MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus yayanosii CH1 chromosome

Total Repeats: 34341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015680	GGT	2	6	251050	251055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283802
5002	NC_015680	GACGAG	2	12	251099	251110	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	337283802
5003	NC_015680	TTC	2	6	251118	251123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283802
5004	NC_015680	CTC	2	6	251177	251182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283802
5005	NC_015680	CTC	2	6	251241	251246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283802
5006	NC_015680	GAG	2	6	251267	251272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283802
5007	NC_015680	CCT	2	6	251291	251296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283802
5008	NC_015680	GAC	2	6	251318	251323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283802
5009	NC_015680	CTC	2	6	251324	251329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283802
5010	NC_015680	CTC	2	6	251345	251350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283802
5011	NC_015680	CTC	2	6	251357	251362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283802
5012	NC_015680	GCT	2	6	251365	251370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283802
5013	NC_015680	AGG	2	6	251439	251444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283802
5014	NC_015680	CTC	2	6	251513	251518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283802
5015	NC_015680	TGAGGT	2	12	251521	251532	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	337283802
5016	NC_015680	ACCTCG	2	12	251586	251597	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	337283802
5017	NC_015680	TCG	2	6	251674	251679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283802
5018	NC_015680	GT	3	6	251691	251696	0 %	50 %	50 %	0 %	337283802
5019	NC_015680	CGA	2	6	251698	251703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283802
5020	NC_015680	CCTT	2	8	251707	251714	0 %	50 %	0 %	50 %	337283802
5021	NC_015680	GAA	2	6	251801	251806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283802
5022	NC_015680	TTC	2	6	251986	251991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283802
5023	NC_015680	ACG	2	6	252018	252023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283802
5024	NC_015680	TCACC	2	10	252073	252082	20 %	20 %	0 %	60 %	337283803
5025	NC_015680	AGC	2	6	252097	252102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283803
5026	NC_015680	CGC	2	6	252149	252154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283803
5027	NC_015680	ACG	4	12	252157	252168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283803
5028	NC_015680	TCG	2	6	252238	252243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283803
5029	NC_015680	CCT	2	6	252281	252286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283803
5030	NC_015680	CCTC	2	8	252290	252297	0 %	25 %	0 %	75 %	337283803
5031	NC_015680	TTC	2	6	252319	252324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283803
5032	NC_015680	CT	3	6	252341	252346	0 %	50 %	0 %	50 %	337283803
5033	NC_015680	CGA	2	6	252347	252352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283803
5034	NC_015680	CCT	2	6	252359	252364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283803
5035	NC_015680	TC	3	6	252377	252382	0 %	50 %	0 %	50 %	337283803
5036	NC_015680	CT	3	6	252404	252409	0 %	50 %	0 %	50 %	337283803
5037	NC_015680	TCC	2	6	252431	252436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283803
5038	NC_015680	TCA	2	6	252451	252456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283803
5039	NC_015680	AGT	2	6	252482	252487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283803
5040	NC_015680	AAG	2	6	252496	252501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283803
5041	NC_015680	GAA	2	6	252600	252605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283803
5042	NC_015680	TCC	2	6	252619	252624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283803
5043	NC_015680	ATC	3	9	252736	252744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283803
5044	NC_015680	TC	3	6	252780	252785	0 %	50 %	0 %	50 %	337283803
5045	NC_015680	TCT	2	6	252941	252946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283803
5046	NC_015680	ATG	2	6	253060	253065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283803
5047	NC_015680	GTC	2	6	253083	253088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283803
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5049	NC_015680	TCT	2	6	253192	253197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283804
5050	NC_015680	AGGGCG	2	12	253259	253270	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	337283804
5051	NC_015680	CT	3	6	253322	253327	0 %	50 %	0 %	50 %	337283804
5052	NC_015680	TCG	2	6	253328	253333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283804
5053	NC_015680	CAT	2	6	253416	253421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283804
5054	NC_015680	CT	3	6	253436	253441	0 %	50 %	0 %	50 %	337283804
5055	NC_015680	TAT	2	6	253444	253449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283804
5056	NC_015680	CGG	2	6	253486	253491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283804
5057	NC_015680	TA	3	6	253589	253594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_015680	CCG	2	6	253628	253633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_015680	AT	3	6	253693	253698	50 %	50 %	0 %	0 %	337283805
5060	NC_015680	G	6	6	253709	253714	0 %	0 %	100 %	0 %	337283805
5061	NC_015680	GAG	2	6	253747	253752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283805
5062	NC_015680	GA	3	6	253804	253809	50 %	0 %	50 %	0 %	337283805
5063	NC_015680	TTC	3	9	253838	253846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283805
5064	NC_015680	TC	3	6	253857	253862	0 %	50 %	0 %	50 %	337283805
5065	NC_015680	CT	3	6	253884	253889	0 %	50 %	0 %	50 %	337283805
5066	NC_015680	TGA	2	6	253898	253903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283805
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5069	NC_015680	GAG	3	9	254035	254043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283805
5070	NC_015680	AGG	2	6	254071	254076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283805
