MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea sp. At-9b plasmid pPAT9B04

Total Repeats: 6741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014841	ATCAC	2	10	48664	48673	40 %	20 %	0 %	40 %	317052941
1002	NC_014841	TTG	2	6	48725	48730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014841	GGAA	2	8	48746	48753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014841	CTT	2	6	48805	48810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_014841	CCAG	2	8	48945	48952	25 %	0 %	25 %	50 %	317052942
1006	NC_014841	CAA	2	6	49022	49027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317052942
1007	NC_014841	CCAG	2	8	49096	49103	25 %	0 %	25 %	50 %	317052942
1008	NC_014841	CAG	2	6	49126	49131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052942
1009	NC_014841	G	6	6	49136	49141	0 %	0 %	100 %	0 %	317052942
1010	NC_014841	TCT	2	6	49186	49191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317052942
1011	NC_014841	GCCA	2	8	49231	49238	25 %	0 %	25 %	50 %	317052942
1012	NC_014841	CGA	2	6	49264	49269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052942
1013	NC_014841	CAT	2	6	49281	49286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052942
1014	NC_014841	CTC	2	6	49288	49293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_014841	ATG	3	9	49333	49341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014841	A	6	6	49379	49384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014841	GTT	2	6	49491	49496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014841	TGCA	2	8	49516	49523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_014841	TATT	2	8	49552	49559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014841	ATA	2	6	49566	49571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014841	TTTTAT	2	12	49572	49583	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014841	TA	3	6	49585	49590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014841	ATT	3	9	49608	49616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014841	ATA	2	6	49782	49787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014841	TGC	2	6	49816	49821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_014841	ATT	2	6	49867	49872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014841	TTC	2	6	49972	49977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_014841	ATG	2	6	50002	50007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014841	CAT	2	6	50009	50014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_014841	GAG	2	6	50039	50044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_014841	CAT	3	9	50060	50068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052943
1032	NC_014841	TCT	2	6	50107	50112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317052943
1033	NC_014841	ATT	2	6	50124	50129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317052943
1034	NC_014841	AAT	2	6	50144	50149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317052943
1035	NC_014841	TAA	2	6	50451	50456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317052944
1036	NC_014841	GCA	3	9	50491	50499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052944
1037	NC_014841	GCGAAA	2	12	50557	50568	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	317052944
1038	NC_014841	GTG	2	6	50629	50634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052944
1039	NC_014841	AAGGG	2	10	50637	50646	40 %	0 %	60 %	0 %	317052944
1040	NC_014841	TTCG	2	8	50717	50724	0 %	50 %	25 %	25 %	317052944
1041	NC_014841	GAA	2	6	50823	50828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317052944
1042	NC_014841	GTG	2	6	50858	50863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052944
1043	NC_014841	GAC	2	6	50898	50903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052944
1044	NC_014841	GC	3	6	50918	50923	0 %	0 %	50 %	50 %	317052944
1045	NC_014841	ACA	2	6	50927	50932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317052944
1046	NC_014841	A	6	6	50937	50942	100 %	0 %	0 %	0 %	317052944
1047	NC_014841	AG	3	6	51118	51123	50 %	0 %	50 %	0 %	317052944
1048	NC_014841	TGA	2	6	51330	51335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052944
1049	NC_014841	GAT	2	6	51339	51344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052944
1050	NC_014841	TAC	2	6	51456	51461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_014841	ATC	2	6	51481	51486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_014841	TCTG	2	8	51511	51518	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_014841	CTGC	2	8	51538	51545	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_014841	TTG	2	6	51565	51570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014841	TCGC	2	8	51576	51583	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_014841	AGA	2	6	51659	51664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014841	ATG	2	6	51720	51725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_014841	TAA	2	6	51730	51735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014841	A	6	6	51749	51754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014841	GCA	2	6	51791	