MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudonocardia dioxanivorans CB1190 plasmid pPSED03

Total Repeats: 321

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015313	GGC	2	6	18	23	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015313	GCG	2	6	32	37	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015313	GT	4	8	41	48	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015313	GC	3	6	55	60	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015313	C	6	6	161	166	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_015313	GGA	2	6	195	200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015313	GGA	2	6	206	211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015313	GGA	2	6	215	220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015313	TCC	2	6	232	237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015313	TCC	2	6	244	249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_015313	GGAG	2	8	298	305	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015313	GGA	2	6	311	316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015313	TA	3	6	340	345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015313	TCC	2	6	386	391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015313	TCC	2	6	395	400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015313	GGA	2	6	454	459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015313	GGA	2	6	466	471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015313	GGA	2	6	476	481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015313	GGA	2	6	485	490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015313	TCC	2	6	504	509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015313	GGC	2	6	522	527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015313	GGC	2	6	544	549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015313	TTG	2	6	553	558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015313	CCG	2	6	578	583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015313	AGG	2	6	709	714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015313	GGACA	2	10	734	743	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015313	GCTG	2	8	763	770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015313	TGC	2	6	790	795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015313	CG	3	6	805	810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015313	CGC	2	6	828	833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015313	GAA	2	6	846	851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015313	GTCT	2	8	921	928	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015313	CGG	2	6	942	947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015313	ATCG	2	8	1004	1011	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015313	CCG	2	6	1030	1035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015313	CG	3	6	1042	1047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015313	GTC	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015313	CGA	2	6	1388	1393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015313	GCGT	2	8	1434	1441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015313	TA	3	6	1442	1447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015313	TCG	2	6	1492	1497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015313	GC	3	6	1798	1803	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
43	NC_015313	AGTCC	2	10	1842	1851	20 %	20 %	20 %	40 %	327309735
44	NC_015313	GCC	2	6	1853	1858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309735
45	NC_015313	GA	3	6	1925	1930	50 %	0 %	50 %	0 %	327309735
46	NC_015313	TCC	2	6	2019	2024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309735
47	NC_015313	GCT	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309735
48	NC_015313	CCG	2	6	2272	2277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309735
49	NC_015313	GCG	2	6	2302	2307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309735
50	NC_015313	GCG	2	6	2355	2360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309735
51	NC_015313	GTG	2	6	2444	2449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309735
52	NC_015313	TGC	2	6	2510	2515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309735
53	NC_015313	GC	3	6	2532	2537	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
54	NC_015313	TCG	2	6	2548	2553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309735
55	NC_015313	GC	4	8	2561	2568	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
56	NC_015313	CGCAG	2	10	2680	2689	20 %	0 %	40 %	40 %	327309735
57	NC_015313	GTC	2	6	2697	2702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309735
58	NC_015313	CTA	2	6	2759	2764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309735
59	NC_015313	GTGC	2	8	2766	2773	0 %	25 %	50 %	25 %	327309735
60	NC_015313	ACA	2	6	2809	2814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309735
61	NC_015313	TTC	2	6	2845	2850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327309735
62	NC_015313	CG	3	6	2899	2904	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
63	NC_015313	CAC	3	9	2923	2931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309735
64	NC_015313	CAC	2	6	2951	2956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309735
65	NC_015313	GTG	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309735
66	NC_015313	CG	3	6	3045	3050	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
67	NC_015313	CGGA	2	8	3134	3141	25 %	0 %	50 %	25 %	327309735
68	NC_015313	CTC	2	6	3189	3194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309735
69	NC_015313	ACGG	2	8	3262	3269	25 %	0 %	50 %	25 %	327309735
70	NC_015313	CGGA	2	8	3303	3310	25 %	0 %	50 %	25 %	327309735
71	NC_015313	GAA	2	6	3315	3320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309735
72	NC_015313	GTCG	2	8	3389	3396	0 %	25 %	50 %	25 %	327309735
73	NC_015313	GCGG	2	8	3480	3487	0 %	0 %	75 %	25 %	327309735