5071	NC_015680	TTA	2	6	254081	254086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283805
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5073	NC_015680	CGA	2	6	254163	254168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283805
5074	NC_015680	AAG	2	6	254194	254199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283805
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5080	NC_015680	CCTC	2	8	254420	254427	0 %	25 %	0 %	75 %	337283805
5081	NC_015680	A	6	6	254438	254443	100 %	0 %	0 %	0 %	337283805
5082	NC_015680	AG	3	6	254452	254457	50 %	0 %	50 %	0 %	337283805
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5089	NC_015680	GAA	2	6	254744	254749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283806
5090	NC_015680	T	6	6	254835	254840	0 %	100 %	0 %	0 %	337283806
5091	NC_015680	CGC	2	6	254857	254862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283806
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5094	NC_015680	GAG	2	6	255164	255169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283806
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5097	NC_015680	TAG	2	6	255205	255210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283806
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5100	NC_015680	AGGC	2	8	255325	255332	25 %	0 %	50 %	25 %	337283806
5101	NC_015680	AGGC	2	8	255352	255359	25 %	0 %	50 %	25 %	337283806
5102	NC_015680	AGA	2	6	255394	255399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283806
5103	NC_015680	TGG	2	6	255466	255471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283806
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5105	NC_015680	TCCT	2	8	255543	255550	0 %	50 %	0 %	50 %	337283806
5106	NC_015680	TCA	2	6	255608	255613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283807
5107	NC_015680	TCA	2	6	255635	255640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283807
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5115	NC_015680	TA	3	6	255914	255919	50 %	50 %	0 %	0 %	337283807
5116	NC_015680	AAC	2	6	255958	255963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_015680	CT	3	6	256005	256010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5118	NC_015680	TCA	2	6	256011	256016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_015680	TAA	2	6	256040	256045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_015680	GAAAA	2	10	256053	256062	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_015680	CAG	2	6	256087	256092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283808
5122	NC_015680	CAA	2	6	256118	256123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283808
5123	NC_015680	CGG	2	6	256194	256199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283808
5124	NC_015680	CGA	2	6	256352	256357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283808
5125	NC_015680	GAC	2	6	256401	256406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283808
5126	NC_015680	TCTGCC	2	12	256571	256582	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	337283808
5127	NC_015680	CAA	2	6	256641	256646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283808
5128	NC_015680	CATTT	2	10	256786	256795	20 %	60 %	0 %	20 %	337283808
5129	NC_015680	CCT	2	6	256817	256822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283808
5130	NC_015680	TCC	2	6	256874	256879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283808
5131	NC_015680	CGT	2	6	256881	256886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283808
5132	NC_015680	CTAT	2	8	256933	256940	25 %	50 %	0 %	25 %	337283808
5133	NC_015680	TGA	2	6	256985	256990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283808
5134	NC_015680	CTT	2	6	257010	257015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283808
5135	NC_015680	TGA	2	6	257182	257187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283809
5136	NC_015680	TTGGG	2	10	257236	257245	0 %	40 %	60 %	0 %	337283809
5137	NC_015680	GAG	2	6	257255	257260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283809
5138	NC_015680	TG	3	6	257265	257270	0 %	50 %	50 %	0 %	337283809
5139	NC_015680	CGA	2	6	257365	257370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283809
5140	NC_015680	CAG	2	6	257429	257434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283809
5141	NC_015680	GTG	2	6	257472	257477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283809
5142	NC_015680	GAC	2	6	257528	257533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283809
5143	NC_015680	GCT	2	6	257536	257541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283809
5144	NC_015680	TTC	2	6	257571	257576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283809
5145	NC_015680	CTCTC	2	10	257578	257587	0 %	40 %	0 %	60 %	337283809
5146	NC_015680	TTCC	2	8	257635	257642	0 %	50 %	0 %	50 %	337283809
5147	NC_015680	AG	3	6	257715	257720	50 %	0 %	50 %	0 %	337283809
5148	NC_015680	GAG	2	6	257792	257797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283809
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5150	NC_015680	CT	3	6	257859	257864	0 %	50 %	0 %	50 %	337283809
5151	NC_015680	CGA	2	6	257917	257922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283809
5152	NC_015680	CTC	2	6	258042	258047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283809
5153	NC_015680	CTT	3	9	258054	258062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283810
5154	NC_015680	AGG	2	6	258124	258129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283810
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5156	NC_015680	CGT	2	6	258209	258214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283810
5157	NC_015680	ACCGAG	2	12	258252	258263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283810
5158	NC_015680	GAC	2	6	258288	258293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283810
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5162	NC_015680	CCA	2	6	258462	258467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337283810
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5164	NC_015680	CT	4	8	258519	258526	0 %	50 %	0 %	50 %	337283810
5165	NC_015680	CCG	2	6	258608	258613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283810
