MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 34341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015680	GAG	2	6	24733	24738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283537
502	NC_015680	AGG	2	6	24753	24758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283537
503	NC_015680	CGT	2	6	24787	24792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283537
504	NC_015680	GAA	2	6	24803	24808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283537
505	NC_015680	ATGA	2	8	24822	24829	50 %	25 %	25 %	0 %	337283537
506	NC_015680	CTC	2	6	24841	24846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_015680	TAAA	2	8	24867	24874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015680	CTA	3	9	24883	24891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_015680	GGA	2	6	24916	24921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283538
510	NC_015680	GTTAAA	2	12	24924	24935	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337283538
511	NC_015680	GAG	2	6	25027	25032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283538
512	NC_015680	CGA	2	6	25131	25136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283538
513	NC_015680	CAGT	2	8	25218	25225	25 %	25 %	25 %	25 %	337283538
514	NC_015680	AG	3	6	25233	25238	50 %	0 %	50 %	0 %	337283538
515	NC_015680	T	6	6	25314	25319	0 %	100 %	0 %	0 %	337283538
516	NC_015680	GA	3	6	25336	25341	50 %	0 %	50 %	0 %	337283538
517	NC_015680	CCT	2	6	25414	25419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283538
518	NC_015680	GAG	2	6	25474	25479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283538
519	NC_015680	ACT	2	6	25485	25490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283538
520	NC_015680	CCTG	2	8	25491	25498	0 %	25 %	25 %	50 %	337283538
521	NC_015680	GAA	2	6	25602	25607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283538
522	NC_015680	AGG	2	6	25670	25675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283538
523	NC_015680	CTA	2	6	25768	25773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283539
524	NC_015680	T	6	6	25843	25848	0 %	100 %	0 %	0 %	337283539
525	NC_015680	GAG	2	6	25856	25861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283539
526	NC_015680	GCT	3	9	25878	25886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283539
527	NC_015680	CTT	2	6	25933	25938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283539
528	NC_015680	TCT	2	6	25958	25963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283539
529	NC_015680	AAT	2	6	26025	26030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283539
530	NC_015680	CTT	2	6	26087	26092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283539
531	NC_015680	TCG	2	6	26118	26123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283539
532	NC_015680	GGC	2	6	26153	26158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283539
533	NC_015680	TAA	2	6	26200	26205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283539
534	NC_015680	CCT	2	6	26210	26215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283539
535	NC_015680	GCC	2	6	26238	26243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283539
536	NC_015680	TCC	2	6	26244	26249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283539
537	NC_015680	GCA	2	6	26325	26330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283539
538	NC_015680	CCT	2	6	26357	26362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283539
539	NC_015680	TCT	2	6	26374	26379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283539
540	NC_015680	TCA	2	6	26383	26388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283539
541	NC_015680	GA	3	6	26396	26401	50 %	0 %	50 %	0 %	337283539
542	NC_015680	GA	3	6	26424	26429	50 %	0 %	50 %	0 %	337283539
543	NC_015680	GAA	3	9	26440	26448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283539
544	NC_015680	T	6	6	26477	26482	0 %	100 %	0 %	0 %	337283539
545	NC_015680	TAT	2	6	26540	26545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283539
546	NC_015680	TCAC	2	8	26653	26660	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_015680	ATG	2	6	26670	26675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015680	TCC	2	6	26823	26828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283540
549	NC_015680	T	6	6	26844	26849	0 %	100 %	0 %	0 %	337283540
550	NC_015680	TGT	3	9	26891	26899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283540
551	NC_015680	AT	3	6	26932	26937	50 %	50 %	0 %	0 %	337283540
552	NC_015680	CTC	2	6	26938	26943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283540
553	NC_015680	CTT	2	6	27064	27069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283540
554	NC_015680	CTT	2	6	27100	27105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283540
555	NC_015680	CTT	2	6	27158	27163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283540
556	NC_015680	TAGGGG	2	12	27218	27229	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	337283540
557	NC_015680	GCTC	2	8	27284	27291	0 %	25 %	25 %	50 %	337283540
558	NC_015680	AGA	2	6	27328	27333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283540
