MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea sp. At-9b plasmid pPAT9B05

Total Repeats: 2494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014842	TCT	2	6	26732	26737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317052799
502	NC_014842	A	6	6	26780	26785	100 %	0 %	0 %	0 %	317052799
503	NC_014842	CAG	2	6	26800	26805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052799
504	NC_014842	CTG	2	6	27001	27006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052799
505	NC_014842	TGC	2	6	27011	27016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052799
506	NC_014842	AG	3	6	27122	27127	50 %	0 %	50 %	0 %	317052799
507	NC_014842	GTT	2	6	27147	27152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052799
508	NC_014842	TGA	2	6	27374	27379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052799
509	NC_014842	GGCA	2	8	27392	27399	25 %	0 %	50 %	25 %	317052799
510	NC_014842	TCA	2	6	27411	27416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052799
511	NC_014842	AAAG	2	8	27437	27444	75 %	0 %	25 %	0 %	317052799
512	NC_014842	TCA	2	6	27638	27643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052799
513	NC_014842	AAG	2	6	27700	27705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317052799
514	NC_014842	ATT	2	6	27743	27748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317052800
515	NC_014842	GAA	2	6	27769	27774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317052800
516	NC_014842	GCA	3	9	27811	27819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052800
517	NC_014842	GAA	2	6	27862	27867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317052800
518	NC_014842	AAT	2	6	27918	27923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317052800
519	NC_014842	TCCA	2	8	27924	27931	25 %	25 %	0 %	50 %	317052800
520	NC_014842	AAG	2	6	27939	27944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317052800
521	NC_014842	T	6	6	27947	27952	0 %	100 %	0 %	0 %	317052800
522	NC_014842	GA	4	8	27959	27966	50 %	0 %	50 %	0 %	317052800
523	NC_014842	TAC	2	6	27986	27991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052800
524	NC_014842	AAAT	2	8	28001	28008	75 %	25 %	0 %	0 %	317052800
525	NC_014842	AGA	2	6	28040	28045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317052800
526	NC_014842	GA	3	6	28069	28074	50 %	0 %	50 %	0 %	317052800
527	NC_014842	GAA	2	6	28208	28213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317052800
528	NC_014842	A	6	6	28335	28340	100 %	0 %	0 %	0 %	317052800
529	NC_014842	AGA	2	6	28426	28431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317052800
530	NC_014842	TCA	2	6	28474	28479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052800
531	NC_014842	ATT	2	6	28588	28593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317052800
532	NC_014842	T	7	7	28592	28598	0 %	100 %	0 %	0 %	317052800
533	NC_014842	CAG	2	6	28619	28624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052800
534	NC_014842	TGC	2	6	28749	28754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052800
535	NC_014842	GCT	2	6	28807	28812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052800
536	NC_014842	T	7	7	28814	28820	0 %	100 %	0 %	0 %	317052800
537	NC_014842	AC	3	6	28847	28852	50 %	0 %	0 %	50 %	317052800
538	NC_014842	CAT	2	6	28874	28879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052800
539	NC_014842	CGC	2	6	28927	28932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052800
540	NC_014842	AT	3	6	28942	28947	50 %	50 %	0 %	0 %	317052800
541	NC_014842	GTT	2	6	28970	28975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052800
542	NC_014842	CAAC	2	8	29038	29045	50 %	0 %	0 %	50 %	317052800
543	NC_014842	GAA	2	6	29057	29062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317052800
544	NC_014842	CCT	2	6	29174	29179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317052800
545	NC_014842	AT	3	6	29201	29206	50 %	50 %	0 %	0 %	317052800
546	NC_014842	CA	3	6	29210	29215	50 %	0 %	0 %	50 %	317052800
547	NC_014842	TAC	2	6	29267	29272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052800
548	NC_014842	CAG	2	6	29301	29306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052800
549	NC_014842	TAA	2	6	29344	29349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317052800
550	NC_014842	TCA	2	6	29395	29400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052800
551	NC_014842	ACAT	2	8	29401	29408	50 %	25 %	0 %	25 %	317052800
552	NC_014842	TC	3	6	29549	29554	0 %	50 %	0 %	50 %	317052800
553	NC_014842	GCA	2	6	29564	29569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052800
554	NC_014842	CCA	2	6	29636	29641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052800
555	NC_014842	CT	3	6	29668	29673	0 %	50 %	0 %	50 %	317052800
556	NC_014842	CCA	4	12	29759	29770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052800
557	NC_014842	ATC	2	6	29841	29846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052800
558	NC_014842	CACG	2	8	29884	29891	25 %	0 %	25 %	50 %	317052800
559	NC_014842	CCA	2	6	29929	29934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052800
560	NC_014842	T	6	6	30063	30068	0 %	100 %	0 %	0 %	317052800
561	NC_014842	CGA	2	6	30078	30083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052800
562	NC_014842	A	6	6	30288	30293	100 %	0 %	0 %	0 %	317052800
563	NC_014842	TCA	2	6	30310	30315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052800
564	NC_014842	CAG	2	6	30332	30337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052800
565	NC_014842	ATC	2	6	30414	30419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052800
566	NC_014842	TGC	2	6	30428	30433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052800
567	NC_014842	TGA	3	9	30458	30466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052800
568	NC_014842	GT	3	6	30487	30492	0 %	50 %	50 %	0 %	317052800
569	NC_014842	CTGT	2	8	30496	30503	0 %	50 %	25 %	25 %	317052800
570	NC_014842	ATTT	2	8	30521	30528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014842	T	6	6	30532	30537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014842	GC	3	6	30629	30634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_014842	ACC	2	6	30658	30663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_014842	ACC	2	6	30683	30688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_014842	TCAT	2	8	30689	30696	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
576	NC_014842	ATA	2	6	30821	30826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_014842	TAC	2	6	30868	30873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_014842	TAT	2	6	30899	30904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_014842	CCCTA	2	10	30936	30945	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
580	NC_014842	TGGC	2	8	30957	30964	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