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5169	NC_015680	AAG	2	6	258934	258939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283810
5170	NC_015680	GGGAG	2	10	259020	259029	20 %	0 %	80 %	0 %	337283810
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5178	NC_015680	CGCC	2	8	259689	259696	0 %	0 %	25 %	75 %	337283811
5179	NC_015680	GAA	2	6	259720	259725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283811
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5184	NC_015680	CAG	2	6	259966	259971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283811
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5187	NC_015680	ATT	2	6	260030	260035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337283811
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5189	NC_015680	CTG	2	6	260091	260096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283811
5190	NC_015680	TCG	2	6	260142	260147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283811
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5192	NC_015680	AGAAA	2	10	260260	260269	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5193	NC_015680	CAT	2	6	260270	260275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283812
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5198	NC_015680	GTA	2	6	260518	260523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283812
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5200	NC_015680	GCT	2	6	260571	260576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337283812
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5224	NC_015680	TCC	2	6	261629	261634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283812
5225	NC_015680	TCC	2	6	261806	261811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283812
5226	NC_015680	AGG	2	6	261815	261820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283812
5227	NC_015680	GTA	2	6	261847	261852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283812
5228	NC_015680	GTA	2	6	261919	261924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283812
5229	NC_015680	TC	4	8	261978	261985	0 %	50 %	0 %	50 %	337283812
5230	NC_015680	GAA	2	6	262024	262029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283812
5231	NC_015680	ACA	2	6	262103	262108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337283812
5232	NC_015680	CTT	2	6	262126	262131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337283812
5233	NC_015680	CTC	2	6	262156	262161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283812
5234	NC_015680	CTA	2	6	262173	262178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337283812
5235	NC_015680	TGGG	2	8	262274	262281	0 %	25 %	75 %	0 %	337283812
5236	NC_015680	GTG	2	6	262284	262289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283812
5237	NC_015680	TGT	2	6	262291	262296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337283812
5238	NC_015680	GGT	2	6	262297	262302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337283812
5239	NC_015680	TAA	2	6	262442	262447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5240	NC_015680	GA	3	6	262483	262488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_015680	TCAT	2	8	262497	262504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5242	NC_015680	CTGT	2	8	262618	262625	0 %	50 %	25 %	25 %	337283813
5243	NC_015680	TGA	2	6	262683	262688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337283813
5244	NC_015680	CTC	2	6	262742	262747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337283813
5245	NC_015680	GGC	2	6	262759	262764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337283813
5246	NC_015680	TTCC	2	8	262797	262804	0 %	50 %	0 %	50 %	337283813
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5258	NC_015680	AAG	2	6	263346	263351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_015680	ATT	2	6	263355	263360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5261	NC_015680	GGCTA	2	10	263442	263451	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5342	NC_015680	CGG	2	6	267236	267241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5346	NC_015680	CT	3	6	267411	267416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5347	NC_015680	TCC	2	6	267507	267512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5351	NC_015680	GAG	2	6	267592	267597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5352	NC_015680	CCT	2	6	267630	267635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5353	NC_015680	CAA	2	6	267688	267693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5355	NC_015680	TCC	2	6	267759	267764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5356	NC_015680	AG	3	6	267818	267823	50 %	0 %	50 %	0 %	337283818
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5368	NC_015680	CTC	2	6	268483	268488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5369	NC_015680	CCCA	2	8	268490	268497	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5370	NC_015680	GCC	2	6	268511	268516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5371	NC_015680	TAGCT	2	10	268518	268527	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5372	NC_015680	CGG	2	6	268551	268556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5373	NC_015680	GCG	3	9	268575	268583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5473	NC_015680	GGT	2	6	274311	274316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5487	NC_015680	GA	3	6	275112	275117	50 %	0 %	50 %	0 %	337283831
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5493	NC_015680	CGA	2	6	275249	275254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337283831
5494	NC_015680	AGG	2	6	275317	275322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337283831
5495	NC_015680	CATGA	2	10	275325	275334	40 %	20 %	20 %	20 %	337283831
5496	NC_015680	AGCAG	2	10	275366	275375	40 %	0 %	40 %	20 %	337283831
5497	NC_015680	GATAG	2	10	275382	275391	40 %	20 %	40 %	0 %	337283831
5498	NC_015680	GCC	2	6	275427	275432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337283831
5499	NC_015680	GAA	2	6	275441	275446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337283831
5500	NC_015680	ATA	2	6	275463	275468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337283831

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