51796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_014841	ACG	2	6	51906	51911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_014841	CCA	2	6	51963	51968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_014841	TGA	2	6	52058	52063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014841	TGAT	2	8	52180	52187	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014841	GAA	2	6	52194	52199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_014841	AGG	2	6	52443	52448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014841	GTG	2	6	52460	52465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_014841	ATCT	2	8	52468	52475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_014841	TA	3	6	52486	52491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014841	TTCA	2	8	52516	52523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_014841	TGC	2	6	52644	52649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_014841	TGG	2	6	52805	52810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052945
1073	NC_014841	TGC	2	6	52843	52848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052945
1074	NC_014841	GAC	2	6	52860	52865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052945
1075	NC_014841	ATC	2	6	52866	52871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052945
1076	NC_014841	GCC	2	6	52951	52956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052945
1077	NC_014841	CGA	2	6	52976	52981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052945
1078	NC_014841	GCG	2	6	52989	52994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052945
1079	NC_014841	AAGA	2	8	53010	53017	75 %	0 %	25 %	0 %	317052945
1080	NC_014841	TGT	2	6	53057	53062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052945
1081	NC_014841	CGTT	2	8	53122	53129	0 %	50 %	25 %	25 %	317052945
1082	NC_014841	GATC	2	8	53243	53250	25 %	25 %	25 %	25 %	317052945
1083	NC_014841	AGC	2	6	53353	53358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052945
1084	NC_014841	CAT	2	6	53369	53374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052945
1085	NC_014841	CAT	2	6	53384	53389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052945
1086	NC_014841	ATC	2	6	53403	53408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052945
1087	NC_014841	CGA	2	6	53420	53425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052945
1088	NC_014841	GCCA	2	8	53436	53443	25 %	0 %	25 %	50 %	317052945
1089	NC_014841	AGTT	2	8	53452	53459	25 %	50 %	25 %	0 %	317052945
1090	NC_014841	TGC	2	6	53494	53499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052945
1091	NC_014841	GAT	2	6	53526	53531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052945
1092	NC_014841	GCG	2	6	53592	53597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052945
1093	NC_014841	AGG	2	6	53698	53703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317052945
1094	NC_014841	ACC	2	6	53751	53756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052945
1095	NC_014841	GC	3	6	53787	53792	0 %	0 %	50 %	50 %	317052945
1096	NC_014841	GAA	2	6	54010	54015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317052946
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1098	NC_014841	TGC	2	6	54129	54134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052946
1099	NC_014841	ACG	2	6	54135	54140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052946
1100	NC_014841	TTC	2	6	54166	54171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317052946
1101	NC_014841	CAA	2	6	54242	54247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317052946
1102	NC_014841	TTC	2	6	54248	54253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317052946
1103	NC_014841	CGC	2	6	54305	54310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052946
1104	NC_014841	GC	3	6	54383	54388	0 %	0 %	50 %	50 %	317052946
1105	NC_014841	AC	3	6	54421	54426	50 %	0 %	0 %	50 %	317052946
1106	NC_014841	GCC	3	9	54539	54547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052946
1107	NC_014841	GAT	2	6	54559	54564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052946
1108	NC_014841	T	6	6	54748	54753	0 %	100 %	0 %	0 %	317052946
1109	NC_014841	AGC	2	6	54764	54769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052946
1110	NC_014841	A	6	6	54794	54799	100 %	0 %	0 %	0 %	317052946
1111	NC_014841	TGG	2	6	54816	54821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052946
1112	NC_014841	CG	3	6	54938	54943	0 %	0 %	50 %	50 %	317052946
1113	NC_014841	A	6	6	54951	54956	100 %	0 %	0 %	0 %	317052946
1114	NC_014841	AAC	2	6	54978	54983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317052946
1115	NC_014841	GTACC	2	10	55006	55015	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1116	NC_014841	T	7	7	55039	55045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014841	CCAGGC	2	12	55114	55125	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	317052947
1118	NC_014841	AG	3	6	55132	55137	50 %	0 %	50 %	0 %	317052947
1119	NC_014841	ATCG	2	8	55193	55200	25 %	25 %	25 %	25 %	317052947
1120	NC_014841	ATCT	2	8	55279	55286	25 %	50 %	0 %	25 %	317052947