559	NC_015680	TCT	2	6	27388	27393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283540
560	NC_015680	AACG	2	8	27413	27420	50 %	0 %	25 %	25 %	337283540
561	NC_015680	ACG	2	6	27501	27506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283540
562	NC_015680	AGA	2	6	27589	27594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283540
563	NC_015680	TCT	2	6	27654	27659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283540
564	NC_015680	GTG	2	6	27707	27712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283540
565	NC_015680	ATT	2	6	27759	27764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283540
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567	NC_015680	T	6	6	27878	27883	0 %	100 %	0 %	0 %	337283540
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569	NC_015680	T	6	6	28100	28105	0 %	100 %	0 %	0 %	337283540
570	NC_015680	TAG	2	6	28176	28181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283540
571	NC_015680	AT	3	6	28206	28211	50 %	50 %	0 %	0 %	337283540
572	NC_015680	ATG	2	6	28240	28245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283540
573	NC_015680	TTATGT	2	12	28246	28257	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	337283540
574	NC_015680	ATTG	2	8	28317	28324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015680	GGA	2	6	28406	28411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283541
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578	NC_015680	A	6	6	28667	28672	100 %	0 %	0 %	0 %	337283541
579	NC_015680	AGA	2	6	28710	28715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283541
580	NC_015680	TTG	2	6	28758	28763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283541
581	NC_015680	GTT	2	6	28797	28802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283541
582	NC_015680	GAGC	2	8	28820	28827	25 %	0 %	50 %	25 %	337283541
583	NC_015680	TTG	2	6	28912	28917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283541
584	NC_015680	GAG	2	6	28920	28925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283541
585	NC_015680	GGCTTG	2	12	28930	28941	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	337283541
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587	NC_015680	CTTT	2	8	28969	28976	0 %	75 %	0 %	25 %	337283541
588	NC_015680	TGGAG	2	10	29140	29149	20 %	20 %	60 %	0 %	337283541
589	NC_015680	GA	3	6	29210	29215	50 %	0 %	50 %	0 %	337283541
590	NC_015680	GAG	2	6	29364	29369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283541
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592	NC_015680	GAG	2	6	29439	29444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283541
593	NC_015680	G	6	6	29492	29497	0 %	0 %	100 %	0 %	337283541
594	NC_015680	TTA	2	6	29552	29557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283541
595	NC_015680	TGA	2	6	29696	29701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283541
596	NC_015680	TGA	2	6	29723	29728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283541
597	NC_015680	GA	4	8	29745	29752	50 %	0 %	50 %	0 %	337283541
598	NC_015680	ATT	2	6	29758	29763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283541
599	NC_015680	GGA	2	6	29780	29785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283541
600	NC_015680	TA	3	6	29786	29791	50 %	50 %	0 %	0 %	337283541
601	NC_015680	CA	3	6	29799	29804	50 %	0 %	0 %	50 %	337283541
602	NC_015680	GGT	3	9	29834	29842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283541
603	NC_015680	GT	3	6	29860	29865	0 %	50 %	50 %	0 %	337283541
604	NC_015680	GAAG	2	8	29881	29888	50 %	0 %	50 %	0 %	337283541
605	NC_015680	GAC	2	6	29925	29930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283541
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608	NC_015680	AT	3	6	30102	30107	50 %	50 %	0 %	0 %	337283542
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611	NC_015680	ATGC	2	8	30190	30197	25 %	25 %	25 %	25 %	337283542
612	NC_015680	AGA	2	6	30285	30290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283542
613	NC_015680	AAG	2	6	30292	30297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283542
614	NC_015680	AG	3	6	30340	30345	50 %	0 %	50 %	0 %	337283542
615	NC_015680	AAT	2	6	30372	30377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283542
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618	NC_015680	GGGGA	2	10	30492	30501	20 %	0 %	80 %	0 %	337283542
619	NC_015680	AAC	2	6	30520	30525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283542
620	NC_015680	TAAA	2	8	30548	30555	75 %	25 %	0 %	0 %	337283542
621	NC_015680	GAAC	2	8	30561	30568	50 %	0 %	25 %	25 %	337283542
622	NC_015680	TACAT	2	10	30669	30678	40 %	40 %	0 %	20 %	337283542
623	NC_015680	CATCT	2	10	30710	30719	20 %	40 %	0 %	40 %	337283542
624	NC_015680	CTT	2	6	30820	30825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283542
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626	NC_015680	TAT	2	6	30898	30903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283542
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630	NC_015680	CGA	2	6	31014	31019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283542
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