MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 34341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_015680	CGG	2	6	299083	299088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283854
6003	NC_015680	GA	3	6	299123	299128	50 %	0 %	50 %	0 %	337283854
6004	NC_015680	CCT	2	6	299134	299139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283854
6005	NC_015680	AAAGG	2	10	299155	299164	60 %	0 %	40 %	0 %	337283854
6006	NC_015680	GAG	2	6	299420	299425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283854
6007	NC_015680	ACT	2	6	299493	299498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283854
6008	NC_015680	GAG	2	6	299515	299520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283854
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6011	NC_015680	CAG	2	6	299602	299607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283854
6012	NC_015680	AGCCTT	2	12	299645	299656	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	337283854
6013	NC_015680	TAC	2	6	299660	299665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283854
6014	NC_015680	TGA	2	6	299673	299678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283854
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6016	NC_015680	TCCAC	2	10	299796	299805	20 %	20 %	0 %	60 %	337283854
6017	NC_015680	GAA	2	6	299848	299853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283854
6018	NC_015680	AGA	2	6	299920	299925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283854
6019	NC_015680	GCC	2	6	299982	299987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283854
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6022	NC_015680	T	6	6	300052	300057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_015680	CTTTC	2	10	300062	300071	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6024	NC_015680	CTA	2	6	300076	300081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_015680	CCG	2	6	300102	300107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_015680	GAG	2	6	300161	300166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_015680	CGA	2	6	300217	300222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_015680	GCT	2	6	300291	300296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_015680	GTT	2	6	300305	300310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_015680	ATC	2	6	300318	300323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_015680	TAC	2	6	300352	300357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6033	NC_015680	ACA	2	6	300387	300392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_015680	ACT	2	6	300435	300440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_015680	AGG	2	6	300462	300467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_015680	CATTC	2	10	300494	300503	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6037	NC_015680	CTT	2	6	300513	300518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_015680	GAA	2	6	300579	300584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_015680	ACG	2	6	300649	300654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_015680	AT	3	6	300663	300668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_015680	GAA	2	6	300669	300674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_015680	TTA	2	6	300806	300811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_015680	ACCT	2	8	300897	300904	25 %	25 %	0 %	50 %	337283855
6044	NC_015680	CTA	2	6	300933	300938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283855
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6050	NC_015680	GTC	2	6	301178	301183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283855
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6053	NC_015680	GGA	2	6	301240	301245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283855
6054	NC_015680	CCGACG	2	12	301277	301288	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	337283855
6055	NC_015680	GTC	2	6	301295	301300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283855
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6057	NC_015680	TTG	2	6	301333	301338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_015680	AAGTT	2	10	301430	301439	40 %	40 %	20 %	0 %	337283856
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6105	NC_015680	GCG	2	6	304276	304281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283859
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6111	NC_015680	CCCG	2	8	304622	304629	0 %	0 %	25 %	75 %	337283859
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6119	NC_015680	GCTC	2	8	304853	304860	0 %	25 %	25 %	50 %	337283859
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6125	NC_015680	AT	3	6	305247	305252	50 %	50 %	0 %	0 %	337283860
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6193	NC_015680	TGAAA	2	10	308480	308489	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6233	NC_015680	CAA	2	6	310477	310482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283866
6234	NC_015680	CCTCC	2	10	310652	310661	0 %	20 %	0 %	80 %	337283866
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6241	NC_015680	CTG	2	6	310998	311003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283866
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6243	NC_015680	TCT	2	6	311110	311115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283866
6244	NC_015680	TCC	2	6	311160	311165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283866
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6246	NC_015680	TGA	2	6	311224	311229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6493	NC_015680	CAT	2	6	323691	323696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283878
6494	NC_015680	TGG	2	6	323724	323729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283878
6495	NC_015680	GGC	2	6	323749	323754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283878
6496	NC_015680	CTG	2	6	323758	323763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283878
6497	NC_015680	CG	3	6	323765	323770	0 %	0 %	50 %	50 %	337283878
6498	NC_015680	TGACC	2	10	323916	323925	20 %	20 %	20 %	40 %	337283878
6499	NC_015680	CGA	2	6	323949	323954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283878
6500	NC_015680	AGG	2	6	324014	324019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283878

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