MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pyrococcus sp. NA2 chromosome

Total Repeats: 36693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015474	GAAG	2	8	1	8	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015474	AAG	2	6	15	20	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015474	AGG	2	6	57	62	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015474	GTG	2	6	90	95	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015474	AGG	2	6	246	251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015474	TGA	2	6	256	261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015474	CCAC	2	8	274	281	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_015474	AAG	2	6	309	314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015474	ACT	2	6	331	336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015474	CTT	2	6	340	345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015474	CAG	2	6	363	368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015474	TAC	2	6	384	389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015474	GTA	2	6	416	421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015474	GAG	2	6	476	481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015474	ACT	2	6	654	659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015474	CAA	2	6	666	671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015474	AG	3	6	687	692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015474	CTA	2	6	737	742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015474	AGAC	2	8	831	838	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015474	ACA	2	6	960	965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015474	AAT	2	6	1027	1032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015474	AAG	2	6	1074	1079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015474	CAAG	2	8	1092	1099	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015474	TGT	2	6	1261	1266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015474	CTTTT	2	10	1375	1384	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015474	TTTA	2	8	1407	1414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015474	CAA	2	6	1449	1454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015474	AAG	2	6	1486	1491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157645
29	NC_015474	TAA	2	6	1496	1501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157645
30	NC_015474	CAA	2	6	1523	1528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332157645
31	NC_015474	GGA	2	6	1600	1605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157645
32	NC_015474	GA	3	6	1604	1609	50 %	0 %	50 %	0 %	332157645
33	NC_015474	GAT	2	6	1632	1637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157645
34	NC_015474	ATA	2	6	1714	1719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157645
35	NC_015474	TAA	2	6	1811	1816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157645
36	NC_015474	GATA	2	8	1863	1870	50 %	25 %	25 %	0 %	332157645
37	NC_015474	GTT	2	6	1873	1878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157645
38	NC_015474	TCT	2	6	1943	1948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157645
39	NC_015474	CCA	2	6	1984	1989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157645
40	NC_015474	CTT	2	6	2175	2180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157645
41	NC_015474	GAA	2	6	2226	2231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157645
42	NC_015474	GGA	2	6	2272	2277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157645
43	NC_015474	GGA	2	6	2284	2289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157645
44	NC_015474	TCAA	2	8	2343	2350	50 %	25 %	0 %	25 %	332157645
45	NC_015474	GTT	2	6	2371	2376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157645
46	NC_015474	AAT	2	6	2400	2405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157645
47	NC_015474	ATA	2	6	2482	2487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015474	AAG	2	6	2503	2508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157646
49	NC_015474	TCA	2	6	2558	2563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157646
50	NC_015474	AAG	2	6	2572	2577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157646
51	NC_015474	TGGA	2	8	2581	2588	25 %	25 %	50 %	0 %	332157646
52	NC_015474	GAA	2	6	2608	2613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157646
53	NC_015474	CTT	2	6	2733	2738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157646
54	NC_015474	TA	3	6	2747	2752	50 %	50 %	0 %	0 %	332157646
55	NC_015474	TCC	2	6	2781	2786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157646
56	NC_015474	GTA	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157646
57	NC_015474	TCT	2	6	2874	2879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157646
58	NC_015474	AAT	2	6	2913	2918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157646
59	NC_015474	GGA	2	6	2977	2982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157646
60	NC_015474	TAA	2	6	2996	3001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157646
61	NC_015474	TAC	2	6	3065	3070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157646
62	NC_015474	CAGA	2	8	3071	3078	50 %	0 %	25 %	25 %	332157646
63	NC_015474	CATT	2	8	3086	3093	25 %	50 %	0 %	25 %	332157646
64	NC_015474	AGA	2	6	3113	3118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157646
65	NC_015474	TGCAT	2	10	3135	3144	20 %	40 %	20 %	20 %	332157646
66	NC_015474	GA	4	8	3145	3152	50 %	0 %	50 %	0 %	332157646
