015680	TCG	2	6	521787	521792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284106
10514	NC_015680	GAG	2	6	521861	521866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284106
10515	NC_015680	TTC	2	6	521909	521914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284106
10516	NC_015680	GTG	2	6	521931	521936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284106
10517	NC_015680	G	6	6	521973	521978	0 %	0 %	100 %	0 %	337284106
10518	NC_015680	CCA	2	6	522037	522042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284106
10519	NC_015680	TGG	2	6	522049	522054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284106
10520	NC_015680	TGA	2	6	522132	522137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284106
10521	NC_015680	CTC	2	6	522222	522227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284107
10522	NC_015680	CCA	2	6	522275	522280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284107
10523	NC_015680	GA	3	6	522347	522352	50 %	0 %	50 %	0 %	337284107
10524	NC_015680	CTT	2	6	522405	522410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284107
10525	NC_015680	GTG	2	6	522465	522470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284107
10526	NC_015680	CCG	3	9	522550	522558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284108
10527	NC_015680	GTG	2	6	522559	522564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284108
10528	NC_015680	GAG	2	6	522595	522600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284108
10529	NC_015680	TGGCTC	2	12	522610	522621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284108
10530	NC_015680	GTG	2	6	522642	522647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284108
10531	NC_015680	AATT	2	8	522656	522663	50 %	50 %	0 %	0 %	337284108
10532	NC_015680	AG	4	8	522688	522695	50 %	0 %	50 %	0 %	337284108
10533	NC_015680	GAG	2	6	522784	522789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284108
10534	NC_015680	GGA	2	6	522835	522840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284108
10535	NC_015680	AAG	2	6	522874	522879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284108
10536	NC_015680	GAG	2	6	523147	523152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284108
10537	NC_015680	GAG	2	6	523156	523161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284108
10538	NC_015680	TTC	2	6	523171	523176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284108
10539	NC_015680	GAA	2	6	523181	523186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284108
10540	NC_015680	AAGT	2	8	523195	523202	50 %	25 %	25 %	0 %	337284108
10541	NC_015680	TCT	2	6	523241	523246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284109
10542	NC_015680	TAT	2	6	523254	523259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284109
10543	NC_015680	CCT	2	6	523277	523282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284109
10544	NC_015680	TTC	2	6	523294	523299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284109
10545	NC_015680	TCG	2	6	523432	523437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284109
10546	NC_015680	CTT	2	6	523482	523487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284109
10547	NC_015680	TGA	2	6	523520	523525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284109
10548	NC_015680	TC	3	6	523593	523598	0 %	50 %	0 %	50 %	337284109
10549	NC_015680	CTT	2	6	523832	523837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284109
10550	NC_015680	GCGTAG	2	12	523855	523866	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	337284109
10551	NC_015680	CCTGTC	2	12	523884	523895	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	337284109
10552	NC_015680	TCC	2	6	523897	523902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284109
10553	NC_015680	CGT	2	6	523953	523958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284109
10554	NC_015680	CACT	2	8	523996	524003	25 %	25 %	0 %	50 %	337284109
10555	NC_015680	CCT	2	6	524111	524116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284109
10556	NC_015680	GTA	2	6	524262	524267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284109
10557	NC_015680	C	6	6	524276	524281	0 %	0 %	0 %	100 %	337284109
10558	NC_015680	CAA	2	6	524398	524403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_015680	A	6	6	524487	524492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_015680	TAA	2	6	524493	524498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_015680	GAG	2	6	524503	524508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_015680	CTA	2	6	524511	524516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284110
10563	NC_015680	GGC	2	6	524544	524549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284110
10564	NC_015680	GCC	2	6	524571	524576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284110
10565	NC_015680	GGC	2	6	524616	524621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284110
10566	NC_015680	CTT	2	6	524651	524656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284110
10567	NC_015680	GAG	2	6	524739	524744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284110
10568	NC_015680	GAC	2	6	524880	524885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284110
10569	NC_015680	CTC	2	6	524997	525002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284110
10570	NC_015680	TCG	2	6	525019	525024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284110
10571	NC_015680	CCT	3	9	525038	525046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284110
10572	NC_015680	ACC	2	6	525052	525057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284110
10573	NC_015680	ACC	2	6	525072	525077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284110
10574	NC_015680	CTT	2	6	525105	525110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284110
10575	NC_015680	AGT	2	6	525146	525151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284110
10576	NC_015680	ATT	2	6	525238	525243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337284110
10577	NC_015680	GGT	2	6	525343	525348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_015680	GGA	2	6	525364	525369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284111
10579	NC_015680	GGA	2	6	525391	525396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284111
10580	NC_015680	AGGG	2	8	525416	525423	25 %	0 %	75 %	0 %	337284111
10581	NC_015680	CGT	2	6	525523	525528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284111
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10584	NC_015680	CGG	2	6	525649	525654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284111