1121	NC_014841	AT	3	6	55302	55307	50 %	50 %	0 %	0 %	317052947
1122	NC_014841	AAC	2	6	55331	55336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317052947
1123	NC_014841	TGA	2	6	55338	55343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052947
1124	NC_014841	TTG	2	6	55385	55390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052947
1125	NC_014841	CGG	2	6	55439	55444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052947
1126	NC_014841	TGC	2	6	55454	55459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052947
1127	NC_014841	TGA	3	9	55464	55472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052947
1128	NC_014841	CAG	2	6	55574	55579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052947
1129	NC_014841	TGC	2	6	55604	55609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052947
1130	NC_014841	TTC	2	6	55679	55684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317052947
1131	NC_014841	CGC	2	6	55743	55748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052948
1132	NC_014841	AGA	2	6	55752	55757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317052948
1133	NC_014841	TGG	2	6	55768	55773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052948
1134	NC_014841	GACA	2	8	55811	55818	50 %	0 %	25 %	25 %	317052948
1135	NC_014841	CATGA	2	10	55949	55958	40 %	20 %	20 %	20 %	317052949
1136	NC_014841	CCG	2	6	56004	56009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317052949
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1138	NC_014841	GGC	2	6	56054	56059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317052949
1139	NC_014841	TGGCG	2	10	56162	56171	0 %	20 %	60 %	20 %	317052949
1140	NC_014841	GC	3	6	56229	56234	0 %	0 %	50 %	50 %	317052949
1141	NC_014841	CGT	2	6	56263	56268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052949
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1143	NC_014841	ATG	2	6	56455	56460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052949
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1151	NC_014841	TAAAT	2	10	56727	56736	60 %	40 %	0 %	0 %	317052949
1152	NC_014841	ACC	2	6	56753	56758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317052949
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1155	NC_014841	CCAG	2	8	56854	56861	25 %	0 %	25 %	50 %	317052949
1156	NC_014841	ATC	2	6	56879	56884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317052949
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1162	NC_014841	GGT	2	6	57134	57139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052949
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1167	NC_014841	GAA	2	6	57336	57341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1168	NC_014841	ATTG	2	8	57388	57395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1169	NC_014841	ATG	2	6	57409	57414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1170	NC_014841	TG	3	6	57423	57428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1171	NC_014841	T	6	6	57525	57530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1174	NC_014841	C	6	6	57651	57656	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1184	NC_014841	GC	3	6	58171	58176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1239	NC_014841	TGCGC	2	10	60324	60333	0 %	20 %	40 %	40 %	317052953
1240	NC_014841	TCT	2	6	60341	60346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317052953
1241	NC_014841	TGTT	2	8	60362	60369	0 %	75 %	25 %	0 %	317052953
1242	NC_014841	GAT	2	6	60382	60387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317052953
1243	NC_014841	ATCG	2	8	60388	60395	25 %	25 %	25 %	25 %	317052953
1244	NC_014841	TGG	2	6	60410	60415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052953
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1247	NC_014841	TCG	2	6	60525	60530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317052953
1248	NC_014841	GC	3	6	60575	60580	0 %	0 %	50 %	50 %	317052953
1249	NC_014841	GTT	2	6	60633	60638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317052953
1250	NC_014841	CTGG	2	8	60666	60673	0 %	25 %	50 %	25 %	317052953
1251	NC_014841	CA	3	6	60874	60879	50 %	0 %	0 %	50 %	317052954
1252	NC_014841	CAG	2	6	60891	60896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317052954
1253	NC_014841	AAC	2	6	60904	60909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317052954
1254	NC_014841	AGG	2	6	60913	60918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317052954
1255	NC_014841	GTG	2	6	61043	61048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052954
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1257	NC_014841	GGT	2	6	61103	61108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317052954
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1380	NC_014841	GCAG	2	8	65794	65801	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1381	NC_014841	TTA	2	6	65814	65819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1384	NC_014841	CGG	2	6	65897	65902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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