67	NC_015474	CTC	2	6	3172	3177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157646
68	NC_015474	TGG	2	6	3205	3210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332157646
69	NC_015474	GA	4	8	3250	3257	50 %	0 %	50 %	0 %	332157646
70	NC_015474	GCT	2	6	3274	3279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332157646
71	NC_015474	CTAC	2	8	3292	3299	25 %	25 %	0 %	50 %	332157646
72	NC_015474	ATA	2	6	3334	3339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157646
73	NC_015474	ACG	2	6	3458	3463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332157646
74	NC_015474	TGG	2	6	3487	3492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332157646
75	NC_015474	TAC	2	6	3518	3523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157646
76	NC_015474	CCT	2	6	3543	3548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157646
77	NC_015474	GAA	2	6	3587	3592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157646
78	NC_015474	AAG	2	6	3610	3615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157646
79	NC_015474	AGG	2	6	3623	3628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157646
80	NC_015474	GAA	2	6	3825	3830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157647
81	NC_015474	TAG	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157647
82	NC_015474	AG	3	6	3857	3862	50 %	0 %	50 %	0 %	332157647
83	NC_015474	AGGA	2	8	4035	4042	50 %	0 %	50 %	0 %	332157647
84	NC_015474	AAGG	2	8	4045	4052	50 %	0 %	50 %	0 %	332157647
85	NC_015474	GTCC	2	8	4069	4076	0 %	25 %	25 %	50 %	332157647
86	NC_015474	AGA	2	6	4094	4099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157647
87	NC_015474	AG	3	6	4140	4145	50 %	0 %	50 %	0 %	332157647
88	NC_015474	AAT	2	6	4169	4174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157647
89	NC_015474	TGA	2	6	4192	4197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157647
90	NC_015474	ACT	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157647
91	NC_015474	GA	3	6	4250	4255	50 %	0 %	50 %	0 %	332157647
92	NC_015474	CAG	2	6	4320	4325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332157647
93	NC_015474	CTC	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157647
94	NC_015474	AG	3	6	4453	4458	50 %	0 %	50 %	0 %	332157647
95	NC_015474	AATC	2	8	4492	4499	50 %	25 %	0 %	25 %	332157647
96	NC_015474	TCCA	2	8	4518	4525	25 %	25 %	0 %	50 %	332157647
97	NC_015474	GCAA	2	8	4551	4558	50 %	0 %	25 %	25 %	332157647
98	NC_015474	GAAA	2	8	4573	4580	75 %	0 %	25 %	0 %	332157647
99	NC_015474	GTGA	2	8	4620	4627	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015474	GTC	2	6	4642	4647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332157648
101	NC_015474	AAG	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157648
102	NC_015474	ATT	2	6	4689	4694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157648
103	NC_015474	AAG	2	6	4743	4748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157648
104	NC_015474	TTG	2	6	4766	4771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157648
105	NC_015474	ACA	2	6	4792	4797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332157648
106	NC_015474	ATA	2	6	4843	4848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157648
107	NC_015474	GAA	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157648
108	NC_015474	CTC	2	6	4935	4940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332157648
109	NC_015474	ATA	2	6	4969	4974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157648
110	NC_015474	GAT	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157648
111	NC_015474	GGT	2	6	5095	5100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332157648
112	NC_015474	CAGAGA	2	12	5101	5112	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332157648
113	NC_015474	CTAG	2	8	5119	5126	25 %	25 %	25 %	25 %	332157648
114	NC_015474	AC	3	6	5210	5215	50 %	0 %	0 %	50 %	332157648
115	NC_015474	GTT	2	6	5275	5280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157648
116	NC_015474	CTG	2	6	5339	5344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332157648
117	NC_015474	CAATTC	2	12	5396	5407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157648
118	NC_015474	AG	3	6	5425	5430	50 %	0 %	50 %	0 %	332157648
119	NC_015474	GAA	2	6	5433	5438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157648
120	NC_015474	ACC	2	6	5463	5468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157648
121	NC_015474	CCA	2	6	5482	5487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157648
122	NC_015474	TCCA	2	8	5501	5508	25 %	25 %	0 %	50 %	332157648
123	NC_015474	AAG	2	6	5542	5547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157648
124	NC_015474	ACC	2	6	5550	5555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157648
125	NC_015474	CTG	2	6	5589	5594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332157648
126	NC_015474	CTT	2	6	5617	5622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015474	ATA	2	6	5703	5708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157649
128	NC_015474	GAG	2	6	5781	5786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157649
129	NC_015474	AT	3	6	5814	5819	50 %	50 %	0 %	0 %	332157649
130	NC_015474	GAG	2	6	5861	5866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157649
131	NC_015474	TGG	2	6	5908	5913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332157649
132	NC_015474	CAA	2	6	6003	6008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332157649