74	NC_015313	CGG	2	6	3497	3502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309735
75	NC_015313	GTA	2	6	3513	3518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309735
76	NC_015313	TTC	2	6	3556	3561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327309735
77	NC_015313	TCCG	2	8	3566	3573	0 %	25 %	25 %	50 %	327309735
78	NC_015313	AAC	2	6	3589	3594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309735
79	NC_015313	GC	3	6	3646	3651	0 %	0 %	50 %	50 %	327309735
80	NC_015313	GATC	2	8	3788	3795	25 %	25 %	25 %	25 %	327309735
81	NC_015313	GGCATC	2	12	3837	3848	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	327309735
82	NC_015313	CGG	2	6	3956	3961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309735
83	NC_015313	TCG	2	6	3970	3975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309735
84	NC_015313	TGCT	2	8	4011	4018	0 %	50 %	25 %	25 %	327309735
85	NC_015313	GCTTG	2	10	4040	4049	0 %	40 %	40 %	20 %	327309735
86	NC_015313	CGT	2	6	4127	4132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309735
87	NC_015313	CGC	2	6	4133	4138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309735
88	NC_015313	GCC	2	6	4189	4194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309735
89	NC_015313	G	7	7	4196	4202	0 %	0 %	100 %	0 %	327309735
90	NC_015313	TAT	2	6	4214	4219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309735
91	NC_015313	TCA	2	6	4223	4228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309735
92	NC_015313	GGC	2	6	4263	4268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015313	TCG	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015313	AAAT	2	8	4306	4313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015313	GAT	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015313	ACC	2	6	4343	4348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015313	CGC	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_015313	TAA	2	6	4378	4383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015313	GGCCGG	2	12	4590	4601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309736
100	NC_015313	TCG	2	6	4739	4744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309736
101	NC_015313	TAG	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309736
102	NC_015313	GAC	2	6	4764	4769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309736
103	NC_015313	TCC	2	6	4781	4786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309736
104	NC_015313	CGA	2	6	4808	4813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309736
105	NC_015313	GAG	2	6	4876	4881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309736
106	NC_015313	TAA	2	6	4890	4895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327309736
107	NC_015313	CG	3	6	4931	4936	0 %	0 %	50 %	50 %	327309736
108	NC_015313	GCC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309736
109	NC_015313	TCG	2	6	4978	4983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309736
110	NC_015313	ACTC	2	8	5015	5022	25 %	25 %	0 %	50 %	327309736
111	NC_015313	GAT	2	6	5042	5047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309736
112	NC_015313	GTGC	2	8	5063	5070	0 %	25 %	50 %	25 %	327309736
113	NC_015313	TCC	2	6	5165	5170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_015313	CGGC	2	8	5204	5211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015313	TC	3	6	5244	5249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015313	CG	3	6	5375	5380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015313	ACG	2	6	5440	5445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015313	CGG	2	6	5457	5462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015313	AAC	2	6	5657	5662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309737
120	NC_015313	TC	3	6	5670	5675	0 %	50 %	0 %	50 %	327309737
121	NC_015313	ATT	2	6	5744	5749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309737
122	NC_015313	TCC	2	6	5755	5760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309738
123	NC_015313	TGA	2	6	5762	5767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309738
124	NC_015313	CGC	2	6	5793	5798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309738
125	NC_015313	CCGG	2	8	5799	5806	0 %	0 %	50 %	50 %	327309738
126	NC_015313	ATG	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309738
127	NC_015313	CG	3	6	5883	5888	0 %	0 %	50 %	50 %	327309738
128	NC_015313	TCG	2	6	5920	5925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309738
129	NC_015313	CCG	2	6	5994	5999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309739
130	NC_015313	CGAT	2	8	6078	6085	25 %	25 %	25 %	25 %	327309739
131	NC_015313	TCG	2	6	6105	6110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309739
132	NC_015313	CGG	2	6	6145	6150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309739
133	NC_015313	CGG	2	6	6245	6250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309739
134	NC_015313	GC	3	6	6259	6264	0 %	0 %	50 %	50 %	327309739
135	NC_015313	GGC	2	6	6336	6341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309740
136	NC_015313	GGC	2	6	6349	6354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309740
137	NC_015313	GCG	2	6	6368	6373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309740
138	NC_015313	CG	3	6	6437	6442	0 %	0 %	50 %	50 %	327309740
139	NC_015313	CGGC	2	8	6516	6523	0 %	0 %	50 %	50 %	327309740
140	NC_015313	GCAGC	2	10	6621	6630	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_015313	CAC	2	6	6637	6642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_015313	AG	4	8	6695	6702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015313	GCGTC	2	10	6784	6793	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_015313	GCC	2	6	6812	6817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_015313	GCT	2	6	6818	6823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015313	GCG	2	6	6923	6928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309741
