MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pantoea sp. At-9b plasmid pPAT9B03

Total Repeats: 6618

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014840	A	6	6	51138	51143	100 %	0 %	0 %	0 %	317053230
1002	NC_014840	ATG	2	6	51145	51150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053230
1003	NC_014840	TTTGGT	2	12	51162	51173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317053230
1004	NC_014840	CCA	2	6	51179	51184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053230
1005	NC_014840	ATCT	2	8	51186	51193	25 %	50 %	0 %	25 %	317053230
1006	NC_014840	GGC	2	6	51212	51217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053230
1007	NC_014840	CGC	2	6	51293	51298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053230
1008	NC_014840	TGC	2	6	51319	51324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053230
1009	NC_014840	TCGC	2	8	51486	51493	0 %	25 %	25 %	50 %	317053231
1010	NC_014840	CCA	2	6	51496	51501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053231
1011	NC_014840	TGCCG	2	10	51505	51514	0 %	20 %	40 %	40 %	317053231
1012	NC_014840	GGC	2	6	51521	51526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053231
1013	NC_014840	ATC	2	6	51545	51550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053231
1014	NC_014840	TGC	2	6	51635	51640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053231
1015	NC_014840	GC	3	6	51674	51679	0 %	0 %	50 %	50 %	317053231
1016	NC_014840	GCG	2	6	51684	51689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053231
1017	NC_014840	CGC	2	6	51733	51738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053231
1018	NC_014840	CTGC	2	8	51794	51801	0 %	25 %	25 %	50 %	317053231
1019	NC_014840	CAC	2	6	51816	51821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053231
1020	NC_014840	AGC	2	6	51880	51885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053231
1021	NC_014840	CAG	2	6	51901	51906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053231
1022	NC_014840	TGC	2	6	52042	52047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053231
1023	NC_014840	CCA	2	6	52079	52084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053231
1024	NC_014840	TTC	2	6	52160	52165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317053231
1025	NC_014840	GCG	2	6	52178	52183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053231
1026	NC_014840	CTG	2	6	52190	52195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053231
1027	NC_014840	GCA	2	6	52224	52229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053231
1028	NC_014840	TCCC	2	8	52256	52263	0 %	25 %	0 %	75 %	317053231
1029	NC_014840	GCG	2	6	52277	52282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053231
1030	NC_014840	TGCGG	2	10	52288	52297	0 %	20 %	60 %	20 %	317053231
1031	NC_014840	GCA	2	6	52324	52329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053231
1032	NC_014840	ATG	2	6	52332	52337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053231
1033	NC_014840	CCAA	2	8	52344	52351	50 %	0 %	0 %	50 %	317053231
1034	NC_014840	GC	4	8	52390	52397	0 %	0 %	50 %	50 %	317053231
1035	NC_014840	GC	3	6	52467	52472	0 %	0 %	50 %	50 %	317053231
1036	NC_014840	AACG	2	8	52489	52496	50 %	0 %	25 %	25 %	317053231
1037	NC_014840	AAG	2	6	52497	52502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317053231
1038	NC_014840	CCG	2	6	52552	52557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053231
1039	NC_014840	ACT	2	6	52652	52657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053232
1040	NC_014840	CAC	2	6	52664	52669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053232
1041	NC_014840	TTGG	2	8	52688	52695	0 %	50 %	50 %	0 %	317053232
1042	NC_014840	GAT	2	6	52717	52722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053232
1043	NC_014840	GGC	2	6	52764	52769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053232
1044	NC_014840	CG	3	6	52771	52776	0 %	0 %	50 %	50 %	317053232
1045	NC_014840	GCAAA	2	10	52785	52794	60 %	0 %	20 %	20 %	317053232
1046	NC_014840	GTT	2	6	52800	52805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317053232
1047	NC_014840	CGT	2	6	52851	52856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053232
1048	NC_014840	CCG	2	6	52876	52881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053232
1049	NC_014840	TGGC	2	8	52944	52951	0 %	25 %	50 %	25 %	317053232
1050	NC_014840	AG	3	6	53001	53006	50 %	0 %	50 %	0 %	317053232
1051	NC_014840	GCG	2	6	53041	53046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053232
1052	NC_014840	GCAC	2	8	53049	53056	25 %	0 %	25 %	50 %	317053232
1053	NC_014840	GCA	2	6	53070	53075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053232
1054	NC_014840	CAG	2	6	53178	53183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053232
1055	NC_014840	TGGC	2	8	53209	53216	0 %	25 %	50 %	25 %	317053232
1056	NC_014840	TGG	2	6	53252	53257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053232
1057	NC_014840	A	6	6	53266	53271	100 %	0 %	0 %	0 %	317053232
1058	NC_014840	GTT	2	6	53274	53279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317053232
1059	NC_014840	CCG	2	6	53303	53308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053232
1060	NC_014840	GCA	3	9	53375	53383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053232
1061	NC_014840	A	6	6	53396	53401	100 %	0 %	0 %	0 %	317053232
1062	NC_014840	ACA	2	6	53511	53516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317053232
1063	NC_014840	CCA	2	6	53546	53551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053232
1064	NC_014840	CTG	2	6	53563	53568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053232
1065	NC_014840	ACC	2	6	53594	53599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053232
1066	NC_014840	GCG	2	6	53602	53607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053232
1067	NC_014840	CGG	3	9	53687	53695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053232
1068	NC_014840	CCG	2	6	53744	53749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053232
1069	NC_014840	ACG	2	6	53807	53812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053232
1070	NC_014840	CCCAC	2	10	53862	53871	20 %	0 %	0 %	80 %	317053232
1071	NC_014840	CCG	2	6	53878	53883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053232
1072	NC_014840	CGC	2	6	53993	53998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053232
1073	NC_014840	CTG	2	6	54048	54053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053232
1074	NC_014840	TGAT	2	8	54092	54099	25 %	50 %	25 %	0 %	317053232
1075	NC_014840	GCC	2	6	54115	54120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053232
1076	NC_014840	GCC	2	6	54131	54136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053232
1077	NC_014840	CTG	2	6	54226	54231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053232
1078	NC_014840	ATG	2	6	54292	54297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053232