133	NC_015474	AT	3	6	6020	6025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015474	TGA	3	9	6049	6057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015474	TGA	2	6	6079	6084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015474	GAAA	2	8	6146	6153	75 %	0 %	25 %	0 %	332157650
137	NC_015474	GAA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157650
138	NC_015474	TC	3	6	6218	6223	0 %	50 %	0 %	50 %	332157650
139	NC_015474	AG	3	6	6235	6240	50 %	0 %	50 %	0 %	332157650
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173	NC_015474	AACT	2	8	8059	8066	50 %	25 %	0 %	25 %	332157651
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268	NC_015474	ACT	2	6	13065	13070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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270	NC_015474	A	6	6	13160	13165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_015474	ATA	2	6	20214	20219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157670
402	NC_015474	CTT	2	6	20249	20254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157670
403	NC_015474	AG	3	6	20310	20315	50 %	0 %	50 %	0 %	332157670
404	NC_015474	ATG	2	6	20346	20351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157670
405	NC_015474	AT	3	6	20434	20439	50 %	50 %	0 %	0 %	332157670
406	NC_015474	AGT	2	6	20471	20476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157670
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410	NC_015474	CAT	2	6	20641	20646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157670
411	NC_015474	GCA	2	6	20832	20837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332157670
412	NC_015474	GTT	2	6	20841	20846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157670
413	NC_015474	CTT	2	6	20856	20861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157670
414	NC_015474	CTGT	2	8	21039	21046	0 %	50 %	25 %	25 %	332157671
415	NC_015474	TACC	2	8	21065	21072	25 %	25 %	0 %	50 %	332157671
416	NC_015474	AAGG	2	8	21079	21086	50 %	0 %	50 %	0 %	332157671
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420	NC_015474	AAG	3	9	21242	21250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157671
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422	NC_015474	AAG	2	6	21263	21268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332157671
423	NC_015474	A	6	6	21275	21280	100 %	0 %	0 %	0 %	332157671
424	NC_015474	TCA	2	6	21298	21303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_015474	TCAGG	2	10	21308	21317	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
426	NC_015474	TCA	2	6	21324	21329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_015474	CTTTT	2	10	21356	21365	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
428	NC_015474	ATA	2	6	21383	21388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157672
429	NC_015474	CAATA	2	10	21414	21423	60 %	20 %	0 %	20 %	332157672
430	NC_015474	AGG	3	9	21469	21477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157672
431	NC_015474	ATC	2	6	21522	21527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332157672
432	NC_015474	TGA	2	6	21574	21579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157672
433	NC_015474	TTC	2	6	21605	21610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332157672
434	NC_015474	AG	3	6	21630	21635	50 %	0 %	50 %	0 %	332157672
435	NC_015474	TGA	2	6	21652	21657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157672
436	NC_015474	GAG	2	6	21674	21679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332157672
437	NC_015474	TTAGG	2	10	21693	21702	20 %	40 %	40 %	0 %	332157672
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439	NC_015474	TTGGA	2	10	21750	21759	20 %	40 %	40 %	0 %	332157672
440	NC_015474	AT	3	6	21777	21782	50 %	50 %	0 %	0 %	332157672
441	NC_015474	AGAA	2	8	21806	21813	75 %	0 %	25 %	0 %	332157672
442	NC_015474	GAT	2	6	21925	21930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332157672
443	NC_015474	A	6	6	21987	21992	100 %	0 %	0 %	0 %	332157672
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448	NC_015474	CAG	2	6	22149	22154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332157672
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450	NC_015474	AG	3	6	22201	22206	50 %	0 %	50 %	0 %	332157672
451	NC_015474	TAA	2	6	22233	22238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332157672
452	NC_015474	GTC	2	6	22361	22366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332157672
453	NC_015474	ACC	2	6	22405	22410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157672
454	NC_015474	GA	3	6	22418	22423	50 %	0 %	50 %	0 %	332157672
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459	NC_015474	TTAA	2	8	22654	22661	50 %	50 %	0 %	0 %	332157672
460	NC_015474	CAA	2	6	22674	22679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332157673
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480	NC_015474	CTTC	2	8	23557	23564	0 %	50 %	0 %	50 %	332157673
481	NC_015474	ATT	3	9	23596	23604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332157673
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497	NC_015474	ACC	2	6	24565	24570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
498	NC_015474	TA	3	6	24598	24603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_015474	CCA	2	6	24663	24668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332157674
500	NC_015474	TTG	2	6	24681	24686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332157674

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