581	NC_014842	CTT	2	6	30970	30975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_014842	CAA	2	6	30979	30984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_014842	ACT	2	6	31042	31047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_014842	AAC	2	6	31064	31069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_014842	ATG	2	6	31111	31116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014842	ATG	2	6	31147	31152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_014842	AAT	2	6	31204	31209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014842	A	6	6	31226	31231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_014842	AAT	2	6	31235	31240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014842	CAA	2	6	31251	31256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_014842	TTAA	2	8	31263	31270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014842	AAC	2	6	31385	31390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_014842	TAT	2	6	31400	31405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014842	TG	3	6	31411	31416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_014842	AAG	2	6	31501	31506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317052801
596	NC_014842	CTT	2	6	31644	31649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317052801
597	NC_014842	CAAT	2	8	31674	31681	50 %	25 %	0 %	25 %	317052801
598	NC_014842	TGAT	2	8	31709	31716	25 %	50 %	25 %	0 %	317052801
599	NC_014842	ATT	2	6	31871	31876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317052801
600	NC_014842	ACC	2	6	31954	31959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052801
601	NC_014842	TC	3	6	32078	32083	0 %	50 %	0 %	50 %	317052801
602	NC_014842	G	6	6	32129	32134	0 %	0 %	100 %	0 %	317052801
603	NC_014842	TG	3	6	32146	32151	0 %	50 %	50 %	0 %	317052801
604	NC_014842	GGC	2	6	32167	32172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052801
605	NC_014842	CTG	2	6	32192	32197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052801
606	NC_014842	A	6	6	32213	32218	100 %	0 %	0 %	0 %	317052801
607	NC_014842	TGGG	2	8	32243	32250	0 %	25 %	75 %	0 %	317052801
608	NC_014842	TAG	2	6	32254	32259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052801
609	NC_014842	CCA	2	6	32319	32324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052801
610	NC_014842	CTG	2	6	32334	32339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052801
611	NC_014842	CGC	2	6	32427	32432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052801
612	NC_014842	GAA	2	6	32507	32512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317052801
613	NC_014842	CCAT	2	8	32533	32540	25 %	25 %	0 %	50 %	317052801
614	NC_014842	TTGC	2	8	32609	32616	0 %	50 %	25 %	25 %	317052801
615	NC_014842	ATA	2	6	32750	32755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317052801
616	NC_014842	TTA	2	6	32821	32826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014842	ATT	2	6	32864	32869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014842	CTTC	2	8	32904	32911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_014842	TAA	2	6	32914	32919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014842	GACG	2	8	32966	32973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
621	NC_014842	TCA	2	6	33023	33028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052802
622	NC_014842	TTC	2	6	33060	33065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317052802
623	NC_014842	TCC	2	6	33108	33113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317052802
624	NC_014842	GCAT	2	8	33196	33203	25 %	25 %	25 %	25 %	317052802
625	NC_014842	CT	3	6	33226	33231	0 %	50 %	0 %	50 %	317052802
626	NC_014842	ACG	2	6	33249	33254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052802
627	NC_014842	TAC	2	6	33257	33262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052802
628	NC_014842	CAA	2	6	33303	33308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317052802
629	NC_014842	T	7	7	33360	33366	0 %	100 %	0 %	0 %	317052802
630	NC_014842	AT	3	6	33404	33409	50 %	50 %	0 %	0 %	317052802
631	NC_014842	CTG	2	6	33482	33487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052802
632	NC_014842	TCTT	2	8	33502	33509	0 %	75 %	0 %	25 %	317052802
633	NC_014842	ACTG	2	8	33528	33535	25 %	25 %	25 %	25 %	317052802
634	NC_014842	AAAT	2	8	33555	33562	75 %	25 %	0 %	0 %	317052802
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657	NC_014842	A	6	6	34461	34466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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785	NC_014842	ACAT	2	8	40002	40009	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
786	NC_014842	TCC	2	6	40034	40039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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788	NC_014842	TCC	2	6	40126	40131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
789	NC_014842	GGA	2	6	40171	40176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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792	NC_014842	AT	3	6	40222	40227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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852	NC_014842	TGG	2	6	42807	42812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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877	NC_014842	T	6	6	43986	43991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
878	NC_014842	TA	3	6	43993	43998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
879	NC_014842	GAC	2	6	43999	44004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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883	NC_014842	GAA	2	6	44251	44256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317052812
884	NC_014842	GCA	2	6	44279	44284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
885	NC_014842	TGA	2	6	44410	44415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052813
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887	NC_014842	GGTAA	2	10	44526	44535	40 %	20 %	40 %	0 %	317052813
888	NC_014842	CGCT	2	8	44538	44545	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
889	NC_014842	TCA	2	6	44733	44738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052814
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891	NC_014842	GCG	2	6	44799	44804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052814
892	NC_014842	CCAG	2	8	44850	44857	25 %	0 %	25 %	50 %	317052814
893	NC_014842	ATG	2	6	44888	44893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052814
894	NC_014842	GCC	2	6	45032	45037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052814
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896	NC_014842	CTG	2	6	45118	45123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052814
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