147	NC_015313	GAC	2	6	6936	6941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309741
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149	NC_015313	GTC	2	6	7014	7019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309741
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151	NC_015313	TGG	2	6	7115	7120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309741
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153	NC_015313	GCG	2	6	7148	7153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309741
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155	NC_015313	CG	3	6	7220	7225	0 %	0 %	50 %	50 %	327309741
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161	NC_015313	ACG	2	6	7457	7462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309741
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165	NC_015313	CGA	2	6	7648	7653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309742
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179	NC_015313	TC	3	6	8562	8567	0 %	50 %	0 %	50 %	327309743
180	NC_015313	CGAT	2	8	8573	8580	25 %	25 %	25 %	25 %	327309743
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189	NC_015313	CCG	2	6	8930	8935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
190	NC_015313	GTA	2	6	8940	8945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_015313	ACTC	2	8	11413	11420	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
248	NC_015313	CTCA	2	8	11433	11440	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
249	NC_015313	CGG	2	6	11506	11511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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251	NC_015313	TCG	2	6	11596	11601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_015313	TA	3	6	11611	11616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_015313	GCC	2	6	11678	11683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
254	NC_015313	CGCGC	2	10	11751	11760	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
255	NC_015313	CCG	2	6	11802	11807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
256	NC_015313	ATAG	2	8	11854	11861	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
257	NC_015313	GCAC	2	8	11866	11873	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
258	NC_015313	TG	3	6	12050	12055	0 %	50 %	50 %	0 %	327309746
259	NC_015313	ACT	2	6	12123	12128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309746
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262	NC_015313	TG	3	6	12242	12247	0 %	50 %	50 %	0 %	327309746
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271	NC_015313	CGA	2	6	12518	12523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309746
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273	NC_015313	GCG	2	6	12574	12579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309746
274	NC_015313	CG	3	6	12597	12602	0 %	0 %	50 %	50 %	327309746
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276	NC_015313	GC	3	6	12653	12658	0 %	0 %	50 %	50 %	327309746
277	NC_015313	CG	3	6	12740	12745	0 %	0 %	50 %	50 %	327309746
278	NC_015313	GAT	2	6	12795	12800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309746
279	NC_015313	AC	3	6	12817	12822	50 %	0 %	0 %	50 %	327309746
280	NC_015313	CGG	2	6	12881	12886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309746
281	NC_015313	CGG	2	6	13063	13068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309747
282	NC_015313	AAT	2	6	13091	13096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327309747
283	NC_015313	AG	3	6	13135	13140	50 %	0 %	50 %	0 %	327309747
284	NC_015313	TAA	2	6	13141	13146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327309747
285	NC_015313	AAG	2	6	13184	13189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309747
286	NC_015313	CGG	2	6	13243	13248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309747
287	NC_015313	ACC	2	6	13292	13297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309747
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289	NC_015313	AG	3	6	13575	13580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015313	GGT	2	6	13612	13617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309748
291	NC_015313	GCG	2	6	13737	13742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309748
292	NC_015313	TAA	2	6	13747	13752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327309748
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296	NC_015313	GCA	2	6	14047	14052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_015313	CAT	2	6	14160	14165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_015313	TCG	2	6	14180	14185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_015313	CGA	2	6	14196	14201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
300	NC_015313	CTG	2	6	14327	14332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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311	NC_015313	TCC	2	6	14750	14755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
312	NC_015313	TCC	2	6	14762	14767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
313	NC_015313	GGA	2	6	14821	14826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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315	NC_015313	TCC	2	6	14849	14854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
316	NC_015313	GGC	2	6	14867	14872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
317	NC_015313	GGC	2	6	14888	14893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
318	NC_015313	CCG	2	6	14923	14928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
319	NC_015313	CGG	2	6	14937	14942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
320	NC_015313	AT	3	6	15034	15039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
321	NC_015313	CCA	2	6	15041	15046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.