1079	NC_014840	TCCG	2	8	54467	54474	0 %	25 %	25 %	50 %	317053232
1080	NC_014840	TGT	2	6	54524	54529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317053232
1081	NC_014840	TG	3	6	54563	54568	0 %	50 %	50 %	0 %	317053232
1082	NC_014840	TGAA	2	8	54584	54591	50 %	25 %	25 %	0 %	317053232
1083	NC_014840	ATT	2	6	54625	54630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317053233
1084	NC_014840	GCG	2	6	54680	54685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053233
1085	NC_014840	TTG	2	6	54686	54691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317053233
1086	NC_014840	TGA	2	6	54733	54738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053233
1087	NC_014840	TGGGTA	2	12	54741	54752	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	317053233
1088	NC_014840	CGC	3	9	54763	54771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053233
1089	NC_014840	GCG	2	6	54791	54796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053233
1090	NC_014840	GGT	2	6	54824	54829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053233
1091	NC_014840	GGC	2	6	54832	54837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053233
1092	NC_014840	GAA	2	6	54848	54853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317053233
1093	NC_014840	CGC	2	6	54910	54915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317053233
1094	NC_014840	ACACC	2	10	54933	54942	40 %	0 %	0 %	60 %	317053233
1095	NC_014840	AAC	2	6	54951	54956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317053233
1096	NC_014840	TGA	2	6	54963	54968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053233
1097	NC_014840	GCA	2	6	55054	55059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053233
1098	NC_014840	GC	3	6	55099	55104	0 %	0 %	50 %	50 %	317053233
1099	NC_014840	CTGC	2	8	55136	55143	0 %	25 %	25 %	50 %	317053233
1100	NC_014840	CTG	3	9	55202	55210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053233
1101	NC_014840	CCA	2	6	55243	55248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053233
1102	NC_014840	CCA	2	6	55254	55259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317053233
1103	NC_014840	GGGCTG	2	12	55265	55276	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	317053233
1104	NC_014840	AGC	2	6	55331	55336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053233
1105	NC_014840	CTG	2	6	55346	55351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053233
1106	NC_014840	CGT	2	6	55382	55387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053233
1107	NC_014840	GCA	2	6	55432	55437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053233
1108	NC_014840	TGC	2	6	55473	55478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053233
1109	NC_014840	ACA	2	6	55543	55548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317053233
1110	NC_014840	GCG	2	6	55603	55608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053233
1111	NC_014840	TCC	2	6	55641	55646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317053233
1112	NC_014840	CTG	2	6	55829	55834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053233
1113	NC_014840	AGA	2	6	55843	55848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317053233
1114	NC_014840	GAA	2	6	55871	55876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317053233
1115	NC_014840	GCA	2	6	55879	55884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053233
1116	NC_014840	GAC	2	6	55889	55894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053233
1117	NC_014840	CAG	2	6	55928	55933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053233
1118	NC_014840	GCA	2	6	55937	55942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053233
1119	NC_014840	TGG	2	6	55943	55948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053233
1120	NC_014840	CAA	3	9	55949	55957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317053233
1121	NC_014840	CG	5	10	56119	56128	0 %	0 %	50 %	50 %	317053233
1122	NC_014840	ACG	2	6	56296	56301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053233
1123	NC_014840	TCG	2	6	56308	56313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053233
1124	NC_014840	CTG	2	6	56318	56323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053233
1125	NC_014840	TCAATC	2	12	56400	56411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053233
1126	NC_014840	CAG	2	6	56466	56471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053233
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1128	NC_014840	CAG	2	6	56591	56596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317053233
1129	NC_014840	ATC	2	6	56615	56620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053233
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1133	NC_014840	TGC	2	6	56808	56813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317053233
1134	NC_014840	GGT	2	6	56833	56838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053233
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1138	NC_014840	GC	4	8	57019	57026	0 %	0 %	50 %	50 %	317053233
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1140	NC_014840	ATA	2	6	57176	57181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_014840	GAA	2	6	57209	57214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_014840	GAA	2	6	57216	57221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_014840	GTT	2	6	57234	57239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1150	NC_014840	ATTC	2	8	57687	57694	25 %	50 %	0 %	25 %	317053234
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1154	NC_014840	TATGT	2	10	57865	57874	20 %	60 %	20 %	0 %	317053234
1155	NC_014840	TGA	2	6	58011	58016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317053234
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1157	NC_014840	TCA	2	6	58058	58063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053234
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1184	NC_014840	TAA	2	6	59273	59278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1187	NC_014840	GAA	2	6	59307	59312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1188	NC_014840	TGC	2	6	59362	59367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1194	NC_014840	GGC	2	6	59543	59548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1252	NC_014840	TGGTG	2	10	62252	62261	0 %	40 %	60 %	0 %	317053236
1253	NC_014840	GCG	2	6	62262	62267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317053236
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1255	NC_014840	CAT	2	6	62585	62590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317053236
1256	NC_014840	GGT	2	6	62594	62599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053236
1257	NC_014840	GGT	2	6	62642	62647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317053236
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1264	NC_014840	AGTC	2	8	63038	63045	25 %	25 %	25 %	25 %	317053237
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