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10586	NC_015680	GGC	2	6	525727	525732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284111
10587	NC_015680	GAG	2	6	525734	525739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284111
10588	NC_015680	CAT	2	6	525760	525765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337284111
10589	NC_015680	CAA	2	6	525831	525836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337284111
10590	NC_015680	AGG	2	6	525855	525860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284111
10591	NC_015680	TCG	2	6	525861	525866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284111
10592	NC_015680	AGA	2	6	525867	525872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284111
10593	NC_015680	GAA	2	6	525874	525879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284111
10594	NC_015680	TCG	2	6	525891	525896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284111
10595	NC_015680	GGC	2	6	525925	525930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284111
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10598	NC_015680	AG	3	6	526118	526123	50 %	0 %	50 %	0 %	337284111
10599	NC_015680	TGG	2	6	526140	526145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337284111
10600	NC_015680	GCT	2	6	526280	526285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284111
10601	NC_015680	GCC	2	6	526301	526306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284111
10602	NC_015680	CTATG	2	10	526325	526334	20 %	40 %	20 %	20 %	337284111
10603	NC_015680	CCG	2	6	526341	526346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337284111
10604	NC_015680	AGC	2	6	526405	526410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284111
10605	NC_015680	AAG	2	6	526448	526453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284111
10606	NC_015680	CCA	2	6	526554	526559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284111
10607	NC_015680	AAG	2	6	526625	526630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284111
10608	NC_015680	GAG	2	6	526634	526639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284111
10609	NC_015680	GAA	2	6	526668	526673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337284112
10610	NC_015680	CTCC	2	8	526716	526723	0 %	25 %	0 %	75 %	337284112
10611	NC_015680	TTC	2	6	526813	526818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284112
10612	NC_015680	GGA	2	6	526830	526835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284112
10613	NC_015680	GA	3	6	526873	526878	50 %	0 %	50 %	0 %	337284112
10614	NC_015680	GGGT	2	8	526966	526973	0 %	25 %	75 %	0 %	337284112
10615	NC_015680	TCG	2	6	526997	527002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284112
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10618	NC_015680	GAAA	2	8	527100	527107	75 %	0 %	25 %	0 %	337284112
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10620	NC_015680	TTC	2	6	527140	527145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337284112
10621	NC_015680	GAG	2	6	527190	527195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284112
10622	NC_015680	CGA	2	6	527217	527222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337284112
10623	NC_015680	GCG	2	6	527228	527233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284112
10624	NC_015680	GAT	2	6	527297	527302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284112
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10702	NC_015680	CTGCCC	2	12	530785	530796	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	337284116
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10704	NC_015680	TC	3	6	530879	530884	0 %	50 %	0 %	50 %	337284116
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10726	NC_015680	TGA	2	6	532430	532435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284118
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10732	NC_015680	AGCA	2	8	532743	532750	50 %	0 %	25 %	25 %	337284118
10733	NC_015680	TCGT	2	8	532821	532828	0 %	50 %	25 %	25 %	337284118
10734	NC_015680	ATG	2	6	532843	532848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284118
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10737	NC_015680	AGT	2	6	532990	532995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284118
10738	NC_015680	C	6	6	533014	533019	0 %	0 %	0 %	100 %	337284119
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10740	NC_015680	ACC	2	6	533061	533066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337284119
10741	NC_015680	CGT	2	6	533069	533074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337284119
10742	NC_015680	CGG	2	6	533086	533091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284119
10743	NC_015680	GAGGG	2	10	533123	533132	20 %	0 %	80 %	0 %	337284119
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10745	NC_015680	TGA	2	6	533227	533232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337284119
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10853	NC_015680	GAAGA	2	10	538078	538087	60 %	0 %	40 %	0 %	337284128
10854	NC_015680	GA	3	6	538126	538131	50 %	0 %	50 %	0 %	337284128
10855	NC_015680	TGC	2	6	538180	538185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10856	NC_015680	TGA	2	6	538210	538215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10983	NC_015680	AGG	2	6	544665	544670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284135
10984	NC_015680	GGA	2	6	544772	544777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337284135
10985	NC_015680	CCT	2	6	544799	544804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337284135
10986	NC_015680	GCG	3	9	544921	544929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284135
10987	NC_015680	CGG	2	6	545054	545059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337284135
10988	NC_015680	TCTA	2	8	545062	545069	25 %	50 %	0 %	25 %	337284135
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10991	NC_015680	ACGT	2	8	545112	545119	25 %	25 %	25 %	25 %	337284136
10992	NC_015680	ACCTCC	2	12	545127	545138	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	337284136
10993	NC_015680	GCTC	2	8	545143	545150	0 %	25 %	25 %	50 %	337284136
10994	NC_015680	CT	3	6	545273	545278	0 %	50 %	0 %	50 %	337284136
10995	NC_015680	AG	3	6	545282	545287	50 %	0 %	50 %	0 %	337284136
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10999	NC_015680	CCCT	2	8	545581	545588	0 %	25 %	0 %	75 %	337284136
11000	NC_015680	GTCGAG	2	12	545660	545671	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	337284136

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